Illumina DNA Prep Training
20022900
Illumina DNA Prep可灵活用于多种全基因组测序应用。
Illumina DNA Prep采用了快速且用户友好的工作流程。磁珠固化转座酶技术将文库制备的总时间(从DNA提取到文库归一化)缩短至3.5小时。
Illumina DNA Prep的工作流程支持广泛的DNA起始量(1-500 ng),多种类型的样本,以及小型和大型基因组。这个流程包括从血液、唾液、干血斑*或细菌菌落*中提取DNA。
灵活地对人类或其他复杂的大型基因组以及扩增子或微生物群落进行测序,这一切通过单个试剂盒都能实现。
在满足不同研究需求的同时,Illumina DNA Prep的工作流程可提供大小一致的插入片段,具备均一的覆盖和优化的性能,不论DNA起始量或基因组大小如何。这种基于磁珠的技术大幅减少了偏向性和错误机会,带来高度可重现的测序数据。
IDT for Illumina-DNA/RNA UD A、B、C和D标签提供多达384个唯一双标签,可准确分配read,高效利用流动槽。Sets A和B现已上市。Sets C和D即将发布。)这些唯一双标签码使用10个碱基对码。碱基对标签码的这种改变需要调整测序运行设置。
Nextera DNA CD Indexes支持多达96样本的组合双标签。24规格的CD标签以试管的形式提供,96规格的CD标签以孔板的形式提供。
对于全基因组测序,推荐使用Illumina DNA Prep作为Nextera DNA Library Prep Kit(已停产)的替代产品。如果您正在使用Nextera DNA(货号FC-121-1030)或独立组件(货号15027865和15027866)进行ATAC Seq**或其他定制应用,我们建议可将Illumina Tagment DNA TDE1 Enzyme and Buffer Kit作为替代产品使用。
一天内即可制备好用于Illumina测序的文库。通过我们的合作伙伴可在一系列自动化平台上应用Illumina认证的方法。
*提供经过验证的实验方案。
**客户报告的应用
通过这种互动体验,感受Illumina文库制备酶法片段化技术为您的实验室带来的力量。我们的文库制备解决方案支持各种应用中的全基因组测序、灵活兼容Illumina测序仪,整合血液和唾液的样本制备,且无需定量。
查看信息图仪器 | 推荐的样本数 | 读长 |
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NextSeq 550 System | 每次运行1个样本(高输出;基于30×的人类基因组覆盖度) | 高达2×150 bp |
NovaSeq 6000 System | 每次运行2-10个样本(双流动槽;基于30×的人类基因组覆盖度) | 高达2×125 bp(快速运行) 高达2×150 bp(高输出) |
Illumina DNA Prep | TruSeq DNA PCR-Free | TruSeq DNA Nano | |
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作用机制 | 连接磁珠的转座酶 | 机械DNA片段化和接头连接。 工作流程采用降低偏向性的PCR,无凝胶。 | 机械DNA片段化和接头连接。 工作流程采用降低偏向性的PCR,无凝胶。 |
分析时间 | 约3–4小时(从DNA提取到文库归一化) | 5小时的总分析时间 | 约6小时的总分析时间 |
多重分析 | 多达384个唯一双(UD)标签组合和96个组合(CD)双标签组合 | 多达24个单标签、96个组合(CD)双标签、24个唯一双标签以及96个唯一双(UD)标签组合 | 多达24个单标签、96个组合(CD)双标签、24个唯一双标签以及96个唯一双(UD)标签组合 |
手动操作时间 | 1-1.5小时 | 4小时 | 约4小时 |
方法 | 鸟枪法测序, De Novo Sequencing, 全基因组测序, 扩增子测序 | 基于测序的基因分型, 鸟枪法测序, 全基因组测序 | 基于测序的基因分型, 鸟枪法测序, 全基因组测序 |
物种类别 | 任何物种, 人类, 小鼠, 大鼠, 植物, 果蝇, 斑马鱼, 线虫, 酵母, 哺乳动物, 细菌, 病毒 | 其它, 植物, 哺乳动物, 大鼠, 小鼠, 人类 | 其它, 植物, 哺乳动物, 大鼠, 小鼠, 人类 |
物种详情 | 与任何物种都兼容 系 | 与大多数大型DNA基因组兼容。 | 与大多数大型DNA基因组兼容。 |
特殊的样本类型 | 血液, 唾液 | 不兼容FFPE | 低起始量样本, 不兼容FFPE |
目标插入片段大小 | 约350 bp | 350 bp或550 bp | 350 bp或550 bp |
自动化功能 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 |
说明 | 快速、灵活的工作流程,适用于各种研究应用和样本类型,包括人类全基因组测序、微生物全基因组测序等等。 | 用于全基因组测序研究的简单、一站式无PCR制备方法,可对具有挑战性的基因组区域进行测序。 | 低起始量研究方法,可提供较高的基因组覆盖度质量,减少偏差。 |
起始量 | 小型基因组(例如微生物群):1-500 ng DNA。大型基因组(例如人类): 100-500 ng DNA。(请参阅参考指南,了解有关血液和唾液的信息)。 | 1 ug DNA | 100 ng基因组DNA |
Application Note | PDF 3 MB
An automated Nextera DNA Flex library preparation workflow for high-throughput metagenomics
Application Note | PDF < 1 MB
Direct Bacterial Colony Sequencing with the Nextera™ DNA Flex Library Preparation Kit
Application Note | PDF 1 MB
Fast, Flexible, and Self-Normalizing Library Prep with Nextera Flex Chemistry
Application Note | HTML
Nextera DNA Flex Library Preparation for Soil Shotgun Metagenomics Analysis
Application Note | HTML
Illumina library preparation solutions
Brochure | PDF 2 MB
Illumina DNA Prep crude lysate protocol for NGS
Application Note | PDF < 1 MB
Data Sheet | PDF < 1 MB
Illumina DNA Prep Support Documentation
Illumina DNA Prep Consumables & Equipment List Documentation
Illumina DNA Prep Reference Guide Documentation
Trim Adapters for Nextera DNA Flex in Local Run Manager for MiniSeq Documentation
Index Adapters Pooling Guide Documentation
Illumina DNA Prep Checklist Documentation
自定义协议选择器
Generates customized, end-to-end instructions
全部 Illumina DNA RNA UD Indexes Support 全部 Illumina DNA Prep Support