Nextera XT DNA Library Preparation Kit

提供90分钟的工作流程,以较低的DNA起始量要求制备用于小型基因组、PCR扩增子、质粒和cDNA测序的DNA文库。

从DNA提取到归一化文库大约5.5小时。(文库制备时间:约90分钟)。

分析时间

15分钟

手动操作时间

1 ng DNA

起始量

详情请参见规格表

我们建议订购Illumina DNA/RNA UD Indexes Sets A-D(20091654、20091656、20091658、20091660)。IDT for Illumina DNA/RNA UD Indexes Sets A-D(20027213、20027214、20042666、20042667)即将停产;最后订购日期为2025年1月30日。

概述

Nextera XT DNA Library Preparation Kit提供了一种快速简便的工作流程,用于小型基因组、PCR扩增子、质粒、微生物基因组、多联扩增子和双链cDNA测序文库的制备、定量和归一化,该试剂盒使用的DNA起始量较低(1 ng),因此适用于有限数量的珍贵样本。

主要特点

  • 仅需90分钟即可快速制备文库,手动操作时间仅为15分钟

  • 无需在样本混合和测序之前进行文库定量

  • 使用因美纳基因测序仪在8小时内提供快速结果

  • 针对PCR扩增子实现较高且均匀的覆盖度和准确的变异检出

  • 产生高质量的小型基因组从头组装

  • 具有可扩展性,可在单次实验中对多达384个样本进行处理并为每个样本添加唯一的标签

该产品也是Illumina Advantage(TG)产品。Illumina Advantage大规模测序产品分批配送和测试,其保质期更长,且如有变动会预先通知,提高实验室的效率。

规格

需要的产品

所需产品:

用于纯化扩增文库的Illumina纯化磁珠。

以下标签试剂盒之一:

基于磁珠的文库浓度均一化:

  • Nextera XT V2 Index Kit Set A、B、C或D 
  • Nextera XT Index Kit(FC-131-1001)

标准归一化:

  • Illumina DNA/RNA UD Indexes Set A、B、C或D
/ 结果

应用

Nextera XT DNA Library Preparation Kit支持低DNA起始量(1 ng),可在短短90分钟内为小型基因组、PCR扩增子和质粒提供高质量的测序文库。

工作流程示例

1
制备

Nextera XT DNA文库制备试剂盒

项目建议

仪器 Recommended number of samples Read length
MiSeq System

每次运行多达384个样本

高达2 × 300 bp

NextSeq 550 System

每次运行多达384个样本

长达2 × 150 bp

相关应用和方法

比较

Nextera XT DNA Library Preparation Kit Illumina DNA Prep
分析时间 从DNA提取到归一化文库大约5.5小时。(文库制备时间:约90分钟)。 约3-4小时(从DNA提取到归一化文库)
自动化功能 液体处理机器人 液体处理机器人
自动化详情 探索可用的自动化方法 探索可用的自动化方法
说明 在90分钟内制备用于小型基因组、PCR扩增子和质粒的测序文库,DNA起始量要求低。 快速、灵活的文库制备工作流程,可适应各种样本类型和DNA起始量,可用于从人类到微生物全基因组测序等各种应用。 
手动操作时间 15分钟 1-1.5小时
起始量 1 ng DNA 1-500 ng DNA用于小型基因组(例如微生物),或100-500 ng DNA用于大型基因组(例如人类)。(对于血液和唾液样本,请参阅参考指南)。
系统 MiSeq 系统, iSeq 100系统, NextSeq 550系统, NextSeq 2000系统, NextSeq 1000系统, MiniSeq基因测序仪, NextSeq 500系统 MiSeq 系统, iSeq 100系统, NextSeq 550系统, NextSeq 2000系统, NextSeq 1000系统, 研究模式下的MiSeqDx, MiniSeq基因测序仪, 研究模式下的NextSeq 550Dx, NovaSeq X基因测序仪, NovaSeq 6000系统, NovaSeq X Plus基因测序仪
作用机制 酶切法 片段化 链接磁珠转座酶
方法 扩增子测序, 16s rRNA测序, 从头测序, 全基因组测序, 鸟枪法测序 扩增子测序, 从头测序, 全基因组测序, 鸟枪法测序
多重分析 多达384个唯一标签的样本可混合并一起测序。 多达384个唯一双(UD)标签组合和96个组合(CD)双标签组合
核酸类型 DNA DNA
特殊的样本类型 低起始量样本, 单细胞 血液, 不兼容FFPE, 唾液
物种 果蝇, 任意, 哺乳动物, 小鼠, 酵母, 斑马鱼, 真菌, 人, 大鼠, 植物, 病毒, 线虫, 细菌 果蝇, 任意, 哺乳动物, 小鼠, 酵母, 斑马鱼, 人, 大鼠, 植物, 病毒, 线虫, 细菌
物种详情 与任何物种兼容 与任何物种兼容
目标插入片段大小 300 bp–1.5 kb ~350 bp
技术 Illumina测序 Illumina测序
变异类别 单核苷酸多态性(SNP), 结构变异 单核苷酸多态性(SNP), 基因融合, 杂合性缺失(LOH), 体细胞变异, 染色体异常, 生殖系变异, 结构变异, 插入缺失(indel), 拷贝数变异(CNV)

选择工具:

高覆盖度、准确的检出

Nextera XT试剂盒可对多种扩增子大小进行高、均匀的覆盖,并在dbSNP数据库中确认变异检出准确。 

均匀覆盖大型扩增子

Nextera XT试剂盒显示(A)高测序覆盖度(> 1000×)和(B)人类基因组高度可变非编码区域中大扩增子(5.1 kb)位置的准确变异检出。

小型基因组的高质量从头组装

Nextera XT试剂盒可对大肠杆菌基因组进行高质量的从头组装,N50分值出色,覆盖1 ng基因组DNA。

相关资源

Nextera文库制备的最佳实践

本视频回顾了Nextera文库制备过程中的关键步骤,并提供了有关如何获得最佳结果的一些提示和技巧。

Nextera XT:样本制备和使用

本次关于Nextera XT样本制备流程的网络研讨会将介绍实验方案、关键步骤的最佳实践以及推荐的应用。

文库制备 (2)

Nextera XT DNA Library Preparation Kit(24样本)

FC-131-1024

包含用于制备24个文库的试剂。单独购买标签接头和纯化磁珠。

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Nextera XT DNA Library Preparation Kit(96样本)

FC-131-1096

包含用于制备96个文库的试剂。单独购买标签接头和纯化磁珠。

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Illumina Advantage产品 (3)

TG Nextera® XT DNA Sample Preparation Kit(96样本)

TG-131-1096

每个Nextera® XT DNA Sample Preparation Kit都提供了足以制备多达96个样本的试剂。

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TG Nextera® XT Index Kit v2 Set A(96标签,384样本)

TG-131-2001

Nextera XT样本制备(Set A)的96个标签的第2版。

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TG Nextera® XT Index Kit v2 Set B(96标签,384样本)

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Nextera XT样本制备(Set B)的96个标签的第2版。

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标签接头 (13)

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation(96标签,96样本)

20091654

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation(96个标签,96个样本)包括96个10 bp标签,足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。

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Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96标签, 96样本)

20091656

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation(96个标签,96个样本)包括96个10 bp标签,足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。

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Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96标签, 96样本)

20091658

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation(96个标签,96个样本)包括96个10 bp标签,足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。

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Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96标签, 96样本)

20091660

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation(96个标签,96个样本)包括96个10 bp标签,足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。

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IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation(96标签,96样本)

20027213

包含96、10 bp标签,足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。

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IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation(96标签,96样本)

20027214

包含96、10 bp标签,足以标记96个样本。单独购买文库制备试剂、富集试剂和探针panel。

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IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation(96标签,96样本)

20042666

包含96、10 bp标签,足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。

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IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation(96标签,96样本)

20042667

包含96、10 bp标签,足以标记96个样本。单独购买文库制备试剂、富集试剂和探针panel。

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Nextera XT Index Kit v2 Set A(96标签,384样本)

FC-131-2001

包含96、8 bp标签,足以标记384个样本。单独购买文库制备试剂盒和纯化磁珠。

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Nextera XT Index Kit v2 Set B(96标签,384样本)

FC-131-2002

包含96、8 bp标签,足以标记384个样本。单独购买文库制备试剂盒和纯化磁珠。

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Nextera XT Index Kit v2 Set C(96标签,384样本)

FC-131-2003

包含96、8 bp标签,足以标记384个样本。单独购买文库制备试剂盒和纯化磁珠。

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Nextera XT Index Kit v2 Set D(96标签,384样本)

FC-131-2004

包含96、8 bp标签,足以标记384个样本。单独购买文库制备试剂盒和纯化磁珠。

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Nextera XT Index Kit(24标签,96样本)

FC-131-1001

包含24、8 bp标签,足以标记96个样本。单独购买文库制备和纯化磁珠。

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配套产品 (2)

Illumin纯化磁珠, 100mL

20060057

包含一个100 mL微珠容器,用于文库纯化和大小选择。单独购买文库制备和富集试剂、探针panel和标签。

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Illumina纯化磁珠, 400mL

20060058

包含四个100 mL微珠容器,用于文库纯化和大小选择。单独购买文库制备和富集试剂、探针panel和标签。

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常见问题解答

Nextera酶切法片段化利用体外转座制备基因组DNA的可进行测序的文库,适用于所有Illumina测序平台。酶切法片段化技术可在单管酶促反应中同时使用测序接头对DNA进行片段化和标记。 

Nextera化学技术使用基于转座子的DNA片段化,转座子用接头切割并标记DNA,而TruSeq化学技术则遵循使用机械剪切对DNA进行片段化的替代富集方案。

每个Nextera XT文库最多可多重分析384个样本。
/ 结果

NovaSeq X系列

将先进的化学、光学和信息学技术相结合,实现了超凡的速度和数据质量、出色的通量和可扩展性。

MiSeq v3试剂盒

与早期版本相比,优化的试剂盒可增加簇密度和读长,从而提高测序质量分值。

TruSight Oncology 500

使用涵盖所有主要变异类别以及来自FFPE组织的基因特征(TMB、MSI和HRD)的大型泛癌panel实现CGP。

Illumina DNA Prep

快速、集成的文库制备工作流程,适用于各种测序应用。

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