NovaSeq X系列
将先进的化学、光学和信息学技术相结合，实现了超凡的速度和数据质量、出色的通量和可扩展性。
Illumina RNA Prep with Enrichment使用链接磁珠转座酶，然后进行简化、单一的90分钟杂交步骤，为RNA测序（RNA-Seq）应用提供非常快速的解决方案。
Illumina RNA Prep with Enrichment
快速、集成的工作流程，针对各种样本类型和RNA起始量生成富集并标记的测序文库。
＜9小时
分析时间
< 2小时
手动操作时间
10 ng RNA；20 ng FFPE RNA
起始量
快速、简单且可扩展的工作流程
总时间不到9小时，制备和富集测序文库的手动操作时间不到2小时。与因美纳高通量测序仪器结合使用，每次运行的样本量显著增加。
从复杂样本中获取高质量数据
能够从有限的起始材料和损坏或降解的样本（例如福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）组织）中获得可重现的结果。
经济、全面的RNA-Seq
在测序深度方面大幅提高发现能力。Illumina RNA Prep with Enrichment可提供出色的捕获效率和覆盖度均一性，极大地减少所需的测序深度，实现无偏差的准确检测。
灵活的模块化panel设计
使用各种预先构建的、经过验证的探针或定制探针来检测和发现等位基因特异性表达、融合检测、生物标志物筛查等，以实现最大的灵活性。
规格
| 分析时间 | ＜9小时 |
|---|---|
| 自动化功能 | 液体处理机器人 |
| 内容说明 | 与Illumina Exome Panel一起使用时可捕获编码转录组 |
| 说明 | 一种可重现且经济的解决方案，可使用多种类型的样本和起始材料来检测和发现目标转录本，包括福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）组织和其他低质量样本 |
| 手动操作时间 | < 2小时 |
| 起始量 | 10 ng RNA；20 ng FFPE RNA |
| 系统 | MiSeq桌面式基因测序仪, iSeq 100系统, NextSeq 550桌面式基因测序仪, NextSeq 2000基因测序仪, NextSeq 1000系统, MiniSeq基因测序仪, NovaSeq 6000基因测序仪 |
| 作用机制 | 链接磁珠转座酶 |
| 方法 | mRNA测序, 靶向RNA测序, 靶向富集 |
| 多重分析 | 多达384个唯一双标签（UDI） |
| 核酸类型 | RNA |
| 特殊的样本类型 | 血液, 低起始量样本, FFPE组织 |
| 物种 | 人, 病毒 |
| 链特异性 | 非链 |
| 技术 | Illumina测序 |
| 变异类别 | 单核苷酸多态性（SNP）, 基因融合, 新型转录本, 转录本变异 |
需要的产品
完整的RNA Prep with Enrichment工作流程需要使用文库制备、探针panel和标签接头（所有物品均单独出售）。
可选组件包括：
Illumina RNA Fast Hyb Enrichment — 仅包含富集试剂，适用于处理复杂度与建议不同的客户
Illumina RNA Prep， （L） Tagmentation — 包含预富集试剂，仅适用于处理与建议序列不同的客户
/
结果
应用
Illumina RNA Prep with Enrichment可在制备靶向测序文库时灵活地制备样本类型和RNA起始量，适用于支持等位基因特异性表达、融合检测、生物标志物筛选等检测和发现研究的各种RNA-Seq应用。
工作流程示例
项目建议
| 仪器 | Recommended number of samples | Read length |
|---|---|---|
| NextSeq 550 System | Illumina RNA Prep with Enrichment + Exome Panel 中通量：5 高通量：16 （基于每个样本25M read） |
2×100 bp |
| NextSeq 1000 System, NextSeq 2000 System | Illumina RNA Prep with Enrichment + Exome Panel P2: 16 P3: 48 （基于每个样本25M read） |
2×100 bp |
| NovaSeq 6000 System | Illumina RNA Prep with Enrichment + Exome Panel SP: 32 S1: 64 S2: 164 S4: 384 （基于每个样本25M read） |
2×100 bp |
| MiSeq System | Illumina RNA Prep with Enrichment + Viral Surveillance Panel或Pan-Coronavirus Panel 多达25个样本（基于每个样本1M read） |
2 × 150 bp |
| NextSeq 550 System | Illumina RNA Prep with Enrichment + Viral Surveillance Panel或Pan-Coronavirus Panel 多达384个样本（基于每个样本1M read） |
2 × 150 bp |
相关应用和方法
NGS可用于发现新的微生物、监测爆发、分析食物来源等等。
利用RNA测序检测癌症基因表达和转录组变化，鉴定新的癌症转录本。
对可预测治疗反应的RNA生物标志物的评估逐渐成为了药物开发过程中不可或缺的一部分。
文档
产品资料
支持文档
- Illumina RNA Prep with Enrichment (L) Tagmentation Consumables & Equipment
- Illumina RNA Prep with Enrichment (L) Tagmentation Documentation
- Illumina RNA Prep with Enrichment (L) Tagmentation Reference Guide
- Illumina RNA Prep with Enrichment (L) Tagmentation Checklist
- 全部 Illumina RNA Prep with Enrichment (L) Tagmentation Support
比较
| Illumina RNA Prep with Enrichment | TruSeq RNA Exome | Illumina Stranded mRNA Prep | |||
|---|---|---|---|---|---|
| 分析时间 | ＜9小时 | 约2天 | 6.5小时 | ||
| 自动化功能 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 | ||
| 内容说明 | 与Illumina Exome Panel一起使用时可捕获编码转录组 | 捕获编码转录组/RNA外显子组 | 捕获编码转录组（带链信息） | ||
| 说明 | 一种可重现且经济的解决方案，可使用多种类型的样本和起始材料来检测和发现目标转录本，包括福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）组织和其他低质量样本 | 为研究人员提供清晰、全面的编码转录组视图，链信息精确且样本起始量低。 | 简单、经济的编码转录组分析解决方案，可提供精确的链信息 | ||
| 手动操作时间 | < 2小时 | 约11小时 | ＜3小时 | ||
| 起始量 | 10 ng RNA；20 ng FFPE RNA | 来自新鲜/冷冻样本的10 ng总RNA，或来自FFPE样本的20 ng总RNA | 25-1000 ng标准质量的总RNA | ||
| 系统 | MiSeq桌面式基因测序仪, iSeq 100系统, NextSeq 550桌面式基因测序仪, NextSeq 2000基因测序仪, NextSeq 1000系统, MiniSeq基因测序仪, NovaSeq 6000基因测序仪 | NextSeq 550桌面式基因测序仪, HiSeq 3000, NextSeq 2000基因测序仪, NextSeq 1000系统, NovaSeq X基因测序仪, NextSeq 500桌面式基因测序仪, NovaSeq 6000基因测序仪, NovaSeq X Plus基因测序仪, HiSeq 4000 | NextSeq 550桌面式基因测序仪, NextSeq 2000基因测序仪, NextSeq 1000系统, NovaSeq X基因测序仪, NextSeq 500桌面式基因测序仪, NovaSeq 6000基因测序仪, NovaSeq X Plus基因测序仪 | ||
| 作用机制 | 链接磁珠转座酶 | 以编码RNA为靶标的生物素化的捕获探针。不要求RNA带有poly-A尾巴。 | PolyA捕获，连接接头和标签 | ||
| 方法 | mRNA测序, 靶向RNA测序, 靶向富集 | 外显子组测序, mRNA测序 | mRNA测序 | ||
| 多重分析 | 多达384个唯一双标签（UDI） | 多达24个单标签、96个组合（CD）双标签 | 多达384个唯一双标签（UDI） | ||
| 核酸类型 | RNA | RNA | RNA | ||
| 特殊的样本类型 | 血液, 低起始量样本, FFPE组织 | 低起始量样本, FFPE组织 | 不兼容FFPE, 低起始量样本 | ||
| 物种 | 人, 病毒 | 人 | 哺乳动物, 牛, 小鼠, 人, 大鼠 | ||
| 链特异性 | 非链 | 链状 | 链状 | ||
| 技术 | Illumina测序 | Illumina测序 | Illumina测序 | ||
| 变异类别 | 单核苷酸多态性（SNP）, 基因融合, 新型转录本, 转录本变异 | 单核苷酸多态性（SNP）, 新型转录本, 转录本变异 | 单核苷酸多态性（SNP）, 基因融合, 新型转录本, 转录本变异 |
选择工具：
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图
Illumina RNA Prep with Enrichment提供快速的工作流程
与TruSeq RNA Exome相比，磁珠上酶切法片段化和90分钟的杂交步骤相结合，可提供更快的工作流程，步骤更少。
来自低起始量样本的高质量数据
Illumina RNA Prep with Enrichment实现了通用人类参考（UHR）中10 ng和100 ng总RNA起始量之间的高度数据一致性。
检测低起始量样本中的BCR-ABL1基因融合
使用Illumina RNA Prep with Enrichment和Illumina Exome Panel从K-562细胞系的10 ng RNA制备文库，成功检测出BCR-ABL1基因融合。顶部比对轨迹显示所有read，底部轨迹仅显示支持BCR-ABL1融合基因的read。
使用Illumina RNA Prep with Enrichment覆盖编码区
使用Illumina RNA Prep with Enrichment和Illumina Exome Panel从10 ng UHR RNA和20 ng FFPE RNA制备的文库显示，生成的数据中有超过85%与编码转录本和UTR比对。展示了来自TruSeq RNA Exome文库的数据以供比较。
从低起始量样本和FFPE样本进行基因融合检测
在K-562BCR-ABL11和TPM3-NTRK1基因融合的检出率为100%。 DV200 DV200
| 融合（来源） | RIN | RNA起始量 | 检测 |
| BCR-ABL 1 （K-562） | 7.4 | 10 ng | 6/6次重复（100%） |
| TPM3-NTRK1 （结直肠癌） | 2.5 | 20 ng | 6/6次重复（100%） |
相关资源
Illumina RNA Prep with Enrichment: Introduction
RNA Sequencing Part I: Introduction to Illumina RNA library preparation workflows
RNA Sequencing Part II: Best practices for Illumina RNA Prep protocols
Advancements in translational biomarker identification from cell-free RNA
文库制备 (2)
Illumina® RNA Prep with Enrichment, (L) Tagmentation（16样本）
20040536
包含用于制备和富集16个文库的试剂（16，1重富集反应）。单独购买富集探针panel、纯化磁珠和标签接头。
Illumina® RNA Prep with Enrichment, (L) Tagmentation（96样本）
20040537
包含用于制备和富集96个文库的试剂（32，3重富集反应）。单独购买富集探针panel、纯化磁珠和标签接头。
标签接头 (8)
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation（96标签，96样本）
20091654
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A， Tagmentation（96个标签，96个样本）包括96个10 bp标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96标签, 96样本)
20091656
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B， Tagmentation（96个标签，96个样本）包括96个10 bp标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96标签, 96样本)
20091658
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C， Tagmentation（96个标签，96个样本）包括96个10 bp标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96标签, 96样本)
20091660
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D， Tagmentation（96个标签，96个样本）包括96个10 bp标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。
IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation（96标签，96样本）
20027213
包含96、10 bp标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。
IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation（96标签，96样本）
20027214
包含96、10 bp标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备试剂、富集试剂和探针panel。
IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation（96标签，96样本）
20042666
包含96、10 bp标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。
IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation（96标签，96样本）
20042667
包含96、10 bp标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备试剂、富集试剂和探针panel。
Panel (4)
Illumina Exome Panel – 仅富集寡核苷酸
20020183
与Illumina DNA Prep with Enrichment搭配使用时可进行8次富集反应，与TruSeq RNA Exome搭配使用时可进行12次反应，与Illumina RNA Prep with Enrichment搭配使用时可进行32次反应。单独购买文库制备和富集试剂以及标签接头。
Respiratory Virus Oligos Panel V2
20044311
与Illumina RNA Prep with Enrichment（96样本）试剂盒搭配使用时，足够进行32次3重富集反应。单独购买文库制备和富集试剂盒以及标签接头。
Viral Surveillance Panel, RUO 96 Rxns
20088154
包含与Illumina RNA Prep with Enrichment Kit搭配使用时足以进行32次3重富集反应的Viral Surveillance Panel。单独购买文库制备和富集试剂盒以及标签接头。
Pan-Coronavirus Panel, RUO 96 Rxns
20088155
包含与Illumina RNA Prep with Enrichment Kit搭配使用时足以进行32次3重富集反应的Viral Surveillance Panel。单独购买文库制备和富集试剂盒以及标签接头。
服务 (1)
Illumina RNA Library Prep with Enrichment培训
20044763
配套产品 (2)
Illumina RNA Fast Hyb Enrichment（16样本）
20040540
包含Illumina RNA Prep with Enrichment Kit的快速杂交富集试剂，可用于16次1重富集反应。支持客户处理与建议不同的复杂度。不包括预富集试剂。如需进行富集的完整制备，请订购Illumina RNA Prep with Enrichment试剂盒。
Illumina RNA Prep, (L) Tagmentation（16样本）
20040542
包含来自Illumina RNA Prep with Enrichment Kit的预富集模块，适用于16个文库。支持客户处理与建议不同的复杂度。不包括富集试剂和纯化磁珠。要进行富集的完整制备，请订购Illumina RNA Prep with Enrichment Kit。
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常见问题解答
Illumina建议使用Agilent Technologies Universal Human Reference RNA（UHR）（货号740000）作为阳性对照样本。
Illumina Exome Panel、Respiratory Virus Oligos Panel V2、Viral Surveillance Panel和Pan-Coronavirus Panel可与Illumina RNA Prep and Enrichment Kit搭配使用。
eBLTL是与磁珠结合的富集转座酶，通过在单个快速反应步骤中对cDNA进行片段化和添加接头标签序列来标记cDNA。
16次反应试剂盒可实现1重工作流程，而96次反应试剂盒可实现3重工作流程。可将其他辅助产品添加到任一工作流程中，以便以与建议不同的复杂度进行处理。
/
结果
MiSeq v3试剂盒
与早期版本相比，优化的试剂盒可增加簇密度和读长，从而提高测序质量分值。
TruSight Oncology 500
使用涵盖所有主要变异类别以及来自FFPE组织的基因特征（TMB、MSI和HRD）的大型泛癌panel实现CGP。
Illumina DNA Prep
快速、集成的文库制备工作流程，适用于各种测序应用。
Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment
高性能、快速、可靠的人类全外显子组测序解决方案，包括全面、最新的外显子组富集panel。
Respiratory Pathogen ID/AMR Enrichment Panel试剂盒
文库制备和富集试剂盒，可提供高度灵敏、全面的呼吸道病原体鉴定和抗菌素耐药性见解。
NextSeq 1000/1000-CN和NextSeq 2000/2000-CN试剂盒
用于NextSeq 1000/2000系列基因测序仪的试剂盒，具有简便易用的卡盒和多种流动槽配置，可提供灵活的测序选项。
Illumina UD Indexes
唯一双（UD）标签能够制备可多重分析的高质量文库，从而提高通量并节省成本。
Nextera XT DNA Library Preparation Kit
提供90分钟的工作流程，以较低的DNA起始量要求制备用于小型基因组、PCR扩增子、质粒和cDNA测序的DNA文库。
Illumina DNA Prep
快速、集成的文库制备工作流程，适用于各种测序应用。
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