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靶向RNA测序

靶向RNA测序简介

靶向RNA测序(RNA-Seq)是一种高度准确的方法,可选择并测序感兴趣的特定转录本。它能同时提供定量和定性信息。靶向RNA-Seq可通过富集或基于扩增子的方法实现,二者都能分析一组目标基因的表达。富集检测也能在福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)组织等许多样本类型中检测已知和新的基因融合伴侣。

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靶向富集RNA-Seq的优势

RNA富集能提供定量表达信息以及小变异和基因融合的检测。RNA富集具有以下特点:

  • 兼容困难的样本,例如FFPE组织
  • 低起始量(仅需10 ng总RNA或20–100 ng FFPE RNA)
  • 同时检测已知和新的基因融合伴侣
  • 用广泛的动态范围分析基因表达

靶向扩增子RNA-Seq的优势

RNA表达panel可设计为专注于目标RNA序列,也可以向完全优化并经过实验验证的panel添加定制内容。

  • 提供测量感兴趣转录本的高精度的特定方法
  • 提供定性和定量信息用于差异表达分析、等位基因特异性表达测量和基因融合验证
  • 同时测定数十个至数千个靶标
  • 兼容低质量或来自FFPE的RNA样本
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靶向RNA-Seq工作流程

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Illumina提供了集成的靶向RNA-Seq工作流程,简化了从文库制备到数据分析和生物解读的整个过程。

Gene Panel and Array Finder

Identify sequencing panels or microarrays that target your genes of interest. Search panels by gene, or find genotyping arrays by genomic location, variant ID, or species.

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*根据Illumina公司2015年存档数据计算