TruSight Oncology 500 ctDNA v2

使用能够检测血浆中ctDNA的关键IO基因特征（TMB、MSI）以及所有主要变异类别的泛癌panel进行CGP分析。

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数据表 PDF 1 MB 7 版本

从纯化核酸到变异报告，＜4天

分析时间

文库制备和富集约2.5小时

手动操作时间

20 ng cfDNA（4 mL血浆）

起始量

详情请参见规格表

此产品仅在某些选定区域可用。请选择您希望发货的目的地，查看该产品是否在该区域可用。

TruSight Oncology 500 ctDNA v2现已上市，凭借更低的cfDNA起始量、更快的周转时间和更精简的工作流程，提高了灵敏度。

学习
目

概述

TruSight Oncology 500 ctDNA v2是一种泛癌NGS检测方法，可在内部对血浆中的循环肿瘤DNA（ctDNA）进行全面的基因组分析（CGP），以供研究使用。

利用微创血液样本作为组织活检的补充或替代方法
靶向523个基因，以评估主要变异类别（SNV、MNV、插入缺失、CNV和基因重排）的DNA变异，以及关键的免疫肿瘤学基因特征（TMB、MSI）
从最少的cfDNA起始量实现超灵敏检测
通过简化的工作流程，在＜4天内从cfDNA获得最终报告

低水平生物标志物检测

使用基于UMI的杂交捕获文库制备和深度测序，以低起始量（20 ng）实现灵敏准确的检测（SNV为0.2% VAF）。

集成的生物信息学

DRAGEN二级分析使用Illumina Connected Analytics在本地或云端支持快速变异检出算法。使用Illumina Connected Insights*或Velsera的集成报告获取见解。

一体化的工作流程

先进的化学技术和广泛的工作流程优化，可实现一天的文库制备和富集，总周转时间＜4天。自动化友好的试剂盒和方法可提高效率。

*部分国家/地区上市。Illumina Connected Insights通过对第三方知识库的API调用，支持用户自定义的三级分析。

通过全面的产品组合实现CGP

使用TruSight Oncology 500产品系列最大限度地提高鉴定可操作变异的几率。

TruSight Oncology 500 ctDNA v2

分析血浆中的循环肿瘤DNA（ctDNA），DNA panel内容与TruSight Oncology 500相似。

TruSight Oncology 500

通过辅助试剂盒评估FFPE肿瘤组织的相关DNA和RNA癌症生物标志物，包括HRD，以评估基因组不稳定性评分（GIS）。^†

TruSight Oncology 500 High-Throughput（大样本量方案）检测

使用与TruSight Oncology 500相同的panel内容和组织起始量类型时，一次最多可批量处理192个样本。

深入了解TruSight Oncology 500产品系列

^†HRD仅适用于在TruSight Oncology 500试剂盒中加入TruSight Oncology 500 HRD试剂盒的情况。暂未在日本推出。

性能参数

Cancer type	Pan-Cancer, Solid Tumor
Method	Target Enrichment, Targeted DNA Sequencing
Specialized sample types	Circulating Tumor DNA, Blood
Variant class	Single nucleotide variants (SNVs), Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs)
作用机制	杂交捕获化学试剂
内容说明	靶向选择523个基因（完整编码序列），panel总共1.94 Mb。 • 免疫肿瘤学生物标志物覆盖度：TMB和MSI • 指南覆盖范围：广泛覆盖多种实体瘤的重要指南 • 临床试验覆盖范围：600多项临床试验（基于Pierian临床知识库，截至2023年2月）
分析时间	从纯化核酸到变异报告，＜4天
分析灵敏度	≥ 95%（小变异，≥ 0.5% VAF）
分析特异性	≥99.995%（小变异，≥ 0.5% VAF）
基因计数	523个基因的DNA
多重分析	在S2上可进行8重分析，在S4上可进行24重分析（使用Xp-4 Lane工作流程，最多16个标签）
手动操作时间	文库制备和富集约2.5小时
技术	Illumina测序
核酸类型	DNA
物种	人
系统	NovaSeq 6000 System
说明	通过液体活检样本（血浆中的ctDNA）的全景基因组图谱分析，提供了一种非侵入性方法，用于癌症研究应用的实体瘤图谱分析。这种液体活检方法利用微创样本采集方法来补充基于组织的CGP，提供了有关肿瘤内和肿瘤间异质性的见解。
起始量	20 ng cfDNA（4 mL血浆）

所需产品

要运行 TruSight Oncology 500 ctDNA v2，您需要：

TruSight Oncology 500 ctDNA v2试剂盒（带或不带Velsera）
NovaSeq 6000基因测序仪
NovaSeq 6000试剂盒，根据通量需求提供不同的流动槽选项。可选：NovaSeq Xp工作流程灵活地独立装载每个流动槽通道。

要使用DRAGEN流程进行分析，您需要：

用于本地分析的DRAGEN服务器许可证，或
Illumina Connected Analytics订阅和用于云端分析的iCredit

要生成最终变异报告，您需要：

Illumina Connected Insights^*或
Velsera Clinical Genomics Workspace^†或
其他商业选项

^* 并非所有国家/地区均提供。Illumina Connected Insights通过对第三方知识库的API调用，支持用户自定义的三级分析。

^† Velsera原名为Pierian。其他商业选项也可用。

应用

工作流程示例

制备

TruSight Oncology 500 ctDNA v2检测

测序

分析

变异检出：

见解和报告：

Illumina Connected Insights^†

Velsera Clinical Genomics Workspace软件

^*Novaseq X和NovaSeq 6000Dx（RUO模式）兼容性将于2024年推出。

^†并非所有国家/地区均提供。Illumina Connected Insights通过对第三方知识库的API调用，支持用户自定义的三级分析。

项目建议

仪器	Recommended number of samples	Read length
NovaSeq 6000 System	24 samples per run (S4 flow cell), 800M paired-end reads, 35,000x coverage	2 × 150 bp
NovaSeq 6000 System	8 samples per run (S2 flow cell), 800M paired-end reads, 35,000x coverage	2 × 150 bp

文档

产品资料

Simplifying the process to identify applicable variants in oncology samples
宣传册 PDF 2 MB

Liquid Biopsy and NGS: Driving translational clinical research to the next level
应用指南 PDF < 1 MB

- English
- Simplified Chinese
技术说明 PDF < 1 MB 2 版本

TruSight Oncology 500 ctDNA Gene List
product_file Excel < 1 MB

- English
- Chinese (Simplified)
产品信息表 PDF 1 MB 2 版本

TruSight Oncology 500 ctDNA v2 provides superior performance and an improved workflow
应用指南 PDF < 1 MB

Using lower input amounts with TruSight Oncology ctDNA v2
技术说明 PDF < 1 MB

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数据表 PDF 1 MB 7 版本

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数据表 PDF 2 MB 3 版本

支持文档

DRAGEN TruSight Oncology 500 ctDNA Analysis Software v1.2 Documentation 文档

DRAGEN TruSight Oncology 500 ctDNA Local Analysis Software v2.1 Documentation 文档

TruSight Oncology 500 ctDNA v2 Product Documentation 文档

DRAGEN TruSight Oncology 500 ctDNA Analysis Software v1.2 on ICA 文档

TruSight Oncology 500 ctDNA Checklist 文档

DRAGEN TruSight Oncology 500 ctDNA Analysis Software v2.1.1 on ICA Documentation 文档

TruSight Oncology 500 ctDNA Consumables & Equipment 文档

DRAGEN TruSight Oncology 500 ctDNA v1.1 Local Analysis Software Documentation 文档

TruSight Oncology 500 ctDNA Analysis Software Documentation 文档

TruSight Oncology 500 ctDNA Reference Guide 文档

DRAGEN Analysis Workflows Product Documentation 文档

TruSight Oncology 500 ctDNA Local App Documentation 文档

TruSight Oncology 500 ctDNA支持文档

比较

	TruSight Oncology 500 ctDNA v2	TruSight Oncology 500	TruSight Oncology 500 High-Throughput（大样本量方案）
Cancer type	Pan-Cancer, Solid Tumor	Pan-Cancer, Solid Tumor	Pan-Cancer, Solid Tumor
Method	Target Enrichment, Targeted DNA Sequencing	Target Enrichment, Targeted RNA Sequencing, Targeted DNA Sequencing	Target Enrichment, Targeted RNA Sequencing, Targeted DNA Sequencing
Specialized sample types	Circulating Tumor DNA, Blood	FFPE Tissue	FFPE Tissue
Variant class	Single nucleotide variants (SNVs), Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs)	Gene fusions, Transcript variants, Single nucleotide variants (SNVs), Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs), Loss of heterozygosity (LOH), Somatic variants, Novel transcripts, Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Structural variants	Gene fusions, Transcript variants, Single nucleotide variants (SNVs), Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs), Novel transcripts, Structural variants, Somatic variants
作用机制	杂交捕获化学试剂
内容说明	靶向选择523个基因（完整编码序列），panel总共1.94 Mb。 • 免疫肿瘤学生物标志物覆盖度：TMB和MSI • 指南覆盖范围：广泛覆盖多种实体瘤的重要指南 • 临床试验覆盖范围：600多项临床试验（基于Pierian临床知识库，截至2023年2月）	对来自523个基因的DNA和来自55个基因的RNA进行靶向测序，总panel大小为1.94 Mb。包括MSI和TMB测量。可选的TruSight Oncology 500 HRD试剂盒（日本不可用）内容包括约25K SNP的覆盖度，可通过Myriad Genetics支持的全面基因组不稳定性评分（LOH+TAI+LST）评估同源重组缺陷。	靶向测序523个目标基因的DNA和55个基因的RNA，panel大小总计为1.94 Mb。包括MSI和TMB测量。
分析时间	从纯化核酸到变异报告，＜4天	从样本到结果需要4-5天	从样本到结果需要4-5天
分析灵敏度	≥ 95%（小变异，≥ 0.5% VAF）
分析特异性	≥99.995%（小变异，≥ 0.5% VAF）
基因计数	523个基因的DNA
多重分析	在S2上可进行8重分析，在S4上可进行24重分析（使用Xp-4 Lane工作流程，最多16个标签）	多达8重	多达16重（SP流动槽）、32重（S1流动槽）、72重（S2流动槽）和192重（S4流动槽）
手动操作时间	文库制备和富集约2.5小时	自动化工作流程约2.5小时。手动工作流程约10.5小时。	自动化工作流程约2.5小时。手动工作流程约10.5小时。
技术	Illumina测序	Illumina测序	Illumina测序
核酸类型	DNA	DNA, RNA	DNA, RNA
物种	人	人	人
系统	NovaSeq 6000 System	NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 550Dx in Research Mode, NextSeq 500 Desktop Sequencer	NovaSeq 6000Dx in Research Mode, NovaSeq 6000 System
说明	通过液体活检样本（血浆中的ctDNA）的全景基因组图谱分析，提供了一种非侵入性方法，用于癌症研究应用的实体瘤图谱分析。这种液体活检方法利用微创样本采集方法来补充基于组织的CGP，提供了有关肿瘤内和肿瘤间异质性的见解。	该检测能够对FFPE组织进行全面的基因组分析，并在NextSeq 550系统或NextSeq 550Dx仪器（研究模式）上运行，一次最多可批量处理8个样本。	一种高通量的综合NGS检测方法，利用NovaSeq 6000系统或NovaSeq 6000Dx仪器（研究模式），通过简化的工作流程鉴定指南和>1K临床试验中的关键生物标志物。覆盖免疫肿瘤学生物标志物MSI和TMB。
起始量	20 ng cfDNA（4 mL血浆）	40 ng DNA和/或40 ng RNA	40 ng DNA和/或40–80 ng RNA

^* 基于Pierian临床知识库，截至2023年2月。

^* RUO模式下的NovaSeq 6000Dx系统需要一台独立的DRAGEN服务器进行二级分析。

^* NovaSeq X和NovaSeq 6000 Dx兼容性将于2024年推出

图

低VAF下的小核苷酸变异检测

将每个单核苷酸变异的已知变异等位基因频率（VAF）的合成对照样本稀释至0.20%–0.50% VAF的值，并通过TruSight Oncology 500 ctDNA v2进行分析。

低VAF下的插入缺失检测

将已知每个插入或缺失的VAF的合成对照样本稀释至0.20%–0.50% VAF值，然后使用TruSight Oncology 500 ctDNA v2进行分析。

与肿瘤-正常检出相比，TMB相关性高

与肿瘤-正常工作流程相比，TSO 500 ctDNA v2的仅肿瘤工作流程利用先进的生物信息学进行生殖系和CH变异过滤，产生高度一致的bTMB。

用于免疫肿瘤学研究的灵敏MSI检测

在已知MSI高状态的3个细胞系（样本1–3）中评估微卫星不稳定性（MSI），并检测低至0.3%的肿瘤分数，评估多达约2300个均聚物位点。

CNV的分析性能，扩增的LOD≥1.3倍，缺失的LOD≤0.6倍

由于起始拷贝数较少，检测限导致相对MYC检测速度更快。 Illumina存档数据，2023年。

LOD检测基因重排的分析性能（0.5%）

VAF的计算方法为支持read总数除以断裂点两侧的较高深度。因美纳2023年存档数据。

相关资源

TruSight Oncology 500 ctDNA v2

Illumina使用TruSight Oncology ctDNA 500 v2改进了循环肿瘤的分析。在视频中了解新功能和优势。

TruSight Oncology 500产品系列手册

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因美纳与日本国立癌症研究中心合作解决亚洲的主要死因

了解这项共同努力，加速开发基于基因组信息的个性化治疗。

手动制备 (12)

TruSight Oncology 500 ctDNA v2 (24 samples)

20105899

TSO 500 ctDNA v2手动试剂盒

List Price:

Discounts:

TruSight Oncology 500 ctDNA v2 for Use with NovaSeq 6000 S2 Flow Cell (24 samples)

20105901

混合工作流程TSO 500 ctDNA v2 + S2 FC手动试剂盒

List Price:

Discounts:

TruSight Oncology 500 ctDNA v2 for Use with NovaSeq 6000 S4 Flow Cell (24 samples)

20105902

混合工作流程TSO 500 ctDNA v2 + S4 FC手动试剂盒

List Price:

Discounts:

TruSight Oncology 500 ctDNA v2 (24 samples) plus Velsera Interpretation Report

20105905

TSO 500 ctDNA v2手动试剂盒 + Velsera解读报告

List Price:

Discounts:

TruSight Oncology 500 ctDNA v2 plus Velsera Interpretation Report, for Use with NovaSeq 6000 S2 Flow Cell (24 samples)

20105907

混合工作流程TSO 500 ctDNA v2 + S2 FC手动试剂盒 + Velsera解读报告

List Price:

Discounts:

TruSight Oncology 500 ctDNA v2 plus Velsera Interpretation Report, for Use with NovaSeq 6000 S4 Flow Cell (24 samples)

20105908

混合工作流程TSO 500 ctDNA v2 + S4 FC手动试剂盒 + Velsera解读报告

List Price:

Discounts:

TruSight Oncology 500 ctDNA Kit (48 samples)

20039252

TruSight Oncology 500 ctDNA Kit（包括DNA文库和富集试剂）；不包括NovaSeq核心试剂。

List Price:

Discounts:

TruSight Oncology 500 ctDNA Kit plus Velsera Interpretation Report (16 indexes, 48 Samples)

20043410

包含文库制备试剂、富集试剂，以及数据解读报告（通过Velsera Clinical Genomics Workspac软件提供）。不包括NovaSeq系统核心试剂。

List Price:

Discounts:

TruSight Oncology 500 ctDNA Kit, for use with NovaSeq 6000 S2 (48 samples)

20101995

TSO500 ctDNA和NovaSeq 6000 S2核心耗材的组合SKU

List Price:

Discounts:

TruSight Oncology 500 ctDNA Kit, for use with NovaSeq 6000 S4 (48 samples)

20101998

用于TSO500 ctDNA和NovaSeq 6000 S4核心耗材的组合SKU

List Price:

Discounts:

TruSight Oncology 500 ctDNA Kit for use with NovaSeq 6000 S2 plus Velsera interpretation report (16 indexes, 48 samples)

20102000

TSO500 ctDNA和NovaSeq 6000 S2核心耗材的组合SKU + Velsera报告

List Price:

Discounts:

TruSight Oncology 500 ctDNA Kit for use with NovaSeq 6000 S4 plus Velsera interpretation report (16 indexes, 48 samples)

20102001

TSO500 ctDNA和NovaSeq 6000 S4核心耗材的组合SKU + Velsera报告

List Price:

Discounts:

标签接头 (4)

IDT® for Illumina® UMI DNA/RNA UD Indexes Set A, Ligation (96 Indexes, 96 Samples)

20034701

UMI DNA Index Anchors（板 = 20031416，盒 = 20032620）+ Nextera Compatible Unique Dual Index A（销售试剂盒 = 20027213，板 = 20025019，盒 = 20026121）

List Price:

Discounts:

IDT® for Illumina® UMI DNA/RNA UD Indexes Set B, Ligation (96 Indexes, 96 Samples)

20034702

IDT for Illumina UMI DNA Index Anchors Set B

List Price:

Discounts:

IDT for Illumina UMI DNA/DNA Index Anchors Set A for Automation

20066404

包括一盒96个IDT for Illumina - UMI DNA/RNA UD Indexes Set A for Automation，足以标记96个样本，一盒96个IDT for Illumina - UMI DNA Index Anchors for Automation。

List Price:

Discounts:

IDT for Illumina UMI DNA/DNA Index Anchors Set B for Automation

20063213

包括一盒96个IDT for Illumina - UMI DNA/RNA UD Indexes Set B for Automation，足以标记96个样本，一盒96个IDT for Illumina - UMI DNA Index Anchors for Automation。

List Price:

Discounts:

试剂 (2)

NovaSeq 6000 S2 Reagent Kit v1.5 (300 cycles)

20028314

包含一个 S2 流动槽、一个缓冲液夹盒、一个簇生成夹盒和一个测序夹盒，以支持在 NovaSeq 6000 系统上进行 300 次循环运行。

List Price:

Discounts:

NovaSeq 6000 S4 Reagent Kit v1.5 (300 cycles)

20028312

包含一个 S4 流动槽、一个缓冲液夹盒、一个簇生成夹盒和一个测序夹盒，以支持在 NovaSeq 6000 系统上进行 300 次循环运行。

List Price:

Discounts:

软件和信息学选项 (15)

Illumina DRAGEN Server v4

20051343

包括第一年的Avance Exchange支持。需要购买年度DRAGEN许可证。

List Price:

Discounts:

ICA Basic Annual Subscription

20044874

Illumina Connected Analytics（ICA）基础版年度订阅。该产品为TSO500客户免费提供1年ICA，包括测序仪器连接、数据管理功能、使用预先打包的工具。

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List Price:

Discounts:

ICA Professional Annual Subscription

20044876

Illumina Connected Analytics（ICA）专业版年度订阅。该产品包括1年的ICA访问权，包括测序仪器连接、数据管理功能、预包装工具的访问权，以及创建由工具、流程、数据仓库和笔记本组成的定制工作流程的能力。

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ICA Enterprise Annual Subscription

20038994

Illumina Connected Analytics（ICA）企业版年度订阅。该产品包括1年的ICA企业版访问权，包括测序仪器连接、数据管理功能、定制和预包装分析工具，以及用于数据仓储和挖掘的基础模块。ICA Enterprise还包括可选的HIPPAA BAA（仅限美国）、单点登录（SSO）和服务水平协议（SLA）。

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ICA Enterprise Service and Compliance Add-on (applies to Basic only)

20066830

Illumina Connected Analytics（ICA）企业服务和合规性插件。本产品适用于ICA基础年度订阅1年，包括HIPPAA BAA（仅限美国）、单点登录（SSO）和服务水平协议（SLA）。

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Illumina Analytics - 1 iCredit

20042038