AmpliSeq for Illumina Cancer Hotspot Panel v2是一款靶向重测序分析套装,用于研究50个基因的热点区域体细胞突变,癌症体细胞突变目录(COSMIC)1数据库已确认这些基因与癌症有关联。主要特点包括:
Cancer HotSpot Panel是集成工作流程的一部分,该工作流程包括基于AmpliSeq for Illumina聚合酶链式反应(PCR)的文库制备、采用因美纳边合成边测序(SBS)的新一代测序(NGS)技术以及自动化分析过程。
这种panel能够对肺癌、结肠癌、乳腺癌、卵巢癌、黑色素瘤及前列腺癌等多种癌症类型实现高灵敏的变异检测。即用型panel助您节省鉴定目标基因、设计引物和优化panel所需的时间和精力。
仪器 | 推荐的样本数 | 读长 |
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iSeq 100 System | 每次运行16个样本(假设最小覆盖度为500倍) | 2 × 150 bp |
MiniSeq System | 每次运行的样本:中通量:32,高通量:96(假设最小覆盖度为500倍) | 2 × 150 bp |
MiSeq System | 每次运行的样本(按试剂盒版本):v2 nano:4,v2 micro:16,v2:60,v3:96(假设最小覆盖度为500倍) | 2 × 150 bp |
AmpliSeq for Illumina Cancer Hotspot Panel v2 | AmpliSeq for Illumina Focus Panel | AmpliSeq for Illumina Comprehensive Panel v3 | TruSight Tumor 15 | |
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内容说明 | 50种与癌症具有已知关联的基因的热点区域 | 52个癌基因的DNA和RNA靶点 | 161个癌基因的DNA和RNA靶点 | 从15个实体瘤相关基因中扩增250个扩增子 |
分析时间 | 5小时(仅包括文库制备时间;不包括文库定量、归一化或混合时间) | 5-6小时(仅为文库制备时间,不包括文库定量、归一化或混合时间) | 5-6小时(仅为文库制备时间,不包括文库定量、归一化或混合时间) | 7小时 |
多重分析 | 96个双标签序列组合 | 96个双标签序列组合 | 96个双标签序列组合 | 1-24重 |
方法 | 扩增子测序, 靶向DNA测序 | 扩增子测序, 靶向RNA测序, 靶向DNA测序 | 扩增子测序, 靶向RNA测序, 靶向DNA测序 | 扩增子测序, 靶向DNA测序 |
核酸类型 | DNA | DNA, RNA | DNA, RNA | DNA |
物种类别 | 人类 | 人类 | 人类 | 人类 |
特殊的样本类型 | FFPE组织 | FFPE组织 | FFPE组织 | FFPE组织 |
癌症类型 | 泛癌种, 实体瘤 | 实体瘤 | 实体瘤 | 实体瘤 |
说明 | 针对50个癌症相关基因的热点区域的体细胞分析研究。 | 针对52个实体瘤相关基因的体细胞分析研究。 | 针对实体瘤相关基因热点及全长靶点的体细胞分析研究。 | 重点panel,使用简单的工作流程研究15个基因中的相关实体瘤体细胞变异。 |
起始量 | 1–100 ng(建议每个混池10 ng) | 1–100 ng(建议每个混池10 ng) | 1–100 ng(建议每个混池10 ng) | 20 ng |
AmpliSeq for Illumina Oncology Panels on the iSeq 100 System
Application Note | PDF < 1 MB
Automated Solutions for AmpliSeq for Illumina Sequencing Panels
Application Note | HTML
AmpliSeq for Illumina Cancer HotSpot Panel Gene List
product_file | EXCEL < 1 MB
Data Sheet | HTML | 5 versions
Sample identification with the AmpliSeq for Illumina Sample ID Panel
Application Note | PDF < 1 MB
Illumina Adapter Sequences Documentation
AmpliSeq for Illumina Cancer HotSpot Panel v2 Checklist Documentation
AmpliSeq for Illumina Cancer Hotspot Panel v2 Support - Documentation & Literature
AmpliSeq for Illumina Cancer HotSpot Panel v2 Reference Guide Documentation
AmpliSeq for Illumina Cancer HotSpot Panel v2 Consumables & Equipment Documentation
Index Adapters Pooling Guide Documentation
AmpliSeq for Illumina Direct FFPE DNA Kit Reference Guide Documentation
自定义协议选择器
Generates customized, end-to-end instructions