使用涵盖所有主要变异类型及TMB、MSI、HRD等基因特征的泛癌种综合panel,以更高效的流程,更快从FFPE样本中获得CGP检测结果。
TruSight Oncology 500 系列提供泛癌种新一代测序检测,可在实验室内完成全面基因组分析(CGP)。通过一次整合检测即可同步获取关键指南与临床试验关注的生物标志物,相较分步检测,样本用量更少,结果更多。
化肿瘤的“未知”为“可知”
依托组织或液体活检样本,为临床研究提供全面基因组分析解决方案
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TruSight Oncology 500 系列提供泛癌种新一代测序检测,可在实验室内完成全面基因组分析(CGP)。通过一次整合检测即可同步获取关键指南与临床试验关注的生物标志物,相较分步检测,样本用量更少,结果更多。
使用涵盖所有主要变异类型及TMB、MSI、HRD等基因特征的泛癌种综合panel,以更高效的流程,更快从FFPE样本中获得CGP检测结果。
TruSight Oncology 500 ctDNA v2
使用能够检测血浆中ctDNA的关键IO基因特征(TMB、MSI)以及所有主要变异类别的泛癌panel进行CGP分析。
以上为覆盖多种癌症类型的基因组肿瘤分析生物标志物节选a
泛癌种: BRAF, NTRK1, NTRK2, NTRK3, RET, TMB, MSI
有意义的生物标志物基因a | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
AKT1 | BRCA1 | BRCA2 | ESR1 | PIK3CA | PTEN | |||
KRAS | NRAS | POLD1 | POLE | |||||
ALK | BRAF | EGFR | ERBB2 | KRAS | MET | |||
RET | ROS1 | |||||||
KIT | NRAS | |||||||
BRCA1 | BRCA2 | HRD | ||||||
ATM | ATR | BARD1 | BRCA1 | BRCA2 | BRIP1 | |||
CDK12 | CHEK1 | CHEK2 | FANCL | MRE11A | NBN | |||
PALB2 | RAD51B | RAD51C | RAD51D | RAD54L | ||||
POLE |
本表所列基因与生物标志物仅为 panel 包含内容的一部分。完整基因列表请见各自产品页面“产品资料”栏下的产品说明书。
TruSight Oncology 500 v2* | TruSight Oncology 500 ctDNA v2 | |
---|---|---|
分析时间 | 从样本上机到最终结果:3–4 天 | 从纯化核酸到变异报告:3–4 天 |
自动化功能 | 自动化工作站 | 自动化工作站 |
自动化详情 | 探索可用的自动化方法 | 探索可用的自动化方法 |
癌症类型 | 泛癌种、实体瘤 | 泛癌种、实体瘤 |
内容说明 |
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说明 | 利用 FFPE 样本的 DNA 与 RNA,一次性完成实体瘤综合基因组分析;单份样本即可实现变异检测与生物标志物评估,全面刻画肿瘤特征。 | 为液体活检样本(血浆 ctDNA)提供非侵入式研究方案,实现全面基因组分析;凭借微创采样,揭示肿瘤内部及肿瘤间异质性,与基于组织的 CGP 互为补充。 |
手动操作时间 | 手动流程约 7 小时 | 自动化流程约 1.5 小时 手动流程约 2.5 小时 |
起始量 | DNA 30 ng(最低 10 ng)、RNA 40 ng(最低 20 ng) | cfDNA 20 ng(对应 4 ml 血浆) |
仪器 | NextSeq 550 测序仪, NextSeq 2000 测序仪, NextSeq 1000 测序仪, NextSeq 550Dx(研究模式下), NovaSeq X 测序仪, NovaSeq 6000 测序仪, NovaSeq X Plus 测序仪 | NovaSeq X 测序仪, NovaSeq X Plus测序仪, NovaSeq 6000测序仪 |
方法 | 靶向DNA测序, 靶向RNA测序, 靶向富集 | 靶向富集, 靶向DNA测序 |
多重分析 | NextSeq 550/Dx: 8 样本/运行。 NexSeq 1000/2000: P2 芯片 8 样本,P3 芯片 24 样本,P4 芯片 36 样本。 NovaSeq 6000: SP 芯片 16 样本,S1 芯片 32 样本,S2 芯片 72 样本,S4 芯片 192 样本。 NovaSeq X/X+: 1.5 B 芯片 32 样本,10 B 芯片 192 样本,25 B 芯片 480 样本。 |
NovaSeq X Series: 1.5B 芯片可测 4 样本,10B 芯片可测 24 样本 NovaSeq 6000 System: S2 芯片可测 8 样本,S4 芯片可测 24 样本,最多支持 192 种 index |
核酸类别 | RNA, DNA | DNA |
样本通量 | 8–960 样本/运行 | 4-48 样本/运行 |
特殊的样本类型 | FFPE 组织 | 循环肿瘤DNA、血液 |
物种类别 | 人类 | 人类 |
技术 | 测序 | 测序 |
变异种类 | 基因融合、杂合性缺失(LOH)、体细胞变异、转录本变异、单核苷酸变异(SNVs)、插入/缺失(indels)、拷贝数变异(CNVs)、基因组不稳定评分(GIS)、微卫星不稳定性(MSI)、肿瘤突变负荷(TMB)、新型转录本、单核苷酸多态性(SNPs)、结构变异 | 单核苷酸位点变异(SNV)、插入缺失(indel)、拷贝数变异(CNV) |
TruSight Oncology 500、TruSight Oncology 500 HT和TruSight Oncology 500 ctDNA覆盖了523个涉及DNA和RNA变异的癌症相关基因。(只有TruSight Oncology 500和基于组织的TruSight Oncology 500 High-Throughput检测包含RNA变异。)根据与多种实体瘤类型的指南、药物标签和临床试验的比对来选择基因。更多详细信息和完整的基因列表,请参阅TruSight Oncology 500和TruSight Oncology 500 HT和TruSight Oncology 500 ctDNA数据表。
HRD是一种基因组特征,与细胞无法使用同源重组修复(HRR)通路来修复双链DNA断裂相关。当HRR通路受损时,这些断裂要么无法修复,要么被其他通路修复,导致基因组不稳定和肿瘤发生2。TruSight Oncology 500 HRD作为TruSight Oncology 500的附加产品,可评估基因组不稳定性(GIS),揭示与卵巢癌、乳腺癌、胰腺癌和前列腺癌相关的肿瘤信息3。
TruSight Oncology 500 ctDNA v2包含与TruSight Oncology 500 HT相似的内容,但仅从23个基因的DNA中检出基因融合(而组织为55个)。此外,TruSight Oncology 500 ctDNA v2不包括HRD评估。
联系因美纳代表,了解有关TruSight Oncology 500产品的更多信息,寻找满足您需求的检测方法。
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*TruSight Oncology v2 目前未在日本上市销售。
参考文献