Correlation Engine

交互式组学知识库与数据搜索引擎,将私有数据与高度精编的公共组学数据置于生物学背景中。

概述

Correlation Engine 是全球最大的生物数据库之一,为生命科学研究人员提供前所未有的高质量组学级分析与科研工具。该知识库整合并标准化了海量组学研究成果,可检索数十亿数据点,助力新发现。其专有算法自动简化关联分析,通过扫描私有数据及数千套公共数据集,快速找到可对比的科研洞察。

Correlation Engine功能:

  • 综合型平台,具有一套用于确定生物学背景的应用程序以及不断丰富的精选数据集库,支持多个物种和多组学数据集

  • 简便易用的图形用户界面采用引导式工作流程、一键式应用程序和API

  • 一种专有算法,可自动化并简化相关性分析,通过扫描私人数据和数千个公共数据集查找可比较的见解

规格

合规认证

应用

Correlation Engine提供了一个易于使用的交互式基因组学分析平台,可将私人数据置于生物学背景下,并包含高度精选的公共数据。应用程序支持早期研究,以识别疾病机制、药物靶点以及预后或预测生物标志物。

软件产品组合

1
实验室
2
运行
3
分析
4
解读

Correlation Engine

交互式组学知识库,将私人组学数据置于生物学背景下,并具有高度精选的公共数据。

主要使用案例

生物标志物发现和验证

识别关键生物标志物并发现特征中的哪些基因可以为主要疾病区域、最佳治疗靶点和作用机制提供最佳标志物。

药物再利用

寻找反向相关性,发现表明药物新用途的基因-疾病化合物关联。

作用机制

将您的数据特征与公共或内部数据,以及代表生物状态或功能(如通路)的特征进行关联,从而解析作用机制。

药物安全性和毒性基因组学

利用公共毒理学研究来评估化合物特征,并使用精选的研究或元分析应用程序来发现与其他已知毒性基因组特征的重叠。


相关应用和方法

用户案例

文档

产品资料

从组学数据到发现,加速每一步

利用 Correlation Engine 的 25.6 万条精编组学特征,快速关联并深度追问您的数据。

关联多种数据类型

对于给定的查询,可以快速识别新的相关性和关联,揭示基因、疾病、化合物、组织和通路之间的数据驱动的关联。

Body Atlas

身体图谱提供了有关基因表达位置及其在该位置内的表达水平的见解。

Disease Atlas

疾病图谱提供了与查询数据相关的疾病、性状和病症之间的相关性。

Pharmaco Atlas

药物图谱有助于发现化合物、对化合物的基因组和表观基因组反应,以及与查询数据相关的治疗。

Meta Analysis

基于一组数据特征进行检索,以生成共有特征或发现相关生物群组(通路、功能群等),结果可通过可下载的热图进行查看。

相关资源

免费试用 Correlation Engine 文献检索应用。

利用 Correlation Engine 探索高级多组学分析流程。

了解综合发现平台 Illumina Correlation Engine 如何帮助您从不断增长的复杂组学数据中提取宝贵解析。

Partek Flow 数据查看器提供可视化功能,设置直观、操作便捷。观看演示,学习如何提升工作效率。

常见问题解答

Correlation Engine支持RNA表达(RNA-Seq)、基因分型/SNP GWAS、DNA蛋白相互作用分析、体细胞突变分析和DNA甲基化分析。 

可以。在 Correlation Engine 中,这类知识库签名称为“biogroups”。使用 Pathway Enrichment 应用,可判断您的 bioset 是否在 GO 联盟MSigDBTargetScanInterPro 的基因或蛋白集合对应的 biogroups 中富集。

Correlation Engine 可识别大多数公共及标准商业平台的标识符,包括 NCBI Gene ID、基因符号、NCBI 登录号、ENSEMBL ID、RefSeq 标识符、IPI ID,以及来自 Affymetrix、Illumina、Agilent 和 GE Healthcare 等平台的自定义 ID。

平台采用专有的秩次统计法,将你导入的数据与全球所有实验数据进行关联计算。借此,你的结果可被置于世界实验背景中验证、发现新关联并指导后续实验。系统亦会将你的数据与全部 biogroups 关联,帮助你发现研究中基因或蛋白的共同特征。

平台已整合超过 26,000 项研究,对应逾 190,000 条公共数据签名,且每周更新。

/ 结果

NovaSeq X系列基因测序仪

将先进的化学、光学和信息学技术相结合,实现了超凡的速度和数据质量、出色的通量和可扩展性。

MiSeq v3试剂盒

与早期版本相比,经过优化的试剂盒可增加簇密度和读长,从而提高测序质量分值。

TruSight Oncology 500 v2

使用涵盖所有主要变异类别以及来自FFPE组织的关键生物标志物(TMB、MSI和HRD)的大型泛癌种panel实现CGP。

Illumina DNA Prep

快速、集成的文库制备工作流程,适用于各种测序应用。

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