Local Run Manager

轻松创建测序运行、监控运行状态、分析测序数据和查看结果

整合数据分析

Local Run Manager软件是一款集成解决方案,旨在创建测序运行、监控运行状态、分析测序数据和查看结果。它为扩增子测序、靶向测序等各种应用提供了一系列自动化数据分析工具。 

  • 使用各种分析模块进行数据分析

  • 生成全面且易于解读的PDF报告 

  • 记录样本和输入文件,例如清单和参考基因组  

  • 分析完成后查看分析指标

 

兼容仪器

Local Run Manager软件与仪器控制软件集成,可通过网络浏览器直接在MiniSeq和iSeq 100系统上访问。仪器外版本可用于iSeq 100、MiniSeq、MiSeq和NextSeq 550系统。

特色Local Run Manager模块

DNA Amplicon分析模块

可简化在Illumina测序系统上测序的AmpliSeq for Illumina DNA和TruSeq Amplicon panel的变异检测。 

兼容仪器:

  • iSeq 100系统
  • MiniSeq基因测序仪
  • MiSeq基因测序仪
  • NextSeq 550系统

DNA Enrichment分析模块

将read与整个参考基因组进行比对,并对指定目标区域进行变异分析。

兼容仪器:

  • iSeq 100系统
  • MiniSeq基因测序仪
  • MiSeq系统 
  • NextSeq 550系统

Generate FASTQ分析模块

生成拆分好的FASTQ格式文件进行下游分析。

兼容仪器:

  • iSeq 100系统
  • MiniSeq基因测序仪
  • MiSeq基因测序仪
  • NextSeq 550系统

文库QC分析模块

本模块评估DNA文库的丰度、片段长度和样本质量。文库QC工作流程提供了每个DNA样本特征的高级报告。 

兼容仪器:

  • iSeq 100系统
  • MiniSeq基因测序仪
  • MiSeq系统 
  • NextSeq 550系统

Oncology Gene Panel 170分析模块

支持运行设置、测序和分析由 Oncology Gene Panel 170 IUO/PEO 检测生成的制备好的 DNA 和 RNA 文库。

兼容仪器:

  • NextSeq 550Dx仪器

PCR Amplicon分析模块

将read与整个参考基因组进行比对,并对指定目标区域进行变异分析。此工作流程用于分析使用Nextera片段化进行片段化的PCR扩增子。

兼容仪器:

  • iSeq 100系统
  • MiniSeq基因测序仪
  • MiSeq系统 
  • NextSeq 550系统

重测序分析模块

为小型基因组的全基因组测序进行read比对和变异分析。

兼容仪器:

  • iSeq 100系统
  • MiniSeq基因测序仪
  • MiSeq系统 
  • NextSeq 550系统

RNA Amplicon分析模块

对在Illumina测序系统上测序的AmpliSeq for Illumina RNA靶向panel进行简化的差异表达分析。

兼容仪器:

  • iSeq 100系统
  • MiniSeq基因测序仪
  • MiSeq系统 
  • NextSeq 550系统

RNA融合分析模块

比对read并检测使用TruSight RNA Fusion Panel试剂盒制备的RNA文库的融合。

兼容仪器:

  • MiniSeq基因测序仪
  • MiSeq系统 
  • NextSeq 550系统

Small RNA分析模块

比对read和输出命中。探索新的前体并开展成对的差异表达分析。

兼容仪器:

  • MiniSeq基因测序仪
  • MiSeq系统 
  • NextSeq 550系统

TruSight Oncology 500分析模块

分析并使用TruSight Oncology 500检测为>500个实体瘤相关基因制备的样本生成过滤报告。

兼容仪器:

  • NextSeq 550仪器

TruSight Tumor 15分析模块

分析并使用TruSight Tumor 15检测针对15个实体瘤相关基因制备的样本并生成过滤报告。 

兼容仪器:

  • MiniSeq基因测序仪
  • MiSeq基因测序仪

16S宏基因组学分析模块

通过扩增16S核糖体RNA中的特定区域,对宏基因组样本中的生物进行分类。该工作流程仅适用于原核生物。

兼容仪器:

  • MiniSeq基因测序仪
  • MiSeq基因测序仪

相关信息

更多资源

了解有关Local Run Manager的更多信息,包括培训、常见问题解答、技术公告等。 

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