产品

TruSight Myeloid Sequencing Panel

这款测序研究Panel能靶向与骨髓细胞性恶性肿瘤相关的变异，例如AML、MDS、MPN、CML、CMML和JMML。

8小时

分析时间

3小时

手动操作时间

50 ng

起始量

详情请参见规格表

概述

TruSight Myeloid Sequencing Panel采用专家定义的内容和成熟的新一代测序（NGS）技术，可识别骨髓细胞性恶性肿瘤中的体细胞变异。

本panel内容由血癌病症领域公认的专家组成的联盟设计，靶向下列病症中频繁突变的基因：

  • 急性骨髓性白血病（AML）

  • 骨髓增生异常综合症（MDS）

  • 骨髓增殖性肿瘤（MPN）

  • 慢性骨髓性白血病（CML）

  • 慢性骨髓单核细胞性白血病（CMML）

  • 青少年骨髓单核细胞性白血病（JMML）

TruSight Myeloid Sequencing Panel涵盖了15个完整基因（仅外显子）和39个覆盖致癌基因热点的其他基因，单次检测即可对已知与骨髓细胞性恶性肿瘤相关的关键基因进行综合性评估。本方案适用于实体瘤谱分析，结果准确、成本低廉。在“图”部分查看基因列表。

TruSight Myeloid文库非常适合在台式测序仪上运行，可通过带有Somatic Variant Caller的MiSeq Reporter或Local Run Manager Amplicon工作流程进行比对和变异检出。然后可以使用变异分析软件进行过滤和注释。

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性能参数

Specialized sample types Not FFPE-Compatible
内容说明 靶向与骨髓恶性肿瘤相关的54个基因。探针可从肿瘤抑制基因和突变热点中扩增568个扩增子。
分析时间 8小时
多重分析 多达96重
手动操作时间 3小时
说明 用于骨髓恶性肿瘤的体细胞突变检测研究。
起始量 50 ng

所需产品

每个 TruSight Myeloid 文库制备试剂盒（96个样本）需要以下 辅助 试剂盒：

  • TruSeq Custom Amplicon Index Kit （96个标签，384个样本）FC-130-1003：  每4个TruSight Myeloid试剂盒需要1个Index试剂盒。
  • TruSeq Custom Amplicon Filter Plate（1块板），FC-130-1006：  每个TruSight Myeloid试剂盒一个（96个样本）。
  • TruSeq Index Plate Fixture and Collar Kit （每个2个），FC-130-1007：在PCR扩增之前，便于对序列接头、标签引物和试剂进行移液。仅限 一次性购买（可重复使用）。
/

应用

工作流程示例

1
制备

TruSight Myeloid Sequencing Panel

2
测序
3
分析

项目建议

仪器 Recommended number of samples Read length
MiniSeq System

Samples per run: mid output: 2-3, high output: 8 (based on 95% amplicons at > 500x coverage)

2 × 150 bp（建议最大）
MiSeq System

8 samples per run with v3 reagents (based on 95% amplicons at > 500x coverage)

2 × 150 bp（建议最大）
NextSeq 550 System

Samples per run: mid output: 48, high output: 96 (based on 95% amplicons at > 500x coverage)

2 × 150 bp（建议最大）

相关应用和方法

病理学和临床癌症研究

我们的临床癌症研究解决方案能提供准确的基因组信息，让实验室能够在单次检测中分析多个基因。

扩增子测序

PCR扩增子的超深度测序能够分析感兴趣的特定基因组区域。深入了解扩增子测序并查找全面的解决方案。

癌症测序方法

与单基因和基于阵列的方法相比，基于 NGS 的癌症测序方法可在更短的时间内提供更多信息。

文档

产品资料
Support documentation

比较

TruSight Myeloid Sequencing Panel AmpliSeq for Illumina Myeloid Panel AmpliSeq for Illumina Cancer Hotspot Panel v2
Cancer type Hematologic Hematologic Pan-Cancer, Solid Tumor
Method Targeted DNA Sequencing, Amplicon Sequencing Targeted RNA Sequencing, Targeted DNA Sequencing, Amplicon Sequencing Targeted DNA Sequencing, Amplicon Sequencing
Specialized sample types Not FFPE-Compatible Bone Marrow, Not FFPE-Compatible, Blood FFPE Tissue
Variant class Insertions-deletions (indels), Somatic variants Gene fusions, Insertions-deletions (indels), Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Somatic variants Insertions-deletions (indels), Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Somatic variants
内容说明 靶向与骨髓恶性肿瘤相关的54个基因。探针可从肿瘤抑制基因和突变热点中扩增568个扩增子。 靶向69个基因的生物标志物（40个关键DNA靶标基因、29个RNA融合驱动基因和5个基因表达水平） 50种与癌症具有已知关联的基因的热点区域
分析时间 8小时 5.5–7.5小时（仅包括文库制备时间，不包括文库定量、归一化或混合时间） 5小时（仅文库制备；不包括文库定量、归一化或混合时间）
多重分析 多达96重 多达96重 96个双标签序列组合
手动操作时间 3小时 < 1.5小时 < 1.5小时
技术 Illumina测序 Illumina测序 Illumina测序
核酸类型 DNA DNA, RNA DNA
物种 人 人 人
系统 MiSeq Desktop Sequencer, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeq System, NextSeq 500 Desktop Sequencer MiSeq Desktop Sequencer, MiniSeq System MiSeq Desktop Sequencer, iSeq 100 System, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeq System
说明 用于骨髓恶性肿瘤的体细胞突变检测研究。 靶向panel，用于研究40个DNA基因、29个RNA融合驱动基因和5个与骨髓癌相关的基因表达水平。 针对50个癌症相关基因的热点区域的体细胞分析研究。
起始量 50 ng 20 ng高质量DNA；10 ng高质量RNA
（建议每个混合池10 ng）		 1–100 ng（建议每个混池10 ng）

图

TruSight Myeloid Sequencing Panel基因列表

ABL1 CEBPA HRAS MYD88 SF3B1
ASXL1 CSF3R IDH1 NOTCH1 SMC1A
ATRX CUX1 IDH2 NPM1 SMC3
BCOR DNMT3A IKZF1 NRAS SRSF2
BCORL1 ETV6/TEL JAK2 PDGFRA STAG2
BRAF EZH2 JAK3 PHF6 TET2
CALR FBXW7 KDM6A PTEN TP53
CBL FLT3 KIT PTPN11 U2AF1
CBLB GATA1 KRAS RAD21 WT1
CBLC GATA2 MLL RUNX1 ZRSR2
CDKN2A GNAS MPL SETBP1  

TruSight Myeloid Sequencing Panel (96 samples)

FC-130-1010

适用于54个骨髓细胞性恶性肿瘤相关基因（完整基因或目标区域）的TruSeq定制扩增子文库制备试剂。包括足够用于96个样本的文库制备试剂和TruSight Myeloid寡核苷酸。

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Discounts:

TruSeq Custom Amplicon Index Kit (96 indexes, 384 samples)

FC-130-1003

每个TruSeq Custom Amplicon Index Kit内有96个唯一标签，可制备最多384个样本。

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TruSeq Custom Amplicon Filter Plate (1 plate)

FC-130-1006

包含1个在TruSeq Custom Amplicon检测中使用的可更换过滤板。

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TruSeq Index Plate Fixture & Collar Kit (2 each)

FC-130-1007

有助于正确地加入PCR扩增步骤的标签引物。内含两（2）个TruSeq Index Plate Fixture和两（2）个Plate Collar。

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