NovaSeq X系列
将先进的化学、光学和信息学技术相结合，实现了超凡的速度和数据质量、出色的通量和可扩展性。
Illumina Cell-Free DNA Prep with Enrichment是一种高度灵敏的文库制备解决方案，用于检测cfDNA样本中的低丰度突变。该工作流程包括用于纠错和降低假阳性率的唯一分子标记（UMI），从而准确、灵敏地检测低频突变。
Illumina cell-free DNA Prep with Enrichment
快速、灵活、可扩展的cfDNA文库制备试剂盒，用于高灵敏度突变检测
概述
快速、灵活的格式
Illumina cell-free DNA Prep with Enrichment与用户提供的因美纳或第三方供应商的富集寡核苷酸兼容，包括Integrated DNA Technologies（IDT）的单链DNA（ssDNA）和Twist Bioscience的双链DNA（dsDNA），具有更出色的内容可移植性。该试剂盒可用于55-2000 Kb（ssDNA）和70-2000 Kb（dsDNA）panel内容物，从而实现灵活的研究设计。可在约8.5-9.5小时内制备好可直接用于测序的文库，手动操作时间约为2.5-3小时，使研究人员能够在一天内完成从提取的cfDNA到测序的整个流程。NextSeq 550的推荐读长为2 × 149 bp，NextSeq 2000和NovaSeq 6000的推荐读长为2 × 151 bp。
高性能文库制备
Illumina cfDNA Prep with Enrichment可检测低频变异，包括SNV、CNV、插入缺失变异和基因融合。该试剂盒可从仅20 ng cfDNA中识别等位基因频率低至0.2%的小变异，灵敏度≥90%。
从样本到结果的精简工作流程
该试剂盒是集成式工作流程的一部分，从cfDNA提取开始，然后在因美纳中高通量系统上进行测序，并使用DRAGEN for ILMN cfDNA Prep with Enrichment App进行高度准确的变异检出。这种用户友好的解决方案与液体处理自动化兼容，并支持样本拆分，以实现可扩展的效率和高数据质量。
规格
| 系统 | NovaSeq 6000Dx仪器, NextSeq 550系统, NextSeq 2000系统, NextSeq 1000系统, 研究模式下的NextSeq 550Dx, NovaSeq X基因测序仪, NextSeq 500系统, NovaSeq 6000系统 |
|---|---|
| 方法 | 定制测序, 靶向DNA测序, 靶向富集 |
| 核酸类型 | DNA |
| 特殊的样本类型 | 游离DNA |
| 物种 | 人 |
| 技术 | Illumina测序 |
| 变异类别 | 基因融合, 体细胞变异, 单核苷酸位点变异（SNV）, 插入缺失（indel）, 拷贝数变异（CNV） |
需要的产品
完成工作流程需要上述标签板。手动和自动化工作流程有特定的SKU。
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结果
应用
工作流程示例
文档
支持文档
- Illumina Adapter Sequences
- Illumina cell-free DNA Prep with Enrichment Analysis
- Index Adapters Pooling Guide
- Denature and Dilute Protocol Generator
- DRAGEN Analysis Workflows Product Documentation
- Illumina Cell-Free DNA Prep with Enrichment Product Documentation
- 因美纳接头序列
- Illumina游离DNA Prep with Enrichment分析
- DRAGEN分析工作流程产品
- Illumina Cell-Free DNA Prep with Enrichment产品
- 变性和稀释实验方案生成器
- 标签序列接头混合指南
比较
| Illumina cell-free DNA Prep with Enrichment | Illumina DNA Prep with Enrichment | TruSight Oncology 500 ctDNA v2 | |
|---|---|---|---|
| 系统 | NovaSeq 6000Dx仪器, NextSeq 550系统, NextSeq 2000系统, NextSeq 1000系统, 研究模式下的NextSeq 550Dx, NovaSeq X基因测序仪, NextSeq 500系统, NovaSeq 6000系统 | MiSeq 系统, iSeq 100系统, NextSeq 550系统, NextSeq 2000系统, 研究模式下的MiSeqDx, MiniSeq基因测序仪, 研究模式下的NextSeq 550Dx, NovaSeq X基因测序仪, 研究模式下的NovaSeq 6000Dx, NovaSeq 6000系统, NovaSeq X Plus基因测序仪 | NovaSeq 6000系统 |
| 方法 | 定制测序, 靶向DNA测序, 靶向富集 | 定制测序, 靶向DNA测序, 外显子组测序, 靶向富集 | 靶向DNA测序, 靶向富集 |
| 核酸类型 | DNA | DNA | DNA |
| 特殊的样本类型 | 游离DNA | 血液, 低起始量样本, FFPE组织, 唾液 | 循环肿瘤DNA, 血液 |
| 物种 | 人 | 其他, 人 | 人 |
| 技术 | Illumina测序 | Illumina测序 | Illumina测序 |
| 变异类别 | 基因融合, 体细胞变异, 单核苷酸位点变异（SNV）, 插入缺失（indel）, 拷贝数变异（CNV） | 单核苷酸多态性（SNP）, 杂合性缺失（LOH）, 体细胞变异, 生殖系变异, 插入缺失（indel）, 拷贝数变异（CNV） | 单核苷酸位点变异（SNV）, 插入缺失（indel）, 拷贝数变异（CNV）, 血液肿瘤突变负荷（bTMB）, 血液微卫星不稳定性（bMSI） |
*系统兼容性：对于NextSeq2000，仅测试P3流动槽
Illumina® cfDNA Prep, Ligation (16样本)
20104105
包括基于连接的文库制备，用于自动化制备16个文库或手动制备24个文库。不包含富集试剂。在Illumina Connected Analytics或BaseSpace Sequence Hub上免费分析数据。需要基础订阅云端平台。不包括数据存储。UMI标签接头和唯一双标签需单独购买，两者是文库制备所必需的。根据自动化或手动工作流程选择UMI标签接头和唯一双标签。不包括富集panel内容。
Illumina® cfDNA Prep, Ligation (96样本)
20104106
包括基于连接的文库制备，用于自动化制备96个文库或手动制备120个文库。不包含富集试剂。在Illumina Connected Analytics或BaseSpace Sequence Hub上免费分析数据。需要基础订阅云端平台。不包括数据存储。UMI标签接头和唯一双标签需单独购买，两者是文库制备所必需的。根据自动化或手动工作流程选择UMI标签接头和唯一双标签。不包括富集panel内容。
Illumina® cfDNA Enrichment (16次反应)
20104107
包括用于富集Illumina cfDNA Prep文库的快速富集试剂，用于自动化制备的16次反应，或手动制备的24次反应。建议使用1-plex和4-plex的富集重数（在单次富集中混合4个文库）。在Illumina Connected Analytics或BaseSpace Sequence Hub上免费分析数据。需要基础订阅云端平台。不包括数据存储。UMI标签接头和唯一双标签需单独购买，两者是文库制备所必需的。根据自动化或手动工作流程选择UMI标签接头和唯一双标签。不包括富集panel内容。
Illumina® cfDNA Prep with Enrichment, Ligation（192个样本，4-plex），云端分析
20104103
包括基于连接的文库制备和快速富集试剂，用于自动化制备192个文库，或手动制备240个文库，使用4-plex富集（在单次富集中混合4个文库）。在Illumina Connected Analytics或BaseSpace Sequence Hub上免费分析数据。需要基础订阅云端平台。不包括数据存储。UMI标签接头和唯一双标签需单独购买，两者是文库制备所必需的。根据自动化或手动工作流程选择UMI标签接头和唯一双标签。不包括富集panel内容。
ILMN cfDNA Prep ENR，本地（192/240）
20104104
包括基于连接的文库制备和快速富集试剂，用于自动化制备192个文库，或手动制备240个文库，使用4-plex富集（在单次富集中混合4个文库）。包含10,000 Gb、1年DRAGEN服务器许可证。足以采用30,000X测序深度分析高达400 kb内容的测序输出。需要Illumina DRAGEN Server。UMI标签接头和唯一双标签需单独购买，两者是文库制备所必需的。根据自动化或手动工作流程选择UMI标签接头和唯一双标签。不包括富集panel内容。
配套产品 (4)
IDT® for Illumina® UMI DNA/RNA UD Indexes Set A, Ligation（96个标签，96个样本）
20034701
UMI DNA Index Anchors（板 = 20031416，盒 = 20032620）+ Nextera Compatible Unique Dual Index A（销售试剂盒 = 20027213，板 = 20025019，盒 = 20026121）
IDT® for Illumina® UMI DNA/RNA UD Indexes Set B, Ligation（96标签，96样本）
20034702
IDT for Illumina UMI DNA Index Anchors Set B
IDT for Illumina UMI DNA/DNA Index Anchors Set A for Automation
20066404
包括一盒96个IDT for Illumina - UMI DNA/RNA UD Indexes Set A for Automation，足以标记96个样本，一盒96个IDT for Illumina - UMI DNA Index Anchors for Automation。
IDT for Illumina UMI DNA/DNA Index Anchors Set B for Automation
20063213
包括一盒96个IDT for Illumina - UMI DNA/RNA UD Indexes Set B for Automation，足以标记96个样本，一盒96个IDT for Illumina - UMI DNA Index Anchors for Automation。
服务 (1)
Illumina Cell-Free DNA Prep with Enrichment培训
20122119
为期两天的入门课程旨在通过详细的实际操作指导，让新用户熟悉Illumina cfDNA Prep with Enrichment工作流程。参与者将学习工作流程中的所有基本步骤，包括手动文库制备、富集、测序和数据分析。
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MiSeq v3试剂盒
与早期版本相比，优化的试剂盒可增加簇密度和读长，从而提高测序质量分值。
TruSight Oncology 500
使用涵盖所有主要变异类别以及来自FFPE组织的基因特征（TMB、MSI和HRD）的大型泛癌panel实现CGP。
Illumina DNA Prep
快速、集成的文库制备工作流程，适用于各种测序应用。
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