一种快速、灵活且可扩展的cfDNA文库制备试剂盒，用于高精度的突变检测。
Illumina Cell-Free DNA Prep with Enrichment 是一种高灵敏度的文库制备解决方案，用于检测cfDNA样本中的低丰度突变。该工作流程包括用于纠错和降低假阳性率的唯一分子标记（UMI），从而准确、灵敏地检测低频突变。我们最快、最高质量且最稳健的测序化学技术——XLEAP-SBS化学技术，现已在NextSeq 2000（P4流动槽）和NovaSeq X测序仪上启用。
Illumina Cell-Free DNA Prep with Enrichment 具有增强的产品特性，能够为实验室带来更高的效率，例如保质期延长至六个月以及提前变更通知。
Illumina cell-free DNA Prep with Enrichment与用户提供的因美纳或第三方供应商的富集寡核苷酸兼容，包括Integrated DNA Technologies（IDT）的单链DNA（ssDNA）和Twist Bioscience的双链DNA（dsDNA），具有更出色的内容可移植性。该试剂盒可用于55-2000 Kb（ssDNA）和70-2000 Kb（dsDNA）panel内容物，从而实现灵活的研究设计。可在约8.5-9.5小时内制备好可直接用于测序的文库，手动操作时间约为2.5-3小时，使研究人员能够在一天内完成从提取的cfDNA到测序的整个流程。NextSeq 550测序仪的推荐读长为2 × 149 bp，NextSeq 2000测序仪和NovaSeq 6000测序仪的推荐读长为2 × 151 bp。
Illumina cfDNA Prep with Enrichment可检测低频变异，包括SNV、CNV、插入缺失变异和基因融合。该试剂盒可从仅20 ng cfDNA中识别等位基因频率低至0.2%的小变异，灵敏度≥90%。
该试剂盒是集成式工作流程的一部分，从cfDNA提取开始，然后在因美纳中高通量系统上进行测序，并使用DRAGEN for ILMN cfDNA Prep with Enrichment App进行高度准确的变异检出。这种用户友好的解决方案与液体处理自动化兼容，并支持样本拆分，以实现可扩展的效率和高数据质量。
为了增强内容的便携性，Illumina Cell-Free DNA Prep with Enrichment试剂盒兼容用户提供的富集寡核苷酸，这些寡核苷酸可以来自Illumina或第三方供应商，包括来自Integrated DNA Technologies（IDT）的单链DNA（ssDNA）和来自Twist Bioscience的双链DNA（dsDNA）。该试剂盒支持55–2000 Kb（ssDNA）和70–2000 Kb（dsDNA）的panel内容，能够实现灵活的研究设计。
Illumina Custom Enrichment Panel v2 提供动态反馈以优化目标覆盖范围，是创建特定于您感兴趣内容的panel的推荐解决方案。DesignStudio 软件是一款免费的、用户友好的基于网络的实验设计工具，用于创建定制测序panel。
| Analytical sensitivity | Analytical sensitivity at 20ng: ≥ 90% (SNVs ≥0.2% and indels ≥0.5%) |
|---|---|
| Analytical specificity | Analytical specificity at 20ng: ≥ 99.98% (SNVs ≥0.2% and indels ≥0.5%) |
| Assay time | ~8.5–9.5 hr |
| Description | A fast, flexible, and scalable cfDNA library preparation kit for highly accurate mutation detection |
| Hands-on time | ~2.5–3 hr |
| Input quantity | 10–30 ng cfDNA |
| 系统 | NextSeq 550系统, NextSeq 2000系统, NextSeq 1000系统, 研究模式下的NextSeq 550Dx, NovaSeq X基因测序仪, 研究模式下的NovaSeq 6000Dx, NovaSeq 6000系统 |
| 方法 | 定制测序, 靶向DNA测序, 靶向富集 |
| 核酸类型 | DNA |
| 特殊的样本类型 | 游离DNA |
| 物种 | 人 |
| 技术 | Illumina测序 |
| 变异类别 | 基因融合, 体细胞变异, 单核苷酸位点变异（SNV）, 插入缺失（indel）, 拷贝数变异（CNV） |
Illumina Cell-Free DNA Prep with Enrichment试剂盒包含文库制备和富集试剂。富集探针面板和索引适配器需单独通过Illumina购买（见下文）。
要使用DRAGEN对Illumina Cell-Free DNA Prep with Enrichment的二级数据进行分析，且无需额外费用，您需要以下内容：
Illumina Custom Enrichment Panel v2 can be used as spike-in panels, using the DesignStudio Assay Design Tool or with the Illumina Concierge design team.
Index plates listed above are required to conplete the workflow. There are specific SKUs for manual and automation workflow. Illumina Custom Enrichment Panel v2 is a 120 bp, double-stranded probe panel designed using DesignStudio and includes enrichment oligos for hybridization capture.
| Illumina Cell-Free DNA Prep with Enrichment | Illumina DNA Prep with Enrichment | TruSight Oncology 500 ctDNA v2 | |
|---|---|---|---|
| Analytical sensitivity | Analytical sensitivity at 20ng: ≥ 90% (SNVs ≥0.2% and indels ≥0.5%) | ≥ 95%（小变异，≥ 0.5% VAF） | |
| Analytical specificity | Analytical specificity at 20ng: ≥ 99.98% (SNVs ≥0.2% and indels ≥0.5%) | ≥99.995%（小变异，≥ 0.5% VAF） | |
| Assay time | ~8.5–9.5 hr | 约6.5小时 | 从纯化核酸到变异报告，＜4天 |
| Description | A fast, flexible, and scalable cfDNA library preparation kit for highly accurate mutation detection | 在约6.5小时内，从低DNA起始量和各种样本类型中制备用于各种实验的测序文库，包括全外显子组、定制和固定panel靶向测序。 | 通过液体活检样本（血浆中的ctDNA）的全景基因组图谱分析，提供了一种非侵入性方法，用于癌症研究应用的实体瘤图谱分析。这种液体活检方法利用微创样本采集方法来补充基于组织的CGP，提供了有关肿瘤内和肿瘤间异质性的见解。 |
| Hands-on time | ~2.5–3 hr | 约2小时, 约2小时 | 文库制备和富集约2.5小时 |
| Input quantity | 10–30 ng cfDNA | 10 -1000 ng高质量基因组DNA或50-1000 ng FFPE DNA。（对于血液和唾液样本，请参阅参考指南）。 | 20 ng cfDNA（4 mL血浆） |
| 系统 | NextSeq 550系统, NextSeq 2000系统, NextSeq 1000系统, 研究模式下的NextSeq 550Dx, NovaSeq X基因测序仪, 研究模式下的NovaSeq 6000Dx, NovaSeq 6000系统 | MiSeq 系统, iSeq 100系统, NextSeq 550系统, NextSeq 2000系统, 研究模式下的MiSeqDx, MiniSeq基因测序仪, 研究模式下的NextSeq 550Dx, NovaSeq X基因测序仪, 研究模式下的NovaSeq 6000Dx, NovaSeq 6000系统, NovaSeq X Plus基因测序仪 | NovaSeq 6000系统 |
| 方法 | 定制测序, 靶向DNA测序, 靶向富集 | 定制测序, 靶向DNA测序, 外显子组测序, 靶向富集 | 靶向DNA测序, 靶向富集 |
| 核酸类型 | DNA | DNA | DNA |
| 特殊的样本类型 | 游离DNA | 血液, 低起始量样本, FFPE组织, 唾液 | 循环肿瘤DNA, 血液 |
| 物种 | 人 | 其他, 人 | 人 |
| 技术 | Illumina测序 | Illumina测序 | Illumina测序 |
| 变异类别 | 基因融合, 体细胞变异, 单核苷酸位点变异（SNV）, 插入缺失（indel）, 拷贝数变异（CNV） | 单核苷酸多态性（SNP）, 杂合性缺失（LOH）, 体细胞变异, 生殖系变异, 插入缺失（indel）, 拷贝数变异（CNV） | 单核苷酸位点变异（SNV）, 插入缺失（indel）, 拷贝数变异（CNV）, 血液肿瘤突变负荷（bTMB）, 血液微卫星不稳定性（bMSI） |
** 系统兼容性：已测试P4和P3流动槽
从探针设计到数据分析的全面解决方案，适用于多种靶向测序应用。我们定制的panel确保了高均匀性和覆盖度，并增强了对富含GC和难以测序区域的覆盖。
Illumina® cfDNA Prep, Ligation (16样本)
20104105
包括基于连接的文库制备，用于自动化制备16个文库或手动制备24个文库。不包含富集试剂。在Illumina Connected Analytics或BaseSpace Sequence Hub上免费分析数据。需要基础订阅云端平台。不包括数据存储。UMI标签接头和唯一双标签需单独购买，两者是文库制备所必需的。根据自动化或手动工作流程选择UMI标签接头和唯一双标签。不包括富集panel内容。
List Price:
Discounts:
Illumina® cfDNA Prep, Ligation (96样本)
20104106
包括基于连接的文库制备，用于自动化制备96个文库或手动制备120个文库。不包含富集试剂。在Illumina Connected Analytics或BaseSpace Sequence Hub上免费分析数据。需要基础订阅云端平台。不包括数据存储。UMI标签接头和唯一双标签需单独购买，两者是文库制备所必需的。根据自动化或手动工作流程选择UMI标签接头和唯一双标签。不包括富集panel内容。
List Price:
Discounts:
Illumina® cfDNA Enrichment (16次反应)
20104107
包括用于富集Illumina cfDNA Prep文库的快速富集试剂，用于自动化制备的16次反应，或手动制备的24次反应。建议使用1-plex和4-plex的富集重数（在单次富集中混合4个文库）。在Illumina Connected Analytics或BaseSpace Sequence Hub上免费分析数据。需要基础订阅云端平台。不包括数据存储。UMI标签接头和唯一双标签需单独购买，两者是文库制备所必需的。根据自动化或手动工作流程选择UMI标签接头和唯一双标签。不包括富集panel内容。
List Price:
Discounts:
Illumina® cfDNA Prep with Enrichment, Ligation（192个样本，4-plex），云端分析
20104103
包括基于连接的文库制备和快速富集试剂，用于自动化制备192个文库，或手动制备240个文库，使用4-plex富集（在单次富集中混合4个文库）。在Illumina Connected Analytics或BaseSpace Sequence Hub上免费分析数据。需要基础订阅云端平台。不包括数据存储。UMI标签接头和唯一双标签需单独购买，两者是文库制备所必需的。根据自动化或手动工作流程选择UMI标签接头和唯一双标签。不包括富集panel内容。
List Price:
Discounts:
ILMN cfDNA Prep ENR，本地（192/240）
20104104
包括基于连接的文库制备和快速富集试剂，用于自动化制备192个文库，或手动制备240个文库，使用4-plex富集（在单次富集中混合4个文库）。包含10,000 Gb、1年DRAGEN服务器许可证。足以采用30,000X测序深度分析高达400 kb内容的测序输出。需要Illumina DRAGEN Server。UMI标签接头和唯一双标签需单独购买，两者是文库制备所必需的。根据自动化或手动工作流程选择UMI标签接头和唯一双标签。不包括富集panel内容。
IDT® for Illumina® UMI DNA/RNA UD Indexes Set A, Ligation（96个标签，96个样本）
20034701
UMI DNA Index Anchors（板 = 20031416，盒 = 20032620）+ Nextera Compatible Unique Dual Index A（销售试剂盒 = 20027213，板 = 20025019，盒 = 20026121）
List Price:
Discounts:
IDT® for Illumina® UMI DNA/RNA UD Indexes Set B, Ligation（96标签，96样本）
20034702
IDT for Illumina UMI DNA Index Anchors Set B
List Price:
Discounts:
IDT for Illumina UMI DNA/DNA Index Anchors Set A for Automation
20066404
包括一盒96个IDT for Illumina - UMI DNA/RNA UD Indexes Set A for Automation，足以标记96个样本，一盒96个IDT for Illumina - UMI DNA Index Anchors for Automation。
List Price:
Discounts:
IDT for Illumina UMI DNA/DNA Index Anchors Set B for Automation
20063213
包括一盒96个IDT for Illumina - UMI DNA/RNA UD Indexes Set B for Automation，足以标记96个样本，一盒96个IDT for Illumina - UMI DNA Index Anchors for Automation。
List Price:
Discounts:
Illumina Cell-Free DNA Prep with Enrichment培训
20122119
为期两天的入门课程旨在通过详细的实际操作指导，让新用户熟悉Illumina cfDNA Prep with Enrichment工作流程。参与者将学习工作流程中的所有基本步骤，包括手动文库制备、富集、测序和数据分析。
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如需了解定价、供应情况等信息，请咨询销售代表。
用于NovaSeq 6000基因测序仪的试剂盒，由即用型预装试剂卡盒和流动槽组成。
使用涵盖所有主要变异类别以及来自FFPE组织的基因特征（TMB、MSI和HRD）的大型泛癌panel实现CGP。
快速、集成的文库制备工作流程，适用于各种测序应用。
请联系我们，了解我们产品和服务的相关信息，或获取技术支持。
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