甲基化测序
甲基化测序的优势
胞嘧啶甲基化可显著改变基因的时空表达和染色质重塑。使用新一代测序（NGS），全基因组分析和靶向方法都可以在单核苷酸水平上对甲基化模式进行深入研究。
甲基化测序的优势：
- 了解人类基因组中CpG、CHH和CHG区域的甲基化模式
- 利用全基因组亚硫酸氢盐测序（WGBS），几乎可以查看大部分物种基因组中每个胞嘧啶的甲基化
- 用少量DNA捕获完整的样本多样性
- 靶向甲基化测序覆盖了经ENCODE、FANTOM5和表观基因组学路线图计划（Epigenomics RoadMap Consortium）确认的人类基因组中感兴趣的区域
亚硫酸氢盐测序的工作原理是什么？
许多方法利用了NGS的高质量和灵敏度来进行甲基化分析。大多数方法依赖DNA的亚硫酸氢盐转化来检测未甲基化的胞嘧啶。在文库制备过程中，亚硫酸氢盐的转化会将未甲基化的胞嘧啶转化为尿嘧啶。在测序数据中，转化后的碱基会被识别为（PCR后）胸腺嘧啶，并使用read读数来确定甲基化胞嘧啶的百分比。
亚硫酸氢盐转化测序可以用扩增子methyl-seq、靶向富集或全基因组亚硫酸氢盐测序等靶向方法进行。此外，OxBS和TAB-Seq等替代化学技术也可以与NGS一起用于羟甲基化（5-hMc）的鉴定以及甲基化（5-mc）分析。
请参阅DNA甲基化分析领域指南，深入了解甲基化分析方法。
特色甲基化测序工作流程
获取完整的甲基化测序工作流程，涵盖从文库制备到数据分析的全过程。全基因组亚硫酸氢盐测序（WGBS）能够为所有胞嘧啶提供基于单碱基水平的甲基化定量分析。
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