AmpliSeq for Illumina Comprehensive Panel v3
靶向DNA和RNA研究panel，可研究161种基因中与一系列癌症类型相关的变异。
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AmpliSeq for Illumina Comprehensive Panel v3可覆盖关键癌症基因，包括参与DNA修复的激酶域和基因。
Comprehensive Panel v3是集成工作流程的一部分，该工作流程包括基于AmpliSeq for Illumina聚合酶链式反应（PCR）的文库制备、采用因美纳边合成边测序（SBS）的新一代测序（NGS）技术以及自动化分析过程。
该panel涵盖了热点区域、全长基因*、拷贝数基因、基因间和基因内融合。 即用型panel助您节省鉴定目标基因、设计引物和优化panel所需的时间和精力。
| 仪器 | 推荐的样本数 | 读长 |
|---|---|---|
| MiniSeq System | 每次运行3个样本（高通量；假设最小覆盖度为500倍） | 2 × 150 bp |
| MiSeq System | 每次运行3个样本（v3试剂，假设最小覆盖度为500倍） | 2 × 150 bp |
| NextSeq 550 System | 每次运行的样本：中通量： 16，高通量： 48（假设最小覆盖度为500倍） | 2 × 150 bp |
| AmpliSeq for Illumina Comprehensive Panel v3 | TruSight Tumor 170 | TruSight Tumor 15 | AmpliSeq for Illumina Focus Panel | AmpliSeq for Illumina Cancer Hotspot Panel v2 | |
|---|---|---|---|---|---|
| 内容说明 | 161个癌基因的DNA和RNA靶点 | Probes enrich for full coding sequences of 170 genes. Calls single nucleotide variants, small insertions, and deletions in 151 genes, amplifications in 59 genes, and fusions plus splice variants in 55 genes. | 从15个实体瘤相关基因中扩增250个扩增子 | 52个癌基因的DNA和RNA靶点 | 50种与癌症具有已知关联的基因的热点区域 |
| 分析时间 | 5-6小时（仅为文库制备时间，不包括文库定量、归一化或混合时间） | 约2天（文库制备） | 7小时 | 5-6小时（仅为文库制备时间，不包括文库定量、归一化或混合时间） | 5小时（仅包括文库制备时间；不包括文库定量、归一化或混合时间） |
| 多重分析 | 96个双标签序列组合 | Up to 32-plex for DNA using both index sets, up to 16-plex for RNA | 1-24重 | 96个双标签序列组合 | 96个双标签序列组合 |
| 手动操作时间 | ＜1.5小时 | 约10.5小时 | 3.5小时 | ＜1.5小时 | ＜1.5小时 |
| 方法 | 扩增子测序, 靶向RNA测序, 靶向DNA测序 | 靶向富集, 靶向RNA测序, 靶向DNA测序 | 扩增子测序, 靶向DNA测序 | 扩增子测序, 靶向RNA测序, 靶向DNA测序 | 扩增子测序, 靶向DNA测序 |
| 核酸类型 | DNA, RNA | RNA, DNA | DNA | DNA, RNA | DNA |
| 物种类别 | 人类 | 人类 | 人类 | 人类 | 人类 |
| 特殊的样本类型 | FFPE组织 | 低起始量样本, FFPE组织 | FFPE组织 | FFPE组织 | FFPE组织 |
| 癌症类型 | 实体瘤 | 实体瘤 | 实体瘤 | 实体瘤 | 泛癌种, 实体瘤 |
| 说明 | 针对实体瘤相关基因热点及全长靶点的体细胞分析研究。 | Perform comprehensive somatic variant detection research in solid tumors using variant calling information from both DNA and RNA. | 重点panel，使用简单的工作流程研究15个基因中的相关实体瘤体细胞变异。 | 针对52个实体瘤相关基因的体细胞分析研究。 | 针对50个癌症相关基因的热点区域的体细胞分析研究。 |
| 起始量 | 1–100 ng（建议每个混池10 ng） | 40 ng DNA和/或RNA | 20 ng | 1–100 ng（建议每个混池10 ng） | 1–100 ng（建议每个混池10 ng） |
Automated Solutions for AmpliSeq for Illumina Sequencing Panels
Application Note | HTML
Ampliseq for Illumina Comprehensive Panel v3 Gene List
product_file | EXCEL < 1 MB
Data Sheet | HTML | 5 versions
NextSeq 550 amplicon sequencing solution
Application Note | PDF < 1 MB
AmpliSeq for Illumina Comprehensive Panel v3 Support - Documentation & Literature
Illumina Adapter Sequences Documentation
AmpliSeq for Illumina Comprehensive Panel v3 Reference Guide Documentation
AmpliSeq for Illumina Comprehensive Panel v3 Checklist Documentation
Index Adapters Pooling Guide Documentation
AmpliSeq for Illumina Direct FFPE DNA Kit Reference Guide Documentation
自定义协议选择器
Generates customized, end-to-end instructions
