NovaSeq X系列
将先进的化学、光学和信息学技术相结合，实现了超凡的速度和数据质量、出色的通量和可扩展性。
TruSeq Stranded Total RNA提供了清晰的转录组视图，为总RNA测序分析提供了经济高效的一体化可扩展解决方案。
TruSeq Stranded Total RNA
可靠的、扩展自如的全转录组分析（RNA-Seq）解决方案适用于各种物种与样本类型，包括人类、小鼠与福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）样本。
11.5小时
分析时间
5.5小时
手动操作时间
0.1 – 1 ug高质量总RNA。低质量样本可能需要进一步优化。
起始量
以前名为TruSeq Stranded Total RNA Library Prep Kit with Ribo-Zero Human/Mouse/Rat（货号RS-122-2201、RS-122-2202和RS-122-2203）和TruSeq Stranded Total RNA Library Prep Kit with Ribo-Zero Gold（货号RS-122-2301、RS-122-2302和RS-122-2303）的产品现分别更名为TruSeq Stranded Total RNA Human/Mouse/Rat和TruSeq Stranded Total RNA Gold。该产品的配置已更改。您需要单独订购文库制备和标签接头产品（而不是在试剂盒中提供）。
概述
精确测量链方向的全转录组分析
TruSeq Stranded Total RNA可兼容包括低质量DNA/RNA和福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）样本在内的多种样本，结合了TruSeq RNA技术与Ribo-Zero核糖体RNA去除方法的所有优点。该产品可分析编码和多种形式的非编码RNA，能够精确测量链方向，实现均匀覆盖，并发现高度可信的替代转录本、基因融合和等位基因特异性表达等特征。
适用于各种研究设计的灵活解决方案
TruSeq Stranded Total RNA有多种版本，可满足特定研究设计需要：
快速、自动化的工作流程
一天内即可制备好用于因美纳测序的文库。通过我们的合作伙伴可在一系列自动化平台上应用因美纳认证的方法。
规格
| 分析时间 | 11.5小时 |
|---|---|
| 自动化功能 | 液体处理机器人 |
| 自动化详情 | 探索可用的自动化方法 |
| 内容说明 | 捕获编码RNA以及多种形式的非编码RNA |
| 说明 | 用于全转录组测序研究。Total RNA版本可去除细胞质rRNA，而Total RNA Gold版本可去除细胞质和线粒体rRNA。 |
| 手动操作时间 | 5.5小时 |
| 起始量 | 0.1 – 1 ug高质量总RNA。低质量样本可能需要进一步优化。 |
| 系统 | NextSeq 550桌面式基因测序仪, NextSeq 2000基因测序仪, NextSeq 1000系统, NovaSeq X基因测序仪, NextSeq 500桌面式基因测序仪, NovaSeq 6000基因测序仪, NovaSeq X Plus基因测序仪 |
| 作用机制 | 基于磁珠的rRNA去除、cDNA合成和PCR |
| 方法 | 全转录组测序 |
| 多重分析 | 低通量试剂盒：混合最多12个样本。或混合24个样本（组A和B一起）, 高通量试剂盒：使用组合双标签序列或唯一双标签序列制备96个标签样本 |
| 核酸类型 | RNA |
| 特殊的样本类型 | FFPE组织 |
| 物种 | 小鼠, 人, 大鼠 |
| 物种详情 | rRNA去除：去除人类、小鼠和大鼠rRNA |
| 技术 | Illumina测序 |
| 变异类别 | 单核苷酸多态性（SNP）, 基因融合, 新型转录本, 转录本变异 |
需要的产品
Illumina现提供模块化产品的预订，让您的工作流程变得灵活。您可以订购带有以下任何标签的以下任何文库制备产品。
/
结果
应用
工作流程示例
项目建议
| 仪器 | Recommended number of samples | Read length |
|---|---|---|
| NextSeq 550 System | RNA分析：每次运行6–20个样本（基于每个样本2000万条read） |
2×75 bp |
| NovaSeq 6000 System | RNA分析（每次运行的样本，双流动槽）：S1：160、S2：320、S4：768。受标签组合的限制（双重）。基于2000万条read。 |
≤ 2 × 100 bp |
相关应用和方法
RNA-Seq使用新一代测序技术分析全转录组的表达，使研究人员能够检测已知或新的特性并对RNA进行定量。
查找从降解的FFPE组织和其他低质量样本中获得高质量结果的FFPE RNA测序解决方案。
文档
比较
| TruSeq Stranded Total RNA | Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus或Ribo-Zero Plus Microbiome | ||||
|---|---|---|---|---|---|
| 分析时间 | 11.5小时 | 约7小时 | |||
| 自动化功能 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 | |||
| 自动化详情 | 探索可用的自动化方法 | ||||
| 内容说明 | 捕获编码RNA以及多种形式的非编码RNA | 捕获编码RNA以及多种形式的非编码RNA | |||
| 说明 | 用于全转录组测序研究。Total RNA版本可去除细胞质rRNA，而Total RNA Gold版本可去除细胞质和线粒体rRNA。 | 用于从低RNA起始量和低质量样本制备全转录组测序文库，支持多种RNA-Seq应用。包括Ribo-Zero Plus，用于单管去除来自多个物种的rRNA和珠蛋白RNA，以便进行丰富的转录组分析。 | |||
| 手动操作时间 | 5.5小时 | ＜3小时 | |||
| 起始量 | 0.1 – 1 ug高质量总RNA。低质量样本可能需要进一步优化。 | 标准质量RNA样本为1–1000 ng总RNA。建议至少10 ng总RNA，以获得最佳性能和FFPE样本 | |||
| 系统 | NextSeq 550桌面式基因测序仪, NextSeq 2000基因测序仪, NextSeq 1000系统, NovaSeq X基因测序仪, NextSeq 500桌面式基因测序仪, NovaSeq 6000基因测序仪, NovaSeq X Plus基因测序仪 | NextSeq 550桌面式基因测序仪, NextSeq 2000基因测序仪, NextSeq 1000系统, NovaSeq X基因测序仪, NextSeq 500桌面式基因测序仪, NovaSeq 6000基因测序仪, NovaSeq X Plus基因测序仪 | |||
| 作用机制 | 基于磁珠的rRNA去除、cDNA合成和PCR | 酶法rRNA去除，连接接头和标签 | |||
| 方法 | 全转录组测序 | 全转录组测序, 宏转录组测序 | |||
| 多重分析 | 低通量试剂盒：混合最多12个样本。或混合24个样本（组A和B一起）, 高通量试剂盒：使用组合双标签序列或唯一双标签序列制备96个标签样本 | 多达384个唯一双标签（UDI） | |||
| 核酸类型 | RNA | RNA | |||
| 特殊的样本类型 | FFPE组织 | 微生物组样本, 低起始量样本, FFPE组织 | |||
| 物种 | 小鼠, 人, 大鼠 | 小鼠, 人, 大鼠, 细菌 | |||
| 物种详情 | rRNA去除：去除人类、小鼠和大鼠rRNA | Ribo-Zero Plus可去除多个物种的大量转录本，包括：人类细胞质和线粒体rRNA、小鼠rRNA、大鼠rRNA、细菌（大肠杆菌和枯草芽孢杆菌）rRNA以及人类β珠蛋白转录本 Ribo-Zero Plus Microbiome去除了多个物种的大量转录本，包括：在Ribo-Zero Plus中去除的转录本以及多种微生物物种和ATCC MSA-2002, MSA-2005和MSA-2006 | |||
| 技术 | Illumina测序 | Illumina测序 | |||
| 变异类别 | 单核苷酸多态性（SNP）, 基因融合, 新型转录本, 转录本变异 | 单核苷酸多态性（SNP）, 基因融合, 新型转录本, 转录本变异 |
选择工具：
寻找符合您需求的测序文库制备试剂盒或芯片。按方法、种类等筛选。比较、分享和订购试剂盒。
图
高质量链信息
技术平行分析间的高重复性反映了对RNA丰度一致、精确的测量。FFPE组织的技术平行分析显示出高度的一致性，表明文库制备的性能稳定。轴为log2(FPKM)。显示 R2 值。
均匀覆盖转录本
TruSeq Stranded Total RNA在新鲜冷冻（FF，上图）和FFPE（下图）肿瘤以及匹配正常乳腺组织中的前1000个表达转录本中具有出色的覆盖度，比对链read＞98%。X轴：沿转录本的位置，Y轴：组合read的覆盖度百分比。
文库制备 (4)
TruSeq® Stranded Total RNA Library Prep Human/Mouse/Rat（48样本）
20020596
包含用于从人、小鼠和大鼠中去除rRNA的RiboZero磁珠、用于将RNA转录为cDNA的PCR预混液，以及用于制备48个样本的试剂。单独购买标签接头和纯化磁珠。
TruSeq® Stranded Total RNA Library Prep Human/Mouse/Rat（96样本）
20020597
包含用于从人、小鼠和大鼠中去除rRNA的RiboZero磁珠、用于将RNA转录为cDNA的PCR预混液，以及用于制备48个样本的试剂。单独购买标签接头和纯化磁珠。
TruSeq Stranded Total RNA Library Prep Gold（48样本）
20020598
包括用于从人、小鼠和大鼠中去除rRNA和线粒体rRNA的RiboZero磁珠、用于将RNA转录为cDNA的PCR预混液，以及用于制备48个样本的试剂。单独购买标签接头。单独购买标签接头和纯化磁珠。
TruSeq® Stranded Total RNA Library Prep Gold（96样本）
20020599
包括用于从人、小鼠和大鼠中去除rRNA和线粒体rRNA的RiboZero磁珠、用于将RNA转录为cDNA的PCR预混液，以及用于制备48个样本的试剂。单独购买标签接头。单独购买标签接头和纯化磁珠。
标签接头 (4)
TruSeq RNA CD Index Plate（96标签，96样本）
20019792
TruSeq Stranded RNA HT Kit 96样本接头孔板盒
TruSeq RNA Single Indexes Set A（12标签，48样本）
20020492
包括24个标签中的12个（标签：2、4、5、6、7、12、13、14、15、16、18、19），用于制备48个单独的RNA样本。
TruSeq RNA Single Indexes Set B（12标签，48样本）
20020493
包括24个标签中的12个（标签：1、3、8、9、10、11、20、21、22、23、25、27），用于制备48个单独的RNA样本。
IDT for Illumina – TruSeq RNA UD Indexes v2（96标签，96样本）
20040871
包含96、8 bp标签，足以标记96个样本，与TruSeq Stranded mRNA和TruSeq Stranded Total RNA Library Prep Kit兼容。版本 2 包含板 20022371 中 192 个标签寡核苷酸中 8 个的改进，其余 184 个未作更改。单独购买文库制备和探针panel。
配套产品 (1)
Illumina Ribo-Zero plus rRNA Depletion Kit（96样本）
20037135
包括Ribo-Zero Plus去除模块，用于去除96个样本的人类、小鼠、大鼠以及细菌和珠蛋白转录本中的核糖体RNA。单独购买纯化磁珠、文库制备试剂和标签接头。如需完整的试剂盒，包括文库制备试剂，请订购Illumina Stranded Total RNA with Ribo-Zero Plus试剂盒。
服务 (1)
TruSeq Total RNA培训
15044069
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MiSeq v3试剂盒
与早期版本相比，优化的试剂盒可增加簇密度和读长，从而提高测序质量分值。
TruSight Oncology 500
使用涵盖所有主要变异类别以及来自FFPE组织的基因特征（TMB、MSI和HRD）的大型泛癌panel实现CGP。
Illumina DNA Prep
快速、集成的文库制备工作流程，适用于各种测序应用。
NextSeq 500/550 v2.5试剂盒
与早期版本相比，v2.5试剂盒使用弹性流动槽，可保持起始荧光强度，具有更高的稳定性和性能。
TruSight Hereditary Cancer Panel
评估与遗传癌症风险倾向相关的113个基因和125个SNP的生殖系突变的靶向测序panel。
TruSeq Stranded mRNA
从mRNA制备测序文库，获得清晰的编码转录组视图以及链特异性信息。
TruSeq RNA Exome
为FFPE组织及其他低质量样本的RNA测序提供的可重现且经济的解决方案。只需10 ng的总RNA即可保证准确性。
Illumina RNA Prep with Enrichment
快速、集成的工作流程，针对各种样本类型和RNA起始量生成富集并标记的测序文库。
AmpliSeq for Illumina Custom RNA Panel
优化的靶向定制RNA研究panel，可测序多达1200个感兴趣的基因组靶点。
有限使用标签许可证：此产品及其使用受Max Planck Gesellschaft所拥有且独家授权给New England Biolabs, Inc.并再授权给Illumina, Inc.的一个或多个已公告和/或待批准的美国和外国专利申请的约束。向Illumina, Inc.、其关联机构或其授权经销商和分销商购买此产品，即向买方转让使用买方所购数量产品和产品组件的权利（不论买方是学术性还是盈利性实体），该权利不可转让。购买此产品并不会转让前述专利或专利申请中针对产品生产的任何权利要求项下的许可。买方不得向第三方出售或以其他方式转让此产品及其组件，亦不得以其他方式将此产品用于下商业用途：（1）在生产中使用此产品或其组件；或（2）出于治疗或预防疾病的目的，在人或动物身上使用此产品或其组件。
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