Illumina Protein Prep
这种基于NGS的自动化蛋白质组学解决方案采用了SOMAmer技术和因美纳测序与分析技术，可在2.5天内检测9500种独特人类蛋白质。
Illumina Connected Multiomics是一个易于使用的生物信息学平台，可通过直观的可视化用户界面简化NGS、芯片和大规模多组学数据的分析流程。强大的统计算法、信息丰富的可视化、交互式界面和前沿基因组工具使研究人员能够自信地分析数据，无需先进的信息学专业知识。
Illumina Connected Multiomics
Illumina Connected Multiomics是一款强大、直观的云端解决方案，可实现大规模多组学数据分析和可视化。
概述
强大的分析能力
Illumina Connected Multiomics利用通过公开的行业标准统计算法（包括归一化和降噪模型）构建的分析工具揭示组学各层的模式
直观的界面
预配置和可定制的分析选项在用户友好的可视化界面中整合了DRAGEN二次分析的输出结果，让用户能够自信、轻松地探索其多组学数据集
一体化的工作流程
Illumina Connected Multiomics旨在提供从检测到见解的集成多组学工作流程，允许用户在单个可扩展的平台上整合其多组学分析，加速发现进程
规格
| 系统 | MiSeq测序仪, MiSeqDx测序仪, iSeq 100测序仪, NextSeq 550测序仪, NextSeq 2000测序仪, NextSeq 1000测序仪, MiSeqDx测序仪下的科研模式, MiniSeq测序仪, NextSeq 550Dx测序仪下的科研模式, NovaSeq X测序仪, 研究模式下的NovaSeq 6000Dx, iScan, NovaSeq 6000测序仪, NovaSeq X Plus测序仪, MiSeq i100 Plus系统, MiSeq i100系统 |
|---|---|
| 软件格式 | 云端 |
| 技术 | Illumina芯片, Illumina测序 |
应用
Illumina Connected Multiomics可在一系列多组学应用中进行高分辨率数据分析，包括蛋白质组学、转录组学、表观基因组学和基因组学，以及模式，包括单细胞和空间分析。
工作流程示例
实验室
高度可定制的实验室信息管理系统，使基因组学实验室能够高效、安全地追踪样本并管理工作流程。
运行
简单易用、基于云端的基因组运行管理和生物信息学计算与存储环境，可实现安全、高性能的测序操作。
分析学
对新一代测序（NGS）数据进行准确、全面、高效的二级分析。
一个安全、可扩展的生物信息学平台，可与测序仪无缝集成，并支持灵活的工作流程。
BaseSpace Sequence Hub为常用的因美纳测序方法提供了多样化的NGS数据分析应用程序。
解读
Illumina Connected Multiomics
一款强大的云端多组学分析和解读软件，借助交互式可视化功能、可扩展的基础设施以及安全的数据管理，实现从样本到见解的工作流程。
一款交互式组学知识库及数据搜索引擎，其通过专家精选的公共组学数据，将私有数据置于生物学背景中进行关联分析。
相关应用和方法
一种基于测序的高分辨率空间分析技术，可在完整组织结构中实现全转录组研究。
借助 Illumina 5碱基基因组方案，一次读取即可同时获得高精度基因组与甲基化组信息。
借助多组学分析放大发现能力，更紧密地将基因型与表型连接。
Illumina Connected Multiomics 的研究进展
Illumina Protein Prep 为科罗拉多大学的研究人员提供了一种强大且无偏的工具，用以深入探究这些独特疾病。
计划和定价
Illumina Connected Multiomics提供两个层次：
llumina Connected Software Basic
包含支持选定因美纳检测的预配置分析工作流程，可免费使用。根据通量需要购买足够的iCredit，以满足数据存储和分析需求。
Illumina Connected Multiomics Professional
包含支持选定因美纳检测的预配置分析工作流程，以及为因美纳和选定的第三方检测创建新定制工作流程的能力。通过整合Illumina Correlation Engine或KEGG Pathway数据库，可实现通路分析功能。需要购买年度或月度许可证，并准备足够的iCredit，以满足基于通量的数据存储与分析需求。
访问Order（订单）选项卡，了解这些层次之间差异的更多信息。
关于iCredit的更多信息，请访问 iCredit概览页面。
订阅选项
| 特征 | 基础 | 专业版 |
|---|---|---|
| 已部署在因美纳的AWS云区域实例中 | ||
免费使用Illumina Connected Analytics Basic与Illumina BaseSpace Sequence Hub |
||
| 访问DRAGEN输出 | ||
| 高级安全性和合规性 | ||
| 默认分析流程 | ||
| 定制分析流程 | ||
| 选择第三方检测支持 | ||
| 通路分析和集成的Correlation Engine | ||
| 可及性 | 所有域和工作组成员 | 基于席位的许可证，每份许可证对应1名指定用户 |
数据图
蛋白质组学
样本分布通过基于主成分分析的2D散点图进行可视化。蛋白质簇生成模式以热图和树状图的形式显示。点图重点关注基于特定蛋白表达的样品组。通路显示一组相对于另一组的富集。
单细胞分析
通过降维图（UMAP和t-SNE）、饼图和显示经典单核细胞高表达的条形图对免疫细胞类型进行可视化。该表描绘了基于图的簇生成生物标志物。热图和气泡图显示了比较中显著基因的Z评分分布和值频率。基因集富集分析图突出显示了关键生物学KEGG通路。
5-碱基测序
此图表通过5-碱基甲基化QC任务创建，其数据源自对二级分析输出的指标文件进行统计量提取与图示呈现。在QC报告中，我们将描述read定位质量和DNA甲基化检出质量的样本级QC指标进行可视化，例如样本、未甲基化对照和甲基化对照中CpG甲基化的百分比。
空间分析
妊娠小鼠大脑缰核区域的详细信息。细胞的颜色根据数据簇生成分析的结果进行标注。UMAP显示了细胞的簇生成，饼图显示了数据集中每个簇的相对丰度。
相关资源
Illumina Protein Prep检测数据在Illumina Connected Multiomics中展示，用于在生物学背景下交互探索蛋白质组学数据。
Introducing Illumina Connected Multiomics
Illumina Connected Multiomics简介
借助多样化的交互式图表，Illumina Connected Multiomics平台能够揭示有意义的生物模式、标志物与通路，让生物数据跃然眼前。
欢迎查看Illumina Connected Multiomics的YouTube播放列表，获取关于多组学研究设计、检测流程、数据整合策略及实际应用的简明、高价值视频解读。
软件与信息学 (4)
Illumina Connected Multiomics – 专业版试用
20141939
30 天试用，支持 1 名用户访问 Illumina Connected Multiomics，含预配置工作流、自定义工作流及 100 iCredits 用于计算与存储。
List Price:
Discounts:
Illumina Connected Software – 基础版许可权
20141940
Illumina Connected Software 基础版许可权，涵盖运行规划、DRAGEN 管线分析及预配置的多组学流程；同时开放 Illumina Connected Multiomics – 基础版、Illumina Connected Analytics 和 BaseSpace Sequence Hub 的完整权限。
List Price:
Discounts:
Illumina Connected Multiomics – 专业版年度许可权
20141942
Illumina Connected Multiomics 专业版年度许可权：1 名用户可在一年内使用预配置及自定义工作流，并享受由 Correlation Engine 驱动的通路分析；同时包含 BaseSpace 与 Illumina Connected Analytics 的完整访问权限。
List Price:
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Illumina Connected Multiomics – 专业版月度许可权
20156707
Illumina Connected Multiomics 专业版月度许可权：1 名用户可在一个月内使用预配置及自定义工作流，并享受由 Correlation Engine 驱动的通路分析；同时包含 BaseSpace 与 Illumina Connected Analytics 的完整访问权限。
List Price:
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常见问题解答
Illumina Connected Multiomics支持大量蛋白质组学、转录组学、表观基因组学和基因组学，以及单细胞和空间转录组学。
有关Illumina Connected Multiomics支持的数据格式的信息，请参阅有关支持数据类型的Illumina Connected Multiomics在线帮助。
访问文档获取最新信息。
访问BaseSpace在线帮助iCredit部分 获取关于BaseSpace iCredit使用情况的更多信息。
Illumina Connected Software: Illumina iCredit使用资源管理器
不可以，Illumina Connected Multiomics仅适用于Illumina AWS实例。如需本地云安装，请与我们联系 :info@illumina.com
是的。作为Illumina Connected Software生态系统的一部分，Illumina Connected Multiomics遵循因美纳“安全第一”的基础架构原则，在满足各类软件要求与法规的同时保障数据隐私与合规性。
有关Illumina Connected Multiomics中使用的行业标准统计算法的完整列表，请访问Illumina Connected Multiomics中使用的统计数据。
Illumina Connected Multiomics 提供全面的三级分析功能，包括 QA/QC、注释、过滤、归一化、批次校正、统计分析、探索性分析、区域分析、分类、生物学解读、通路分析等。欲了解更多，请访问 Connected Multiomics 任务操作页面。
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结果
Illumina Single Cell 3' RNA Prep
易于使用且高度可扩展的单细胞RNA-Seq解决方案，可实现mRNA捕获、条码编制和文库制备，无需复杂的工作流程或微流控技术
Illumina 5-Base DNA Prep
一项检测即可全面探索5-碱基基因组（A、T、G、C与5mC），为全基因组与甲基化组提供双重见解。
Illumina 5-Base DNA Prep with Enrichment
单次检测即可靶向识别五种 DNA 碱基（A、T、G、C 和 5mC），同步获得基因组变异与甲基化事件的双重洞察。
Illumina DRAGEN二级分析
通过DRAGEN二级分析获得更多基因组见解，了解最新更新信息，阅读常见问题解答并寻找产品支持。
Illumina Connected Analytics
利用Illumina Connected Analytics实现信息学分析并推动获得新的科学见解。如需了解定价、订阅等信息，请联系我们。
Correlation Engine
交互式组学知识库与数据搜索引擎，将私有数据与高度精编的公共组学数据置于生物学背景中。
BaseSpace Sequence Hub订购
在BaseSpace Sequence Hub中管理运行、分析、存储和共享测序数据。查找应用程序、订阅选项和文档。
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