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Illumina DNA Prep

快速、集成的文库制备工作流程，适用于各种测序应用。

约3-4小时（从DNA提取到归一化文库）

分析时间

1-1.5小时

手动操作时间

1-500 ng DNA用于小型基因组（例如微生物），或100-500 ng DNA用于大型基因组（例如人类）。（对于血液和唾液样本，请参阅参考指南）。

起始量

详情请参见规格表

Nextera DNA Flex产品现称为Illumina DNA Prep。(M) 名称表示链接磁珠转座酶，它可产生约350 bp的插入片段。我们建议订购Illumina DNA/RNA UD Indexes Sets A-D（20091654、20091656、20091658、20091660）。IDT for Illumina DNA/RNA UD Indexes Sets A-D（20027213、20027214、20042666、20042667）即将停产；最后订购日期为2025年1月30日。

概述

Illumina DNA Prep，以前称为Nextera DNA Flex，提供了一个快速、稳定和灵活的工作流程，从广泛的DNA起始材料类型和数量制备可直接用于测序的归一化文库，推动从人类全基因组测序到测序扩增子、质粒和微生物物种等一系列应用。1

  • 提供均一的基因组覆盖度和卓越的数据质量

  • 通过整合DNA提取方案提高文库制备效率

  • 提供快速、用户友好的工作流程，将总文库制备时间缩短至约3.5小时

获得可靠的结果

无论DNA起始量或基因组大小如何，Illumina DNA Prep都能提供大小一致的插入片段、均一的覆盖度和优化的性能。这种基于磁珠的技术大幅减少了偏向性和错误机会，带来高度可重现的测序数据。 

获得灵活的通量选项

Illumina DNA/RNA UD Indexes Sets提供多达384个唯一双标签，可准确分配读数，高效利用流动槽。

深入了解多重分析

Illumina DNA Prep产品系列

查找快速、优化的测序文库制备解决方案，适用于各种应用。

Illumina DNA Prep

快速、集成的文库制备工作流程，适用于各种测序应用。

Illumina DNA Prep with Enrichment

适用于广泛应用的完整靶向重测序解决方案，具有快速、集成的工作流程以及定制和固定富集panel选项。

Illumina DNA PCR-Free Prep

高效、快速、集成的文库制备工作流程，为灵敏的测序应用生成高度准确的数据。

深入了解Illumina DNA Prep产品系列

规格

分析时间 约3-4小时（从DNA提取到归一化文库）
自动化功能 液体处理机器人
自动化详情 探索可用的自动化方法
说明 快速、灵活的文库制备工作流程，可适应各种样本类型和DNA起始量，可用于从人类到微生物全基因组测序等各种应用。 
手动操作时间 1-1.5小时
起始量 1-500 ng DNA用于小型基因组（例如微生物），或100-500 ng DNA用于大型基因组（例如人类）。（对于血液和唾液样本，请参阅参考指南）。
系统 MiSeq 系统, iSeq 100系统, NextSeq 550系统, NextSeq 2000系统, NextSeq 1000系统, 研究模式下的MiSeqDx, MiniSeq基因测序仪, 研究模式下的NextSeq 550Dx, NovaSeq X基因测序仪, NovaSeq 6000系统, NovaSeq X Plus基因测序仪
作用机制 链接磁珠转座酶
方法 扩增子测序, 从头测序, 全基因组测序, 鸟枪法测序
多重分析 多达384个唯一双（UD）标签组合和96个组合（CD）双标签组合
核酸类型 DNA
样本类型详情 未验证用于FFPE样本 
特殊的样本类型 血液, 不兼容FFPE, 唾液
物种 果蝇, 任意, 哺乳动物, 小鼠, 酵母, 斑马鱼, 人, 大鼠, 植物, 病毒, 线虫, 细菌
物种详情 与任何物种兼容
目标插入片段大小 ~350 bp
技术 Illumina测序
变异类别 单核苷酸多态性（SNP）, 基因融合, 杂合性缺失（LOH）, 体细胞变异, 染色体异常, 生殖系变异, 结构变异, 插入缺失（indel）, 拷贝数变异（CNV）

需要的产品

每个Illumina DNA Prep Kit都需要一个标签试剂盒来完成实验方案，无论用于测序的样本混合水平如何。我们鼓励客户尽可能使用唯一的双标签。深入了解如何 为您的应用选择正确的标签选项。 

 

标签试剂盒不能与Nextera DNA或Nextera XT Index Kit互换使用。 

 

Flex Lysis Kit是一款单独的产品，是对Illumina DNA Prep血液DNA提取方面的补充。 

 

Illumina DNA Prep Kit中包含Illumina纯化磁珠，无需单独购买。  

/ 结果

应用

Illumina DNA Prep支持广泛的DNA起始量范围（1–500 ng），可在约3.5小时内为从大型全基因组到扩增子、质粒和微生物物种的样本提供高质量的测序文库。 

工作流程示例

1
制备

Illumina DNA Prep 

2
测序
3
分析

项目建议

仪器 样本类型及应用
（每样本最低测序深度或读数）		 每个流动槽样本数 推荐读长
NextSeq 2000测序仪 人类基因组 (30x 覆盖度, >120 Gb) P2 - 1个样本, P3 - 3个样本, P4 - 4个样本 2x150 bp

细菌分离株全基因组（5 Mb基因组的30x覆盖度，150 Mb/样本）

 P1 - 192个样本, P2- 384个样本 2x150 bp

浅层鸟枪法宏基因组学（1M单端读数或2M双端读数/样本）

 P1 - 96个样本s, P2 - 384个样本 2x150 或 2x300 bp

鸟枪法宏基因组学（10M单端读数或20M双端读数/样本）

 P1 - 10个样本, P2 - 40个样本, P3 - 120个样本, P4 - 180个样本 2x150 或 2x300 bp
NovaSeq 6000测序仪 人类基因组 (30x 覆盖度, >120 Gb) SP - 2个样本, S1- 4个样本, S2- 10个样本, S4- 24个样本 2x150 bp

细菌分离株全基因组（5 Mb基因组的30x覆盖度，150 Mb/样本）

 SP - 384个样本 2x150 bp

浅层鸟枪法宏基因组学（1M单端读数或2M双端读数/样本）

 SP - 384个样本 2x150 bp

鸟枪法宏基因组学（10M单端读数或20M双端读数/样本）

 SP - 80个样本, S1- 150个样本, S2 - 384个样本 2x150 bp
NovaSeq X测序仪 人类基因组 (30x 覆盖度, >120 Gb) 1.5B - 4个样本, 10B - 24个样本, 25B - 64个样本 2x150 bp

细菌分离株全基因组（5 Mb基因组30x覆盖，150 Mb/样本）

 1.5B - 384个样本 2x150 bp

浅层鸟枪法宏基因组学（1M单端读数或2M双端读数/样本）

 1.5B - 384个样本 2x150 或 2x300 bp

宏基因组学鸟枪法测序（10M单端读数或20M双端读数/样本）

 1.5B - 150个样本, 10B - 384个样本 2x150 或 2x300 bp

相关应用和方法

微生物全基因组测序

利用微生物全基因组测序绘制新型生物的基因组，完善已知生物的基因组，或者比对多个样本的基因组。

大型全基因组测序

大规模全基因组测序为疾病研究和群体基因组学研究提供信息，并揭示疾病相关的等位基因。

宏基因组测序

使用NGS全面检测复杂样本中所有生物体的所有基因，评估细菌多样性，发现无法培养的微生物。

文档

产品资料
支持文档

比较

Illumina DNA Prep TruSeq DNA PCR-Free TruSeq DNA Nano Nextera XT DNA Library Preparation Kit
分析时间 约3-4小时（从DNA提取到归一化文库） 总检测时间5小时 总检测时间约为6小时 从DNA提取到归一化文库大约5.5小时。（文库制备时间：约90分钟）。
自动化功能 液体处理机器人 液体处理机器人 液体处理机器人 液体处理机器人
自动化详情 探索可用的自动化方法 探索可用的自动化方法 探索可用的自动化方法 探索可用的自动化方法
说明 快速、灵活的文库制备工作流程，可适应各种样本类型和DNA起始量，可用于从人类到微生物全基因组测序等各种应用。  用于全基因组测序研究的简单、一站式无PCR制备方法，可对具有挑战性的基因组区域进行测序。 低起始量研究方法，可提供较高的基因组覆盖度质量，减少偏差。 在90分钟内制备用于小型基因组、PCR扩增子和质粒的测序文库，DNA起始量要求低。
手动操作时间 1-1.5小时 4小时 约4小时 15分钟
起始量 1-500 ng DNA用于小型基因组（例如微生物），或100-500 ng DNA用于大型基因组（例如人类）。（对于血液和唾液样本，请参阅参考指南）。 1 ug DNA 100 ng基因组DNA 1 ng DNA
系统 MiSeq 系统, iSeq 100系统, NextSeq 550系统, NextSeq 2000系统, NextSeq 1000系统, 研究模式下的MiSeqDx, MiniSeq基因测序仪, 研究模式下的NextSeq 550Dx, NovaSeq X基因测序仪, NovaSeq 6000系统, NovaSeq X Plus基因测序仪 MiSeq 系统, NextSeq 550系统, NextSeq 2000系统, NextSeq 1000系统, 研究模式下的MiSeqDx, MiniSeq基因测序仪, NovaSeq X基因测序仪, NextSeq 500系统, NovaSeq 6000系统, NovaSeq X Plus基因测序仪 MiSeq 系统, NextSeq 550系统, NextSeq 2000系统, 研究模式下的MiSeqDx, MiniSeq基因测序仪, NovaSeq X基因测序仪, NextSeq 500系统, NovaSeq 6000系统, NovaSeq X Plus基因测序仪 MiSeq 系统, iSeq 100系统, NextSeq 550系统, NextSeq 2000系统, NextSeq 1000系统, MiniSeq基因测序仪, NextSeq 500系统
作用机制 链接磁珠转座酶 机械DNA片段化和接头连接。工作流程无PCR且无凝胶。 机械DNA片段化和接头连接。工作流程采用降低偏向性的PCR，无凝胶。 酶切法 片段化
方法 扩增子测序, 从头测序, 全基因组测序, 鸟枪法测序 通过测序进行基因分型, 全基因组测序, 鸟枪法测序 通过测序进行基因分型, 全基因组测序, 鸟枪法测序 扩增子测序, 16s rRNA测序, 从头测序, 全基因组测序, 鸟枪法测序
多重分析 多达384个唯一双（UD）标签组合和96个组合（CD）双标签组合 多达24个单标签、96个组合（CD）双标签、24个唯一双标签以及96个唯一双（UD）标签组合 多达24个单标签、96个组合（CD）双标签、24个唯一双标签以及96个唯一双（UD）标签组合 多达384个唯一标签的样本可混合并一起测序。
核酸类型 DNA DNA DNA DNA
样本类型详情 未验证用于FFPE样本 
特殊的样本类型 血液, 不兼容FFPE, 唾液 不兼容FFPE 不兼容FFPE, 低起始量样本 低起始量样本, 单细胞
物种 果蝇, 任意, 哺乳动物, 小鼠, 酵母, 斑马鱼, 人, 大鼠, 植物, 病毒, 线虫, 细菌 其他, 哺乳动物, 小鼠, 人, 大鼠, 植物 其他, 哺乳动物, 小鼠, 人, 大鼠, 植物 果蝇, 任意, 哺乳动物, 小鼠, 酵母, 斑马鱼, 真菌, 人, 大鼠, 植物, 病毒, 线虫, 细菌
物种详情 与任何物种兼容 与大多数大型DNA基因组兼容。 与大多数大型DNA基因组兼容。 与任何物种兼容
目标插入片段大小 ~350 bp 350 bp或550 bp 350 bp或550 bp 300 bp–1.5 kb
技术 Illumina测序 Illumina测序 Illumina测序 Illumina测序
变异类别 单核苷酸多态性（SNP）, 基因融合, 杂合性缺失（LOH）, 体细胞变异, 染色体异常, 生殖系变异, 结构变异, 插入缺失（indel）, 拷贝数变异（CNV） 单核苷酸多态性（SNP）, 基因融合, 杂合性缺失（LOH）, 体细胞变异, 染色体异常, 生殖系变异, 结构变异, 插入缺失（indel）, 拷贝数变异（CNV） 单核苷酸多态性（SNP）, 基因融合, 杂合性缺失（LOH）, 体细胞变异, 染色体异常, 生殖系变异, 结构变异, 插入缺失（indel）, 拷贝数变异（CNV） 单核苷酸多态性（SNP）, 结构变异

选择工具：

文库制备和芯片试剂盒选择器

寻找符合您需求的测序文库制备试剂盒或芯片。按方法、种类等筛选。比较、分享和订购试剂盒。

测序覆盖度计算器

一个用于帮助确定实验所需试剂和测序运行次数以达到期望覆盖度的工具。

图

Illumina磁珠连接的转座酶化学技术

(A) 与磁珠结合的转座酶介导gDNA的同步片段化和因美纳测序引物的添加。(B) 循环数较少的PCR扩增生成了可立即测序的DNA片段，并添加标签和接头。(C) 对可上机测序的片段进行洗脱并混合。

Illumina DNA Prep提供最快的Illumina工作流程

比较从DNA提取到文库归一化和混合的总工作流程时间。Illumina DNA Prep可生成步骤最少且总工作流程时间最快的工作流程。 

提高覆盖均一性

（A） Illumina DNA Prep能均匀覆盖整个基因组，与TruSeq DNA Nano试剂盒相当。（B） 显示了GC含量极高或极低的微生物的覆盖度。由于磁珠上酶切法片段化文库制备化学技术得到改进，Illumina DNA Prep的覆盖度比Nextera XT更均匀。

相关资源

Illumina DNA Prep：可靠且自均一化的酶促文库制备技术

Illumina的文库制备创新流程

了解Illumina技术，该技术旨在为DNA和RNA文库制备提供易于使用、快速且简单的解决方案。

Illumina DNA Prep：简介

Illumina DNA Prep Kit简介。

磁珠上酶切法片段化的工作原理

磁珠上酶切法片段化文库制备化学技术整合了DNA提取、片段化、文库制备和文库归一化。

文库制备 (2)

Illumina DNA Prep, (M) Tagmentation (24样本, IPB)

20060060

包含用于制备24个文库的试剂。包含Illumina纯化磁珠。单独购买富集探针panel和标签接头。

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Discounts:

Illumina DNA Prep, (M) Tagmentation (96样本, IPB)

20060059

包含用于制备96个文库的试剂。包含Illumina纯化磁珠。单独购买富集探针panel和标签接头。

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标签接头 (9)

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation（96标签，96样本）

20091654

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A， Tagmentation（96个标签，96个样本）包括96个10 bp标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。

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Discounts:

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96标签, 96样本)

20091656

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B， Tagmentation（96个标签，96个样本）包括96个10 bp标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。

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Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96标签, 96样本)

20091658

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C， Tagmentation（96个标签，96个样本）包括96个10 bp标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。

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Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96标签, 96样本)

20091660

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D， Tagmentation（96个标签，96个样本）包括96个10 bp标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。

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IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation（96标签，96样本）

20027213

包含96、10 bp标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。

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IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation（96标签，96样本）

20027214

包含96、10 bp标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备试剂、富集试剂和探针panel。

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IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation（96标签，96样本）

20042666

包含96、10 bp标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。

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IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation（96标签，96样本）

20042667

包含96、10 bp标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备试剂、富集试剂和探针panel。

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Nextera™ DNA CD Indexes（96标签，96样本）

20018708

包括20个标签、8个i500和12个i700标签，它们共同提供了96个双标签功能，足以标记96个样本。标签以96孔形式提供。单独购买文库制备和探针panel。

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服务 (1)

Nextera DNA Flex - 客户现场

20022900

基因组DNA的定量和质量控制，检查文库质量和数量，完整的Nextera DNA Flex工作流程培训。

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配套产品 (6)

Illumin纯化磁珠, 100mL

20060057

包含一个100 mL微珠容器，用于文库纯化和大小选择。单独购买文库制备和富集试剂、探针panel和标签。

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Illumina纯化磁珠, 400mL

20060058

包含四个100 mL微珠容器，用于文库纯化和大小选择。单独购买文库制备和富集试剂、探针panel和标签。

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Flex Lysis Reagent Kit（96次反应）

20018706

包含使用Illumina DNA Prep和Illumina DNA Prep with Enrichment处理血液样本的试剂。单独购买文库制备、富集、富集探针panel和标签接头试剂。

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Illumina® Free Adapter Blocking Reagent（12次反应）

20024144

该试剂在文库制备过程中使用，可降低标签跳跃水平。

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Illumina® Free Adapter Blocking Reagent（48次反应）

20024145

该试剂在文库制备过程中使用，可降低标签跳跃水平。

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NextSeq PhiX Control Kit

FC-110-3002

用于NextSeq Illumina测序平台的DNA质控品。兼容单端和双端read，150 bp。10 µl 10 nM PhiX溶液。

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常见问题解答

是的，Illumina为血液和唾液设计了特定的提取方案。有关实验方案，请参阅Illumina DNA Prep参考指南。

一般来说，Illumina DNA Prep与大多数自动化液体处理系统兼容。 

所有因美纳自动化合作伙伴都在为至少一个现有自动化平台开发方法。请联系各个合作伙伴，了解更多信息。 

GC富集区域的覆盖度可能会受到所用扩增仪的型号、设置和性能的影响。因美纳已经验证了Bio-Rad DNA Engine Tetrad 2、Bio-Rad S1000、Bio-Rad C1000和MJ Research PTC-225 DNA Engine Tetrad扩增仪，可与因美纳DNA Prep配合使用。其他扩增仪的性能可能有所不同，这可能会影响基因组覆盖度。

是的，Illumina DNA Prep的最小起始量范围（1–500 ng）允许使用从干血斑（DBS）卡中提取的DNA。Illumina演示的干血斑提取实验方案请参阅Nextera DNA Flex干血斑实验方案指南文档。

/ 结果

NovaSeq X系列

将先进的化学、光学和信息学技术相结合，实现了超凡的速度和数据质量、出色的通量和可扩展性。

MiSeq v3试剂盒

与早期版本相比，经过优化的试剂盒可增加簇密度和读长，从而提高测序质量分值。

TruSight Oncology 500

使用涵盖所有主要变异类别以及来自FFPE组织的基因特征（TMB、MSI和HRD）的大型泛癌panel实现CGP。

Illumina DNA Prep

快速、集成的文库制备工作流程，适用于各种测序应用。

Illumina DNA PCR-Free Prep

高效、快速、集成的文库制备工作流程，为灵敏的测序应用生成高度准确的数据。

Illumina UD Indexes

唯一双（UD）标签能够制备可多重分析的高质量文库，从而提高通量并节省成本。

参考文献

1. Bruinsma S, Burgess J, Schlingman D, et al. 与磁珠结合的转座酶为NGS文库制备提供了无需标准化的工作流程。2018；19：722。BMC Genomics. 2018年10月1日在线发布。doi：10.1186/s12864-018-5096-9

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