NovaSeq X系列
将先进的化学、光学和信息学技术相结合，实现了超凡的速度和数据质量、出色的通量和可扩展性。
Illumina RNA Prep with Enrichment使用链接磁珠转座酶，然后进行简化、单一的90分钟杂交步骤，为RNA测序（RNA-Seq）应用提供非常快速的解决方案。
Illumina RNA Prep with Enrichment
快速、集成的工作流程，针对各种样本类型和RNA起始量生成富集并标记的测序文库。
＜9小时
分析时间
< 2小时
手动操作时间
10 ng RNA；20 ng FFPE RNA
起始量
快速、简单且可扩展的工作流程
总时间不到9小时，制备和富集测序文库的手动操作时间不到2小时。与因美纳高通量测序仪器结合使用，每次运行的样本量显著增加。
从复杂样本中获取高质量数据
能够从有限的起始材料和损坏或降解的样本（例如福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）组织）中获得可重现的结果。
经济、全面的RNA-Seq
在测序深度方面大幅提高发现能力。Illumina RNA Prep with Enrichment可提供出色的捕获效率和覆盖度均一性，极大地减少所需的测序深度，实现无偏差的准确检测。
灵活的模块化panel设计
使用各种预先构建的、经过验证的探针或定制探针来检测和发现等位基因特异性表达、融合检测、生物标志物筛查等，以实现最大的灵活性。
规格
| 分析时间 | ＜9小时 |
|---|---|
| 自动化功能 | 液体处理机器人 |
| 内容说明 | 与Illumina Exome Panel一起使用时可捕获编码转录组 |
| 说明 | 一种可重现且经济的解决方案，可使用多种类型的样本和起始材料来检测和发现目标转录本，包括福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）组织和其他低质量样本 |
| 手动操作时间 | < 2小时 |
| 起始量 | 10 ng RNA；20 ng FFPE RNA |
| 系统 | MiSeq 系统, iSeq 100系统, NextSeq 550系统, NextSeq 2000系统, NextSeq 1000系统, MiniSeq基因测序仪, NovaSeq 6000系统 |
| 作用机制 | 链接磁珠转座酶 |
| 方法 | mRNA测序, 靶向RNA测序, 靶向富集 |
| 多重分析 | 多达384个唯一双标签（UDI） |
| 核酸类型 | RNA |
| 特殊的样本类型 | 血液, 低起始量样本, FFPE组织 |
| 物种 | 人, 病毒 |
| 链特异性 | 非链 |
| 技术 | Illumina测序 |
| 变异类别 | 单核苷酸多态性（SNP）, 基因融合, 新型转录本, 转录本变异 |
需要的产品
完整的RNA Prep with Enrichment工作流程需要使用文库制备、探针panel和标签接头（所有物品均单独出售）。
可选组件包括：
Illumina RNA Fast Hyb Enrichment — 仅包含富集试剂，适用于处理复杂度与建议不同的客户
Illumina RNA Prep， （L） Tagmentation — 包含预富集试剂，仅适用于处理与建议序列不同的客户
/
结果
应用
Illumina RNA Prep with Enrichment可在制备靶向测序文库时灵活地制备样本类型和RNA起始量，适用于支持等位基因特异性表达、融合检测、生物标志物筛选等检测和发现研究的各种RNA-Seq应用。
工作流程示例
制备
Illumina RNA Prep with Enrichment
项目建议
| 仪器 | 推荐的样本数 | 读长 |
|---|---|---|
| NextSeq 550系统 | Illumina RNA Prep with Enrichment + Exome Panel 中通量：5 高通量：16 （基于每个样本25M read） |
2×100 bp |
| NextSeq 1000系统, NextSeq 2000系统 | Illumina RNA Prep with Enrichment + Exome Panel P2: 16 P3: 48 （基于每个样本25M read） |
2×100 bp |
| NovaSeq 6000系统 | Illumina RNA Prep with Enrichment + Exome Panel SP: 32 S1: 64 S2: 164 S4: 384 （基于每个样本25M read） |
2×100 bp |
| MiSeq 系统 | Illumina RNA Prep with Enrichment + Viral Surveillance Panel或Pan-Coronavirus Panel 多达25个样本（基于每个样本1M read） |
2 × 150 bp |
| NextSeq 550系统 | Illumina RNA Prep with Enrichment + Viral Surveillance Panel或Pan-Coronavirus Panel 多达384个样本（基于每个样本1M read） |
2 × 150 bp |
相关应用和方法
NGS可用于发现新的微生物、监测爆发、分析食物来源等等。
利用RNA测序检测癌症基因表达和转录组变化，鉴定新的癌症转录本。
对可预测治疗反应的RNA生物标志物的评估逐渐成为了药物开发过程中不可或缺的一部分。
文档
产品资料
比较
| Illumina RNA Prep with Enrichment | TruSeq RNA Exome | Illumina Stranded mRNA Prep | |
|---|---|---|---|
| 分析时间 | ＜9小时 | 约2天 | 6.5小时 |
| 自动化功能 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 |
| 内容说明 | 与Illumina Exome Panel一起使用时可捕获编码转录组 | 捕获编码转录组/RNA外显子组 | 捕获编码转录组（带链信息） |
| 说明 | 一种可重现且经济的解决方案，可使用多种类型的样本和起始材料来检测和发现目标转录本，包括福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）组织和其他低质量样本 | 为研究人员提供清晰、全面的编码转录组视图，链信息精确且样本起始量低。 | 简单、经济的编码转录组分析解决方案，可提供精确的链信息 |
| 手动操作时间 | < 2小时 | 约11小时 | ＜3小时 |
| 起始量 | 10 ng RNA；20 ng FFPE RNA | 来自新鲜/冷冻样本的10 ng总RNA，或来自FFPE样本的20 ng总RNA | 25-1000 ng标准质量的总RNA |
| 系统 | MiSeq 系统, iSeq 100系统, NextSeq 550系统, NextSeq 2000系统, NextSeq 1000系统, MiniSeq基因测序仪, NovaSeq 6000系统 | NextSeq 550系统, HiSeq 3000, NextSeq 2000系统, NextSeq 1000系统, NovaSeq X基因测序仪, NextSeq 500系统, NovaSeq 6000系统, NovaSeq X Plus基因测序仪, HiSeq 4000 | NextSeq 550系统, NextSeq 2000系统, NextSeq 1000系统, NovaSeq X基因测序仪, NextSeq 500系统, NovaSeq 6000系统, NovaSeq X Plus基因测序仪 |
| 作用机制 | 链接磁珠转座酶 | 以编码RNA为靶标的生物素化的捕获探针。不要求RNA带有poly-A尾巴。 | PolyA捕获，连接接头和标签 |
| 方法 | mRNA测序, 靶向RNA测序, 靶向富集 | 外显子组测序, mRNA测序 | mRNA测序 |
| 多重分析 | 多达384个唯一双标签（UDI） | 多达24个单标签、96个组合（CD）双标签 | 多达384个唯一双标签（UDI） |
| 核酸类型 | RNA | RNA | RNA |
| 特殊的样本类型 | 血液, 低起始量样本, FFPE组织 | 低起始量样本, FFPE组织 | 不兼容FFPE, 低起始量样本 |
| 物种 | 人, 病毒 | 人 | 哺乳动物, 牛, 小鼠, 人, 大鼠 |
| 链特异性 | 非链 | 链状 | 链状 |
| 技术 | Illumina测序 | Illumina测序 | Illumina测序 |
| 变异类别 | 单核苷酸多态性（SNP）, 基因融合, 新型转录本, 转录本变异 | 单核苷酸多态性（SNP）, 新型转录本, 转录本变异 | 单核苷酸多态性（SNP）, 基因融合, 新型转录本, 转录本变异 |
选择工具：
寻找符合您需求的测序文库制备试剂盒或芯片。按方法、种类等筛选。比较、分享和订购试剂盒。
图
Illumina RNA Prep with Enrichment提供快速的工作流程
与TruSeq RNA Exome相比，磁珠上酶切法片段化和90分钟的杂交步骤相结合，可提供更快的工作流程，步骤更少。
来自低起始量样本的高质量数据
Illumina RNA Prep with Enrichment实现了通用人类参考（UHR）中10 ng和100 ng总RNA起始量之间的高度数据一致性。
检测低起始量样本中的BCR-ABL1基因融合
使用Illumina RNA Prep with Enrichment和Illumina Exome Panel从K-562细胞系的10 ng RNA制备文库，成功检测出BCR-ABL1基因融合。顶部比对轨迹显示所有read，底部轨迹仅显示支持BCR-ABL1融合基因的read。
使用Illumina RNA Prep with Enrichment覆盖编码区
使用Illumina RNA Prep with Enrichment和Illumina Exome Panel从10 ng UHR RNA和20 ng FFPE RNA制备的文库显示，生成的数据中有超过85%与编码转录本和UTR比对。展示了来自TruSeq RNA Exome文库的数据以供比较。
从低起始量样本和FFPE样本进行基因融合检测
在K-562BCR-ABL11和TPM3-NTRK1基因融合的检出率为100%。 DV200 DV200
| 融合（来源） | RIN | RNA起始量 | 检测 |
| BCR-ABL 1 （K-562） | 7.4 | 10 ng | 6/6次重复（100%） |
| TPM3-NTRK1 （结直肠癌） | 2.5 | 20 ng | 6/6次重复（100%） |
相关资源
Illumina RNA Prep with Enrichment: Introduction
RNA Sequencing Part I: Introduction to Illumina RNA library preparation workflows
RNA Sequencing Part II: Best practices for Illumina RNA Prep protocols
Advancements in translational biomarker identification from cell-free RNA
文库制备 (2)
Illumina® RNA Prep with Enrichment, (L) Tagmentation（16样本）
20040536
包含用于制备和富集16个文库的试剂（16，1重富集反应）。单独购买富集探针panel、纯化磁珠和标签接头。
List Price:
Discounts:
Illumina® RNA Prep with Enrichment, (L) Tagmentation（96样本）
20040537
包含用于制备和富集96个文库的试剂（32，3重富集反应）。单独购买富集探针panel、纯化磁珠和标签接头。
List Price:
Discounts:
标签接头 (8)
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation（96标签，96样本）
20091654
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A， Tagmentation（96个标签，96个样本）包括96个10 bp标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。
List Price:
Discounts:
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96标签, 96样本)
20091656
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B， Tagmentation（96个标签，96个样本）包括96个10 bp标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。
List Price:
Discounts:
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96标签, 96样本)
20091658
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C， Tagmentation（96个标签，96个样本）包括96个10 bp标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。
List Price:
Discounts:
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96标签, 96样本)
20091660
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D， Tagmentation（96个标签，96个样本）包括96个10 bp标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。
List Price:
Discounts:
IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation（96标签，96样本）
20027213
包含96、10 bp标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。
List Price:
Discounts:
IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation（96标签，96样本）
20027214
包含96、10 bp标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备试剂、富集试剂和探针panel。
List Price:
Discounts:
IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation（96标签，96样本）
20042666
包含96、10 bp标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。
List Price:
Discounts:
IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation（96标签，96样本）
20042667
包含96、10 bp标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备试剂、富集试剂和探针panel。
List Price:
Discounts:
Panel (4)
Illumina Exome Panel – 仅富集寡核苷酸
20020183
与Illumina DNA Prep with Enrichment搭配使用时可进行8次富集反应，与TruSeq RNA Exome搭配使用时可进行12次反应，与Illumina RNA Prep with Enrichment搭配使用时可进行32次反应。单独购买文库制备和富集试剂以及标签接头。
List Price:
Discounts:
Respiratory Virus Oligos Panel V2
20044311
与Illumina RNA Prep with Enrichment（96样本）试剂盒搭配使用时，足够进行32次3重富集反应。单独购买文库制备和富集试剂盒以及标签接头。
List Price:
Discounts:
Viral Surveillance Panel, RUO 96 Rxns
20088154
包含与Illumina RNA Prep with Enrichment Kit搭配使用时足以进行32次3重富集反应的Viral Surveillance Panel。单独购买文库制备和富集试剂盒以及标签接头。
List Price:
Discounts:
Pan-Coronavirus Panel, RUO 96 Rxns
20088155
包含与Illumina RNA Prep with Enrichment Kit搭配使用时足以进行32次3重富集反应的Viral Surveillance Panel。单独购买文库制备和富集试剂盒以及标签接头。
List Price:
Discounts:
服务 (1)
Illumina RNA Library Prep with Enrichment培训
20044763
配套产品 (2)
Illumina RNA Fast Hyb Enrichment（16样本）
20040540
包含Illumina RNA Prep with Enrichment Kit的快速杂交富集试剂，可用于16次1重富集反应。支持客户处理与建议不同的复杂度。不包括预富集试剂。如需进行富集的完整制备，请订购Illumina RNA Prep with Enrichment试剂盒。
List Price:
Discounts:
Illumina RNA Prep, (L) Tagmentation（16样本）
20040542
包含来自Illumina RNA Prep with Enrichment Kit的预富集模块，适用于16个文库。支持客户处理与建议不同的复杂度。不包括富集试剂和纯化磁珠。要进行富集的完整制备，请订购Illumina RNA Prep with Enrichment Kit。
List Price:
Discounts:
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常见问题解答
Illumina建议使用Agilent Technologies Universal Human Reference RNA（UHR）（货号740000）作为阳性对照样本。
Illumina Exome Panel、Respiratory Virus Oligos Panel V2、Viral Surveillance Panel和Pan-Coronavirus Panel可与Illumina RNA Prep and Enrichment Kit搭配使用。
eBLTL是与磁珠结合的富集转座酶，通过在单个快速反应步骤中对cDNA进行片段化和添加接头标签序列来标记cDNA。
16次反应试剂盒可实现1重工作流程，而96次反应试剂盒可实现3重工作流程。可将其他辅助产品添加到任一工作流程中，以便以与建议不同的复杂度进行处理。
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结果
MiSeq v3试剂盒
与早期版本相比，经过优化的试剂盒可增加簇密度和读长，从而提高测序质量分值。
TruSight Oncology 500
使用涵盖所有主要变异类别以及来自FFPE组织的基因特征（TMB、MSI和HRD）的大型泛癌panel实现CGP。
Illumina DNA Prep
快速、集成的文库制备工作流程，适用于各种测序应用。
Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment
高性能、快速、可靠的人类全外显子组测序解决方案，包括全面、最新的外显子组富集panel。
Respiratory Pathogen ID/AMR Enrichment Panel Kit
文库制备和富集试剂盒，可提供高度灵敏、全面的呼吸道病原体鉴定和抗菌素耐药性见解。
NextSeq 1000/1000-CN和NextSeq 2000/2000-CN试剂盒
用于NextSeq 1000/2000系列基因测序仪的试剂盒，具有简便易用的卡盒和多种流动槽配置，可提供灵活的测序选项。
Illumina UD Indexes
唯一双（UD）标签能够制备可多重分析的高质量文库，从而提高通量并节省成本。
Nextera XT DNA Library Preparation Kit
提供90分钟的工作流程，以较低的DNA起始量要求制备用于小型基因组、PCR扩增子、质粒和cDNA测序的DNA文库。
Illumina DNA Prep
快速、集成的文库制备工作流程，适用于各种测序应用。
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