什么是鸟枪法宏基因组测序？
鸟枪法宏基因组测序技术使研究人员能够对给定的复杂样本中存在的所有生物体的所有基因进行全面的检测。微生物学家可以利用该方法评估细菌多样性，并检测各种环境中微生物的丰度。鸟枪法宏基因组学还可以用来研究不可培养的微生物，其他方法很难或无法分析这些微生物。
与毛细管测序或基于PCR的方法不同，新一代测序（NGS）可以使研究人员同时对数千种生物进行测序。基于NGS的宏基因组测序能够在单一测序运行中组合多个样本，每个样本都可实现高测序覆盖度，因此可以检测微生物群落中丰度非常低的生物，而利用其他方法可能无法识别这些生物或者价格太高。
16S rRNA测序是宏基因组学研究的另一种方法。
推荐的鸟枪法宏基因组学工作流程
有多种方法可以开展鸟枪法宏基因组测序，但工作流程的每个步骤都有一些推荐使用的产品。
点击下方的查看工作流程各步骤所使用的产品。
Illumina DNA Prep
一个快速、集成的工作流程，适合广泛的应用，从人类全基因组测序到扩增子、质粒和各种微生物。
Nextera XT Library Prep Kit90分钟内即可用小型基因组（细菌、古细菌、病毒）、扩增子和质粒制备出可直接用于测序的文库。
TruSeq DNA PCR-Free Library Preparation Kit
为全基因组测序应用提供简单全面的文库制备方案。研究人员可对多种生物进行测序，从细菌等小型基因组到人类全基因组。
BaseSpace Apps可进行k-mer比对和分类学分类
DRAGEN EnrichmentDRAGEN Enrichment应用程序可进行比对和选择性变异检出，可输入FASTQ，BAM或CRAM文件，输出BAM和VCF文件（可同时输出两种格式的文件）。
One Codex
在BaseSpace Sequence Hub使用快速、全面、准确的数据平台快速评估样本，进行宏基因组分析
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参考文献
- Baker BJ, Sheik CS, Taylor CA, Jain S, Bhasi A, et al.(2013) Community transcriptomic assembly reveals microbes that contribute to deep-sea carbon and nitrogen cycling.ISME J 10.1038/ismej.2013.85.
- McLean JS, Lombardo MJ, Ziegler MG, Novotny M, Yee-Greenbaum J, et al.(2013) Genome of the pathogen Porphyromonas gingivalis recovered from a biofilm in a hospital sink using a high-throughput single-cell genomics platform.Genome Res 23:867–77.
- Schofield MM, Sherman DM.(2013) Meta-omic characterization of prokaryotic gene clusters for natural product biosynthesis.Curr Opin Biotechnol: 10.1016/j.copbio.2013.05.001.
- Neafsey DE.(2013) Genome sequencing sheds light on emerging drug resistance in malaria parasites.Nat Genet 45:589–90.