
NovaSeq X系列
将先进的化学、光学和信息学技术相结合,实现了超凡的速度和数据质量、出色的通量和可扩展性。
一种经济高效、灵活的靶向长读长解决方案,可解析人类基因组难以绘制的区域。
分析时间
手动操作时间
起始量
Illumina Complete Long Reads with Enrichment, Human可从低起始量DNA中实现高度准确、经济高效的靶向长读长。该文库制备试剂盒通过选择靶向长读长panel来补充标准的短读长全基因组,从而发挥长读长最大价值,以获得更多具有成本效益的见解。注:执行分析需要来自同一样本的标准≥30×短读长WGS数据,以补充靶向长读长。
分析时间 | 约2天 |
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说明 | 灵活、经济高效的靶向长读长与短读长数据相结合,可实现高度准确的WGS。与预先设计或定制的panel搭配使用,解决难以绘制的基因组区域,或将定相测序添加到目标区域。 |
手动操作时间 | 约6小时 |
起始量 | 建议50 ng DNA;低至10 ng DNA |
系统 | NovaSeq X基因测序仪, 研究模式下的NovaSeq 6000Dx, NovaSeq 6000系统, NovaSeq X Plus基因测序仪 |
方法 | 定制测序, 靶向DNA测序, 长读长测序, 定相测序, 全基因组测序, 靶向富集 |
多重分析 | 每个通道最多384个样本(取决于panel靶标大小和测序输出) |
核酸类型 | DNA |
反应次数 | 24或96次反应 |
特殊的样本类型 | 血液, 不兼容FFPE, 唾液 |
物种 | 人 |
目标插入片段大小 | 插入片段大小:500–700 bp,读长N50 5–7 kb |
技术 | Illumina测序 |
变异类别 | 单核苷酸多态性(SNP), 生殖系变异, 结构变异, 单核苷酸位点变异(SNV), 插入缺失(indel), 拷贝数变异(CNV) |
Illumina Complete Long Read Prep with Enrichment, Human包含用于生成靶向长读长文库的核心试剂。购买用于富集的探针panel,无论是预制的Human Comprehensive Panel(可单独订购,也可作为试剂盒的一部分订购),还是DesignStudio定制检测设计工具上的预设计或定制panel。
我需要哪些配套产品?
需要Illumina唯一双标签序列,以及足够的iCredit,以满足基于通量的数据存储和分析需求。
Illumina Complete Long Read with Enrichment分析需要来自同一样本的标准短读长≥30 x全基因组文库。建议使用Illumina DNA PCR-Free Prep制备标准短读长全基因组的文库。也兼容第三方WGS试剂盒。未标记的文库不需要平行制备或测序;可以使用来自之前检测过的样本的FASTQ文件。
Illumina Complete Long Read Prep with Enrichment,Human
定制panel
DRAGEN ICLR (Illumina Complete Long Read) with Enrichment App
仪器 | Recommended number of samples | Read length |
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NovaSeq 6000 System | Human Comprehensive Panel:每个S4流动槽24个样本 |
2 × 150 |
NovaSeq X System | Human Comprehensive Panel:每个10B流动槽24个样本,每个25B流动槽64个样本 |
2 × 150 |
NextSeq 2000 System | Human Comprehensive Panel:每个P3流动槽3个样本 |
2 × 150 |
Illumina Complete Long Read Prep with Enrichment,Human | Illumina Complete Long Read Prep, Human | Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment | |||
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分析时间 | 约2天 | 约7.5–8.5小时 | 6.5小时 | ||
说明 | 灵活、经济高效的靶向长读长与短读长数据相结合,可实现高度准确的WGS。与预先设计或定制的panel搭配使用,解决难以绘制的基因组区域,或将定相测序添加到目标区域。 | Illumina Complete Long Read Prep,Human使用现有的Illumina NovaSeq平台执行长读长人类生殖系全基因组测序。 | 一种快速、易于使用的文库制备方法,具有富集工作流程,采用具有最新外显子组内容的聚焦富集探针panel,可实现经济高效、可靠的人类全外显子组测序。 | ||
手动操作时间 | 约6小时 | 5–6小时,包括(PCR和QC) | 约2小时 | ||
起始量 | 建议50 ng DNA;低至10 ng DNA | 建议50 ng DNA | 50-1,000 ng高质量基因组DNA(如果直接使用血液和唾液样本,请参阅参考指南) | ||
系统 | NovaSeq X基因测序仪, 研究模式下的NovaSeq 6000Dx, NovaSeq 6000系统, NovaSeq X Plus基因测序仪 | NovaSeq 6000Dx仪器, NovaSeq X基因测序仪, NovaSeq 6000系统, NovaSeq X Plus基因测序仪 | NextSeq 550系统, NextSeq 2000系统, NextSeq 1000系统, 研究模式下的NextSeq 550Dx, NovaSeq X基因测序仪, NovaSeq 6000系统, NovaSeq X Plus基因测序仪 | ||
方法 | 定制测序, 靶向DNA测序, 长读长测序, 定相测序, 全基因组测序, 靶向富集 | 长读长测序, 全基因组测序 | 靶向DNA测序, 外显子组测序, 靶向富集 | ||
多重分析 | 每个通道最多384个样本(取决于panel靶标大小和测序输出) | 多达48个 | 对多达12重预富集文库混合池进行测试。试剂盒配置支持多达192个样本的多重分析。最多支持384个样本。 | ||
核酸类型 | DNA | DNA | DNA | ||
反应次数 | 24或96次反应 | 8或24 | |||
特殊的样本类型 | 血液, 不兼容FFPE, 唾液 | 血液, 不兼容FFPE, 低起始量样本, 唾液 | 血液, 唾液 | ||
物种 | 人 | 人 | 人 | ||
目标插入片段大小 | 插入片段大小:500–700 bp,读长N50 5–7 kb | 500–700 bp | |||
技术 | Illumina测序 | Illumina测序 | Illumina测序 | ||
变异类别 | 单核苷酸多态性(SNP), 生殖系变异, 结构变异, 单核苷酸位点变异(SNV), 插入缺失(indel), 拷贝数变异(CNV) | 短串联重复序列(STR), 生殖系变异, 结构变异, 单核苷酸位点变异(SNV), 插入缺失(indel) | 单核苷酸多态性(SNP), 杂合性缺失(LOH), 体细胞变异, 生殖系变异, 插入缺失(indel), 拷贝数变异(CNV) |
通过靶向长读长提高复杂区域的变异检出准确性
与标准短读长WGS(蓝色)相比,使用Illumina Complete Long Read Prep with Enrichment(橙色)在(A)Illumina Human Comprehensive Panel或(B)CMRG Panel靶向的HG002基因区域的SNP和插入缺失的假阴性(FN)和假阳性(FP)变异检出情况。
Illumina Complete Long Read技术为一系列检测提供支持,可在一台仪器上获得高准确度的长读长和短读长数据。
Illumina Complete Long Read Prep with Enrichment, Human Comprehensive Panel (24 samples)
20113834
一种文库制备和富集解决方案,带有探针panel,旨在解决有利于长读长人类全基因组测序(WGS)应用的区域。
Illumina Complete Long Read Prep with Enrichment, Human Comprehensive Panel (96 samples)
20113835
一种文库制备和富集解决方案,带有探针panel,旨在解决有利于长读长人类全基因组测序(WGS)应用的区域。
Illumina Human Comprehensive Panel (24 samples)
20113836
杂交捕获探针panel,用于靶向人类基因组的区域,将有利于长读长全基因组测序(WGS)应用。
Illumina Human Comprehensive Panel (96 samples)
20113837
杂交捕获探针panel,用于靶向人类基因组的区域,将有利于长读长全基因组测序(WGS)应用。
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation(96标签,96样本)
20091654
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation(96个标签,96个样本)包括96个10 bp标签,足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96标签, 96样本)
20091656
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation(96个标签,96个样本)包括96个10 bp标签,足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96标签, 96样本)
20091658
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation(96个标签,96个样本)包括96个10 bp标签,足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96标签, 96样本)
20091660
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation(96个标签,96个样本)包括96个10 bp标签,足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。
Illumina Analytics - 1 iCredit
20042038
iCredit用于在BaseSpace Sequence Hub或Illumina Connected Analytics上进行的数据存储和分析。
Illumina Analytics Starter Pack - 1,000 iCredits
20042039
iCredit用于在BaseSpace Sequence Hub或Illumina Connected Analytics上进行的数据存储和分析。
Illumina Analytics - 5,000 iCredits
20042040
iCredit用于在BaseSpace Sequence Hub或Illumina Connected Analytics上进行的数据存储和分析。
Illumina® DNA PCR-Free Prep, Tagmentation (24样本)
20041794
包含用于制备24个文库的试剂和Illumina纯化磁珠。单独购买标签接头。
Illumina® DNA PCR-Free Prep, Tagmentation (96样本)
20041795
包含用于制备96个文库的试剂和Illumina纯化磁珠。单独购买标签接头。
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