NovaSeq X系列
将先进的化学、光学和信息学技术相结合，实现了超凡的速度和数据质量、出色的通量和可扩展性。
TruSeq RNA Exome，以前名为TruSeq RNA Access Library Prep Kit，能将总RNA转变为已知链起源的模板分子，然后进行编码RNA的序列特异性捕获。这为从福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）组织和其他低质量样本中分离的人类RNA提供了低成本的分析解决方案。
TruSeq RNA Exome
为FFPE组织及其他低质量样本的RNA测序提供的可重现且经济的解决方案。只需10 ng的总RNA即可保证准确性。
约2天
分析时间
约11小时
手动操作时间
来自新鲜/冷冻样本的10 ng总RNA，或来自FFPE样本的20 ng总RNA
起始量
以前名为TruSeq RNA Access Library Prep Kit的产品（货号RS-301-2001和RS-301-2002）现更名为TruSeq RNA Exome。该产品的配置已更改。在新的配置中，主要组件例如文库制备、标签接头、富集试剂和外显子panel可单独订购。如果您之前买的是货号为RS-301-2001或RS-301-2002的产品，现在可订购以下组件：TruSeq RNA Library Prep for Enrichment（货号20020189）、TruSeq RNA Enrichment（货号20020490）、Exome Panel（货号20020183）以及下方标签接头部分中的一项。
概述
主要特点
TruSeq RNA Exome能从降解样本生成聚焦RNA编码区的RNA测序（RNA-Seq）文库。只需中度的总RNA测序read深度，即可分离这些高价值内容的区域，使信息获取能力加强。结果满足低起始量要求、实现了高样本通量和高性价比的转录组分析。提供的试剂量足以支持1至4重富集反应。
规格
| 分析时间 | 约2天 |
|---|---|
| 自动化功能 | 液体处理机器人 |
| 自动化详情 | 探索可用的自动化方法 |
| 内容说明 | 捕获编码转录组/RNA外显子组 |
| 说明 | 为研究人员提供清晰、全面的编码转录组视图，链信息精确且样本起始量低。 |
| 手动操作时间 | 约11小时 |
| 起始量 | 来自新鲜/冷冻样本的10 ng总RNA，或来自FFPE样本的20 ng总RNA |
| 系统 | NextSeq 550系统, HiSeq 3000, NextSeq 2000系统, NextSeq 1000系统, NovaSeq X基因测序仪, NextSeq 500系统, NovaSeq 6000系统, NovaSeq X Plus基因测序仪, HiSeq 4000 |
| 作用机制 | 以编码RNA为靶标的生物素化的捕获探针。不要求RNA带有poly-A尾巴。 |
| 方法 | 外显子组测序, mRNA测序 |
| 多重分析 | 多达24个单标签、96个组合（CD）双标签 |
| 核酸类型 | RNA |
| 特殊的样本类型 | 低起始量样本, FFPE组织 |
| 物种 | 人 |
| 链特异性 | 链状 |
| 技术 | Illumina测序 |
| 变异类别 | 单核苷酸多态性（SNP）, 新型转录本, 转录本变异 |
需要的产品
Illumina现提供模块化产品的预订，让您的工作流程变得灵活。请单独订购文库制备、富集、标签接头和外显子组panel组件。
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结果
应用
工作流程示例
项目建议
| 仪器 | 推荐的样本数 | 读长 |
|---|---|---|
| NextSeq 550系统 | 每次运行5–16个样本（基于每个样本2500万条read） |
2×75 bp |
| NovaSeq 6000系统 | 每次运行的样本数（双流动槽）：S1：96，S2：96，S4：192（目前受可用标签组合的限制） |
2×100 bp |
| NovaSeq 6000系统 | 每次运行的样本数（双流动槽）：S1：96，S2：96，S4：192（目前受可用标签组合的限制） |
2×100 bp |
相关应用和方法
查找从降解的FFPE组织和其他低质量样本中获得高质量结果的FFPE RNA测序解决方案。
利用RNA新一代测序（RNA-Seq）检测癌症基因表达和转录组变化，鉴定新的癌症转录本。
寻找符合您需求的测序文库制备试剂盒或芯片。按方法、种类等筛选。比较、分享和订购试剂盒。
其他人如何使用该产品
比较
| TruSeq RNA Exome | Illumina RNA Prep with Enrichment | Illumina Stranded mRNA Prep | |
|---|---|---|---|
| 分析时间 | 约2天 | ＜9小时 | 6.5小时 |
| 自动化功能 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 |
| 自动化详情 | 探索可用的自动化方法 | 探索可用的自动化方法 | |
| 内容说明 | 捕获编码转录组/RNA外显子组 | 与Illumina Exome Panel一起使用时可捕获编码转录组 | 捕获编码转录组（带链信息） |
| 说明 | 为研究人员提供清晰、全面的编码转录组视图，链信息精确且样本起始量低。 | 一种可重现且经济的解决方案，可使用多种类型的样本和起始材料来检测和发现目标转录本，包括福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）组织和其他低质量样本 | 简单、经济的编码转录组分析解决方案，可提供精确的链信息 |
| 手动操作时间 | 约11小时 | < 2小时 | ＜3小时 |
| 起始量 | 来自新鲜/冷冻样本的10 ng总RNA，或来自FFPE样本的20 ng总RNA | 10 ng RNA；20 ng FFPE RNA | 25-1000 ng标准质量的总RNA |
| 系统 | NextSeq 550系统, HiSeq 3000, NextSeq 2000系统, NextSeq 1000系统, NovaSeq X基因测序仪, NextSeq 500系统, NovaSeq 6000系统, NovaSeq X Plus基因测序仪, HiSeq 4000 | MiSeq 系统, iSeq 100系统, NextSeq 550系统, NextSeq 2000系统, NextSeq 1000系统, MiniSeq基因测序仪, NovaSeq 6000系统 | NextSeq 550系统, NextSeq 2000系统, NextSeq 1000系统, NovaSeq X基因测序仪, NextSeq 500系统, NovaSeq 6000系统, NovaSeq X Plus基因测序仪 |
| 作用机制 | 以编码RNA为靶标的生物素化的捕获探针。不要求RNA带有poly-A尾巴。 | 链接磁珠转座酶 | PolyA捕获，连接接头和标签 |
| 方法 | 外显子组测序, mRNA测序 | mRNA测序, 靶向RNA测序, 靶向富集 | mRNA测序 |
| 多重分析 | 多达24个单标签、96个组合（CD）双标签 | 多达384个唯一双标签（UDI） | 多达384个唯一双标签（UDI） |
| 核酸类型 | RNA | RNA | RNA |
| 特殊的样本类型 | 低起始量样本, FFPE组织 | 血液, 低起始量样本, FFPE组织 | 不兼容FFPE, 低起始量样本 |
| 物种 | 人 | 人, 病毒 | 哺乳动物, 牛, 小鼠, 人, 大鼠 |
| 链特异性 | 链状 | 非链 | 链状 |
| 技术 | Illumina测序 | Illumina测序 | Illumina测序 |
| 变异类别 | 单核苷酸多态性（SNP）, 新型转录本, 转录本变异 | 单核苷酸多态性（SNP）, 基因融合, 新型转录本, 转录本变异 | 单核苷酸多态性（SNP）, 基因融合, 新型转录本, 转录本变异 |
图
高效发现融合基因
TruSeq RNA Exome能够检测表达的融合转录本，且不需要针对融合连接位点设计探针。在25M read中，通用人类参考RNA（UHRR）样本中已经研究透彻的BCR-ABL融合被高效检测。
相关资源
Ebola and sexual transmission
埃博拉和性传播
一名感染了埃博拉病毒病（EVD）的男性幸存者在结束埃博拉治疗六个月之后，将病毒传染给了他的女性伴侣并致其死亡。传统方法检测的结果表明这位幸存者的精液呈阴性，但作者使用了Illumina TruSeq RNA Access Kit和定制探针对精液样本进行了富集，以获取EBOV RNA。
文库制备 (1)
TruSeq® RNA Library Prep for Enrichment（48样本）
20020189
包含用于制备48个文库的试剂。单独购买标签接头、富集panel和富集试剂。
富集 (1)
TruSeq® RNA Enrichment（12次富集）
20020490
与TruSeq RNA Library Prep for Enrichment搭配使用时，足够进行12次富集反应。单独购买文库制备、标签接头和探针panel。
标签接头 (2)
TruSeq RNA Single Indexes Set A（12标签，48样本）
20020492
包括24个标签中的12个（标签：2、4、5、6、7、12、13、14、15、16、18、19），用于制备48个单独的RNA样本。
TruSeq RNA Single Indexes Set B（12标签，48样本）
20020493
包括24个标签中的12个（标签：1、3、8、9、10、11、20、21、22、23、25、27），用于制备48个单独的RNA样本。
Panel (1)
Illumina Exome Panel – 仅富集寡核苷酸
20020183
与Illumina DNA Prep with Enrichment搭配使用时可进行8次富集反应，与TruSeq RNA Exome搭配使用时可进行12次反应，与Illumina RNA Prep with Enrichment搭配使用时可进行32次反应。单独购买文库制备和富集试剂以及标签接头。
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MiSeq v3试剂盒
与早期版本相比，经过优化的试剂盒可增加簇密度和读长，从而提高测序质量分值。
TruSight Oncology 500
使用涵盖所有主要变异类别以及来自FFPE组织的基因特征（TMB、MSI和HRD）的大型泛癌panel实现CGP。
Illumina DNA Prep
快速、集成的文库制备工作流程，适用于各种测序应用。
NextSeq 1000/1000-CN和NextSeq 2000/2000-CN试剂盒
用于NextSeq 1000/2000系列基因测序仪的试剂盒，具有简便易用的卡盒和多种流动槽配置，可提供灵活的测序选项。
TruSeq Stranded Total RNA
可靠的、扩展自如的全转录组分析（RNA-Seq）解决方案适用于各种物种与样本类型，包括人类、小鼠与福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）样本。
TruSeq Stranded mRNA
从mRNA制备测序文库，获得清晰的编码转录组视图以及链特异性信息。
TruSeq Stranded Total RNA with Ribo-Zero Plant
利用该RNA-Seq文库制备工作流程可全面了解植物转录组。可去除植物叶片、种子和根部组织中的rRNA。
NextSeq 500/550 v2.5试剂盒
与早期版本相比，v2.5试剂盒使用弹性流动槽，可保持起始荧光强度，具有更高的稳定性和性能。
Illumina RNA Prep with Enrichment
快速、集成的工作流程，针对各种样本类型和RNA起始量生成富集并标记的测序文库。
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