TruSight Myeloid Sequencing Panel
这款测序研究Panel能靶向与骨髓细胞性恶性肿瘤相关的变异，例如AML、MDS、MPN、CML、CMML和JMML。
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TruSight Myeloid Sequencing Panel采用专家定义的内容和成熟的新一代测序（NGS）技术，可识别骨髓细胞性恶性肿瘤中的体细胞变异。
本panel内容由血癌病症领域公认的专家组成的联盟设计，靶向下列病症中频繁突变的基因：
TruSight Myeloid Sequencing Panel涵盖了15个完整基因（仅外显子）和39个覆盖致癌基因热点的其他基因，单次检测即可对已知与骨髓细胞性恶性肿瘤相关的关键基因进行综合性评估。本方案适用于实体瘤谱分析，结果准确、成本低廉。
TruSight Myeloid文库非常适合在台式测序仪上运行，可通过带有Somatic Variant Caller的MiSeq Reporter或Local Run Manager Amplicon工作流程进行比对和变异检出。然后可以使用BaseSpace Variant Interpreter执行过滤和注释。
| 仪器 | 推荐的样本数 | 读长 |
|---|---|---|
| MiniSeq System | 每次运行的样本：中通量：2–3，高通量：8（基于95%的扩增子覆盖度＞500倍） | 2×150 bp（最大推荐值） |
| MiSeq System | 每次运行8个样本（v3试剂，基于95%的扩增子覆盖度＞500倍） | 2×150 bp（最大推荐值） |
| NextSeq 550 System | 每次运行的样本：中通量： 48，高通量： 96（基于95%的扩增子覆盖度＞500倍） | 2×150 bp（最大推荐值） |
| TruSight Myeloid Sequencing Panel | AmpliSeq for Illumina Myeloid Panel | AmpliSeq for Illumina Cancer Hotspot Panel v2 | |
|---|---|---|---|
| 分析时间 | 8小时 | 5.5–7.5小时（仅包括文库制备时间，不包括文库定量、归一化或混合时间） | 5小时（仅包括文库制备时间；不包括文库定量、归一化或混合时间） |
| 变异种类 | 体细胞变异, 插入缺失 (indels) | 体细胞变异, 基因融合, 插入缺失 (indels), 单核苷酸多态性 (SNPs) | 体细胞变异, 插入缺失 (indels), 单核苷酸多态性 (SNPs) |
| 多重分析 | 多达96重 | 多达96重 | 96个双标签序列组合 |
| 手动操作时间 | 3小时 | ＜1.5小时 | ＜1.5小时 |
| 方法 | 扩增子测序, 靶向DNA测序 | 扩增子测序, 靶向RNA测序, 靶向DNA测序 | 扩增子测序, 靶向DNA测序 |
| 物种类别 | 人类 | 人类 | 人类 |
| 特殊的样本类型 | 不兼容FFPE, Not FFPE-Compatible | Bone Marrow, Not FFPE-Compatible, 血液 | FFPE组织 |
| 癌症类型 | 血液恶性肿瘤 | 血液恶性肿瘤 | 泛癌种, 实体瘤 |
| 起始量 | 50 ng | 20 ng高质量DNA；10 ng高质量RNA （建议每个池10 ng） |
1–100 ng（建议每个混池10 ng） |
| ABL1 | CEBPA | HRAS | MYD88 | SF3B1 |
| ASXL1 | CSF3R | IDH1 | NOTCH1 | SMC1A |
| ATRX | CUX1 | IDH2 | NPM1 | SMC3 |
| BCOR | DNMT3A | IKZF1 | NRAS | SRSF2 |
| BCORL1 | ETV6/TEL | JAK2 | PDGFRA | STAG2 |
| BRAF | EZH2 | JAK3 | PHF6 | TET2 |
| CALR | FBXW7 | KDM6A | PTEN | TP53 |
| CBL | FLT3 | KIT | PTPN11 | U2AF1 |
| CBLB | GATA1 | KRAS | RAD21 | WT1 |
| CBLC | GATA2 | MLL | RUNX1 | ZRSR2 |
| CDKN2A | GNAS | MPL | SETBP1 |
TruSight Myeloid Sequencing Panel
Data Sheet | PDF < 1 MB
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