DRAGEN Array

DRAGEN Array可对Infinium芯片进行准确、全面、高效的二级分析。

概述

DRAGEN(Dynamic Read Analysis for GENomics)Array二级分析是一款功能强大的生物信息学软件,适用于基于Infinium芯片的检测。DRAGEN Array使用前沿的数据分析工具,提供准确、全面、高效的二级分析,尽可能地获取更多基因组信息,满足您的研究需求。

准确且高效的分析

高质量、快速获得结果,适用于多种应用,包括基因分型、药物基因组学(PGx)分析和甲基化QC。

全面的工作流程

全面的Infinium芯片解决方案中包括DRAGEN Array。从定制、半定制或即用型芯片中进行选择,这些芯片具有专业设计的内容;然后,使用快速的DNA到数据工作流程处理、扫描和分析数据。 

云端和本地部署

DRAGEN Array提供本地命令行软件包(无需专门的现场可编程门阵列(FPGA)服务器或硬件)和云端软件包,具有直观的图形用户界面(GUI)。

规格


软件更新

DRAGEN Array特点包括:

  • 对各种人类Infinium芯片的单核苷酸位点变异(SNV)进行基因分型分析

  • 药物基因组学(PGx)分析流程

  • Infinium Global Diversity Array with Enhanced PGx BeadChip的PGx拷贝数变异(CNV)检出、星号等位基因检出和代谢型状态

  • 甲基化QC分析

  • 更多信息和完整的功能列表,请参见发布说明

应用

DRAGEN Array为Infinium芯片提供了准确、全面且高效的二级分析。

  描述 检测的变异类型 本地分析 云端分析
基因分型 为任何人类Infinium基因分型芯片提供超过99.5%的基因分型准确性。1 SNV​
插入缺失
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PGx – CNV calling​ 提供超过95%的PGx CNV检测准确性2。覆盖6个目标基因的9个目标区域。 SNV​
插入缺失
CNV
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PGx – star allele annotation​​ 为50多个基因的1700多个目标提供PGx星等位基因和变异覆盖。能够以超过98%的检测率评估难以区分的PGx基因,包括难以捉摸的CYP2D63 SNV​
插入缺失
CNV
星号等位基因​
双倍型
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甲基化 QC​ 提供高通量、定量的甲基化质量控制。 甲基化指标  
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如需要进一步的信息: https://help.dragenarray.illumina.com/overview/our-features

工作流程示例

相关应用和方法

DRAGEN芯片云分析,第1步

导航至“运行 – 芯片分析设置”开始分析。

DRAGEN芯片云分析,第2步

设置分析配置。

DRAGEN芯片云分析,第3步

使用导入样本表、选择BeadChip或导入IDAT文件选择要分析的样本。

DRAGEN芯片云分析,第4步

查看您的结果。

高效的分析

在一个平台上进行基因分型、PGx CNV检出和星号等位基因注释,具有多种输出选项。

星号等位基因注释

用于下游处理的星号等位基因注释JSON文件示例。提供支持变异、缺失变异和检测的等位基因。

具有可调阈值的甲基化QC

21个控制指标用于评估输出的质量。可调节的通过/失败阈值能够适应扫描仪差异、样本类型差异或研究设计偏好。

软件选项 (2)

DRAGEN Array Local – 星号等位基因注释

20109885

分析成本按每个样本计算。

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DRAGEN Array Cloud – 星号等位基因注释

20109886

分析成本按每个样本计算。

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数据分析和存储 (8)

Illumina Analytics - 1 iCredit

20042038

iCredit用于在BaseSpace Sequence Hub或Illumina Connected Analytics上进行的数据存储和分析。

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Illumina Analytics  Starter Pack - 1,000 iCredits

20042039

iCredit用于在BaseSpace Sequence Hub或Illumina Connected Analytics上进行的数据存储和分析。

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Discounts:

Illumina Analytics  - 5,000 iCredits

20042040

iCredit用于在BaseSpace Sequence Hub或Illumina Connected Analytics上进行的数据存储和分析。

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Illumina Analytics  - 50,000 iCredits

20042041

iCredit用于在BaseSpace Sequence Hub或Illumina Connected Analytics上进行的数据存储和分析。

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Illumina Analytics - 100,000 iCredits

20042042

iCredit用于在BaseSpace Sequence Hub或Illumina Connected Analytics上进行的数据存储和分析。

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ICA基础版年度订阅

20044874

Illumina Connected Analytics(ICA)基础版年度订阅。该产品为TSO500客户免费提供1年ICA,包括测序仪器连接、数据管理功能、使用预先打包的工具。

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ICA专业版年度订阅

20044876

Illumina Connected Analytics(ICA)专业版年度订阅。该产品包括1年的ICA访问权,包括测序仪器连接、数据管理功能、预包装工具的访问权,以及创建由工具、流程、数据仓库和笔记本组成的定制工作流程的能力。

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ICA企业版年度订阅

20038994

Illumina Connected Analytics(ICA)企业版年度订阅。该产品包括1年的ICA企业版访问权,包括测序仪器连接、数据管理功能、定制和预包装分析工具,以及用于数据仓储和挖掘的基础模块。ICA Enterprise还包括可选的HIPPAA BAA(仅限美国)、单点登录(SSO)和服务水平协议(SLA)。

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选择汇总

产品

数量

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NovaSeq X系列

将先进的化学、光学和信息学技术相结合,实现了超凡的速度和数据质量、出色的通量和可扩展性。

MiSeq v3试剂盒

与早期版本相比,优化的试剂盒可增加簇密度和读长,从而提高测序质量分值。

TruSight Oncology 500

使用涵盖所有主要变异类别以及来自FFPE组织的基因特征(TMB、MSI和HRD)的大型泛癌panel实现CGP。

Illumina DNA Prep

快速、集成的文库制备工作流程,适用于各种测序应用。

参考文献

1,2,3 - Illumina data on file, 2023. 了解更多

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