TruSeq DNA PCR-Free

简单、全面的全基因组测序(WGS)文库制备准确而全面地覆盖了复杂基因组。

总检测时间5小时

分析时间

4小时

手动操作时间

1 ug DNA

起始量

详情请参见规格表

Illumina DNA PCR-Free Prep 现已上市。该文库制备试剂盒的性能与TruSeq DNA PCR-Free相当,同时还能缩短周转时间和手动操作时间。

概述

TruSeq DNA PCR-Free可为全基因组测序应用提供简单、全面的文库制备。研究人员可对多种生物进行测序,从诸如细菌的小型基因组到人类全基因组。其工作流程可:

  • 缩短无凝胶工作流程,无需进行PCR

  • 对具有挑战性的区域进行测序

  • 实现卓越的覆盖质量,深入了解基因组

对具有挑战性的区域进行测序

TruSeq DNA PCR-Free可有效覆盖原本难以测序的区域,例如高GC区域、启动子和重复区域。

该工作流程可调,适用于多种读长,支持用于所有因美纳测序仪器。这使得研究人员可以根据实验需要调整每次运行。

深入了解基因组

无PCR意味着文库偏向和缺口减少。结果得到基因组高质量的数据,实现最佳的变异检测。卓越的基因组覆盖质量意味着结果中缺口极少,高GC区域覆盖度高。

使用无PCR的实验方案节省了时间

去除PCR节约了时间,并消除了与PCR步骤相关的基因组覆盖偏向。基于磁珠的大小选择缩短了工作流程。TruSeq DNA PCR-Free与因美纳测序系统串联,多方位改进了广泛使用的文库制备工作流程。

获得灵活的通量选项

  • 带单标签的TruSeq DNA PCR-Free可用于低通量(LT)研究,手动处理24个样本。
  • 带96 CD标签的TruSeq DNA PCR-Free可用于高通量(HT)研究,处理96个样本,并可在液体处理机器人上进行自动化处理(或手动处理)。
  • IDT for Illumina Unique Dual(UD)Indexes(24或96个标签)的多重性提高,能够准确分配read,高效利用流动槽。

快速、自动化的工作流程

一天内即可制备好用于因美纳测序的文库。Illumina认证方法可通过 我们的合作伙伴在一系列自动化平台上使用。

规格

需要的产品

Illumina现提供模块化产品的预订,让您的工作流程变得灵活。您可以订购具有以下任何标签的以下任何文库制备产品。 

/ 结果

应用

工作流程示例

项目建议

仪器 Recommended number of samples Read length
NextSeq 550 System

每次运行1个样本(基于30×的人类基因组覆盖度) 

350 bp插入片段:≤ 2 × 100 bp
550 bp插入片段:≤ 2 × 150 bp

NovaSeq 6000 System

每次运行的样本数(双流动槽):S1:8,S2:16,S4:48(基于30×的人类基因组覆盖度)

350 bp插入片段:≤ 2 × 150 bp
550 bp插入片段:≤ 2 × 150 bp

相关应用和方法

其他人如何使用该产品

马普研究院和宾夕法尼亚大学的研究人员共同资助了Lil Bub的基因组测序,采用NextSeq 500系统揭示了此种猫罕见疾病的遗传因素。

比较

TruSeq DNA PCR-Free Illumina DNA PCR-Free Prep Illumina DNA Prep TruSeq DNA Nano
分析时间 总检测时间5小时 约1.5小时 约3-4小时(从DNA提取到归一化文库) 总检测时间约为6小时
自动化功能 液体处理机器人 液体处理机器人 液体处理机器人 液体处理机器人
自动化详情 探索可用的自动化方法 探索可用的自动化方法 探索可用的自动化方法 探索可用的自动化方法
说明 用于全基因组测序研究的简单、一站式无PCR制备方法,可对具有挑战性的基因组区域进行测序。 使用磁珠上酶切法片段化与无PCR化学反应的独特组合,为灵敏的应用制备测序文库,同时消除了PCR诱导的偏差,并将文库制备总时间缩短至90分钟。 快速、灵活的文库制备工作流程,可适应各种样本类型和DNA起始量,可用于从人类到微生物全基因组测序等各种应用。  低起始量研究方法,可提供较高的基因组覆盖度质量,减少偏差。
手动操作时间 4小时 约45分钟 1-1.5小时 约4小时
起始量 1 ug DNA 25-300 ng 1-500 ng DNA用于小型基因组(例如微生物),或100-500 ng DNA用于大型基因组(例如人类)。(对于血液和唾液样本,请参阅参考指南)。 100 ng基因组DNA
系统 MiSeq 系统, NextSeq 550系统, NextSeq 2000系统, NextSeq 1000系统, 研究模式下的MiSeqDx, MiniSeq基因测序仪, NovaSeq X基因测序仪, NextSeq 500系统, NovaSeq 6000系统, NovaSeq X Plus基因测序仪 MiSeq 系统, NextSeq 550系统, NextSeq 2000系统, NextSeq 1000系统, 研究模式下的MiSeqDx, 研究模式下的NextSeq 550Dx, NovaSeq X基因测序仪, NextSeq 500系统, NovaSeq 6000系统, NovaSeq X Plus基因测序仪 MiSeq 系统, iSeq 100系统, NextSeq 550系统, NextSeq 2000系统, NextSeq 1000系统, 研究模式下的MiSeqDx, MiniSeq基因测序仪, 研究模式下的NextSeq 550Dx, NovaSeq X基因测序仪, NovaSeq 6000系统, NovaSeq X Plus基因测序仪 MiSeq 系统, NextSeq 550系统, NextSeq 2000系统, 研究模式下的MiSeqDx, MiniSeq基因测序仪, NovaSeq X基因测序仪, NextSeq 500系统, NovaSeq 6000系统, NovaSeq X Plus基因测序仪
作用机制 机械DNA片段化和接头连接。工作流程无PCR且无凝胶。 链接磁珠转座酶 链接磁珠转座酶 机械DNA片段化和接头连接。工作流程采用降低偏向性的PCR,无凝胶。
方法 通过测序进行基因分型, 全基因组测序, 鸟枪法测序 全基因组测序, 从头测序 扩增子测序, 全基因组测序, 从头测序, 鸟枪法测序 通过测序进行基因分型, 全基因组测序, 鸟枪法测序
多重分析 多达24个单标签、96个组合(CD)双标签、24个唯一双标签以及96个唯一双(UD)标签组合 高达384重 多达384个唯一双(UD)标签组合和96个组合(CD)双标签组合 多达24个单标签、96个组合(CD)双标签、24个唯一双标签以及96个唯一双(UD)标签组合
核酸类型 DNA DNA DNA DNA
特殊的样本类型 不兼容FFPE 血液, 不兼容FFPE, 低起始量样本, 唾液, 不兼容FFPE 血液, 不兼容FFPE, 唾液 不兼容FFPE, 低起始量样本
物种 其他, 哺乳动物, 小鼠, 人, 大鼠, 植物 任意, 人 果蝇, 任意, 哺乳动物, 小鼠, 酵母, 斑马鱼, 人, 大鼠, 植物, 病毒, 线虫, 细菌 其他, 哺乳动物, 小鼠, 人, 大鼠, 植物
物种详情 与大多数大型DNA基因组兼容。 与任何物种兼容 与大多数大型DNA基因组兼容。
目标插入片段大小 350 bp或550 bp 450 bp +/- 75 bp ~350 bp 350 bp或550 bp
技术 Illumina测序 Illumina测序 Illumina测序 Illumina测序
变异类别 单核苷酸多态性(SNP), 基因融合, 杂合性缺失(LOH), 体细胞变异, 染色体异常, 生殖系变异, 结构变异, 插入缺失(indel), 拷贝数变异(CNV) 短串联重复序列(STR), 单核苷酸多态性(SNP), 体细胞变异, 染色体异常, 生殖系变异, 结构变异, 插入缺失(indel), 拷贝数变异(CNV) 单核苷酸多态性(SNP), 基因融合, 杂合性缺失(LOH), 体细胞变异, 染色体异常, 生殖系变异, 结构变异, 插入缺失(indel), 拷贝数变异(CNV) 单核苷酸多态性(SNP), 基因融合, 杂合性缺失(LOH), 体细胞变异, 染色体异常, 生殖系变异, 结构变异, 插入缺失(indel), 拷贝数变异(CNV)

选择工具:

文库制备 (2)

TruSeq DNA PCR-Free Low Throughput Library Prep Kit(24样本)

20015962

包含用于制备24个文库的试剂和样本纯化磁珠。单独购买标签接头。

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TruSeq DNA PCR-Free High Throughput Library Prep Kit(96样本)

20015963

包含用于制备24个文库的试剂和样本纯化磁珠。单独购买标签接头。

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标签接头 (1)

IDT for Illumina – TruSeq DNA UD Indexes v2(96标签,96样本)

20040870

包含96、8 bp标签,足以标记96个样本,与TruSeq Nano和TruSeq PCR-Free Library Prep Kit兼容。版本 2 包含板 20022370 中 192 个标签寡核苷酸中 8 个的改进,其余 184 个未作更改。单独购买文库制备和探针panel。

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产品

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NovaSeq X系列

将先进的化学、光学和信息学技术相结合,实现了超凡的速度和数据质量、出色的通量和可扩展性。

MiSeq v3试剂盒

与早期版本相比,优化的试剂盒可增加簇密度和读长,从而提高测序质量分值。

TruSight Oncology 500

使用涵盖所有主要变异类别以及来自FFPE组织的基因特征(TMB、MSI和HRD)的大型泛癌panel实现CGP。

Illumina DNA Prep

快速、集成的文库制备工作流程,适用于各种测序应用。

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