IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, 酶切法片段化(96个标签,96个样本)
20027213
IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, 酶切法片段化(96个标签,96个样本)
20042666
Illumina Purification Beads (IPB)
20060057
Illumina Purification Beads (IPB)
20060058
Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment提供了一种经济高效、可靠的解决方案,用于人类全外显子组测序(WES)。
Twist Bioscience for Illumina Mitochondrial Panel是一个固定含量的面板,旨在覆盖线粒体基因组(chrM)的16,659个碱基对(bp)和37个基因,并允许对线粒体DNA(mtDNA)变体进行浓缩和测序。将此板块作为Twist Bioscience for Illumina Exome 2.5板块的补充,在你的实验中增加ChrM的覆盖率,具有同样高的WES上靶率和覆盖均匀性。
Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment具有较高的在靶率和均一的覆盖度,支持多重分析,可降低成本并提高样本通量。
不到一天的时间即可为 Illumina 测序准备文库。我们的合作伙伴提供了一系列适用于自动化平台的 Illumina 合格方法。要查看合作伙伴文档,请访问我们的合作伙伴网站Eppendorf ,Hamilton 和 PerkinElmer。
Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment采用了快速且用户友好型的工作流程,内置文库产量均一化功能和简化易用的单轮杂交方案。在6.5小时之内即可完成从DNA到文库制备、富集和富集后扩增等一系列过程。
WES解决方案由一家可靠的合作伙伴提供支持,从直接以血液或唾液作为起始材料到文库制备、富集、测序、分析、解读和报告的整个过程为您和您的实验室提供全方位服务,并从中获益。
仪器 | 推荐的样本数 | 读长 |
---|---|---|
NextSeq 2000 System | 每次运行的样本数(按流动槽类型):P2:19,P3:57(基于50倍平均靶标覆盖度、42Mreads、4.2 Gb数据) | 2 × 101 bp |
NovaSeq 6000 System | 每次运行的样本数(按流动槽类型):SP:34,S1:69,S2:176,S4:428(基于50倍平均靶标覆盖度、4200万条read、4.2 Gb数据)注:S4:428,需要NovaSeq Xp工作流程或额外标签。 | 2 × 101 bp |
Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment | Illumina DNA Prep with Enrichment | |
---|---|---|
作用机制 | 链接在磁珠上的转座酶和杂交捕获化学技术 | 磁珠结合的转座酶和杂交捕获化学技术 |
内容说明 | Twist Bioscience for Illumina Exome 2.0 Plus Panel 37.5 Mb编码内容(≥99%的RefSeq、CCDS、ClinVar和ACMG致病/可能致病的变体,COSMIC癌症基因普查),OMIMTwist Bioscience for Illumina Mitochondrial Panel涵盖循环线粒体基因组ChrM(16659 bp,37个基因) | 外显子组:45 Mb外显子内容(RefSeq、CCDS和Ensembl编码内容数据库覆盖≥ 98%)。 定制:0.5-15 Mb感兴趣基因组内容。 固定panel:内容因panel而异。 |
分析时间 | 6.5小时 | 约6.5小时 |
变异种类 | 杂合性缺失 (LOH), 体细胞变异, 生殖系变异, 拷贝数变异 (CNVs), 插入缺失 (indels), 单核苷酸多态性 (SNPs) | 杂合性缺失 (LOH), 体细胞变异, 生殖系变异, 拷贝数变异 (CNVs), 插入缺失 (indels), 单核苷酸多态性 (SNPs) |
在靶片段读数 | (平均)约90%,基于内部测试平均性能 | |
均一性 | ≥ 91% (覆盖百分比在20×,5G),基于内部测试平均性能 | |
多重分析 | 预富集文库可同时混合最多12重。试剂盒配置支持可同时多重分析多达192个样本。最多可同时分析384样本。 | 多达384个可用的唯一双标签。对多达12重预富集文库混合池进行测试。 |
手动操作时间 | 约2个小时 | 约2小时 |
技术 | 测序 | 测序 |
方法 | 外显子组测序, 靶向富集, 靶向DNA测序 | 靶向富集, 定制测序, 外显子组测序, 靶向DNA测序 |
核酸类型 | DNA | DNA |
物种类别 | 人类 | 人类, 其它 |
特殊的样本类型 | 唾液, 血液 | 唾液, 血液, FFPE组织 |
系统兼容性 | NovaSeq X, NextSeq 550Dx in Research Mode, HiSeq 4000, HiSeq 3000, NextSeq 1000, NextSeq 2000, NovaSeq 6000, NextSeq 550 | NovaSeq X, NextSeq 550Dx in Research Mode, 研究模式下的MiSeqDx, HiSeq 4000, HiSeq 3000, iSeq 100, MiniSeq, NextSeq 2000, MiSeq, NovaSeq 6000, NextSeq 550 |
说明 | 一种快速、易于使用的文库制备方法,包含富集工作流程,采用专注、包含最新信息的外显子组探针panel,可实现经济高效和可靠的人类全外显子组测序。 | 一种快速、灵活的研究解决方案,可实现全外显子组、定制和固定基因集panel靶向测序。 |
起始量 | 50-1000 ng 高质量基因组DNA(直接样本血液和唾液,可查看参考手册) | 10-1000 ng 高质量基因组DNA或5—1000 ng FFPE DNA(直接样本血液和唾液,可查看参考手册) |
Dr. Paola Ulivi, Dr. Milena Urbini and Dr. Gianluca Tedali from the Translational Oncology Unit at IRST-IRCCS Bioscience Laboratory discuss how tumor exome sequencing enables a deeper understanding of the molecular landscape of cancers and guides biomarker discovery
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