Illumina DNA PCR-Free Prep已上市。该文库制备试剂盒的性能与TruSeq DNA PCR-Free相当,同时还能缩短周转时间和手动操作时间。
TruSeq DNA PCR-Free可为全基因组测序应用提供简单、全面的文库制备。 研究人员可对多种生物进行测序,从诸如细菌的小型基因组到人类全基因组。 其工作流程可:
TruSeq DNA PCR-Free可有效覆盖原本难以测序的区域,例如高GC区域、启动子和重复区域。
该工作流程可调,适用于多种读长,支持用于所有Illumina测序仪器。这使得研究人员可以根据实验需要调整每次运行。
无PCR意味着文库偏向和缺口减少。 结果得到基因组高质量的数据,实现最佳的变异检测。卓越的基因组覆盖质量意味着结果中缺口极少,高GC区域覆盖度高。
去除PCR节约了时间,并消除了与PCR步骤相关的基因组覆盖偏向。 基于微珠的大小选择缩短了工作流程。 TruSeq DNA PCR-Free与Illumina测序系统串联,多方位改进了广泛使用的文库制备工作流程。
快速、自动化友好的工作流程
在不到一天的时间内准备好Illumina测序库。Illumina合格方法可通过我们的 合作伙伴在一系列自动化平台上使用。
仪器 | 推荐的样本数 | 读长 |
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NextSeq 550 System | 每次运行1个样本(基于30倍的人类基因组覆盖度) | 350 bp插入片段:≤ 2 × 100 bp 550 bp插入片段: ≤ 2 × 150 bp |
HiSeq 2500 System | 每次运行2–10个样本(双流动槽;基于30倍的人类基因组覆盖度) | 350 bp插入片段: ≤ 2 × 100 bp (快速运行) 550 bp插入片段: ≤ 2 × 250 bp (快速运行) 350 bp插入片段: ≤ 2 × 100 bp (高通量) 550 bp插入片段: ≤ 2 × 125 bp (高通量) |
NovaSeq 6000 System | 每次运行的样本(双流动槽):S1: 8, S2: 16, S4: 48 (基于30倍的人类基因组覆盖度) | 350 bp插入片段: ≤ 2 × 150 bp 550 bp插入片段: ≤ 2 × 150 bp |
TruSeq DNA PCR-Free | Illumina DNA PCR-Free Prep | TruSeq DNA Nano | |
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作用机制 | 机械DNA片段化和接头连接。 工作流程采用降低偏向性的PCR,无凝胶。 | 连接磁珠的转座酶 | 机械DNA片段化和接头连接。 工作流程采用降低偏向性的PCR,无凝胶。 |
分析时间 | 5小时的总分析时间 | 约1.5小时 | 约6小时的总分析时间 |
多重分析 | 多达24个单标签、96个组合(CD)双标签、24个唯一双标签以及96个唯一双(UD)标签组合 | 多达384重 | 多达24个单标签、96个组合(CD)双标签、24个唯一双标签以及96个唯一双(UD)标签组合 |
手动操作时间 | 4小时 | 约45分钟 | 约4小时 |
方法 | 基于测序的基因分型, 鸟枪法测序, 全基因组测序 | De Novo Sequencing, 全基因组测序 | 基于测序的基因分型, 鸟枪法测序, 全基因组测序 |
物种类别 | 其它, 植物, 哺乳动物, 大鼠, 小鼠, 人类 | 任何物种, 人类 | 其它, 植物, 哺乳动物, 大鼠, 小鼠, 人类 |
物种详情 | 与大多数大型DNA基因组兼容。 | 与大多数大型DNA基因组兼容。 | |
特殊的样本类型 | 不兼容FFPE | 唾液, Not FFPE-Compatible, 低起始量样本, 血液 | 低起始量样本, 不兼容FFPE |
目标插入片段大小 | 350 bp或550 bp | 450 bp +/- 75 bp | 350 bp或550 bp |
自动化功能 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 |
起始量 | 1 ug DNA | 25 ng to 300 ng | 100 ng基因组DNA |
Data Sheet | PDF | 5 versions
Mechanical DNA Fragmentation with the Q800R2 Sonicator
Technical Note | PDF 4 MB
Comparison of TruSeq Sample Preparation Kits
Technical Note | PDF < 1 MB
TruSeq DNA PCR-Free Library Prep User-Supplied Consumables and Equipment Documentation
TruSeq DNA PCR-Free Reference Guide Documentation
TruSeq DNA PCR-Free Consumables & Equipment Documentation
TruSeq HT Dual Index Quick Reference Card Documentation
Illumina Experiment Manager User Guide Documentation
TruSeq DNA PCR-Free Checklist Documentation
TruSeq DNA PCR-Free Library Prep Checklist Documentation
自定义协议选择器
Generates customized, end-to-end instructions