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TruSight Tumor 15

集中的新一代测序（NGS）panel，通过一个简单快速的工作流程评估实体瘤中的15个常见突变基因。

TruSight Tumor 15

集中的新一代测序（NGS）panel，通过一个简单快速的工作流程评估实体瘤中的15个常见突变基因。

7小时

分析时间

3.5小时

手动操作时间

20 ng FFPE DNA 

起始量

详情请参见规格表

概述

TruSight Tumor 15是一种NGS检测方法，可评估实体瘤中的15个常见突变基因。 

  • 可在单次测定中准确、经济、快速地评估15个基因1 

  • 只需20 ng FFPE组织样本的DNA，即能检测等位基因频率低至5%的体细胞变异1

  • 只需极少的生物信息学资源，即可提供易于解读的报告

  • 可与现有实验室实践无缝整合

相关基因内容

产品内容经过精心挑选，包含了行业组织引用的基因和基因区域，并参考了独立联盟的论文和最新的药物研究成果。产品内容包括已证实与实体瘤相关的单核苷酸位点变异（SNV）和插入缺失。

全面的工作流程

TruSight Tumor 15采用一个简单快速的工作流程评估15个基因，而不是使用聚合酶链式反应（PCR）反复进行单次基因检测。使用机载报告软件或TruSight Tumor 15 BaseSpace Sequence Hub App分析数据。

加速肿瘤分析

大约36小时内即可从DNA获取数据，而手动操作时间仅需3.5小时。大大提高多个肿瘤类型的样本成功率，节省了有限的样本和资源。

规格

分析时间 7小时
自动化详情 探索可用的自动化方法
癌症类型 泛癌种, 实体瘤
内容说明 从15个实体瘤相关基因中扩增250个扩增子
说明 使用20 ng DNA对实体瘤中的15个常见突变基因进行NGS检测。 
手动操作时间 3.5小时
起始量 20 ng FFPE DNA 
系统 MiSeq 系统, 研究模式下的MiSeqDx, MiniSeq基因测序仪
方法 靶向DNA测序, 扩增子测序
多重分析 1-24重
核酸类型 DNA
特殊的样本类型 FFPE组织
物种 人
技术 Illumina测序
变异类别 体细胞变异, 插入缺失（indel）

需要的产品

需要购买TruSight Tumor 15 MiSeq或MiniSeq Kit，或仅购买TruSight Tumor 15文库制备。所有产品都足以容纳24个样本。如果只选择购买TruSight Tumor 15文库制备，您还需要单独购买测序试剂。 

TruSight Tumor 15 MiSeq Kit需要MiSeq Software v2.6或更高版本以及Illumina Annotation Engine。下载文件

/ 结果

应用

TruSight Tumor 15是一种全面的工作流程解决方案，可在单次检测中评估15个通常与实体瘤相关的基因中的体细胞变异，使实验室能够利用NGS的力量专注于最有可能在肿瘤发生中发挥作用的基因，并自信地分析FFPE DNA中的低频变异。 

工作流程示例

1
制备

TruSight Tumor 15

2
测序
3
分析

项目建议

仪器 推荐的样本数 读长
MiniSeq基因测序仪

每次运行的样本数：中通量：2–3，高通量：8（基于93.5%的碱基覆盖度≥500×）

2 × 150 bp（建议最大）
MiSeq 系统

每次运行8个样本（v3试剂，基于93.5%的碱基覆盖度≥500×）

2 × 151 bp（建议最大）

相关应用和方法

癌症测序方法

与单基因和基于阵列的方法相比，基于 NGS 的癌症测序方法可在更短的时间内提供更多信息。

病理学和临床癌症研究

我们的临床癌症研究解决方案能提供准确的基因组信息，让实验室能够在单次检测中分析多个基因。

扩增子测序

对PCR扩增子进行超深度测序能够分析特定感兴趣的基因组区域。了解有关扩增子测序的更多信息，并寻找全面的解决方案。

文档

产品资料
Support documentation

比较

TruSight Tumor 15 TruSight Tumor 170
分析时间 7小时 约2天
自动化详情 探索可用的自动化方法 探索可用的自动化方法
癌症类型 泛癌种, 实体瘤 实体瘤
内容说明 从15个实体瘤相关基因中扩增250个扩增子 探针富集了170个基因的完整编码序列。可检测151个基因中的单核苷酸变异、小插入和缺失，59个基因中的扩增，以及55个基因中的融合和剪接变异。
说明 使用20 ng DNA对实体瘤中的15个常见突变基因进行NGS检测。  利用DNA和RNA的变异检出信息，在实体瘤中开展全面的体细胞变异检测研究。
手动操作时间 3.5小时 约10.5小时
起始量 20 ng FFPE DNA  40 ng DNA和/或RNA
系统 MiSeq 系统, 研究模式下的MiSeqDx, MiniSeq基因测序仪 NextSeq 550系统, NextSeq 500系统, HiSeq 2500
方法 靶向DNA测序, 扩增子测序 靶向DNA测序, 靶向RNA测序, 靶向富集
多重分析 1-24重 使用两个标签集，DNA可重达32重，RNA可重达16重
核酸类型 DNA DNA, RNA
特殊的样本类型 FFPE组织 低起始量样本, FFPE组织
物种 人 人
技术 Illumina测序 Illumina测序
变异类别 体细胞变异, 插入缺失（indel） 基因融合, 体细胞变异, 结构变异, 单核苷酸位点变异（SNV）, 插入缺失（indel）, 拷贝数变异（CNV）

选择工具：

文库制备和芯片试剂盒选择器

寻找符合您需求的测序文库制备试剂盒或芯片。按方法、种类等筛选。比较、分享和订购试剂盒。

图

TruSight Tumor 15化学技术

TruSight Tumor 15检测采用多重PCR方法，可实现高准确度和灵敏度。

TruSight Tumor 15基因列表
AKT1 GNA11 NRAS
BRAF GNAQ PDGFRA
EGFR KIT PIK3CA
ERBB2 KRAS RET
FOXL2 MET TP53

TruSight Tumor 15 MiSeq Kit

OP-101-1001

包含1个文库制备试剂盒和3组MiSeq试剂，足够供24个样本使用。

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TruSight Tumor 15 (Library Prep Only)

OP-101-1002

包含1个文库制备试剂盒，足够供24个样本使用。

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TruSight Tumor 15 MiniSeq Kit

20005610

包含1个文库制备试剂盒和3组MiniSeq试剂，足够供24个样本使用。

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常见问题解答

MiniSeq系统和MiSeq系统（v3化学技术）以及MiSeqDx仪器（研究模式；v3化学技术）均支持TruSight Tumor 15。在其他Illumina系统上测序是可能的，但尚未经过测试。

建议将以下扩增仪与TruSight Tumor 15试剂盒配合使用。请遵循 TruSight Tumor 15 参考指南中列出的建议斜坡速率设置。

  • Bio-Rad C1000

  • Bio-Rad S1000 

  • Applied Biosystems GeneAmp PCR System 9700

  • Applied Biosystems Veriti扩增仪 

  • Eppendorf Mastercycler ep Gradient

  • Eppendorf Mastercycler ep Gradient-S 

  • Bio-Rad C1000、Applied Biosystems GeneAmp PCR System 9700和Eppendorf MasterCycler ep Gradient均经过内部认证

TruSight Tumor 15在MiniSeq、MiSeq和MiSeq Dx（v3化学）系统上使用扩增子测序和靶向DNA测序靶向实体瘤中的15个常见突变基因。TruSight Tumor 170在NextSeq 500和NextSeq 550系统上使用靶向富集和靶向DNA和RNA测序靶向170个基因。 

是的，您可以查看样本运行和样本项目。 要访问此数据，需要登录 BaseSpace Sequence Hub。

/ 结果

NovaSeq X系列

将先进的化学、光学和信息学技术相结合，实现了超凡的速度和数据质量、出色的通量和可扩展性。

MiSeq v3试剂盒

与早期版本相比，经过优化的试剂盒可增加簇密度和读长，从而提高测序质量分值。

TruSight Oncology 500

使用涵盖所有主要变异类别以及来自FFPE组织的基因特征（TMB、MSI和HRD）的大型泛癌panel实现CGP。

Illumina DNA Prep

快速、集成的文库制备工作流程，适用于各种测序应用。

NextSeq 500/550 v2.5试剂盒

与早期版本相比，v2.5试剂盒使用弹性流动槽，可保持起始荧光强度，具有更高的稳定性和性能。

TruSight RNA Pan-Cancer Panel

靶向1385个癌症基因进行基因表达、变异和融合检测研究，适用于多种RNA样本类型，包括血液、骨髓和FFPE组织。

参考文献

1. 根据存档数据计算。Illumina公司 2016年。

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