以前名为TruSeq Stranded mRNA Library Prep Kit的产品(货号RS-122-2101、RS-122-2102和RS-122-2103)现更名为TruSeq Stranded mRNA。该产品的配置已更改。在新的配置中,文库制备试剂和标签接头均可单独购买。可单独购买的组件列表可在“选择产品”部分中找到。

TruSeq Stranded mRNA

从mRNA制备测序文库,获得清晰的编码转录组视图以及链特异性信息。 阅读更多...
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Library Prep

TruSeq® Stranded mRNA Library Prep(48样本)

20020594

TruSeq Stranded mRNA Library Prep(96样本)

20020595


Index Adapters

TruSeq RNA Single Indexes Set A(12标签,48样本)

20020492

TruSeq RNA Single Indexes Set B(12标签,48样本)

20020493

TruSeq RNA CD Index Plate(96标签,96样本)

20019792

IDT for Illumina – TruSeq RNA UD Indexes(96标签,96样本)

20022371

产品特色

TruSeq Stranded mRNA为编码转录组分析提供了经济的一体化可扩展解决方案,可兼容多种样本。

链方向检测

可精确测量mRNA链方向,用于检测反义转录、增强转录本注释和提高比对效率。高覆盖度均一性让诸如替代转录物、基因融合和等位基因特异性表达的发现变得更为容易。

性价比高

通过链的信息来鉴别给定RNA转录本是由两条DNA链中哪一条衍生而来的。该信息提高了转录本注释的可信度,特别是对于非人类样本。鉴别链的起源增加了比对read的百分比,降低了每个样本的测序成本。

可扩展

工作流程能够可靠分析标准和低质量样本,且兼容多种研究设计。

快速、自动化友好的工作流程
在不到一天的时间内准备好Illumina测序库。Illumina合格方法可通过我们的 合作伙伴在一系列自动化平台上使用。

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经常一并购买

规格

计划推荐

仪器 推荐的样本数 读长
NextSeq 550 System RNA分析:每次运行13–40个样本(基于每个样本1000万条read)
转录组分析:每次运行5–16个样本(基于每个样本2500万条read)
2 x 75 bp
2 x 75 bp
NovaSeq 6000 System RNA分析(每次运行的样本,双流动槽):S1:320,S2:384,S4:768。受标签组合的限制(双重)。基于1000万条read。
转录组分析(每次运行的样本,双流动槽):S1:128,S2:256,S4:768。受标签组合的限制(双重)。基于2500万条read。 
≤ 2 × 100 bp
≤ 2 × 100 bp

产品比较

TruSeq Stranded mRNA Illumina Stranded mRNA Prep Illumina RNA Prep with Enrichment
作用机制 寡核苷酸-dT微珠捕获polyA尾巴 PolyA捕获,连接接头和标签 连接磁珠的转座酶
内容说明 捕获编码转录组(带链信息) 捕获编码转录组(带链信息) 与Illumina Exome Panel一起使用时可捕获编码转录组
分析时间 约10.5小时 6.5小时 <9小时
多重分析 1–96 多达384个唯一双标签序列(UDI) 多达384个唯一双标签序列(UDI)
手动操作时间 约4.5小时 <3小时 <2小时
方法 mRNA测序 mRNA测序 mRNA测序, 靶向RNA测序, 靶向富集
物种详情 适用于来自任何带polyA尾巴的种系的高质量RNA Works with high-quality RNA from any species with polyA tails 兼容的物种取决于所使用的panel
特殊的样本类型 不兼容FFPE Not FFPE-Compatible, 低起始量样本 低起始量样本, 血液, FFPE组织
自动化功能 液体处理机器人 液体处理机器人 液体处理机器人
说明 简单、经济的编码转录组分析解决方案,可提供精确的链信息 简单、经济的编码转录组分析解决方案,可提供精确的链信息 一种可重现且经济的解决方案,可使用多种类型的样本和起始材料来检测和发现目标转录本,包括福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)组织和其他低质量样本
起始量 0.1–1 ug 总RNA或10 - 100 ng先前分离的mRNA(来自带polyA尾巴的种系) 25-1000 ng标准质量的总RNA 10 ng新鲜/冷冻样本来源的总RNA,或20 ng FFPE样本来源的总RNA
链特异性 链状 链状 非链状

以前名为TruSeq Stranded mRNA Library Prep Kit的产品(货号RS-122-2101、RS-122-2102和RS-122-2103)现更名为TruSeq Stranded mRNA。该产品的配置已更改。在新的配置中,文库制备试剂和标签接头均可单独购买。可单独购买的组件列表可在“选择产品”部分中找到。

具体的方法工作流程范例

 

客户案例

NextSeq® 500系统助力揭示疾病机理

西奈山伊坎医学院的研究人员正在研究mtDNA、piRNA和TCR谱系多样性,以揭开癌症、不孕症和自体免疫性疾病的秘密。

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使用肿瘤特异性HLA配体的精准免疫疗法

RNA-Seq和HLA分型可提高靶点发现平台的性能和效率。

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支持数据和图像

技术平行分析
支持数据和图像

图2来自TruSeq Stranded mRNA and Total RNA Library Prep Kit数据表,2015年12月

FFPE组织的技术平行分析显示出高度的一致性,表明文库制备的性能稳定。轴为log2(FPKM)。R2值如图所示。

 

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为FFPE组织及其他低质量样本的RNA测序提供的可重现且经济的解决方案。只需10 ng的总RNA即可保证精确度。


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TruSeq Stranded Total RNA with Ribo-Zero Globin

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