TruSight Tumor 15

专注于新一代测序(NGS)panel,通过一个简单快速的工作流程评估实体瘤中的15个常见突变基因。

7小时

分析时间

3.5小时

手动操作时间

20 ng FFPE DNA 

起始量

详情请参见规格表

概述

TruSight Tumor 15是一种NGS检测方法,可评估实体瘤中的15个常见突变基因。 

  • 在单次检测中准确、经济、快速地评估15个基因1 

  • 使用FFPE组织中的20 ng DNA以5%等位基因频率检测体细胞变异1

  • 易于解读的报告,只需极少的生物信息学资源 

  • 与现有实验室实践无缝集成 

相关基因内容

精心挑选的内容包括行业组织引用的基因和基因区域,并由独立的联盟出版物和后期制药研究提供信息。内容包括单核苷酸变异(SNV)和插入缺失,且已证明它们参与实体瘤。

全面的工作流程

TruSight Tumor 15通过简单、快速的工作流程评估15个基因,用聚合酶链式反应(PCR)代替单个反复基因检测。使用机载报告软件或TruSight Tumor 15 BaseSpace Sequence Hub应用程序分析数据。  

加速肿瘤分析

从DNA到数据只需36小时,手动操作时间仅为3.5小时。最大限度地提高多种肿瘤类型的样本成功率,以节省有限的样本和资源。 


性能参数


所需产品

需要购买TruSight Tumor 15 MiSeq或MiniSeq Kit,或仅购买TruSight Tumor 15文库制备。所有产品都足以容纳24个样本。如果只选择购买TruSight Tumor 15文库制备,您还需要单独购买测序试剂。 

TruSight Tumor 15 MiSeq Kit需要MiSeq Software v2.6或更高版本以及Illumina Annotation Engine。下载文件

/

应用

TruSight Tumor 15是一种全面的工作流程解决方案,可在单次检测中评估15个通常与实体瘤相关的基因中的体细胞变异,使实验室能够利用NGS的力量专注于最有可能在肿瘤发生中发挥作用的基因,并自信地分析FFPE DNA中的低频变异。 

工作流程示例


项目建议

仪器 Recommended number of samples Read length
MiniSeq System

Samples per run: mid output: 2-3, high output: 8 (based on 93.5% of the bases covered at 500x minimum)

2 × 150 bp(建议最大)

MiSeq System

8 samples per run with v3 reagents (based on 93.5% of the bases covered at 500x minimum)

2 × 151 bp(建议最大)


相关应用和方法

比较

TruSight Tumor 15 TruSight Tumor 170
Cancer type Pan-Cancer, Solid Tumor Solid Tumor
Method Targeted DNA Sequencing, Amplicon Sequencing Target Enrichment, Targeted RNA Sequencing, Targeted DNA Sequencing
Specialized sample types FFPE Tissue Low-Input Samples, FFPE Tissue
Variant class Insertions-deletions (indels), Somatic variants Gene fusions, Single nucleotide variants (SNVs), Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs), Structural variants, Somatic variants
内容说明 从15个实体瘤相关基因中扩增250个扩增子 探针富集了170个基因的完整编码序列。可检测151个基因中的单核苷酸变异、小插入和缺失,59个基因中的扩增,以及55个基因中的融合和剪接变异。
分析时间 7小时 约2天
多重分析 1-24重 使用两个标签集,DNA可重达32重,RNA可重达16重
手动操作时间 3.5小时 约10.5小时
技术 Illumina测序 Illumina测序
核酸类型 DNA DNA, RNA
物种
系统 MiSeq Desktop Sequencer, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeq System NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 500 Desktop Sequencer, HiSeq 2500
自动化详情 探索可用的自动化方法 探索可用的自动化方法
说明

使用20 ng DNA对实体瘤中的15个常见突变基因进行NGS检测。 

利用DNA和RNA的变异检出信息,在实体瘤中开展全面的体细胞变异检测研究。
起始量

20 ng FFPE DNA 

40 ng DNA和/或RNA

选择工具:

TruSight Tumor 15化学技术

TruSight Tumor 15检测采用多重PCR方法,可实现高准确度和灵敏度。

TruSight Tumor 15基因列表
AKT1 GNA11 NRAS
BRAF GNAQ PDGFRA
EGFR KIT PIK3CA
ERBB2 KRAS RET
FOXL2 MET TP53

TruSight Tumor 15 MiSeq Kit

OP-101-1001

包含1个文库制备试剂盒和3组MiSeq试剂,足够供24个样本使用。

Sign in to add to cart or see pricing.

List Price:

Discounts:

TruSight Tumor 15 (Library Prep Only)

OP-101-1002

包含1个文库制备试剂盒,足够供24个样本使用。

Sign in to add to cart or see pricing.

List Price:

Discounts:

TruSight Tumor 15 MiniSeq Kit

20005610

包含1个文库制备试剂盒和3组MiniSeq试剂,足够供24个样本使用。

Sign in to add to cart or see pricing.

List Price:

Discounts:

显示 /

选择汇总

产品

数量

Unit Price

常见问题解答

MiniSeq系统和MiSeq系统(v3化学技术)以及MiSeqDx仪器(研究模式;v3化学技术)均支持TruSight Tumor 15。在其他Illumina系统上测序是可能的,但尚未经过测试。

建议将以下扩增仪与TruSight Tumor 15试剂盒配合使用。请遵循 TruSight Tumor 15 参考指南中列出的建议斜坡速率设置。

  • Bio-Rad C1000

  • Bio-Rad S1000 

  • Applied Biosystems GeneAmp PCR System 9700

  • Applied Biosystems Veriti扩增仪 

  • Eppendorf Mastercycler ep Gradient

  • Eppendorf Mastercycler ep Gradient-S 

  • Bio-Rad C1000、Applied Biosystems GeneAmp PCR System 9700和Eppendorf MasterCycler ep Gradient均经过内部认证

TruSight Tumor 15在MiniSeq、MiSeq和MiSeq Dx(v3化学)系统上使用扩增子测序和靶向DNA测序靶向实体瘤中的15个常见突变基因。TruSight Tumor 170在NextSeq 500和NextSeq 550系统上使用靶向富集和靶向DNA和RNA测序靶向170个基因。 

是的,您可以查看样本运行样本项目。 要访问此数据,需要登录 BaseSpace Sequence Hub

/

订购NovaSeq X系列

将先进的化学、光学和信息学技术相结合,实现了超凡的速度和数据质量、出色的通量和可扩展性。

MiSeq Reagent Kit v3

与早期版本相比,优化的试剂盒可增加簇密度和读长,从而提高测序质量分值。

TruSight Oncology 500

使用涵盖所有主要变异类别以及来自FFPE组织的基因特征(TMB、MSI和HRD)的大型泛癌panel实现CGP。

Illumina DNA Prep

快速、集成的文库制备工作流程,适用于各种测序应用。

参考文献

1. 根据存档数据计算。Illumina公司 2016年。

咨询专家

获取有关我们产品和服务的信息,或获得有关我们技术问题的答案。