RNA测序

RNA测序简介

RNA测序(RNA-Seq)正在彻底改变转录组的研究。它是一种高度灵敏和准确的检测全转录组表达的工具,它让研究人员能够检测疾病状态、治疗反应、各种环境条件下以及一系列其他研究设计中以前无法检测的变化。

RNA-Seq可使研究人员在单次分析中检测已知的和新的特征,使检测转录本亚型、基因融合、单核苷酸位点变异和其他特征不受先验知识的限制。1,2

替代文本
用RNA-Seq推动进展

RNA测序可以对研究和创新产生深远的影响,改变我们对周围世界的理解。

RNA测序的优势

用新一代测序(NGS)开展RNA-Seq已逐渐成为科学家们研究转录组的首选方法。

  • 覆盖极宽的动态范围
  • 提供灵敏、准确的基因表达测量
  • 捕获已知的和新的特征;无需预先设计探针
  • 生成定性和定量的数据
  • 揭示完整的转录组,而不仅仅是几个选定的转录本
  • 适用于任何物种,即使在没有参考序列的情况下
通过RNA测序推进转录组学研究

了解RNA-Seq如何在各个领域推进转录组的研究,以及基因调控研究如何提供补充信息。

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RNA测序发表回顾

RNA-Seq 是迄今为止被引用最多的 NGS 方法,该合集采用 Illumina 技术的各种 RNA-Seq 方法的相关同行评审出版物。

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RNA测序发表回顾
刚刚接触NGS?

了解Illumina NGS技术的工作原理,以及它支持哪些类型的实验。

如何使用NGS分析RNA?

了解主要的RNA-Seq方法。找出它们的不同之处,帮助您确定适合您的研究方法。

主要RNA-Seq方法介绍

如何应用RNA-Seq?

癌症RNA-Seq研究基因表达和转录组的变化。

微生物RNA-Seq分析病原体转录组的特征。

研究药物反应RNA生物标记

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RNA测序文库制备

RNA-Seq文库制备的进步正在彻底改变转录组的研究。我们的增强型RNA-Seq文库制备产品系列涵盖了多种类型的测序研究。这些解决方案可提供快速的周转时间、广泛的研究灵活性和测序可扩展性。

深入了解RNA文库制备

Experimental Considerations for RNA-Seq

规划您的RNA-Seq实验

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实现差异基因表达分析。

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RNA-Seq常见问题解答

是的,RNA-Seq是一种公认的基因表达定量方法。要了解RNA-Seq与芯片和定量PCR(qPCR)的比较情况,请浏览以下页面:

转录组学泛指与RNA表达水平、功能、结构和调控有关的研究。RNA-Seq则更为具体,指的是研究RNA序列和数量的技术。

RNA测序深度是指测序获得的碱基总数与基因组大小的比率,或基因组中每个碱基的平均测量次数。

细胞群RNA测序是一种分析来自细胞或组织的混合RNA的方法。

通过RNA测序链型,研究人员可以确定转录本来自哪条DNA链(有义链或反义链)。与普通的RNA测序方法相比,链型RNA测序可以发现新转录本、区分重叠基因的转录本、发现反义序列,并对基因进行注释。

更多信息,请访问Illumina Stranded mRNA Prep页面。

在mRNA文库制备方法中,mRNA是通过oligodT微珠从总RNA中筛选出来的,因此只使用样本中的多聚腺苷酸化转录本制备文库。在总RNA工作流程中,从样本中去除rRNA和部分其他的大量转录本,然后将剩余的RNA制备成测序文库,包括多聚腺苷酸化和非多聚腺苷酸化RNA。在富集工作流程中,使用所有RNA样品制备文库。随后使用寡核苷酸探针panel对这些文库进行富集。panel可以靶向完整编码外显子组、与特定疾病相关的转录本、病原体的RNA或定制靶标。如需了解有关这些工作流程的更多信息,请访问以下页面:

提取的RNA必须纯化且不含污染物。因美纳建议您遵循特定RNA分离试剂盒中提供的指导原则,并根据样品类型选择合适的方案。

下面提供了所选方法的RNA起始量范围:

RNA-Seq与所有因美纳测序仪兼容。根据文库制备试剂盒、应用和数据需求的不同,更高通量或更低通量的测序仪可能更合适。

了解所有因美纳测序平台

欲了解产品详情,请联系您的销售代表

可以,RNA-Seq文库制备方法可以实现自动化。请访问我们的文库制备自动化页面了解更多信息。

是的,因美纳可根据您的应用提供质量控制解决方案。详细信息请参阅我们的文库定量和QC参考指南

更多资源

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RNA测序工作流程指南

了解适用于新一代RNA测序应用的因美纳解决方案。

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参考文献
  1. Wang Z, Gerstein M, Snyder M. RNA-Seq: a revolutionary tool for transcriptomics. Nat Rev Genet. 2009;10:57–63.
  2. Wilhelm BT, Landry JR. RNA-Seq—quantitative measurement of expression through massively parallel RNA sequencing. Methods. 2009;48:249–57.