订购NovaSeq X系列
将先进的化学、光学和信息学技术相结合,实现了超凡的速度和数据质量、出色的通量和可扩展性。
快速、集成的工作流程,为广泛的靶向测序应用提供可直接用于测序的DNA文库。
分析时间
手动操作时间
起始量
Illumina DNA Prep with Enrichment,原名为Nextera Flex for Enrichment,是Illumina文库制备产品系列中最快、最灵活的DNA靶向测序解决方案。
通过内置定量和文库归一化,磁珠上酶切法片段化化学技术与简化的单一杂交实验方案相结合,将手动操作时间缩短至约2小时。
兼容多种DNA起始量和样本类型,包括血液、唾液、基因组DNA和福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)组织。
磁珠上酶切法片段化可最大限度减少偏差和出错机会,从而在所有Illumina测序系统中获得高度可重现的数据。
查找快速、优化的测序文库制备解决方案,适用于各种应用。
Illumina DNA Prep with Enrichment
快速、集成的基于DNA的文库制备和富集工作流程,将磁珠上酶切法片段化与单一杂交实验方案相结合,适用于靶向测序应用。
快速、集成的文库制备工作流程,适用于各种应用,包括全人类基因组、扩增子、质粒和微生物基因组的测序。
高性能、快速且集成的无PCR文库制备工作流程,适用于人类全基因组测序或肿瘤-正常测序等敏感应用。
Automation capability | Liquid Handling Robots |
---|---|
Method | Target Enrichment, Exome Sequencing, Targeted DNA Sequencing, Custom Sequencing |
Specialized sample types | Low-Input Samples, FFPE Tissue, Blood, Saliva |
Variant class | Germline variants, Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs), Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Loss of heterozygosity (LOH), Somatic variants |
作用机制 | 磁珠固化转座酶和杂交捕获化学技术 |
内容说明 |
外显子组:45 Mb外显子内容(≥ 98%的RefSeq、CCDS和Ensembl编码内容)。 定制:0.5-15 Mb目标基因组内容。 固定基因集panel:内容因panel而异。 |
分析时间 | 约6.5小时 |
反应次数 | 定制工作流程:16或96个样本 |
在靶read | 外显子组panel≥85%(来自示例数据集的结果;实际性能可能有所不同) |
均一性 | ≥90%(4 Gb、20x下的覆盖度%;对于外显子组panel) |
多重分析 | 多达384个可用的唯一双标签。对多达12重预富集文库混合池进行测试。 |
手动操作时间 | 约2小时 |
技术 | Illumina测序 |
核酸类型 | DNA |
物种 | Other, 人 |
系统 | MiSeq Desktop Sequencer, iSeq 100 System, NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000 System, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeq System, NextSeq 550Dx in Research Mode, NovaSeq X System, NovaSeq 6000Dx in Research Mode, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System |
自动化详情 | 探索可用的自动化方法 |
说明 |
在约6.5小时内,从低DNA起始量和各种样本类型中制备用于各种实验的测序文库,包括全外显子组、定制和固定panel靶向测序。 |
起始量 | 10 -1000 ng高质量基因组DNA或50-1000 ng FFPE DNA。(对于血液和唾液样本,请参阅参考指南)。 |
Illumina DNA Prep and Enrichment试剂盒需要使用Illumina DNA/RNA UD Indexes Set。建议使用双标签。
Panel和探针是可选的,请单独订购。
Flex Lysis Kit是对血液DNA提取的补充。
鉴定FFPE样本需要Infinium FFPE QC Kit。
使用SciGene Hybex Microheating系统时,Infinium MIDI Heatblock Insert是必需的。
Illumina Free Adapter Blocking Reagent(可选)用于降低标签跳跃水平。
Illumina纯化磁珠用于DNA纯化和/或根据磁珠与样本的比例选择DNA片段的大小。
Illumina DNA Prep with Enrichment结合了多种DNA起始量和样本类型的多功能、简单、快速的文库制备和富集,支持广泛的靶向富集应用,包括定制panel、固定panel和全外显子组panel。
Illumina DNA Prep with Enrichment
仪器 | Recommended number of samples | Read length |
---|---|---|
iSeq 100 System | TruSight Cancer: 4 samples per run (based on 280× mean targeted coverage; 99% target coverage at 20×) |
2×100 bp |
MiniSeq System | TruSight Cancer (samples per run): mid output: 8, high output: 25 (based on 280× mean targeted coverage; 99% target coverage at 20×) |
2×100 bp |
MiSeq System | TruSight Cancer (samples per run): v2 reagents: 15, v3 reagents: 25 (based on 280× mean targeted coverage; 99% target coverage at 20×) |
2×100 bp |
NextSeq 550 System | Exome (samples per run): mid output: 5, high output: 16 (based on 50× mean targeted coverage; 90% target coverage at 20×) |
2×100 bp |
NovaSeq 6000 System | Exome (samples per run, by flow cell type): S1: 128, S2: 164, S4: 400 (based on 50× mean targeted coverage; 90% target coverage at 20×; S4 limited by available indexes) |
2×100 bp |
由eBLT介导的均匀片段化反应,加上单一杂交反应,可实现快速、灵活的工作流程。
Illumina DNA Prep with Enrichment与各种Illumina富集panel兼容,并针对低通量、中通量和高通量系统进行了优化。
Illumina DNA Prep with Enrichment为定制、固定和外显子组panel提供了高覆盖度均一性和靶向填充read富集。
Illumina DNA Prep with Enrichment为(A、B)细胞系FFPE对照人类参考DNA样本和(C、D)真实世界FFPE样本提供低丰度体细胞变异检出,观察到的变异频率与直系同源测序检测的频率显著相关。
Illumina® DNA Prep with Enrichment, (S) Tagmentation (96 Samples)
20025524
包括用于制备和富集96个文库的试剂(8次12重富集反应)。单独购买富集探针panel、Illumina纯化磁珠和标签接头。
List Price:
Discounts:
Illumina® DNA Prep with Enrichment, (S) Tagmentation (16 Samples)
20025523
包含用于制备和富集16个文库的试剂(16,1重富集反应)。单独购买富集探针panel、Illumina纯化磁珠和标签接头。
List Price:
Discounts:
Illumina® DNA Prep, (S) Tagmentation (96 Samples)
20025520
包含用于制备96个文库的试剂。不包含富集试剂。单独购买富集探针panel、Illumina纯化磁珠和标签接头。富集试剂只能与文库制备试剂(Illumina DNA Prep with Enrichment, (S) Tagmentation(96样本))一起订购。
List Price:
Discounts:
Illumina® DNA Prep, (S) Tagmentation (16 Samples)
20025519
包含用于制备16个文库的试剂。不包含富集试剂。单独购买富集探针panel、Illumina纯化磁珠和标签接头。富集试剂只能与文库制备试剂(Illumina DNA Prep with Enrichment, (S) Tagmentation(16样本))一起订购。
List Price:
Discounts:
TruSight Cancer – Enrichment Oligos only (4 or 8 Enrichment Reactions)
FC-121-0202
TruSight Cancer能靶向与多种癌症易感性相关的94个基因和284个SNP,与Nextera Flex for Enrichment联合使用时,为单一杂交的工作流程,足够进行8次富集反应,与TruSight Rapid Capture联合使用时足够进行4次富集反应。文库制备、富集和标签接头试剂需单独订购。
List Price:
Discounts:
TruSight Hereditary Cancer – Enrichment Oligos Only (8 Enrichment Reactions)
20029551
TruSight Hereditary Cancer——仅含富集寡核苷酸(8次富集反应)
List Price:
Discounts:
TruSight One – Enrichment Oligos only (6 Enrichment Reactions)
20029227
与Illumina DNA Prep with Enrichment, (S) Tagmentation搭配使用时,足以进行六次富集反应。单独购买文库制备试剂、富集试剂和标签接头。
List Price:
Discounts:
TruSight One Expanded – Enrichment Oligos only (6 Enrichment Reactions)
20029226
与Illumina DNA Prep with Enrichment, (S) Tagmentation搭配使用时,足以进行六次富集反应。单独购买文库制备和富集试剂以及标签接头。
List Price:
Discounts:
Illumina Custom Enrichment Panel (8 Enrichment Reactions)
20025371
与Illumina DNA Prep with Enrichment搭配使用时,足够进行8次富集反应。使用DesignStudio在2K–67K探针之间实现定制panel设计。单独购买文库制备和富集试剂以及标签接头。
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20091654
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation(96个标签,96个样本)包括96个10 bp标签,足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。
List Price:
Discounts:
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20091656
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation(96个标签,96个样本)包括96个10 bp标签,足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。
List Price:
Discounts:
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20091658
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation(96个标签,96个样本)包括96个10 bp标签,足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。
List Price:
Discounts:
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20091660
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation(96个标签,96个样本)包括96个10 bp标签,足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。
List Price:
Discounts:
IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20027213
包含96、10 bp标签,足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。
List Price:
Discounts:
IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20027214
包含96、10 bp标签,足以标记96个样本。单独购买文库制备试剂、富集试剂和探针panel。
List Price:
Discounts:
IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20042666
包含96、10 bp标签,足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。
List Price:
Discounts:
IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20042667
包含96、10 bp标签,足以标记96个样本。单独购买文库制备试剂、富集试剂和探针panel。
List Price:
Discounts:
Illumina DNA Prep with Enrichment Training
20028457
Illumina Purification Bead, 100mL
20060057
包含一个100 mL微珠容器,用于文库纯化和大小选择。单独购买文库制备和富集试剂、探针panel和标签。
List Price:
Discounts:
Illumina Purification Bead, 400mL
20060058
包含四个100 mL微珠容器,用于文库纯化和大小选择。单独购买文库制备和富集试剂、探针panel和标签。
List Price:
Discounts:
Flex Lysis Reagent Kit (96 reactions)
20018706
包含使用Illumina DNA Prep和Illumina DNA Prep with Enrichment处理血液样本的试剂。单独购买文库制备、富集、富集探针panel和标签接头试剂。
List Price:
Discounts:
Infinium FFPE QC Kit (384 reactions)
WG-321-1001
Infinium FFPE QC Kit是使用Nextera Flex for Enrichment鉴定FFPE样本所需的配套产品。文库制备、富集、富集探针panel以及标签接头试剂需单独订购。
List Price:
Discounts:
Infinium MIDI Heatblock Insert
BD-60-601
Nextera Flex for Enrichment杂交步骤所需的SciGene Hybex微型加热系统的加热插块。
List Price:
Discounts:
Illumina® Free Adapter Blocking Reagent (12 Reactions)
20024144
该试剂在文库制备过程中使用,可降低标签跳跃水平。
Illumina® Free Adapter Blocking Reagent (48 Reactions)
20024145
该试剂在文库制备过程中使用,可降低标签跳跃水平。
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Illumina DNA Prep with Enrichment试剂盒兼容10–1000 ng或50–1000 ng FFPE的高质量双链基因组DNA(gDNA)起始量。对于人gDNA样本与其他复杂的大型基因组,建议的最小gDNA起始量为50 ng。
该试剂盒使用基于磁珠的转座酶复合物,用接头对基因组DNA进行片段化和标记,然后进行PCR步骤,将带标签的接头序列添加到DNA片段的末端。文库制备完成后,通过杂交生物素化的寡核苷酸探针并使用链霉亲和素磁珠(SMB)捕获靶向文库片段来富集靶标。从磁珠中洗脱捕获的标签文库,并在测序前扩增。
Illumina不支持或不支持将冷冻或凝固血液与Flex Lysis Reagent Kit一起使用,将血液裂解方案与Illumina DNA Prep with Enrichment一起使用。
Illumina DNA Prep with Enrichment的血液裂解实验方案针对K2-EDTA采集管(由Becton Dickinson生产)进行了优化。其他采血管可能有效,但尚未经过验证。
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