
NovaSeq X系列
将先进的化学、光学和信息学技术相结合,实现了超凡的速度和数据质量、出色的通量和可扩展性。
为FFPE组织及其他低质量样本的RNA测序提供的可重现且经济的解决方案。只需10 ng的总RNA即可保证准确性。
分析时间
手动操作时间
起始量
以前名为TruSeq RNA Access Library Prep Kit的产品(货号RS-301-2001和RS-301-2002)现更名为TruSeq RNA Exome。该产品的配置已更改。在新的配置中,主要组件例如文库制备、标签接头、富集试剂和外显子panel可单独订购。如果您之前买的是货号为RS-301-2001或RS-301-2002的产品,现在可订购以下组件:TruSeq RNA Library Prep for Enrichment(货号20020189)、TruSeq RNA Enrichment(货号20020490)、Exome Panel(货号20020183)以及下方标签接头部分中的一项。
TruSeq RNA Exome,以前名为TruSeq RNA Access Library Prep Kit,能将总RNA转变为已知链起源的模板分子,然后进行编码RNA的序列特异性捕获。这为从福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)组织和其他低质量样本中分离的人类RNA提供了低成本的分析解决方案。
TruSeq RNA Exome能从降解样本生成聚焦RNA编码区的RNA测序(RNA-Seq)文库。只需中度的总RNA测序read深度,即可分离这些高价值内容的区域,使信息获取能力加强。结果满足低起始量要求、实现了高样本通量和高性价比的转录组分析。提供的试剂量足以支持1至4重富集反应。
分析时间 | 约2天 |
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自动化功能 | 液体处理机器人 |
自动化详情 | 探索可用的自动化方法 |
内容说明 | 捕获编码转录组/RNA外显子组 |
说明 | 为研究人员提供清晰、全面的编码转录组视图,链信息精确且样本起始量低。 |
手动操作时间 | 约11小时 |
起始量 | 来自新鲜/冷冻样本的10 ng总RNA,或来自FFPE样本的20 ng总RNA |
系统 | NextSeq 550系统, HiSeq 3000, NextSeq 2000系统, NextSeq 1000系统, NovaSeq X基因测序仪, NextSeq 500系统, NovaSeq 6000系统, NovaSeq X Plus基因测序仪, HiSeq 4000 |
作用机制 | 以编码RNA为靶标的生物素化的捕获探针。不要求RNA带有poly-A尾巴。 |
方法 | 外显子组测序, mRNA测序 |
多重分析 | 多达24个单标签、96个组合(CD)双标签 |
核酸类型 | RNA |
特殊的样本类型 | 低起始量样本, FFPE组织 |
物种 | 人 |
链特异性 | 链状 |
技术 | Illumina测序 |
变异类别 | 单核苷酸多态性(SNP), 新型转录本, 转录本变异 |
Illumina现提供模块化产品的预订,让您的工作流程变得灵活。请单独订购文库制备、富集、标签接头和外显子组panel组件。
仪器 | Recommended number of samples | Read length |
---|---|---|
NextSeq 550 System | 每次运行5–16个样本(基于每个样本2500万条read) |
2×75 bp |
NovaSeq 6000 System | 每次运行的样本数(双流动槽):S1:96,S2:96,S4:192(目前受可用标签组合的限制) |
2×100 bp |
NovaSeq 6000 System | 每次运行的样本数(双流动槽):S1:96,S2:96,S4:192(目前受可用标签组合的限制) |
2×100 bp |
查找从降解的FFPE组织和其他低质量样本中获得高质量结果的FFPE RNA测序解决方案。
利用RNA新一代测序(RNA-Seq)检测癌症基因表达和转录组变化,鉴定新的癌症转录本。
寻找符合您需求的测序文库制备试剂盒或芯片。按方法、种类等筛选。比较、分享和订购试剂盒。
TruSeq RNA Exome | Illumina RNA Prep with Enrichment | Illumina Stranded mRNA Prep | |||
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分析时间 | 约2天 | <9小时 | 6.5小时 | ||
自动化功能 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 | ||
自动化详情 | 探索可用的自动化方法 | 探索可用的自动化方法 | |||
内容说明 | 捕获编码转录组/RNA外显子组 | 与Illumina Exome Panel一起使用时可捕获编码转录组 | 捕获编码转录组(带链信息) | ||
说明 | 为研究人员提供清晰、全面的编码转录组视图,链信息精确且样本起始量低。 | 一种可重现且经济的解决方案,可使用多种类型的样本和起始材料来检测和发现目标转录本,包括福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)组织和其他低质量样本 | 简单、经济的编码转录组分析解决方案,可提供精确的链信息 | ||
手动操作时间 | 约11小时 | < 2小时 | <3小时 | ||
起始量 | 来自新鲜/冷冻样本的10 ng总RNA,或来自FFPE样本的20 ng总RNA | 10 ng RNA;20 ng FFPE RNA | 25-1000 ng标准质量的总RNA | ||
系统 | NextSeq 550系统, HiSeq 3000, NextSeq 2000系统, NextSeq 1000系统, NovaSeq X基因测序仪, NextSeq 500系统, NovaSeq 6000系统, NovaSeq X Plus基因测序仪, HiSeq 4000 | MiSeq 系统, iSeq 100系统, NextSeq 550系统, NextSeq 2000系统, NextSeq 1000系统, MiniSeq基因测序仪, NovaSeq 6000系统 | NextSeq 550系统, NextSeq 2000系统, NextSeq 1000系统, NovaSeq X基因测序仪, NextSeq 500系统, NovaSeq 6000系统, NovaSeq X Plus基因测序仪 | ||
作用机制 | 以编码RNA为靶标的生物素化的捕获探针。不要求RNA带有poly-A尾巴。 | 链接磁珠转座酶 | PolyA捕获,连接接头和标签 | ||
方法 | 外显子组测序, mRNA测序 | mRNA测序, 靶向RNA测序, 靶向富集 | mRNA测序 | ||
多重分析 | 多达24个单标签、96个组合(CD)双标签 | 多达384个唯一双标签(UDI) | 多达384个唯一双标签(UDI) | ||
核酸类型 | RNA | RNA | RNA | ||
特殊的样本类型 | 低起始量样本, FFPE组织 | 血液, 低起始量样本, FFPE组织 | 不兼容FFPE, 低起始量样本 | ||
物种 | 人 | 人, 病毒 | 哺乳动物, 牛, 小鼠, 人, 大鼠 | ||
链特异性 | 链状 | 非链 | 链状 | ||
技术 | Illumina测序 | Illumina测序 | Illumina测序 | ||
变异类别 | 单核苷酸多态性(SNP), 新型转录本, 转录本变异 | 单核苷酸多态性(SNP), 基因融合, 新型转录本, 转录本变异 | 单核苷酸多态性(SNP), 基因融合, 新型转录本, 转录本变异 |
高效发现融合基因
TruSeq RNA Exome能够检测表达的融合转录本,且不需要针对融合连接位点设计探针。在25M read中,通用人类参考RNA(UHRR)样本中已经研究透彻的BCR-ABL融合被高效检测。
埃博拉和性传播
一名感染了埃博拉病毒病(EVD)的男性幸存者在结束埃博拉治疗六个月之后,将病毒传染给了他的女性伴侣并致其死亡。传统方法检测的结果表明这位幸存者的精液呈阴性,但作者使用了Illumina TruSeq RNA Access Kit和定制探针对精液样本进行了富集,以获取EBOV RNA。
TruSeq® RNA Library Prep for Enrichment(48样本)
20020189
包含用于制备48个文库的试剂。单独购买标签接头、富集panel和富集试剂。
TruSeq® RNA Enrichment(12次富集)
20020490
与TruSeq RNA Library Prep for Enrichment搭配使用时,足够进行12次富集反应。单独购买文库制备、标签接头和探针panel。
TruSeq RNA Single Indexes Set A(12标签,48样本)
20020492
包括24个标签中的12个(标签:2、4、5、6、7、12、13、14、15、16、18、19),用于制备48个单独的RNA样本。
TruSeq RNA Single Indexes Set B(12标签,48样本)
20020493
包括24个标签中的12个(标签:1、3、8、9、10、11、20、21、22、23、25、27),用于制备48个单独的RNA样本。
Illumina Exome Panel – 仅富集寡核苷酸
20020183
与Illumina DNA Prep with Enrichment搭配使用时可进行8次富集反应,与TruSeq RNA Exome搭配使用时可进行12次反应,与Illumina RNA Prep with Enrichment搭配使用时可进行32次反应。单独购买文库制备和富集试剂以及标签接头。
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