Illumina DNA Prep Training
20022900
Illumina DNA Prep为多个全基因组测序应用带来灵活性。
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Illumina DNA Prep采用一个快速且用户友好的工作流程。微珠tagmentation技术将文库制备的总时间（从DNA提取到文库归一化）缩短至3.5小时。
Illumina DNA Prepx的工作流程支持广泛的DNA起始量（1-500 ng），多种类型的样本，以及小型和大型基因组。这个流程包括从血液、唾液、干血斑*或细菌菌落*中提取DNA。灵活地对人类或其他复杂的大型基因组以及扩增子或微生物群落进行测序，这一切通过单个试剂盒都能实现。
灵活地对人类或其他复杂的大型基因组以及扩增子或微生物群落进行测序，这一切通过单个试剂盒都能实现。
在满足不同研究需求的同时，Nextera DNA Flex的工作流程带来大小一致的插入片段、均一的覆盖和优化的性能，不论DNA起始量或基因组大小如何。这种基于微珠的技术最大限度地减少了偏向性和错误机会，带来高度可重现的测序数据。
IDT® for Illumina®-Nextera™ DNA UD Indexes set A、B、C和D标签提供多达384个唯一双标签，可准确分配read，高效利用流动槽。 这些唯一双标签码使用10个碱基对码。碱基对标签码的这种改变需要调整测序运行设置。
Nextera DNA CD Indexes支持多达96个样本的组合双标签。24规格的CD标签以试管的形式提供，96规格的CD标签以孔板的形式提供
对于全基因组测序，推荐使用Illumina DNA Prep作为Nextera DNA Library Prep Kit（已停产）的替代产品。如果您之前在ATAC-Seq**或其他定制应用中使用Nextera DNA（货号FC-121-1030）或独立组件（货号15027865和15027866），则建议您使用Illumina Tagment DNA TDE1 Enzyme and Buffer Kit作为替代产品。
*提供经过验证的实验方案。
**客户报告的应用
通过这种互动体验，感受Nextera技术为您的实验室带来的力量。Nextera文库制备试剂盒解决方案支持各种应用中的全基因组测序、灵活兼容Illumina测序仪，整合血液和唾液的样本制备，且无需定量。
查看信息图
| 仪器 | 推荐的样本数 | 读长 |
|---|---|---|
| NextSeq 550 System | 1 sample per run (high output; based on 30× coverage of a human genome) | Up to 2 × 150 bp |
| NovaSeq 6000 System | 2–10 samples per run (dual flow cell; based on 30× coverage of a human genome) | Up to 2 × 125 bp (rapid run) Up to 2 × 150 bp (high output) |
| Illumina DNA Prep | TruSeq DNA PCR-Free | TruSeq DNA Nano | |
|---|---|---|---|
| 作用机制 | 连接磁珠的转座酶 | 机械DNA片段化和接头连接。 工作流程采用降低偏向性的PCR，无凝胶。 | 机械DNA片段化和接头连接。 工作流程采用降低偏向性的PCR，无凝胶。 |
| 分析时间 | 约3–4小时（从DNA提取到文库归一化） | 5小时的总分析时间 | 约6小时的总分析时间 |
| 手动操作时间 | 1-1.5小时 | 4小时 | 约4小时 |
| 方法 | 鸟枪法测序, De Novo Sequencing, 全基因组测序, 扩增子测序 | 基于测序的基因分型, 鸟枪法测序, 全基因组测序 | 基于测序的基因分型, 鸟枪法测序, 全基因组测序 |
| 物种类别 | 任何物种, 人类, 小鼠, 大鼠, 植物, 酵母, 果蝇, 斑马鱼, 线虫, 哺乳动物, 细菌, 病毒 | 其它, 植物, 哺乳动物, 大鼠, 小鼠, 人类 | 其它, 植物, 哺乳动物, 大鼠, 小鼠, 人类 |
| 物种详情 | 与任何物种都兼容 系 | 与大多数大型DNA基因组兼容。 | 与大多数大型DNA基因组兼容。 |
| 特殊的样本类型 | 血液, 唾液 | 不兼容FFPE | 低起始量样本, 不兼容FFPE |
| 目标插入片段大小 | 约350 bp | 350 bp或550 bp | 350 bp或550 bp |
| 自动化功能 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 |
| 说明 | 快速、灵活的工作流程，适用于各种研究应用和样本类型，包括人类全基因组测序、微生物全基因组测序等等。 | 用于全基因组测序研究的简单、一站式无PCR制备方法，可对具有挑战性的基因组区域进行测序。 | 低起始量研究方法，可提供较高的基因组覆盖度质量，减少偏差。 |
| 起始量 | 小型基因组（例如微生物群）：1-500 ng DNA。大型基因组（例如人类）： 100-500 ng DNA。（请参阅参考指南，了解有关血液和唾液的信息）。 | 1 ug DNA | 100 ng基因组DNA |
(A) 固定有转座子酶的磁珠介导gDNA片段化与Illumina测序引物的添加同时发生。(B) 循环数较少的PCR扩增生成了可立即测序的DNA片段，并添加标签和接头。(C) 对可上机测序的片段进行洗脱并混合。
Application Note | PDF 3 MB
An automated Nextera DNA Flex library preparation workflow for high-throughput metagenomics
Application Note | PDF < 1 MB
Nextera Crude Lysate Protocol for Metagenomic Whole-Genome Sequencing Studies
Application Note | PDF < 1 MB
Direct Bacterial Colony Sequencing with the Nextera™ DNA Flex Library Preparation Kit
Application Note | PDF 1 MB
Fast, Flexible, and Self-Normalizing Library Prep with Nextera Flex Chemistry
Application Note | HTML
Nextera DNA Flex Library Preparation for Soil Shotgun Metagenomics Analysis
Application Note | HTML
Data Sheet | PDF | 5 versions
Illumina library preparation solutions
Brochure | PDF 2 MB
Data Sheet | PDF < 1 MB
Illumina DNA Prep Support Documentation
Illumina DNA Prep Consumables & Equipment List Documentation
Illumina DNA Prep Reference Guide Documentation
Trim Adapters for Nextera DNA Flex in Local Run Manager for MiniSeq Documentation
Index Adapters Pooling Guide Documentation
Illumina DNA Prep Checklist Documentation
自定义协议选择器
Generates customized, end-to-end instructions
This kit enables cluster generation for subsequent sequencing on the HiSeq 3000 and HiSeq 4000 Systems.
