检测癌症转录组中的变化

RNA-Seq提供了关于癌症基因表达以及推动肿瘤进展的基因融合的功能信息

癌症RNA测序

利用癌症RNA测序(RNA-Seq)监测基因表达和转录组变化有助于了解肿瘤的分类和进展。癌症积累了许多遗传变化,但通常只有少数变化会推动肿瘤进展。癌症RNA-Seq有助于确定哪些变异在癌症样本中有表达。

肿瘤学

对编码区或整个癌症转录组进行测序可以提供有关肿瘤基因表达变化的重要信息。癌症RNA-Seq能够检测链特异性信息,这是基因调控的重要组成部分。癌症转录组测序能同时捕获编码R和非编码RNA,并为完整的表达动态视图提供链方向。

深入了解RNA-Seq

靶向RNA扩增子测序能分析特定癌症基因的表达。预设计的癌症基因表达panel专注于p53和NFκB等相关通路。研究人员可以添加定制内容来扩大实验范围。

深入了解靶向RNA-Seq

癌症RNA-Seq研究案例

用于精准肿瘤学研究的癌症RNA-Seq
用于精准肿瘤学研究的癌症RNA-Seq

Avera Health的临床研究人员借助新一代测序揭示了多药物敏感性致瘤通路。

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揭示长链非编码RNA在癌症中的作用
揭示长链非编码RNA在癌症中的作用

研究人员正在使用RNA-Seq来揭示如何利用lncRNA来识别、测量和治疗癌症。

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Exploring the Genetic Basis of Oral Cancer
Exploring the Genetic Basis of Oral Cancer

Researchers in India are using RNA-Seq and other methods to study variants that may influence a deadly oral cancer.

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缺失或扩增的miRNA位点所在的基因组区域已经与多种形式的癌症相关联。小RNA-Seq可以发现和分析癌症转录组中存在的miRNA和其他非编码小RNA。

深入了解小RNA-Seq

福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)肿瘤样本中可能包含有关癌症发病机理和结果的重要信息。FFPE样本中通常含有部分降解的RNA,因此,对其进行癌症RNA-Seq可能会面临挑战。新一代RNA-Seq方法能让研究人员获得这些重要数据,并从降解的RNA和FFPE来源的RNA中获得高质量结果。

深入了解FFPE RNA-Seq

Illumina为癌症RNA-Seq提供了多种文库制备、测序和数据分析选项。一体化的文库制备工作流程和灵活的试剂盒配置适合多种研究设计。Illumina系统提供业界领先的数据质量——事实上,全世界约90%的测序数据是用Illumina边合成边测序(SBS)技术产生的。

BaseSpace Sequence Hub中的一键式应用软件简化了数据分析,这样,您就可以减少花在数据分析上的时间,将更多的时间用于下一次的突破。

点击下方的查看工作流程各步骤所使用的产品。

TruSight RNA Pan-Cancer

靶向1385个肿瘤基因,可用于包括FFPE在内的所有RNA样本类型的基因表达、变异和融合检测。

TruSight Tumor 170

检测导致实体瘤进展的单核苷酸位点变异(SNV)、扩增以及融合的全面panel。

TruSeq RNA Exome

可重现且经济的编码RNA测序方法,适用于FFPE样本和其他低质量样本。

AmpliSeq for Illumina Custom RNA Fusion Panel

用于检测融合基因和测定基因表达的可定制靶向panel。

TruSeq Stranded mRNA Library Prep Kit

精确测量mRNA链方向,用于检测反义转录,发现替代转录本、基因融合和等位基因特异性表达。

TruSeq Stranded Total RNA Library Prep Kit

可扩展的全转录组分析解决方案,可为完整的转录组视图提供准确的链信息。

TruSeq Small RNA Library Prep Kit

用于microRNA分析的灵敏试剂盒。

AmpliSeq for Illumina Custom RNA Panel

优化的靶向定制RNA研究panel,可测序多达1200个感兴趣的靶点。

MiniSeq系统

最简单、最实惠的低通量靶向基因表达图谱分析解决方案。

MiSeq系统

桌面式测序仪,NGS工作流程简单、整合数据分析软件,具有无可匹敌的准确性。

MiSeqDx仪器

FDA批准的NGS体外诊断系统,也可在研究模式下运行生成准确、可靠的数据。

NextSeq 550系统

灵活的桌面式测序系统,适用于各种癌症RNA-Seq应用,包括全转录组分析和癌症基因表达图谱分析。

NovaSeq 6000系统

无论何种基因组、何种测序方法和项目规模都有可扩展的通量,灵活简便。

RNA Express App

使用STAR比对器比对RNA read,然后利用DESeq2进行差异表达分析。

TopHat Alignment App

对RNA样本进行剪接比对、变异检出和参考定量。

Cufflinks Assembly & DE App

对RNA样本进行新的转录本组装和差异表达分析。

MiSeq Reporter

MiSeq系统上简便易用的软件,可用于分析和变异检出。

BaseSpace Sequence Hub

用于NGS数据分析和管理的Illumina基因组学计算环境。

BaseSpace Correlation Engine

不断增长的经审核的基因组数据库,可在鉴定疾病机制、药物靶点、预后和预测性生物标记方面为研究人员提供有力支持。

药物反应的RNA生物标记

RNA测序(RNA-Seq)正越来越多地应用于发现和分析基于RNA的药物反应生物标记。寻找能帮助您采用RNA-Seq来进行生物标记分析的资源,包括工作流程简介、实验注意事项和启动建议。

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药物反应的RNA生物标记
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用于癌症转录组分析的RNA-Seq 

了解用于单个癌细胞转录组分析的RNA-Seq。

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癌症研究适用的基因组技术

探索癌症研究的各种基因组学方法。了解癌症RNA-Seq如何提供有关肿瘤基因表达的详细信息。

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揭开癌症的面纱:TruSight Tumor 170

以富集为基础的癌症研究检测方法,整合了DNA和RNA,可检测小型变异、基因扩增、基因融合和剪接变异。

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癌症研究综述

采用Illumina技术进行癌症研究的同行评审文献综述。

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通过整合基因组学来提供癌症预后信息
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结合DNA和RNA数据的分子分析可以更轻易地鉴定出潜在的癌症驱动基因。

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