NovaSeq X系列
将先进的化学、光学和信息学技术相结合，实现了超凡的速度和数据质量、出色的通量和可扩展性。
Myeloid Panel可在一次实验分析中同时分析血液和骨髓样本的DNA和RNA，研究与血液恶性肿瘤相关的生物标记。该panel覆盖急性骨髓性白血病（AML）、骨髓增生异常综合征（MDS）、骨髓增殖性肿瘤（MPN）、慢性骨髓性白血病（CML）、慢性骨髓单核细胞性白血病（CMML）和青少年骨髓单核细胞性白血病（JMML）等主要骨髓疾病的相关靶点。主要特点包括：
AmpliSeq for Illumina Myeloid Panel
这款靶向panel可用于研究40个DNA基因、29个RNA融合驱动基因和5个骨髓癌相关基因的表达水平。
5.5–7.5小时（仅包括文库制备时间，不包括文库定量、归一化或混合时间）
分析时间
< 1.5小时
手动操作时间
20 ng高质量DNA；10 ng高质量RNA （建议每个混合池10 ng）
起始量
概览
主要特点
Myeloid Panel是集成工作流程的一部分，该工作流程包括基于AmpliSeq for Illumina聚合酶链式反应（PCR）的文库制备、采用Illumina边合成边测序（SBS）的新一代测序（NGS）技术以及自动化分析过程。
即用型panel助您节省鉴定目标基因、设计引物和优化panel所需的时间和精力。
规格
| 分析时间 | 5.5–7.5小时（仅包括文库制备时间，不包括文库定量、归一化或混合时间） |
|---|---|
| 癌症类型 | 血液恶性肿瘤 |
| 内容说明 | 靶向69个基因的生物标志物（40个关键DNA靶标基因、29个RNA融合驱动基因和5个基因表达水平） |
| 说明 | 靶向panel，用于研究40个DNA基因、29个RNA融合驱动基因和5个与骨髓癌相关的基因表达水平。 |
| 手动操作时间 | < 1.5小时 |
| 起始量 |
20 ng高质量DNA；10 ng高质量RNA （建议每个混合池10 ng） |
| 系统 | MiSeq 系统, MiniSeq基因测序仪 |
| 方法 | 靶向DNA测序, 扩增子测序, 靶向RNA测序 |
| 多重分析 | 多达96重 |
| 核酸类型 | DNA, RNA |
| 特殊的样本类型 | 血液, 不兼容FFPE, 骨髓 |
| 物种 | 人 |
| 技术 | Illumina测序 |
| 变异类别 | 单核苷酸多态性（SNP）, 基因融合, 体细胞变异, 插入缺失（indel） |
需要的产品
AmpliSeq for Illumina Myeloid Panel工作流程需要Meloid Panel寡核苷酸、AmpliSeq Library PLUS试剂盒之一和至少一个AmpliSeq标签试剂盒。将总RNA转化为cDNA需要cDNA合成。
/
结果
应用
工作流程示例
制备
AmpliSeq for Illumina Myeloid Panel
分析
项目建议
| 仪器 | 推荐的样本数 | 读长 |
|---|---|---|
| MiniSeq基因测序仪 | 每次运行的样本数（中通量）：4个DNA样本，32个RNA样本，3个组合样本（基于95%以上的覆盖度＞500×） |
2×151 bp |
| MiSeq 系统 | 每次运行的样本数（v2试剂）：7个DNA样本，60个RNA样本，6个组合样本 |
2×151 bp |
相关应用和方法
文档
产品资料
手册与支持信息
- AmpliSeq for Illumina Myeloid Panel Checklist
- Infinium Global Clinical Research Array Documentation
- Illumina Adapter Sequences
- Index Adapters Pooling Guide
- AmpliSeq for Illumina Myeloid Panel Reference Guide
- AmpliSeq for Illumina Myeloid Panel Support - Documentation & Literature
- 全部 AmpliSeq for Illumina Myeloid Panel Support
比较
| AmpliSeq for Illumina Myeloid Panel | AmpliSeq for Illumina Cancer Hotspot Panel v2 | TruSight Myeloid Sequencing Panel | |
|---|---|---|---|
| 分析时间 | 5.5–7.5小时（仅包括文库制备时间，不包括文库定量、归一化或混合时间） | 5小时（仅文库制备；不包括文库定量、归一化或混合时间） | 8小时 |
| 癌症类型 | 血液恶性肿瘤 | 泛癌种, 实体瘤 | 血液恶性肿瘤 |
| 内容说明 | 靶向69个基因的生物标志物（40个关键DNA靶标基因、29个RNA融合驱动基因和5个基因表达水平） | 50种与癌症具有已知关联的基因的热点区域 | 靶向与骨髓恶性肿瘤相关的54个基因。探针可从肿瘤抑制基因和突变热点中扩增568个扩增子。 |
| 说明 | 靶向panel，用于研究40个DNA基因、29个RNA融合驱动基因和5个与骨髓癌相关的基因表达水平。 | 针对50个癌症相关基因的热点区域的体细胞分析研究。 | 用于骨髓恶性肿瘤的体细胞突变检测研究。 |
| 手动操作时间 | < 1.5小时 | < 1.5小时 | 3小时 |
| 起始量 |
20 ng高质量DNA；10 ng高质量RNA （建议每个混合池10 ng） |
1–100 ng（建议每个混池10 ng） | 50 ng |
| 系统 | MiSeq 系统, MiniSeq基因测序仪 | MiSeq 系统, iSeq 100系统, 研究模式下的MiSeqDx, MiniSeq基因测序仪 | MiSeq 系统, 研究模式下的MiSeqDx, MiniSeq基因测序仪, NextSeq 500系统 |
| 方法 | 靶向DNA测序, 扩增子测序, 靶向RNA测序 | 靶向DNA测序, 扩增子测序 | 靶向DNA测序, 扩增子测序 |
| 多重分析 | 多达96重 | 96个双标签序列组合 | 多达96重 |
| 核酸类型 | DNA, RNA | DNA | DNA |
| 特殊的样本类型 | 血液, 不兼容FFPE, 骨髓 | FFPE组织 | 不兼容FFPE, 不兼容FFPE |
| 物种 | 人 | 人 | 人 |
| 技术 | Illumina测序 | Illumina测序 | Illumina测序 |
| 变异类别 | 单核苷酸多态性（SNP）, 基因融合, 体细胞变异, 插入缺失（indel） | 单核苷酸多态性（SNP）, 体细胞变异, 插入缺失（indel） | 体细胞变异, 插入缺失（indel） |
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图
CEBPA基因的高覆盖度
利用AmpliSeq for Illumina Myeloid Panel评估的DNA显示，在基因的整个转录本上实现深度覆盖。
Panel (1)
AmpliSeq™ for Illumina® Myeloid Panel
20024478
固定基因集panel包括与血液恶性肿瘤相关的74个基因。试剂盒可进行24次反应（包含24个DNA文库和24个RNA文库）。需要可进行48次反应的LP PLUS。Library PLUS，标签和cDNA合成试剂均为单独出售。
List Price:
Discounts:
文库制备 (3)
AmpliSeq™ Library PLUS（24次反应）for Illumina®
20019101
包含用于制备24个文库的试剂。单独购买AmpliSeq for Illumina panel和标签接头。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ Library PLUS（96次反应）for Illumina®
20019102
包含用于制备96个文库的试剂。单独购买AmpliSeq for Illumina panel和标签接头。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ Library PLUS（384次反应）for Illumina®
20019103
包含用于制备384个文库的试剂。单独购买AmpliSeq for Illumina panel和标签接头。
List Price:
Discounts:
标签接头 (6)
AmpliSeq™ UD Indexes for Illumina®（24标签，24样本）
20019104
包含足以标记24个样本的24个标签。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ CD Indexes Set A for Illumina®
20019105
包含96个标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ CD Indexes Set B for Illumina®
20019106
包含96个标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ CD Indexes Set C for Illumina®
20019107
包含96个标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备试剂、富集试剂和探针panel。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ CD Indexes Set D for Illumina®
20019167
包含96、8 bp标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备试剂和探针panel。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ CD Indexes Set A-D for Illumina®（384标签，384样本）
20031676
包含四组AmpliSeq CD Indexes for Illumina、Set A、Set B、Set C和Set D。每组包含96、8 bp标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备和探针panel。
List Price:
Discounts:
配套产品 (2)
Ampliseq™ cDNA Synthesis for Illumina®
20022654
使用AmpliSeq for Illumina RNA Panel（例如，AmpliSeq for Illumina Immune Response、Immune Repertoire Plus、TCR beta Panel、Myeloid、Transcriptome Human Gene Expression、Focus和 Comprehensive Panel v3以及定制或社区RNA Panel）时，包含反应混合物和酶混合物，可将总RNA转化为cDNA。反应次数因panel而异（例如，AmpliSeq for Illumina Immune Response、Focus、 Comprehensive Panel v3和Custom Panel的每个试剂盒有100次反应，AmpliSeq for Illumina Transcriptome Human Gene Expression、Myeloid、Immune Repertoire Plus和TCR beta Panel的每个试剂盒有200次反应）。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ Library Equalizer for Illumina®
20019171
在制备用于测序的AmpliSeq for Illumina文库时，包含用于文库归一化的磁珠和试剂。
List Price:
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MiSeq v3试剂盒
与早期版本相比，经过优化的试剂盒可增加簇密度和读长，从而提高测序质量分值。
TruSight Oncology 500
使用涵盖所有主要变异类别以及来自FFPE组织的基因特征（TMB、MSI和HRD）的大型泛癌panel实现CGP。
Illumina DNA Prep
快速、集成的文库制备工作流程，适用于各种测序应用。
AmpliSeq for Illumina Immune Response Panel
用于研究395种参与肿瘤—免疫系统相互作用基因的靶向RNA表达panel。
TruSight Hereditary Cancer Panel
评估与遗传癌症风险倾向相关的113个基因和125个SNP的生殖系突变的靶向测序panel。
iSeq 100试剂盒
iSeq 100测序仪的试剂盒采用即用型卡盒以及单通道SBS化学和CMOS技术，可实现简单、低成本的测序。
AmpliSeq for Illumina Custom RNA Panel
优化的靶向定制RNA研究panel，可测序多达1200个感兴趣的基因组靶点。
AmpliSeq for Illumina Custom DNA Panel
专为特异性靶点或感兴趣的基因组内容测序进行优化的靶向定制研究panel。
AmpliSeq for Illumina Focus Panel
用于研究52个与实体瘤相关的基因的靶向DNA和RNA研究panel。
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