这个靶向RNA测序集合是一个经济高效的解决方案，可检测多种癌症类型中的基因融合，而无论其来源如何。这个检测覆盖507个与融合相关的基因，让研究人员能够评估血液、骨髓和FFPE样品中大多数与癌症相关的已知融合，并有能力确定新的基因融合伴侣。
仪器附带的融合检出为实验室提供了基于NGS的融合检测，而无需额外的生物信息学支持。分析带来了检测到的融合列表、相关的疾病关联（通过Mitelman数据库确定），以及支持融合的序列证据。
这项检测允许使用低至20 ng的FFPE RNA或10 ng新鲜冻存的总RNA。TruSight RNA Fusion Panel为癌症研究中基因融合的检测提供了一个灵敏、重复且经济的解决方案。
| 仪器 | 推荐的样本数 | 读长 |
|---|---|---|
| MiniSeq System | Samples per run: mid output: 2-3, high output: 8 (based on 3 million reads per sample) | 2 × 76 bp (max recommended) |
| MiSeq | 8 samples per run with v3 reagents (based on 3 million reads per sample) | 2 × 76 bp (max recommended) |
| NextSeq 550 System | 24 samples per run (mid output; based on 3 million reads per sample) | 2 × 76 bp (max recommended) |
| TruSight RNA Fusion Panel | TruSight Tumor 170 | AmpliSeq for Illumina Focus Panel | AmpliSeq for Illumina Comprehensive Panel v3 | |
|---|---|---|---|---|
| 变异种类 | 基因融合 | 单核苷酸位点变异 (SNV), 结构变异, 体细胞变异, 基因融合, 拷贝数变异 (CNVs), 插入缺失 (indels) | 体细胞变异, 基因融合, 拷贝数变异 (CNVs), 插入缺失 (indels), 单核苷酸多态性 (SNPs) | 体细胞变异, 基因融合, 拷贝数变异 (CNVs), 插入缺失 (indels), 单核苷酸多态性 (SNPs) |
| 技术 | 测序 | 测序 | 测序 | 测序 |
| 方法 | Sequencing for Cytogenomics, 靶向RNA测序 | 靶向RNA测序, 靶向富集, 靶向DNA测序 | 扩增子测序, 靶向RNA测序, 靶向DNA测序 | 扩增子测序, 靶向RNA测序, 靶向DNA测序 |
| 核酸类型 | RNA | RNA, DNA | RNA, DNA | RNA, DNA |
| 物种类别 | 人类 | 人类 | 人类 | 人类 |
| 特殊的样本类型 | 低起始量样本, FFPE组织 | 低起始量样本, FFPE组织 | FFPE组织 | FFPE组织 |
| 癌症类型 | 泛癌种 | 实体瘤 | 实体瘤 | 实体瘤 |
| 系统兼容性 | 研究模式下的MiSeqDx, MiniSeq, NextSeq 500, MiSeq, NextSeq 550 | NextSeq 500, NextSeq 550 | 研究模式下的MiSeqDx, iSeq 100, MiniSeq, MiSeq | NextSeq 550Dx in Research Mode, NextSeq 1000, NextSeq 2000, NextSeq 550 |
TruSight RNA Fusion Panel Gene List
product_file | EXCEL < 1 MB
Brochure | PDF 6 MB
Data Sheet | PDF 1 MB
Local Run Manager RNA Fusion Analysis Module Workflow Guide Documentation
Sequencing Library qPCR Quantification Guide Documentation
Illumina Experiment Manager User Guide Documentation
自定义协议选择器
Generates customized, end-to-end instructions
全部 TruSight RNA Fusion Panel Documentation Support 全部 TruSight RNA Fusion Panel Support
