
NovaSeq X系列
将先进的化学、光学和信息学技术相结合,实现了超凡的速度和数据质量、出色的通量和可扩展性。
从mRNA制备测序文库,获得清晰的编码转录组视图以及链特异性信息。
分析时间
手动操作时间
起始量
TruSeq Stranded mRNA为编码转录组分析提供了经济的一体化可扩展解决方案,可兼容多种样本。
可精确测量mRNA链方向,用于检测反义转录、增强转录本注释和提高比对效率。高覆盖度均一性让诸如替代转录物、基因融合和等位基因特异性表达的发现变得更为容易。
通过链的信息来鉴别给定RNA转录本是由两条DNA链中哪一条衍生而来的。该信息提高了转录本注释的可信度,特别是对于非人类样本。鉴别链的起源增加了比对read的百分比,降低了每个样本的测序成本。
工作流程能够可靠分析标准和低质量样本,且兼容多种研究设计。
分析时间 | 约10.5小时 |
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自动化功能 | 液体处理机器人 |
自动化详情 | 探索可用的自动化方法 |
内容说明 | 捕获编码转录组(带链信息) |
说明 | 为研究人员提供清晰、全面的编码转录组视图以及精确的链信息。 |
手动操作时间 | 约4.5小时 |
起始量 | 0.1–1 ug 总RNA或10 - 100 ng先前分离的mRNA(来自带polyA尾巴的种系) |
系统 | MiSeq 系统, NextSeq 550系统, NextSeq 2000系统, NextSeq 1000系统, NovaSeq X基因测序仪, NextSeq 500系统, NovaSeq 6000系统, NovaSeq X Plus基因测序仪 |
作用机制 | 寡核苷酸-dT微珠捕获polyA尾巴 |
方法 | mRNA测序 |
多重分析 | 1–96 |
核酸类型 | RNA |
特殊的样本类型 | 不兼容FFPE |
物种 | 哺乳动物, 牛, 小鼠, 人, 大鼠 |
物种详情 | 适用于来自任何带polyA尾巴的种系的高质量RNA |
链特异性 | 链状 |
技术 | Illumina测序 |
变异类别 | 单核苷酸多态性(SNP), 基因融合, 新型转录本, 转录本变异 |
Illumina现提供模块化产品的预订,让您的工作流程变得灵活。您可以订购具有以下任何标签的以下任何文库制备产品。
仪器 | Recommended number of samples | Read length |
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NextSeq 550 System | RNA分析:每次运行13-40个样本(基于每个样本1000万条read) |
2×75 bp |
NovaSeq 6000 System | RNA分析(每次运行的样本数,双流动槽):S1:320,S2:384,S4:768。受标签组合的限制(双重)。基于1000万条read。 |
≤ 2 × 100 bp |
西奈山伊坎医学院的研究人员正在研究mtDNA、piRNA和TCR谱系多样性,以揭开癌症、不孕症和自体免疫性疾病的秘密。
RNA-Seq和HLA分型可提高靶点发现平台的性能和效率。
TruSeq Stranded mRNA | Illumina Stranded mRNA Prep | Illumina RNA Prep with Enrichment | |||
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分析时间 | 约10.5小时 | 6.5小时 | <9小时 | ||
自动化功能 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 | ||
自动化详情 | 探索可用的自动化方法 | 探索可用的自动化方法 | |||
内容说明 | 捕获编码转录组(带链信息) | 捕获编码转录组(带链信息) | 与Illumina Exome Panel一起使用时可捕获编码转录组 | ||
说明 | 为研究人员提供清晰、全面的编码转录组视图以及精确的链信息。 | 简单、经济的编码转录组分析解决方案,可提供精确的链信息 | 一种可重现且经济的解决方案,可使用多种类型的样本和起始材料来检测和发现目标转录本,包括福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)组织和其他低质量样本 | ||
手动操作时间 | 约4.5小时 | <3小时 | < 2小时 | ||
起始量 | 0.1–1 ug 总RNA或10 - 100 ng先前分离的mRNA(来自带polyA尾巴的种系) | 25-1000 ng标准质量的总RNA | 10 ng RNA;20 ng FFPE RNA | ||
系统 | MiSeq 系统, NextSeq 550系统, NextSeq 2000系统, NextSeq 1000系统, NovaSeq X基因测序仪, NextSeq 500系统, NovaSeq 6000系统, NovaSeq X Plus基因测序仪 | NextSeq 550系统, NextSeq 2000系统, NextSeq 1000系统, NovaSeq X基因测序仪, NextSeq 500系统, NovaSeq 6000系统, NovaSeq X Plus基因测序仪 | MiSeq 系统, iSeq 100系统, NextSeq 550系统, NextSeq 2000系统, NextSeq 1000系统, MiniSeq基因测序仪, NovaSeq 6000系统 | ||
作用机制 | 寡核苷酸-dT微珠捕获polyA尾巴 | PolyA捕获,连接接头和标签 | 链接磁珠转座酶 | ||
方法 | mRNA测序 | mRNA测序 | mRNA测序, 靶向RNA测序, 靶向富集 | ||
多重分析 | 1–96 | 多达384个唯一双标签(UDI) | 多达384个唯一双标签(UDI) | ||
核酸类型 | RNA | RNA | RNA | ||
特殊的样本类型 | 不兼容FFPE | 不兼容FFPE, 低起始量样本 | 血液, 低起始量样本, FFPE组织 | ||
物种 | 哺乳动物, 牛, 小鼠, 人, 大鼠 | 哺乳动物, 牛, 小鼠, 人, 大鼠 | 人, 病毒 | ||
物种详情 | 适用于来自任何带polyA尾巴的种系的高质量RNA | 适用于来自任何带polyA尾巴的种系的高质量RNA | |||
链特异性 | 链状 | 链状 | 非链 | ||
技术 | Illumina测序 | Illumina测序 | Illumina测序 | ||
变异类别 | 单核苷酸多态性(SNP), 基因融合, 新型转录本, 转录本变异 | 单核苷酸多态性(SNP), 基因融合, 新型转录本, 转录本变异 | 单核苷酸多态性(SNP), 基因融合, 新型转录本, 转录本变异 |
根据您的起始材料和感兴趣的方法,确定能够满足您需求的最佳文库制备试剂盒或芯片。
技术平行分析
FFPE组织的技术平行分析显示出高度的一致性,表明文库制备的性能稳定。轴为log2(FPKM)。显示 R2 值。
TruSeq® Stranded mRNA Library Prep(48样本)
20020594
包括用于前期polyA捕获步骤的RNA纯化磁珠、用于将mRNA转录成cDNA的PCR预混液,以及用于制备48个样本的试剂。单独购买标签接头。PolyA捕获步骤后需要纯化磁珠,并单独出售。
TruSeq Stranded mRNA Library Prep(96样本)
20020595
包括用于前期polyA捕获步骤的RNA纯化磁珠、用于将mRNA转录为cDNA的PCR预混液,以及用于制备48个样本的试剂。单独购买标签接头。PolyA捕获步骤后需要纯化磁珠,并单独出售。
TruSeq RNA Single Indexes Set A(12标签,48样本)
20020492
包括24个标签中的12个(标签:2、4、5、6、7、12、13、14、15、16、18、19),用于制备48个单独的RNA样本。
TruSeq RNA Single Indexes Set B(12标签,48样本)
20020493
包括24个标签中的12个(标签:1、3、8、9、10、11、20、21、22、23、25、27),用于制备48个单独的RNA样本。
TruSeq RNA CD Index Plate(96标签,96样本)
20019792
TruSeq Stranded RNA HT Kit 96样本接头孔板盒
IDT for Illumina – TruSeq RNA UD Indexes v2(96标签,96样本)
20040871
包含96、8 bp标签,足以标记96个样本,与TruSeq Stranded mRNA和TruSeq Stranded Total RNA Library Prep Kit兼容。版本 2 包含板 20022371 中 192 个标签寡核苷酸中 8 个的改进,其余 184 个未作更改。单独购买文库制备和探针panel。
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