AmpliSeq for Illumina Cancer Hotspot Panel v2
研究小组有针对性地调查了50个已知的与癌症相关的基因。
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AmpliSeq for Illumina Cancer Hotspot Panel v2是一款靶向重测序分析套装，用于研究50个基因的热点区域体细胞突变，癌症体细胞突变目录（COSMIC）1数据库已确认这些基因与癌症有关联。主要特点包括：
Cancer HotSpot Panel是集成工作流程的一部分，该工作流程包括基于AmpliSeq for Illumina聚合酶链式反应（PCR）的文库制备、采用因美纳边合成边测序（SBS）的新一代测序（NGS）技术以及自动化分析过程。
这种panel能够对肺癌、结肠癌、乳腺癌、卵巢癌、黑色素瘤及前列腺癌等多种癌症类型实现高灵敏的变异检测。即用型panel助您节省鉴定目标基因、设计引物和优化panel所需的时间和精力。
| 仪器 | 推荐的样本数 | 读长 |
|---|---|---|
| iSeq 100 System | 每次运行16个样本（假设最小覆盖度为500倍） | 2 × 150 bp |
| MiniSeq System | 每次运行的样本：中通量：32，高通量：96（假设最小覆盖度为500倍） | 2 × 150 bp |
| MiSeq System | 每次运行的样本（按试剂盒版本）：v2 nano：4，v2 micro：16，v2：60，v3：96（假设最小覆盖度为500倍） | 2 × 150 bp |
| AmpliSeq for Illumina Cancer Hotspot Panel v2 | AmpliSeq for Illumina Focus Panel | AmpliSeq for Illumina Comprehensive Panel v3 | TruSight Tumor 15 | |
|---|---|---|---|---|
| 内容说明 | 50种与癌症具有已知关联的基因的热点区域 | 52个癌基因的DNA和RNA靶点 | 161个癌基因的DNA和RNA靶点 | 从15个实体瘤相关基因中扩增250个扩增子 |
| 分析时间 | 5小时（仅包括文库制备时间；不包括文库定量、归一化或混合时间） | 5-6小时（仅为文库制备时间，不包括文库定量、归一化或混合时间） | 5-6小时（仅为文库制备时间，不包括文库定量、归一化或混合时间） | 7小时 |
| 多重分析 | 96个双标签序列组合 | 96个双标签序列组合 | 96个双标签序列组合 | 1-24重 |
| 方法 | 扩增子测序, 靶向DNA测序 | 扩增子测序, 靶向RNA测序, 靶向DNA测序 | 扩增子测序, 靶向RNA测序, 靶向DNA测序 | 扩增子测序, 靶向DNA测序 |
| 核酸类型 | DNA | DNA, RNA | DNA, RNA | DNA |
| 物种类别 | 人类 | 人类 | 人类 | 人类 |
| 特殊的样本类型 | FFPE组织 | FFPE组织 | FFPE组织 | FFPE组织 |
| 癌症类型 | 泛癌种, 实体瘤 | 实体瘤 | 实体瘤 | 实体瘤 |
| 说明 | 针对50个癌症相关基因的热点区域的体细胞分析研究。 | 针对52个实体瘤相关基因的体细胞分析研究。 | 针对实体瘤相关基因热点及全长靶点的体细胞分析研究。 | 重点panel，使用简单的工作流程研究15个基因中的相关实体瘤体细胞变异。 |
| 起始量 | 1–100 ng（建议每个混池10 ng） | 1–100 ng（建议每个混池10 ng） | 1–100 ng（建议每个混池10 ng） | 20 ng |
AmpliSeq for Illumina Oncology Panels on the iSeq 100 System
Application Note | PDF < 1 MB
Automated Solutions for AmpliSeq for Illumina Sequencing Panels
Application Note | HTML
AmpliSeq for Illumina Cancer HotSpot Panel Gene List
product_file | EXCEL < 1 MB
Data Sheet | HTML | 5 versions
Sample identification with the AmpliSeq for Illumina Sample ID Panel
Application Note | PDF < 1 MB
Illumina Adapter Sequences Documentation
AmpliSeq for Illumina Cancer HotSpot Panel v2 Checklist Documentation
AmpliSeq for Illumina Cancer Hotspot Panel v2 Support - Documentation & Literature
AmpliSeq for Illumina Cancer HotSpot Panel v2 Reference Guide Documentation
AmpliSeq for Illumina Cancer HotSpot Panel v2 Consumables & Equipment Documentation
Index Adapters Pooling Guide Documentation
AmpliSeq for Illumina Direct FFPE DNA Kit Reference Guide Documentation
自定义协议选择器
Generates customized, end-to-end instructions
用于测定20,000多个人类RefSeq基因的表达水平的靶向panel。
