TruSeq Stranded mRNA
从mRNA制备测序文库，获得清晰的编码转录组视图以及链特异性信息。
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以前名为TruSeq Stranded mRNA Library Prep Kit的产品（货号RS-122-2101、RS-122-2102和RS-122-2103）现更名为TruSeq Stranded mRNA。该产品的配置已更改。在新的配置中，文库制备试剂和标签接头均可单独购买。可单独购买的组件列表可在“选择产品”部分中找到。
TruSeq Stranded mRNA为编码转录组分析提供了经济的一体化可扩展解决方案，可兼容多种样本。
可精确测量mRNA链方向，用于检测反义转录、增强转录本注释和提高比对效率。高覆盖度均一性让诸如替代转录物、基因融合和等位基因特异性表达的发现变得更为容易。
通过链的信息来鉴别给定RNA转录本是由两条DNA链中哪一条衍生而来的。该信息提高了转录本注释的可信度，特别是对于非人类样本。鉴别链的起源增加了比对read的百分比，降低了每个样本的测序成本。
工作流程能够可靠分析标准和低质量样本，且兼容多种研究设计。
快速、自动化友好的工作流程
在不到一天的时间内准备好Illumina测序库。Illumina合格方法可通过我们的 合作伙伴在一系列自动化平台上使用。
| 仪器 | 推荐的样本数 | 读长 |
|---|---|---|
| NextSeq 550 System | RNA Profiling: 13–40 samples per run (based on 10 million reads per sample) Transcriptome Analysis: 5–16 samples per run (based on 25 million reads per sample) |
2 x 75 bp 2 x 75 bp |
| HiSeq 2500 System | RNA Profiling: 60–400 samples per run (dual flow cell; based on 10 million reads per sample) Transcriptome Analysis: 24–160 samples per run (dual flow cell; based on 25 million reads per sample) |
2 x 75 bp 2 x 75 bp |
| NovaSeq 6000 System | RNA Profiling (samples per run, dual flow cell): S1: 320, S2:384, S4:768. Limited by index combinations (dual). Based on 10 million reads. Transcriptome Analysis (samples per run, dual flow cell): S1: 128, S2: 256, S4: 768. Limited by index combinations (dual). Based on 25 million reads. |
≤ 2 × 100 bp ≤ 2 × 100 bp |
| TruSeq Stranded mRNA | Illumina Stranded mRNA Prep | Illumina RNA Prep with Enrichment | |
|---|---|---|---|
| 作用机制 | 寡核苷酸-dT微珠捕获polyA尾巴 | PolyA捕获，连接接头和标签 | 连接磁珠的转座酶 |
| 内容说明 | Captures the coding transcriptome with strand information | 捕获编码转录组（带链信息） | 与Illumina Exome Panel一起使用时可捕获编码转录组 |
| 分析时间 | 约10.5小时 | 6.5小时 | ＜9小时 |
| 多重分析 | 1–96 | 多达384个唯一双标签序列（UDI） | 多达384个唯一双标签序列（UDI） |
| 手动操作时间 | 约4.5小时 | ＜3小时 | ＜2小时 |
| 方法 | mRNA测序 | mRNA测序 | mRNA测序, 靶向RNA测序, 靶向富集 |
| 物种详情 | 适用于来自任何带polyA尾巴的种系的高质量RNA | Works with high-quality RNA from any species with polyA tails | 兼容的物种取决于所使用的panel |
| 特殊的样本类型 | 不兼容FFPE | Not FFPE-Compatible, 低起始量样本 | 低起始量样本, 血液, FFPE组织 |
| 自动化功能 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 |
| 说明 | 简单、经济的编码转录组分析解决方案，可提供精确的链信息 | 简单、经济的编码转录组分析解决方案，可提供精确的链信息 | 一种可重现且经济的解决方案，可使用多种类型的样本和起始材料来检测和发现目标转录本，包括福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）组织和其他低质量样本 |
| 起始量 | 0.1 – 1 ug total RNA or 10 - 100 ng previously isolated mRNA (from species with polyA tails) | 25-1000 ng标准质量的总RNA | 10 ng新鲜/冷冻样本来源的总RNA，或20 ng FFPE样本来源的总RNA |
| 链特异性 | 链状 | 链状 | 非链状 |
The product previously known as the TruSeq Stranded mRNA Library Prep Kit (Cat. No. RS-122-2101, RS-122-2102, and RS-122-2103) is now called TruSeq Stranded mRNA. The product configuration has changed. In the new configuration, the library preparation and index adapters can be purchased separately. The list of components available for individual purchase can be found in the “Select Product(s)” section.
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图2来自TruSeq Stranded mRNA and Total RNA Library Prep Kit数据表，2015年12月
FFPE组织的技术平行分析显示出高度的一致性，表明文库制备的性能稳定。轴为log2(FPKM)。R2值如图所示。
Robust low-input RNA sequencing with TruSeq Stranded Total RNA Library Prep Gold
Application Note | HTML
Data Sheet | PDF | 5 versions
TruSeq Stranded mRNA Checklist Documentation
TruSeq Stranded mRNA Documentation
TruSeq Stranded mRNA Consumables & Equipment Documentation
TruSeq Stranded mRNA Reference Guide Documentation
自定义协议选择器
Generates customized, end-to-end instructions
采用高效率的工作流程从血液来源RNA制备全转录组测序文库，在单个步骤内即可除去核糖体RNA和球蛋白mRNA。
此产品及其使用受Max Planck Gesellschaft所拥有且独家授权给New England Biolabs, Inc.并再授权给Illumina, Inc.的一个或多个已公告和/或待批准的美国和外国专利申请的约束。向Illumina, Inc.、其关联机构或其授权经销商和分销商购买此产品，即向买方转让使用买方所购数量产品和产品组件的权利（不论买方是学术性还是盈利性实体），该权利不可转让。购买此产品并不会转让前述专利或专利申请中针对产品生产的任何权利要求项下的许可。买方不得向第三方出售或以其他方式转让此产品及其组件，亦不得以其他方式将此产品用于下商业用途：（1）在生产中使用此产品或其组件；或（2）出于治疗或预防疾病的目的，在人或动物身上使用此产品或其组件。
