TruSight Myeloid Sequencing Panel

这款测序研究Panel能靶向与骨髓细胞性恶性肿瘤相关的变异，例如AML、MDS、MPN、CML、CMML和JMML。

TruSight Myeloid Sequencing Panel
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3小时

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概述

TruSight Myeloid Sequencing Panel采用专家定义的内容和成熟的新一代测序（NGS）技术，可识别骨髓细胞性恶性肿瘤中的体细胞变异。

本panel内容由血癌病症领域公认的专家组成的联盟设计，靶向下列病症中频繁突变的基因：

急性骨髓性白血病（AML）
骨髓增生异常综合症（MDS）
骨髓增殖性肿瘤（MPN）
慢性骨髓性白血病（CML）
慢性骨髓单核细胞性白血病（CMML）
青少年骨髓单核细胞性白血病（JMML）

TruSight Myeloid Sequencing Panel涵盖了15个完整基因（仅外显子）和39个覆盖致癌基因热点的其他基因，单次检测即可对已知与骨髓细胞性恶性肿瘤相关的关键基因进行综合性评估。本方案适用于实体瘤谱分析，结果准确、成本低廉。在“图”部分查看基因列表。

TruSight Myeloid文库非常适合在台式测序仪上运行，可通过带有Somatic Variant Caller的MiSeq Reporter或Local Run Manager Amplicon工作流程进行比对和变异检出。然后可以使用变异分析软件进行过滤和注释。

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性能参数

分析时间	8小时
癌症类型	血液恶性肿瘤
内容说明	靶向与骨髓恶性肿瘤相关的54个基因。探针可从肿瘤抑制基因和突变热点中扩增568个扩增子。
说明	用于骨髓恶性肿瘤的体细胞突变检测研究。
手动操作时间	3小时
起始量	50 ng
系统	MiSeq 系统, 研究模式下的MiSeqDx, MiniSeq基因测序仪, NextSeq 500系统
方法	靶向DNA测序, 扩增子测序
多重分析	多达96重
核酸类型	DNA
特殊的样本类型	不兼容FFPE, 不兼容FFPE
物种	人
技术	Illumina测序
变异类别	体细胞变异, 插入缺失（indel）

所需产品

每个 TruSight Myeloid 文库制备试剂盒（96个样本）需要以下辅助试剂盒：

TruSeq Custom Amplicon Index Kit （96个标签，384个样本）FC-130-1003：每4个TruSight Myeloid试剂盒需要1个Index试剂盒。
TruSeq Custom Amplicon Filter Plate（1块板），FC-130-1006：每个TruSight Myeloid试剂盒一个（96个样本）。
TruSeq Index Plate Fixture and Collar Kit （每个2个），FC-130-1007：在PCR扩增之前，便于对序列接头、标签引物和试剂进行移液。仅限一次性购买（可重复使用）。

/ 结果

应用

工作流程示例

制备

TruSight Myeloid Sequencing Panel

测序

分析

变异分析软件

项目建议

仪器	推荐的样本数	读长
MiniSeq基因测序仪	每次运行的样本数：中通量：2–3，高通量：8（基于95%的扩增子覆盖度＞500×）	2 × 150 bp（建议最大）
MiSeq 系统	每次运行8个样本（v3试剂，基于95%的扩增子覆盖度＞500×）	2 × 150 bp（建议最大）
NextSeq 550系统	每次运行的样本数：中通量：48，高通量：96（基于95%的扩增子覆盖度＞500×）	2 × 150 bp（建议最大）

文档

产品资料

TruSight Myeloid Sequencing Panel
数据表 PDF < 1 MB

Support documentation

TG VeriSeq NIPT Solution v2 RUO Assay Software Release Notes

Infinium Global Clinical Research Array Documentation

TG VeriSeq NIPT Solution v2 RUO Product Documentation

TruSight Myeloid Sequencing Panel支持

全部 TruSight Myeloid Sequencing Panel Support

比较

	TruSight Myeloid Sequencing Panel	AmpliSeq for Illumina Myeloid Panel	AmpliSeq for Illumina Cancer Hotspot Panel v2
分析时间	8小时	5.5–7.5小时（仅包括文库制备时间，不包括文库定量、归一化或混合时间）	5小时（仅文库制备；不包括文库定量、归一化或混合时间）
癌症类型	血液恶性肿瘤	血液恶性肿瘤	泛癌种, 实体瘤
内容说明	靶向与骨髓恶性肿瘤相关的54个基因。探针可从肿瘤抑制基因和突变热点中扩增568个扩增子。	靶向69个基因的生物标志物（40个关键DNA靶标基因、29个RNA融合驱动基因和5个基因表达水平）	50种与癌症具有已知关联的基因的热点区域
说明	用于骨髓恶性肿瘤的体细胞突变检测研究。	靶向panel，用于研究40个DNA基因、29个RNA融合驱动基因和5个与骨髓癌相关的基因表达水平。	针对50个癌症相关基因的热点区域的体细胞分析研究。
手动操作时间	3小时	< 1.5小时	< 1.5小时
起始量	50 ng	20 ng高质量DNA；10 ng高质量RNA （建议每个混合池10 ng）	1–100 ng（建议每个混池10 ng）
系统	MiSeq 系统, 研究模式下的MiSeqDx, MiniSeq基因测序仪, NextSeq 500系统	MiSeq 系统, MiniSeq基因测序仪	MiSeq 系统, iSeq 100系统, 研究模式下的MiSeqDx, MiniSeq基因测序仪
方法	靶向DNA测序, 扩增子测序	靶向DNA测序, 扩增子测序, 靶向RNA测序	靶向DNA测序, 扩增子测序
多重分析	多达96重	多达96重	96个双标签序列组合
核酸类型	DNA	DNA, RNA	DNA
特殊的样本类型	不兼容FFPE, 不兼容FFPE	血液, 不兼容FFPE, 骨髓	FFPE组织
物种	人	人	人
技术	Illumina测序	Illumina测序	Illumina测序
变异类别	体细胞变异, 插入缺失（indel）	单核苷酸多态性（SNP）, 基因融合, 体细胞变异, 插入缺失（indel）	单核苷酸多态性（SNP）, 体细胞变异, 插入缺失（indel）

图