以前名为TruSeq Stranded mRNA Library Prep Kit的产品(货号RS-122-2101、RS-122-2102和RS-122-2103)现更名为TruSeq Stranded mRNA。该产品的配置已更改。在新的配置中,文库制备试剂和标签接头均可单独购买。可单独购买的组件列表可在“选择产品”部分中找到。
TruSeq Stranded mRNA为编码转录组分析提供了经济的一体化可扩展解决方案,可兼容多种样本。
可精确测量mRNA链方向,用于检测反义转录、增强转录本注释和提高比对效率。高覆盖度均一性让诸如替代转录物、基因融合和等位基因特异性表达的发现变得更为容易。
通过链的信息来鉴别给定RNA转录本是由两条DNA链中哪一条衍生而来的。该信息提高了转录本注释的可信度,特别是对于非人类样本。鉴别链的起源增加了比对read的百分比,降低了每个样本的测序成本。
工作流程能够可靠分析标准和低质量样本,且兼容多种研究设计。
快速、自动化友好的工作流程
在不到一天的时间内准备好Illumina测序库。Illumina合格方法可通过我们的 合作伙伴在一系列自动化平台上使用。
仪器 | 推荐的样本数 | 读长 |
---|---|---|
NextSeq 550 System | RNA分析:每次运行13–40个样本(基于每个样本1000万条read) 转录组分析:每次运行5–16个样本(基于每个样本2500万条read) |
2 x 75 bp 2 x 75 bp |
NovaSeq 6000 System | RNA分析(每次运行的样本,双流动槽):S1:320,S2:384,S4:768。受标签组合的限制(双重)。基于1000万条read。 转录组分析(每次运行的样本,双流动槽):S1:128,S2:256,S4:768。受标签组合的限制(双重)。基于2500万条read。 |
≤ 2 × 100 bp ≤ 2 × 100 bp |
TruSeq Stranded mRNA | Illumina Stranded mRNA Prep | Illumina RNA Prep with Enrichment | |
---|---|---|---|
作用机制 | 寡核苷酸-dT微珠捕获polyA尾巴 | PolyA捕获,连接接头和标签 | 连接磁珠的转座酶 |
内容说明 | 捕获编码转录组(带链信息) | 捕获编码转录组(带链信息) | 与Illumina Exome Panel一起使用时可捕获编码转录组 |
分析时间 | 约10.5小时 | 6.5小时 | <9小时 |
多重分析 | 1–96 | 多达384个唯一双标签序列(UDI) | 多达384个唯一双标签序列(UDI) |
手动操作时间 | 约4.5小时 | <3小时 | <2小时 |
方法 | mRNA测序 | mRNA测序 | mRNA测序, 靶向RNA测序, 靶向富集 |
物种详情 | 适用于来自任何带polyA尾巴的种系的高质量RNA | Works with high-quality RNA from any species with polyA tails | 兼容的物种取决于所使用的panel |
特殊的样本类型 | 不兼容FFPE | Not FFPE-Compatible, 低起始量样本 | 低起始量样本, 血液, FFPE组织 |
自动化功能 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 |
说明 | 简单、经济的编码转录组分析解决方案,可提供精确的链信息 | 简单、经济的编码转录组分析解决方案,可提供精确的链信息 | 一种可重现且经济的解决方案,可使用多种类型的样本和起始材料来检测和发现目标转录本,包括福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)组织和其他低质量样本 |
起始量 | 0.1–1 ug 总RNA或10 - 100 ng先前分离的mRNA(来自带polyA尾巴的种系) | 25-1000 ng标准质量的总RNA | 10 ng新鲜/冷冻样本来源的总RNA,或20 ng FFPE样本来源的总RNA |
链特异性 | 链状 | 链状 | 非链状 |
以前名为TruSeq Stranded mRNA Library Prep Kit的产品(货号RS-122-2101、RS-122-2102和RS-122-2103)现更名为TruSeq Stranded mRNA。该产品的配置已更改。在新的配置中,文库制备试剂和标签接头均可单独购买。可单独购买的组件列表可在“选择产品”部分中找到。
Robust low-input RNA sequencing with TruSeq Stranded Total RNA Library Prep Gold
Application Note | HTML
Data Sheet | PDF | 5 versions
TruSeq Stranded mRNA Checklist Documentation
TruSeq Stranded mRNA Documentation
TruSeq Stranded mRNA Consumables & Equipment Documentation
TruSeq Stranded mRNA Reference Guide Documentation
自定义协议选择器
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