NovaSeq X系列
将先进的化学、光学和信息学技术相结合，实现了超凡的速度和数据质量、出色的通量和可扩展性。
BaseSpace Sequence Hub (BSSH)是一款基因组学云计算软件，以用户友好的格式为研究人员提供精简的运行管理和直观的分析应用程序。BSSH通过提供以下服务，帮助发展中和已建立的实验室拓展新一代测序(NGS)操作：
BaseSpace Sequence Hub订购
在BaseSpace Sequence Hub中管理运行、分析、存储和共享测序数据。查找应用程序、订阅选项和文档。
概述
主要特点
高效的运行设置、监控和分析
可与所有因美纳测序系统集成，实现在任何地方完成一站式运行规划、分析配置和实时运行监测。
简化的数据管理和存储
可根据您的存储需求进行放大或缩小——无需硬件维护或IT支持。存档数据，实现长期保存数据并优化节约成本。
简化的数据分析
通过90多个点击式基因组分析应用程序（包括DRAGEN、因美纳和第三方应用程序）精简菜单有效提高生产率。
规格
| 系统 | MiSeq桌面式基因测序仪, iSeq 100系统, NextSeq 550桌面式基因测序仪, NextSeq 2000基因测序仪, NextSeq 1000系统, 研究模式下的MiSeqDx, MiniSeq基因测序仪, 研究模式下的NextSeq 550Dx, NovaSeq X基因测序仪, 研究模式下的NovaSeq 6000Dx, NovaSeq 6000基因测序仪, NovaSeq X Plus基因测序仪 |
|---|---|
| 软件格式 | 云端 |
| 技术 | Illumina测序 |
合规认证
Compliance certificates
HIPAA Compliant Attested by Schellman
BaseSpace Sequence Hub features an information security program that leverages the Amazon Web Services infrastructure and provides multiple layers of security. Its risk management program conforms to the specifications of the Health Insurance Portability and Accountability Act (HIPAA) Security Rule and the Health Information Technology for Economic and Clinical Health (HITECH) Breach Notification Rule.
ISO 27001 Certified by Schellman
Illumina has received ISO 27001 certification of its information security management system (ISMS) supporting BaseSpace Sequence Hub. The standard specifies the requirements for establishing, implementing, operating, monitoring, reviewing, maintaining, and improving a documented ISMS within the context of the organization’s overall business risks. The certification was performed by Schellman, an ANAB and UKAS accredited certification body based in the US.
ISO 27701 Certified by Schellman
Illumina has received ISO 27701 certification of its privacy information management system (PIMS) supporting BaseSpace Sequence Hub, building on the existing Illumina ISO 27001 certification. ISO 27701 requires documentation of policies, procedures and protocols demonstrating that a company applies high standards to protect personal data. The certification was performed by Schellman, an ANAB and UKAS accredited certification body based in the US.
ISO 13485 Certified by BSI
BaseSpace Sequence Hub was developed in accordance with the Illumina Software Life Cycle (SLC) process under the Illumina Quality Management System. Illumina operates and maintains a Quality Management System (*QMS), which complies with the requirements of ISO 13485. Additionally, processes within the Illumina QMS have adopted industry best practices and relevant standards, such as ISO 14971 for Risk Management and IE62304 for SLC.
GDPR
BaseSpace Sequence Hub is designed to comply with GDPR provisions directly applicable to data processors. Illumina applies industry standard technical and organizational measures designed to protect personal data from unauthorized processing in accordance with GDPR requirements. This includes system controls to manage features such as user authentication, access authorization, data deletion and privacy impact assessments.
应用
BaseSpace Sequence Hub提供了易于使用的分析应用程序，涵盖了与Illumina NGS数据一起使用的各种分析方法，包括RNA-Seq、外显子组/富集、扩增子、全基因组测序、 从头组装、16S宏基因组学等。
软件产品组合
实验室
为基因组学实验室提供高效的样本追踪和工作流程管理。
运行
BaseSpace Sequence Hub
一体化的云端运行设置和监测。
分析
准确、全面且高效的NGS数据分析。
基于Infinium芯片的检测的准确、全面、高效的二级分析。
一个安全的基因组数据平台，用于信息学分析并推动获得新的科学见解。
BaseSpace Sequence Hub为常用的Illumina测序方法提供了多种NGS数据分析应用程序。
解读
Emedgene简化了 罕见病基因组学和其他生殖系研究应用的三级分析工作流程。
交互式组学知识库，利用精选的公共数据分析私人组学数据，以帮助研究人员将他们的数据置于生物学背景中。
相关应用和方法
我们提供多种资源和信息，有助于简化设置信息学基础架构和数据分析流程的过程。
我们的测序数据分析软件可减少配置和运行分析工作流程所需的时间，从而让您有更多的时间进行研究。
Store, process, and share large genomic and NGS datasets in the cloud with built-in speed and scalability.
计划和定价
BaseSpace Sequence Hub需要购买年度许可证和足够的iCredit，以满足基于通量的数据存储和分析需求。
订阅选项
| 特点 | 基础版 | 专业版 | 企业版 |
|---|---|---|---|
| 包含存储空间 | 1 TB | 1 TB | 1 TB |
| 免费积分（包括iCredit的鼠标悬停定义“1个iCredit等于1.00美元” | 250* iCredit | 500个iCredit | 500个iCredit |
| 付款计划 | N/A | 每月账单或预付iCredit | 每月账单或预付iCredit |
| 运行设置和监控 | |||
| FASTQ 生成 | 免费 | 免费 | 免费 |
| 数据输出 | 免费 | 免费 | 免费 |
| 数据共享 | |||
| 高级安全性和合规性（加密、ISO 27001和ISO 27701认证、ISO 13485合规） | |||
| API和命令行访问 | |||
| 用户数量 | 一组 | 无限制 | 无限制 |
| 工作组 | 一组 | 无限制 | |
| 高级安全（私有域、单点登录**、审计跟踪、访问控制） | |||
| HIPAA业务伙伴协议（BAA）支持（仅限美国） | |||
| 服务水平协议 |
* 250个iCredit会在30天的入门试用期后过期。
**适用于安装了支持Universal Copy Service的控制软件的系统。不适用于所有传统系统。
在BaseSpace Sequence Hub中处理一个样本的成本是多少？
| 应用 | 成本 | 详情 |
|---|---|---|
| 人类全基因组测序 | 7个iCredit | 样本：30× hWGS 大小：120 Gb 应用程序：DRAGEN Germline 输出：VCF、BAM/CRAM |
| 外显子组测序 | 2个iCredit | 样本：外显子组 大小：100 Gb 应用程序：DRAGEN Germline 起始量：FASTQ 输出：VCF、BAM/CRAM |
| 癌症panel | 2个iCredit | 样本：骨髓panel 大小：50 Mb 应用程序：DNA Amplicon 起始量：FASTQ 输出：体细胞变异 |
| 转录组 | 2个iCredit | 样本：RNA-Seq 大小：50M Read 应用程序：DRAGEN RNA 起始量：FASTQ 输出： 融合、转录本 |
| 差异表达 | 1 iCredit | 样本：肿瘤外显子组 大小：10 Gb 应用程序：RNA-Seq Differential Expression 起始量：FASTQ 输出：体细胞变异 |
| RNA panel | 2个iCredit | 样本：RNA panel 大小：300万条read 应用程序：RNA扩增子 起始量：FASTQ 输出： 体细胞变异 |
| 16S rRNA | 1-2 iCredit | 样本：16S Metagenomics 应用程序： 16S宏基因组学 起始量：FASTQ 输出：物种分类 |
文档
产品资料
图
直观的BaseSpace Sequence Hub仪表板
一目了然地查找有关最新运行和分析的通知、状态更新和信息。
实时监控数据
BaseSpace Sequence Hub用户界面内置了Sequence Analysis Viewer（SAV）功能，可实现实时、逐个循环的监控。图表视图显示了每个通道和每个循环的数据，以及Q值分布和热图特征。每张图都可以扩展成全尺寸。
按需启动分析工具
在BaseSpace Apps Store中浏览并探索越来越多的DRAGEN和Illumina应用程序，并直接从数据集中单击即可启动选定的应用程序。
个人和工作组账户
使用个人凭据登录BaseSpace，然后在个人账户和工作组账户之间切换。在工作组帐户中，您可以查看工作组共有的所有运行和分析，也可以使用工作组购买的存储和计算时间，如不同的仪表板所示。
了解BaseSpace示例数据集
查看BaseSpace Sequence Hub中多种方法的样本数据集，或者试用感兴趣的应用程序并交互评估结果。
相关资源
BaseSpace Sequence Hub: work better together
BaseSpace Sequence Hub：更好地合作
观看BaseSpace Sequence Hub简介，了解如何轻松存储和分析基因组数据。
了解最新的信息学产品发布、版本更新和特色亮点。
获取旨在帮助新用户开始使用BaseSpace Sequence Hub的资源汇编。
加速冠状病毒检测和鉴定，进行宿主反应研究，简化样本追踪，并为公共数据库做出贡献。
软件和信息学选项 (2)
BaseSpace Sequence Hub专业版年度订阅
20042109
专业级BaseSpace Sequence Hub年度订阅。专业级提供500个iCredit（用于快速开始使用BaseSpace应用程序和存储数据）、1个工作组（用于加强协作）以及对功能强大的API的访问权限。
BaseSpace Sequence Hub企业版年度订阅
15066411
BaseSpace Sequence Hub Enterprise的年度订阅。此订阅支持多个工作组、私有域、单点登录和HIPAA合规性（仅限美国）。
数据分析和存储 (6)
Illumina Analytics - 1 iCredit
20042038
iCredit用于在BaseSpace Sequence Hub或Illumina Connected Analytics上进行的数据存储和分析。
Illumina Analytics Starter Pack - 1,000 iCredits
20042039
iCredit用于在BaseSpace Sequence Hub或Illumina Connected Analytics上进行的数据存储和分析。
Illumina Analytics - 5,000 iCredits
20042040
iCredit用于在BaseSpace Sequence Hub或Illumina Connected Analytics上进行的数据存储和分析。
Illumina Analytics - 50,000 iCredits
20042041
iCredit用于在BaseSpace Sequence Hub或Illumina Connected Analytics上进行的数据存储和分析。
Illumina Analytics - 100,000 iCredits
20042042
iCredit用于在BaseSpace Sequence Hub或Illumina Connected Analytics上进行的数据存储和分析。
Illumina Analytics消费账单
20012931
未超出的金额表示为报价中的金额。每月向客户开具发票，收取计算、储存和第三方App费用，最高金额与货号20012931相关。
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常见问题解答
可以，30天免费试用，在您首次创建帐户并登录时会自动开始。该试验提供250个iCredit（30天后到期），可用于计算任何BaseSpace应用程序的费用和＞1 TB的数据存储。30天后，您可能不再运行应用程序，但仍可以监控测序运行、对上传的运行进行样本拆分、存储有限量的数据、与合作者共享和传输以及下载数据。
iCredit是用于购买Illumina基因组数据存储和分析选项的货币。需要购买iCredit才能运行数据分析应用程序并将数据存储在BaseSpace Sequence Hub中。深入了解BaseSpace Sequence Hub的iCredit和账单。
Illumina致力于保护客户数据的机密性和安全性。所有数据共享均由客户或其代理控制。Illumina使用基于角色的访问控制来禁止未经授权的数据访问，并每年审计基于角色的访问权限授权。
Illumina为BaseSpace Sequence Hub用户提供了广泛的支持。支持文档、培训和其他资源可在 BaseSpace开发人员网站 和 BaseSpace支持部分获取。您也可以联系技术支持。
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结果
MiSeq v3试剂盒
与早期版本相比，优化的试剂盒可增加簇密度和读长，从而提高测序质量分值。
TruSight Oncology 500
使用涵盖所有主要变异类别以及来自FFPE组织的基因特征（TMB、MSI和HRD）的大型泛癌panel实现CGP。
Illumina DNA Prep
快速、集成的文库制备工作流程，适用于各种测序应用。
Illumina DRAGENTM V4 Server
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Illumina Connected Analytics
利用Illumina Connected Analytics实现信息学分析并推动获得新的科学见解。如需了解定价、订阅等信息，请联系我们。
Correlation Engine
交互式组学知识库，利用精选的公共数据分析私人组学数据，以帮助研究人员将他们的数据置于生物学背景中。
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