NovaSeq X系列
将先进的化学、光学和信息学技术相结合，实现了超凡的速度和数据质量、出色的通量和可扩展性。
Illumina DNA Prep with Enrichment，以前称为Nextera Flex for Enrichment，是因美纳文库制备产品线中最快速、灵活的DNA靶向测序解决方案。
Illumina DNA Prep with Enrichment
基于快速且集成的流程，兼容定制化和成品化的富集panel，为各种应用提供完整的靶向重测序解决方案。
约6.5小时
分析时间
约2小时
手动操作时间
10 -1000 ng高质量基因组DNA或50-1000 ng FFPE DNA。（对于血液和唾液样本，请参阅参考指南）。
起始量
概述
快速、用户友好的工作流程
通过内置定量和文库归一化，磁珠上酶切法片段化化学技术与简化的单一杂交实验方案相结合，将手动操作时间缩短至约2小时。
灵活支持样本类型和起始量
与各种DNA起始量和样本类型兼容，包括血液、唾液、基因组DNA和福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）组织。
经过优化的性能
链接磁珠转座酶大大减少了偏差和出错，使得所有因美纳测序系统都能获得高重现性的数据。
Illumina DNA Prep产品系列
查找快速、优化的测序文库制备解决方案，适用于各种应用。
Illumina DNA Prep with Enrichment
快速、集成的基于DNA的文库制备和富集工作流程，将磁珠上酶切法片段化与单一杂交实验方案相结合，适用于靶向测序应用。
快速、集成的文库制备工作流程，适用于各种应用，包括全人类基因组、扩增子、质粒和微生物基因组的测序。
高性能、快速且集成的无PCR文库制备工作流程，适用于人类全基因组测序或肿瘤-正常测序等敏感应用。
规格
| 分析时间 | 约6.5小时 |
|---|---|
| 自动化功能 | 液体处理机器人 |
| 自动化详情 | 探索可用的自动化方法 |
| 内容说明 |
外显子组：45 Mb外显子内容（≥ 98%的RefSeq、CCDS和Ensembl编码内容）。 定制：0.5-15 Mb目标基因组内容。 固定基因集panel：内容因panel而异。 |
| 说明 | 在约6.5小时内，从低DNA起始量和各种样本类型中制备用于各种实验的测序文库，包括全外显子组、定制和固定panel靶向测序。 |
| 手动操作时间 | 约2小时, 约2小时 |
| 起始量 | 10 -1000 ng高质量基因组DNA或50-1000 ng FFPE DNA。（对于血液和唾液样本，请参阅参考指南）。 |
| 系统 | MiSeq桌面式基因测序仪, iSeq 100系统, NextSeq 550桌面式基因测序仪, NextSeq 2000基因测序仪, 研究模式下的MiSeqDx, MiniSeq基因测序仪, 研究模式下的NextSeq 550Dx, NovaSeq X基因测序仪, 研究模式下的NovaSeq 6000Dx, NovaSeq 6000基因测序仪, NovaSeq X Plus基因测序仪 |
| 作用机制 | 磁珠固化转座酶和杂交捕获化学技术 |
| 方法 | 定制测序, 靶向DNA测序, 外显子组测序, 靶向富集 |
| 多重分析 | 多达384个可用的唯一双标签。对多达12重预富集文库混合池进行测试。 |
| 核酸类型 | DNA |
| 反应次数 | 定制工作流程：16或96个样本 |
| 在靶read | 外显子组panel≥85%（来自示例数据集的结果；实际性能可能有所不同） |
| 特殊的样本类型 | 血液, 低起始量样本, FFPE组织, 唾液 |
| 物种 | 其他, 人 |
| 技术 | Illumina测序 |
| 均一性 | ≥90%（4 Gb、20x下的覆盖度%；对于外显子组panel） |
| 变异类别 | 单核苷酸多态性（SNP）, 杂合性缺失（LOH）, 体细胞变异, 生殖系变异, 插入缺失（indel）, 拷贝数变异（CNV） |
需要的产品
Illumina DNA Prep and Enrichment试剂盒需要使用Illumina DNA/RNA UD Indexes Set。建议使用双标签。
Panel和探针是可选的，请单独订购。
Flex Lysis Kit是对血液DNA提取的补充。
鉴定FFPE样本需要Infinium FFPE QC Kit。
使用SciGene Hybex Microheating系统时，Infinium MIDI Heatblock Insert是必需的。
Illumina Free Adapter Blocking Reagent（可选）用于降低标签跳跃水平。
Illumina纯化磁珠用于DNA纯化和/或根据磁珠与样本的比例选择DNA片段的大小。
/
结果
应用
Illumina DNA Prep with Enrichment结合了多种DNA起始量和样本类型的多功能、简单、快速的文库制备和富集，支持广泛的靶向富集应用，包括定制panel、固定panel和全外显子组panel。
工作流程示例
制备
Illumina DNA Prep with Enrichment
项目建议
| 仪器 | Recommended number of samples | Read length |
|---|---|---|
| iSeq 100 System | TruSight Cancer：每次运行4个样本（基于280×平均靶标覆盖度；20×下的靶标覆盖度为99%） |
2×100 bp |
| MiniSeq System | TruSight Cancer（每次运行的样本数）：中通量：8，高通量：25（基于280×平均靶标覆盖度；20×下的靶标覆盖度为99%） |
2×100 bp |
| MiSeq System | TruSight Cancer（每次运行的样本数）：v2试剂：15，v3试剂：25（基于280×平均靶标覆盖度；20×下的靶标覆盖度为99%） |
2×100 bp |
| NextSeq 550 System | 外显子组（每次运行的样本数）：中通量：5，高通量：16（基于50×平均靶标覆盖度；20×下的靶标覆盖度为90%） |
2×100 bp |
| NovaSeq 6000 System | 外显子组（每次运行的样本数，按流动槽类型）：S1：128，S2：164，S4：400（基于50×平均靶标覆盖度；20×下的靶标覆盖度为90%；S4流动槽受可用标签数的限制） |
2×100 bp |
相关应用和方法
文档
产品资料
支持文档
- Illumina DNA Prep with Enrichment Product Documentation
- Illumina DNA Prep with Enrichment Consumables & Equipment
- Enrichment BaseSpace App Documentation
- Illumina Adapter Sequences
- Urinary Pathogen ID/AMR Panel Reference
- Index Adapters Pooling Guide
- Illumina DNA Prep with Enrichment Checklist
- Illumina DNA Prep with Enrichment Documentation
- 全部 Illumina DNA RNA Unique Dual Indexes Support
- 全部 Illumina DNA RNA UD Indexes Support
图
Illumina磁珠上酶切法片段化化学技术
由eBLT介导的均匀片段化反应，加上单一杂交反应，可实现快速、灵活的工作流程。
富集panel兼容性
Illumina DNA Prep with Enrichment与各种Illumina富集panel兼容，并针对低通量、中通量和高通量系统进行了优化。
高覆盖度均一性和加垫read富集
Illumina DNA Prep with Enrichment为定制、固定和外显子组panel提供了高覆盖度均一性和靶向填充read富集。
准确的变异检出
Illumina DNA Prep with Enrichment为（A、B）细胞系FFPE对照人类参考DNA样本和（C、D）真实世界FFPE样本提供低丰度体细胞变异检出，观察到的变异频率与直系同源测序检测的频率显著相关。
文库制备 (4)
Illumina® DNA Prep with Enrichment, (S) Tagmentation（96样本）
20025524
包括用于制备和富集96个文库的试剂（8次12重富集反应）。单独购买富集探针panel、Illumina纯化磁珠和标签接头。
Illumina® DNA Prep with Enrichment, (S) Tagmentation（16样本）
20025523
包含用于制备和富集16个文库的试剂（16，1重富集反应）。单独购买富集探针panel、Illumina纯化磁珠和标签接头。
Illumina® DNA Prep, (S) Tagmentation（96样本）
20025520
包含用于制备96个文库的试剂。不包含富集试剂。单独购买富集探针panel、Illumina纯化磁珠和标签接头。富集试剂只能与文库制备试剂（Illumina DNA Prep with Enrichment，(S) Tagmentation（96样本）一起订购。
Illumina® DNA Prep, (S) Tagmentation (16样本)
20025519
包含用于制备16个文库的试剂。不包含富集试剂。单独购买富集探针panel、Illumina纯化磁珠和标签接头。富集试剂只能与文库制备试剂（Illumina DNA Prep with Enrichment， （S） Tagmentation（16样本））一起订购。
Panel (5)
TruSight Cancer – 仅富集寡核苷酸（4次或8次富集反应）
FC-121-0202
TruSight Cancer能靶向与多种癌症易感性相关的94个基因和284个SNP，与Nextera Flex for Enrichment联合使用时，为单一杂交的工作流程，足够进行8次富集反应，与TruSight Rapid Capture联合使用时足够进行4次富集反应。文库制备、富集和标签接头试剂需单独订购。
TruSight Hereditary Cancer – 仅富集寡核苷酸（8次富集反应）
20029551
TruSight Hereditary Cancer——仅含富集寡核苷酸（8次富集反应）
TruSight One – 仅富集寡核苷酸（6次富集反应）
20029227
与Illumina DNA Prep with Enrichment， （S） Tagmentation搭配使用时，足以进行六次富集反应。单独购买文库制备试剂、富集试剂和标签接头。
TruSight One Expanded – 仅富集寡核苷酸（6次富集反应）
20029226
与Illumina DNA Prep with Enrichment， （S） Tagmentation搭配使用时，足以进行六次富集反应。单独购买文库制备和富集试剂以及标签接头。
Illumina Custom Enrichment Panel（8次富集反应）
20025371
与Illumina DNA Prep with Enrichment搭配使用时，足够进行8次富集反应。使用DesignStudio在2K–67K探针之间实现定制panel设计。单独购买文库制备和富集试剂以及标签接头。
标签接头 (8)
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation（96标签，96样本）
20091654
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A， Tagmentation（96个标签，96个样本）包括96个10 bp标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96标签, 96样本)
20091656
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B， Tagmentation（96个标签，96个样本）包括96个10 bp标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96标签, 96样本)
20091658
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C， Tagmentation（96个标签，96个样本）包括96个10 bp标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96标签, 96样本)
20091660
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D， Tagmentation（96个标签，96个样本）包括96个10 bp标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。
IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation（96标签，96样本）
20027213
包含96、10 bp标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。
IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation（96标签，96样本）
20027214
包含96、10 bp标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备试剂、富集试剂和探针panel。
IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation（96标签，96样本）
20042666
包含96、10 bp标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。
IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation（96标签，96样本）
20042667
包含96、10 bp标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备试剂、富集试剂和探针panel。
服务 (1)
Illumina DNA Prep with Enrichment培训
20028457
配套产品 (7)
Illumin纯化磁珠, 100mL
20060057
包含一个100 mL微珠容器，用于文库纯化和大小选择。单独购买文库制备和富集试剂、探针panel和标签。
Illumina纯化磁珠, 400mL
20060058
包含四个100 mL微珠容器，用于文库纯化和大小选择。单独购买文库制备和富集试剂、探针panel和标签。
Flex Lysis Reagent Kit（96次反应）
20018706
包含使用Illumina DNA Prep和Illumina DNA Prep with Enrichment处理血液样本的试剂。单独购买文库制备、富集、富集探针panel和标签接头试剂。
Infinium FFPE QC Kit (384次反应)
WG-321-1001
Infinium FFPE QC Kit是使用Nextera Flex for Enrichment鉴定FFPE样本所需的配套产品。文库制备、富集、富集探针panel以及标签接头试剂需单独订购。
Infinium MIDI Heatblock Insert
BD-60-601
Nextera Flex for Enrichment杂交步骤所需的SciGene Hybex微型加热系统的加热插块。
Illumina® Free Adapter Blocking Reagent（12次反应）
20024144
该试剂在文库制备过程中使用，可降低标签跳跃水平。
Illumina® Free Adapter Blocking Reagent（48次反应）
20024145
该试剂在文库制备过程中使用，可降低标签跳跃水平。
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常见问题解答
Illumina DNA Prep with Enrichment试剂盒兼容10–1000 ng或50–1000 ng FFPE的高质量双链基因组DNA（gDNA）起始量。对于人gDNA样本与其他复杂的大型基因组，建议的最小gDNA起始量为50 ng。
该试剂盒使用基于磁珠的转座酶复合物，用接头对基因组DNA进行片段化和标记，然后进行PCR步骤，将带标签的接头序列添加到DNA片段的末端。文库制备完成后，通过杂交生物素化的寡核苷酸探针并使用链霉亲和素磁珠（SMB）捕获靶向文库片段来富集靶标。从磁珠中洗脱捕获的标签文库，并在测序前扩增。
Illumina不支持或不支持将冷冻或凝固血液与Flex Lysis Reagent Kit一起使用，将血液裂解方案与Illumina DNA Prep with Enrichment一起使用。
Illumina DNA Prep with Enrichment的血液裂解实验方案针对K2-EDTA采集管（由Becton Dickinson生产）进行了优化。其他采血管可能有效，但尚未经过验证。
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结果
MiSeq v3试剂盒
与早期版本相比，优化的试剂盒可增加簇密度和读长，从而提高测序质量分值。
TruSight Oncology 500
使用涵盖所有主要变异类别以及来自FFPE组织的基因特征（TMB、MSI和HRD）的大型泛癌panel实现CGP。
Illumina DNA Prep
快速、集成的文库制备工作流程，适用于各种测序应用。
TruSight Tumor 15
集中的新一代测序（NGS）panel，通过一个简单快速的工作流程评估实体瘤中的15个常见突变基因。
AmpliSeq for Illumina Custom DNA Panel
专为特异性靶点或感兴趣的基因组内容测序进行优化的靶向定制研究panel。
Nextera XT DNA Library Preparation Kit
提供90分钟的工作流程，以较低的DNA起始量要求制备用于小型基因组、PCR扩增子、质粒和cDNA测序的DNA文库。
Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment
高性能、快速、可靠的人类全外显子组测序解决方案，包括全面、最新的外显子组富集panel。
Illumina DNA PCR-Free Prep
高效、快速、集成的文库制备工作流程，为灵敏的测序应用生成高度准确的数据。
NextSeq 1000/1000-CN和NextSeq 2000/2000-CN试剂盒
用于NextSeq 1000/2000系列基因测序仪的试剂盒，具有简便易用的卡盒和多种流动槽配置，可提供灵活的测序选项。
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