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靶向RNA测序

靶向RNA测序简介

靶向RNA测序(RNA-Seq)是一种高度准确的方法,可选择并测序感兴趣的特定转录本。它能同时提供定量和定性信息。靶向RNA-Seq可通过富集或基于扩增子的方法实现,二者都能分析一组目标基因的表达。富集检测也能在福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)组织等许多样本类型中检测已知和新的基因融合伴侣。

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靶向富集RNA-Seq的优势

RNA富集能提供定量表达信息以及小变异和基因融合的检测。RNA富集具有以下特点:

  • 兼容困难的样本,例如FFPE组织
  • 低起始量(仅需10 ng总RNA或20–100 ng FFPE RNA)
  • 同时检测已知和新的基因融合伴侣
  • 用广泛的动态范围分析基因表达

靶向扩增子RNA-Seq的优势

RNA表达panel可设计为专注于目标RNA序列,也可以向完全优化并经过实验验证的panel添加定制内容。

  • 提供测量感兴趣转录本的高精度的特定方法
  • 提供定性和定量信息用于差异表达分析、等位基因特异性表达测量和基因融合验证
  • 同时测定数十个至数千个靶标
  • 兼容低质量或来自FFPE的RNA样本
儿童白血病中有关癌症通路的最新报道

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靶向RNA-Seq工作流程

Illumina边合成边测序(SBS)技术是最广泛采用的NGS技术,产生了全世界约90%的测序数据。*

Illumina提供了集成的靶向RNA-Seq工作流程,简化了从文库制备到数据分析和生物解读的整个过程。

基因panel和芯片查找工具

确定针对您感兴趣的基因的测序panel和芯片。用基因搜索panel,或用基因组位置、变异ID或物种查找基因分型芯片。

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基因panel和芯片查找工具

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*根据Illumina公司2015年存档数据计算