Illumina DNA Prep with Enrichment
适用于广泛应用的完整靶向重测序解决方案，具有快速、集成的工作流程以及定制和固定富集panel选项。
Illumina Custom Enrichment Panel v2为靶向测序应用提供快速、灵活的内容，从而支持完全定制的富集解决方案。
Illumina Custom Enrichment Panel v2
靶向定制富集panel，为多种靶向测序应用提供简单高效的解决方案。
概述
主要特点
规格
| 描述 | 完全定制的富集panel，兼具速度、灵活性和可扩展性，适用于靶向测序应用。 |
|---|---|
| 系统 | MiSeq测序仪, MiSeqDx测序仪, iSeq 100测序仪, NextSeq 550测序仪, NextSeq 2000测序仪, NextSeq 1000测序仪, MiniSeq测序仪, NextSeq 550Dx测序仪下的科研模式, NovaSeq X测序仪, NextSeq 500测序仪, NovaSeq 6000测序仪, NovaSeq X Plus测序仪 |
| 与文库制备产品的兼容性 | Illlumina cfDNA Prep with Enrichment, Illumina Complete Long Reads with Enrichment, Human, Illlumina DNA Prep with Enrichment |
| 方法 | 靶向富集 |
| 核酸类型 | DNA |
| 物种 | ⼈, 其他, 人 |
| 技术 | Illumina测序 |
需要的产品
Illumina Custom Enrichment Panel v2是使用DesignStudio设计的120 bp双链探针panel，包含用于杂交捕获的富集寡核苷酸。文库制备、富集和标签接头试剂必须单独购买。
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结果
应用
Illumina Custom Enrichment Panel v2与多种靶向富集工作流程兼容。借助DesignStudio，可以设计出与多种因美纳文库制备产品配合使用的panel：
工作流程示例
相关应用和方法
数据图
Illumina Custom Enrichment Panel v2与Illumina DNA Prep with Enrichment可提供更高的填补read富集和平均靶标覆盖度。
Illumina Custom Enrichment Panels v2——灵活、可扩展的定制富集panel，采用简单的DIY设计
估计每个流动槽的预期样本数量（基于探头panel规格）
定制panel样本计算假设使用120 bp双链DNA寡核苷酸panel（Illumina Custom Enrichment Panel v2）或80-mer单链DNA寡核苷酸panel（Illumina Custom Enrichment Panel）实现指示的靶标覆盖深度，以80%的富集效率和2 x 101 bp读长化学技术进行靶标捕获。实际样本的数量可能因工作流程处理、输入样本或文库质量以及每个平台和流动槽的实际测序产出而有所不同。
比较
SKU比较
| 部件号 | 名称 | 体积(µl) | 样本数量：Illumina DNA Prep with Enrichment | 样本数量：Illumina Cell-Free DNA Prep with Enrichment | 样本数量：Illumina Complete Long Reads Prep with Enrichment |
|---|---|---|---|---|---|
| 20073953 | Illumina Custom Enrichment Panel v2 (32 µl, 120 bp) | 32 µl | 96 | 8 (1-plex) 或 32 (4-plex) |
64 |
| 20073952 | Illumina Custom Enrichment Panel v2 (384 µl, 120 bp) | 384 µl | 1152 | 96 (1-plex) 或 384 (4-plex) |
768 |
| 20111339 | Illumina Custom Enrichment Panel v2 (1536 µl, 120 bp) | 1536 µl | 4608 | 384 (1-plex) 或 1536 (4-plex) |
3072 |
| 每次杂交反应的panel体积 | 每次杂交反应使用4 uL探针panel | 每次杂交反应使用4 uL探针panel | 将探针panel稀释5倍，每次杂交使用2.5 uL | ||
| 富集重数 | 每次杂交12个样本* | 每次杂交1个样本或4个样本 | 每次杂交1个样本 |
| Illumina Custom Enrichment Panel v2 | Illumina Custom Enrichment Panel | |
|---|---|---|
| Panel规格，探针数量 | 100 - 1,000,000 | 2000 - 67,000 |
| 寡核苷酸规格 | 120 bp双链寡核苷酸探针 | 80-mer单链寡核苷酸探针 |
| 可用的分配规格 | 32 µl, 384 µl, 1536 µl | 80 µl |
| 99.9%以上的探针存在，经NGS确认 | 是 | 否 |
| 对比因美纳文库制备 | Illumina DNA Prep with Enrichment, Illumina Cell-Free DNA Prep with Enrichment, Illumina Exome 2.5 Enrichment, Illumina Complete Long Reads Enrichment | Illumina DNA Prep with Enrichment, Illumina Cell-Free DNA Prep with Enrichment |
| 设计工具 | DesignStudio或Concierge服务 | DesignStudio或Concierge服务 |
| 周转时间* | 3-6周 | 6-8周 |
| panel成本 | $ | $$$ |
*对于美国以外的目的地，可能需要额外的运输时间
选择工具：
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资源
为多种靶向测序应用提供从探针设计到数据分析的全面解决方案。我们定制化设计的panel确保了高均一性和覆盖度，并增强了对GC-rich和难以测序区域的覆盖。
常见问题解答
因美纳支持将Illumina Custom Enrichment v2 panel与Illumina DNA Prep with Enrichment、Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment、Illumina cfDNA Prep with Enrichment和Illumina Complete Long Reads with Enrichment工作流程结合使用的实验方案。
| Illumina DNA Prep with Enrichment | Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment | Illumina cfDNA Prep with Enrichment | Illumina Complete Long Reads with Enrichment | |
|---|---|---|---|---|
| 最小panel规格 | 500个探针 | 100个探针（与Exome 2.5结合使用时） | 70 kb或700个探针，用于双链探针 | 2500（测试了具有190个探针的0.3 Mb panel，但PRE=34.8%） |
| 支持的重数 | 1-plex或12-plex | 12-plex | 1-plex或4-plex | 1-plex |
| panel使用量 | 每次富集反应使用4 μL | 每次富集反应使用4 μL | 每次富集反应使用4 μL | 将panel稀释5倍，每次富集反应使用2.5 µL |
| # 支持的样本数量（20073952，Illumina Custom Enrichment Panel v2（32 μL，120-bp） |
|
96样本，12-plex/td> |
|
64样本，1-plex |
| # 支持的样本数量（20073953，Illumina Custom Enrichment Panel v2（384 μL，120-bp） |
|
1,152样本，12-plex |
|
768样本，1-plex |
因美纳支持将Illumina Custom Enrichment panel与Illumina DNA Prep with Enrichment和Illumina cfDNA Prep with Enrichment工作流程结合使用的实验方案。
样本类型的兼容性由定制panel搭配的文库制备试剂盒决定。在抢先体验的版本中，我们支持将该panel与Illumina DNA Prep with Enrichment（与唾液、血液、纯化gDNA和FFPE兼容）和Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment（与唾液、血液和纯化gDNA兼容）结合使用的实验方案。随着Illumina cfDNA Prep with Enrichment和Illumina Complete Long Read with Enrichment工作流程的推出，我们将发布具有明确支持样本类型的文库制备和富集方案。
Illumina Concierge设计团队可以帮助进行复杂的设计，或针对非人类靶标的富集panel设计。该服务免费提供给所有客户。请联系您的因美纳销售团队代表，以便与Concierge团队取得联系。
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结果
Panel (3)
Illumina Custom Enrichment Panel V2 (32 µl, 120 bp)
20073953
Illumina Custom Enrichment Panel V2 enables 120 bp double-stranded custom panel design from 100 up to 1,000,000 probes using DesignStudio or Concierge Services and provides 32 µl of material (sufficient for 8 enrichment reactions when paired with Illumina DNA Prep with Enrichment). Library prep, enrichment, and index adapter reagents need to be ordered separately.
Illumina Custom Enrichment Panel V2 (384 µl, 120 bp)
20073952
Illumina Custom Enrichment Panel V2 enables 120 bp double-stranded custom panel design from 100 up to 1,000,000 probes using DesignStudio or Concierge Services and provides 384 µl of material (sufficient for 96 enrichment reactions when paired with Illumina DNA Prep with Enrichment). Library prep, enrichment, and index adapter reagents need to be ordered separately.
Illumina Custom Enrichment Panel V2 (1536 µl, 120 bp)
20111339
Illumina Custom Enrichment Panel V2 enables 120 bp double-stranded custom panel design from 100 up to 1,000,000 probes using DesignStudio or Concierge Services and provides 1536 µl of material (sufficient for 384 enrichment reactions when paired with Illumina DNA Prep with Enrichment). Library prep, enrichment, and index adapter reagents need to be ordered separately.
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Illumina Complete Long Read Prep with Enrichment，Human
一种经济高效、灵活的靶向长读长解决方案，可解析人类基因组难以绘制的区域。
Illumina Cell-Free DNA Prep with Enrichment
一种快速、灵活且可扩展的cfDNA文库制备试剂盒，用于高精度的突变检测。
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