NextSeq 1000/1000-CN和NextSeq 2000/2000-CN试剂盒
用于NextSeq 1000/2000系列基因测序仪的试剂盒，具有简便易用的卡盒和多种流动槽配置，可提供灵活的测序选项。
Illumina Single Cell 3' RNA Prep通过简单、可扩展的无微流控工作流程，让更多实验室能够使用单细胞RNA-Seq（scRNA-Seq）。研究人员能够开展更大规模、更多样的多组学研究，而不受其他单细胞方法的预算或技术限制。
Illumina Single Cell 3' RNA Prep
易于使用且高度可扩展的单细胞RNA-Seq解决方案，可实现mRNA捕获、条码编制和文库制备，无需复杂的工作流程或微流控技术
概述
可扩展且灵活的解决方案
Illumina Single Cell 3' RNA Prep可以轻松地扩展处理规模，支持从数百到数十万个细胞。更高的细胞通量得以揭示稀有细胞类型。该分析方法也非常灵活，可以在进行样本多重分析的同时并行运行1个样本或多达96个样本。
高质量性能
Illumina Single Cell 3' RNA Prep可提供高转录本和基因灵敏度，生成您期望从因美纳获取的高质量数据。这种温和的分离技术有助于检测其他方法经常漏检的脆弱细胞。该分析方法可兼容定制的单细胞测量，适用于扩展的多组学应用。
便捷的工作流程
Illumina Single Cell 3' RNA Prep不需要昂贵的微流控设备或劳动密集型方案。您可以使用简单、具有灵活停止点的手动工作流程在工作台上进行单细胞研究。
简单且可扩展的工作流程
样本制备
使用涡旋混合器创建模板化乳液，从而捕获单细胞 mRNA 并对其进行条形码编码。
文库制备
生成cDNA并准备单细胞文库以用于测序。
测序
在NGS测序仪上进行测序，以匹配您研究的规模。
分析
使用DRAGEN和Partek软件分析和可视化单细胞数据。
规格
| 细胞捕获用时 | 从细胞捕获到文库制备大约需要15小时 |
|---|---|
| 试剂盒应用 | 捕获编码转录组 |
| 描述 | 单细胞mRNA捕获、条形码化和文库制备采用简单手动工作流程，具有高转录本灵敏度和成本效益的可扩展性。 |
| 细胞捕获手动操作时间 | 10分钟用于细胞捕获 |
| 投入细胞数范围 | 100 至 200,000 个细胞 |
| 系统 | NextSeq 550系统, NextSeq 2000系统, NextSeq 1000系统, 研究模式下的NextSeq 550Dx, NovaSeq X基因测序仪, 研究模式下的NovaSeq 6000Dx, NovaSeq 6000系统, NovaSeq X Plus基因测序仪 |
| 作用机制 | PIPseq技术 |
| 方法 | mRNA测序 |
| 多重分析 | 多达96重 |
| 核酸类型 | RNA |
| 特殊的样本类型 | 血液, 不兼容FFPE, 低起始量样本, 骨髓, 单细胞 |
| 物种 | 任意, 小鼠, 酵母, 斑马鱼, 人 |
| 链特异性 | 非链 |
| 技术 | Illumina测序 |
| 变异类别 | 转录本变异 |
需要的产品
Illumina Single Cell 3' RNA Prep包括细胞捕获和文库制备试剂。根据您想要检测的细胞数量选择合适规格的试剂盒。此外，也可以分别购买 Illumina Single Cell 3' RNA Capture 和 Illumina Single Cell Library Prep。
如果需要在每次运行中多重标记超过 8 个样本，请使用Illumina Single Cell Unique Dual Indexes。如果需要输入单个细胞核，请使用 Illumina Single Cell Nuclei Isolation Kit。如果需要富集自定义 RNA 标签序列，请使用 Illumina Single Cell Supplemental Enrichment和扩增试剂盒。
新用户应订购 Illumina Single Cell Prep入门设备，以获取所需的辅助设备。
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结果
应用
单细胞RNA-Seq用于神经科学研究
神经组织是包含多种细胞类型的复杂组织，这些细胞在生物体的整个生命周期中不断重组和重塑。scRNA-Seq是一种宝贵的工具，可利用转录敏感性对神经元细胞群的真实多样性进行分类，从而深入了解神经元组织：
- 神经发育和神经退行性疾病
- 特定神经元群以前未知的作用
- 神经免疫细胞对疾病和发育的影响
单细胞RNA-Seq用于癌症研究
癌症是一种涉及复杂细胞群动态和多样性的疾病。了解驱动癌症的细胞类型和突变需要复杂的方法。scRNA-Seq已成为一种重要工具，可用于：
- 详细了解肿瘤微环境的异质性
- 识别新型癌症生物标志物
- 了解免疫疗法和耐药性的机制
单细胞RNA-Seq用于免疫学
免疫系统由不同细胞类型的复杂层次结构组成，这些细胞协同工作以识别、标记和消除病原体。scRNA-Seq可帮助研究人员：
- 了解免疫细胞群的发育和分化途径
- 评估免疫细胞群的作用和功能
- 研究对病原体的免疫反应
工作流程示例
制备
Illumina Single Cell 3' RNA Prep
计划推荐
| 仪器 | 推荐的样本数 | 读长 |
|---|---|---|
| NextSeq 2000系统 |
|
2 × 100 bp |
| NovaSeq 6000系统 | 每次运行的样本数 (双流动槽)： |
2 × 100 bp |
| NovaSeq X Plus基因测序仪 |
|
2 × 100 bp |
相关应用和方法
通过单细胞RNA测序，您可以研究通常被批量采样隐藏的细胞差异。探索高通量和低通量的单细胞测序方法。
单细胞测序使研究人员能够从单个细胞内的DNA、RNA、表观遗传和蛋白质水平了解癌症的驱动因素。
使用多组学分析来提升发现能力，更好地将基因型与表型相关联。
数据图
利用PIPseq化学技术捕获单细胞mRNA并进行条码编制
使用涡旋混合器制备模板化乳液，来捕获单细胞mRNA并对其进行条码编制。生成cDNA并制备用于测序的单细胞文库。在NGS测序仪上测序，以匹配您的研究规模。使用DRAGEN和Partek软件分析scRNA-Seq数据。
数千个细胞规模的高分辨率scRNA-Seq
条码等级图（左）和Barnyard散点图（右）显示了NIH3T3（小鼠）和HEK 293（人）细胞系混合培养物的有效分离。使用Illumina Single Cell 3ʹ RNA Prep T2试剂盒捕获4106个细胞，多重率小于5%。
数万个细胞规模的高分辨率scRNA-Seq
单细胞RNA-Seq用于分析冷冻保存的人外周血单核细胞（PBMC）。针对使用Illumina Single Cell 3ʹ RNA Prep T20试剂盒捕获的31,613个细胞进行UMAP分析，可分离出多种免疫细胞群。
数十万个细胞规模的高分辨率scRNA-Seq
单细胞RNA-Seq用于分析冷冻组织中的小鼠大脑细胞核。针对使用Illumina Single Cell 3ʹ RNA Prep T100试剂盒捕获的155,000个细胞核进行UMAP分析，可分离出多种脑细胞群。
相关资源
Watch: The Illumina 3' Single Cell RNA Prep Workflow
Illumina 3' Single Cell RNA Prep工作流程
了解Illumina 3' Single Cell RNA Prep工作流程如何使单细胞测序变得简单、经济且无需微流控技术。凭借适用于各种细胞类型、经过验证的性能和可靠、高质量的数据，该方法能以单细胞分辨率更轻松地解码研究，为您的下一个突破提供动力。
Complete prep workflow products (4)
Illumina Single Cell 3' RNA Prep, T2 (8个样本, 2000个细胞/样本)
20135689
Illumina Single Cell 3' RNA Prep，T2（8个样本），包含Illumina单细胞文库制备试剂以及用于单细胞mRNA捕获、条形码标记以及每个样本多达2000个细胞的cDNA合成的试剂。
List Price:
Discounts:
Illumina Single Cell 3' RNA Prep, T10 (8个样本, 10,000个细胞/样本)
20135691
Illumina Single Cell 3' RNA Prep，T10（8个样本），包含Illumina单细胞文库制备试剂以及用于单细胞mRNA捕获、条形码标记以及每个样本多达10,000个细胞的cDNA合成的试剂。
List Price:
Discounts:
Illumina Single Cell 3' RNA Prep, T20 (4个样本, 20,000个细胞/样本)
20135692
Illumina Single Cell 3' RNA Prep，T20（4个样本），包含Illumina单细胞文库制备试剂以及用于单细胞mRNA捕获、条形码标记以及每个样本多达20,000个细胞的cDNA合成的试剂。
List Price:
Discounts:
Illumina Single Cell 3' RNA Prep, T100 (2个样本, 100,000个细胞/样本)
20135693
Illumina Single Cell 3' RNA Prep，T100（2个样本），包含 Illumina单细胞文库制备试剂以及用于单细胞mRNA捕获、条形码标记以及每个样本多达10万个细胞的cDNA合成的试剂。
List Price:
Discounts:
Prep component products (5)
Illumina Single Cell Library Prep (8 反应)
20132789
Illumina Single Cell Library Prep (8 反应)，用于Illumina Single Cell 3' RNA Capture之后的步骤。
List Price:
Discounts:
Illumina Single Cell 3' RNA Capture, T2 (8 样本, 2000 细胞/样本)
20132790
Illumina Single Cell 3' RNA Capture, T2 (8 样本)，用于单细胞mRNA捕获、条形码标记以及每样本多达2000个细胞的cDNA合成，适用于Illumina单细胞文库制备前的步骤。
List Price:
Discounts:
Illumina Single Cell 3' RNA Capture, T10 (8 样本, 10,000 细胞/样本)
20132791
Illumina Single Cell 3' RNA Capture, T10 (8 样本)，用于单细胞mRNA捕获、条形码标记以及每样本多达10,000个细胞的cDNA合成，适用于Illumina单细胞文库制备前的步骤。
List Price:
Discounts:
Illumina Single Cell 3' RNA Capture, T20 (4样本, 20,000 细胞/样本)
20132792
Illumina Single Cell 3' RNA Capture, T20 (4 样本), 用于单细胞mRNA捕获、条形码标记和每样本多达20,000个细胞的cDNA合成，适用于Illumina单细胞文库制备前的步骤。
List Price:
Discounts:
Illumina Single Cell 3' RNA Capture, T100 (2样本, 100,000 细胞/样本)
20132793
Illumina Single Cell 3' RNA Capture, T100 (2样本)，用于单细胞mRNA捕获、条形码标记和每样本多达10万个细胞的cDNA合成，适用于Illumina单细胞文库制备前的步骤。
List Price:
Discounts:
配套产品 (3)
Illumina Nuclei Isolation Kit (4样本)
20132795
Illumina Nuclei Isolation Kit (4 样本)， 用于输入 Illumina Single Cell 3' RNA Prep的可选试剂，包括细胞核分离、洗涤和重悬试剂。
List Price:
Discounts:
Illumina Single Cell Supplemental Enrichment and Amplification Kit
20132794
Illumina Single Cell Supplemental Enrichment and Amplification (SEA) Kit，用于Illumina Single Cell 3' RNA捕获和Illumina单细胞文库制备的可选试剂，适用于定制化的单细胞应用。
List Price:
Discounts:
Illumina Single Cell Prep入门设备
20132796
Illumina Single Cell Prep入门设备，一次性购买的辅助设备，用于准备Illumina Single Cell 3' RNA kits和Illumina Single Cell Library Prep kits。
List Price:
Discounts:
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常见问题解答
Illumina Single Cell 3' RNA Prep采用PIPseq技术和粒子模板即时分区（PIPs）技术。PIPs可以将复杂的细胞混合物分隔成多个小液滴，这些小液滴中包含带条码的模板颗粒，这使单细胞应用的处理变得更加简单，例如单细胞RNA测序（scRNA-Seq）。
是的，我们的涡旋混合器和干浴设备是获取可靠结果的必需设备。涡旋混合器专为实现一致的乳化而设计。干浴设备可确保精确的温度曲线；常规的干浴设备无法实现我们裂解方案中所述的快速温度变化。
可以，可以使用已经过证明的Fluent DSP/甲醇固定方案来处理细胞或细胞核。目前不兼容多聚甲醛（PFA）固定方法。
不能，目前只能进行3’ mRNA捕获。
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结果
NovaSeq X系列试剂盒
NovaSeq X系列试剂盒包含试剂卡盒、缓冲液卡盒、流动槽、冻干插件、预装缓冲液和文库联管。
NovaSeq 6000试剂盒
用于NovaSeq 6000基因测序仪的试剂盒，由即用型预装试剂卡盒和流动槽组成。
Illumina DRAGEN二级分析
通过DRAGEN二级分析获得更多基因组见解，了解最新更新信息，阅读常见问题解答并寻找产品支持。
Illumina Stranded mRNA Prep
快速、经济高效的工作流程，通过精确测量链信息准确、无偏差地检测蛋白质编码转录组。
Illumina DNA Prep
快速、集成的文库制备工作流程，适用于各种测序应用。
Illumina RNA Prep with Enrichment
快速、集成的工作流程，针对各种样本类型和RNA起始量生成富集并标记的测序文库。
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