AmpliSeq for Illumina Focus Panel
用于研究52个与实体瘤相关的基因的靶向DNA和RNA研究panel。
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AmpliSeq for Illumina Focus Panel是一种靶向重测序分析套装，用于对52种与实体瘤具有已知关联的基因的生物标记物进行分析。利用这种Focus Panel，研究人员能够同时分析DNA和RNA。主要特点包括：
Focus Panel是集成工作流程的一部分，该工作流程包括基于AmpliSeq for Illumina聚合酶链式反应（PCR）的文库制备、采用Illumina边合成边测序（SBS）的新一代测序（NGS）技术以及自动化分析过程。
即用型panel助您节省鉴定目标基因、设计引物和优化panel所需的时间和精力。
| 仪器 | 推荐的样本数 | 读长 |
|---|---|---|
| iSeq 100 System | 8 samples per run (assumes minimum coverage of 500×) | 2 × 150 bp |
| MiniSeq System | Samples per run: mid output: 16, high output: 48 (assumes minimum coverage of 500×) | 2 × 150 bp |
| MiSeq System | Samples per run (by reagent kit version): v2 micro: 8, v2: 30, v3: 48 (assumes minimum coverage of 500×) | 2 × 150 bp |
| AmpliSeq for Illumina Focus Panel | AmpliSeq for Illumina Comprehensive Panel v3 | AmpliSeq for Illumina Cancer Hotspot Panel v2 | TruSight Tumor 15 | |
|---|---|---|---|---|
| 内容说明 | 52个癌基因的DNA和RNA靶点 | 161个癌基因的DNA和RNA靶点 | 50种与癌症具有已知关联的基因的热点区域 | 从15个实体瘤相关基因中扩增250个扩增子 |
| 分析时间 | 5-6小时（仅为文库制备时间，不包括文库定量、归一化或混合时间） | 5-6小时（仅为文库制备时间，不包括文库定量、归一化或混合时间） | 5小时（仅包括文库制备时间；不包括文库定量、归一化或混合时间） | 7小时 |
| 多重分析 | 96个双标签序列组合 | 96个双标签序列组合 | 96个双标签序列组合 | 1-24重 |
| 手动操作时间 | ＜1.5小时 | ＜1.5小时 | ＜1.5小时 | 3.5小时 |
| 方法 | 扩增子测序, 靶向RNA测序, 靶向DNA测序 | 扩增子测序, 靶向RNA测序, 靶向DNA测序 | 扩增子测序, 靶向DNA测序 | 扩增子测序, 靶向DNA测序 |
| 核酸类型 | DNA, RNA | DNA, RNA | DNA | DNA |
| 物种类别 | 人类 | 人类 | 人类 | 人类 |
| 特殊的样本类型 | FFPE组织 | FFPE组织 | FFPE组织 | FFPE组织 |
| 癌症类型 | 实体瘤 | 实体瘤 | 泛癌种, 实体瘤 | 实体瘤 |
| 说明 | 针对52个实体瘤相关基因的体细胞分析研究。 | 针对实体瘤相关基因热点及全长靶点的体细胞分析研究。 | 针对50个癌症相关基因的热点区域的体细胞分析研究。 | 重点panel，使用简单的工作流程研究15个基因中的相关实体瘤体细胞变异。 |
| 起始量 | 1–100 ng（建议每个混池10 ng） | 1–100 ng（建议每个混池10 ng） | 1–100 ng（建议每个混池10 ng） | 20 ng |
AmpliSeq for Illumina Oncology Panels on the iSeq 100 System
Application Note | PDF < 1 MB
Analytical performance of the AmpliSeq for Illumina Focus Panel with FFPE samples
Application Note | PDF < 1 MB
Automated Solutions for AmpliSeq for Illumina Sequencing Panels
Application Note | HTML
Ampliseq for Illumina Focus Panel Data Sheet
Data Sheet | HTML
AmpliSeq for Illumina Focus Panel Gene List
product_file | EXCEL < 1 MB
Sample identification with the AmpliSeq for Illumina Sample ID Panel
Application Note | PDF < 1 MB
Illumina Adapter Sequences Documentation
AmpliSeq for Illumina Focus Panel Support - Documentation & Literature
AmpliSeq for Illumina Focus Panel Checklist Documentation
AmpliSeq for Illumina Focus Panel Reference Guide Documentation
Index Adapters Pooling Guide Documentation
AmpliSeq for Illumina Direct FFPE DNA Kit Reference Guide Documentation
AmpliSeq for Illumina Focus Panel Consumables & Equipment Documentation
自定义协议选择器
Generates customized, end-to-end instructions
