AmpliSeq for Illumina Comprehensive Panel v3

靶向DNA和RNA研究panel,可研究161种基因中与一系列癌症类型相关的变异。 阅读更多...
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Panel

AmpliSeq™ Comprehensive Panel v3 for Illumina®

20019109


Library Prep

AmpliSeq™ Library PLUS for Illumina® (24次反应)

20019101

AmpliSeq™ Library PLUS for Illumina® (96次反应)

20019102

AmpliSeq™ Library PLUS for Illumina® (384次反应)

20019103


Index Adapters

AmpliSeq™ UD Indexes for Illumina® (24个标签,24个样本)

20019104

AmpliSeq™ CD Indexes Set A for Illumina®

20019105

AmpliSeq™ CD Indexes Set B for Illumina®

20019106

AmpliSeq™ CD Indexes Set C for Illumina®

20019107

AmpliSeq™ CD Indexes Set D for Illumina®

20019167

AmpliSeq™ CD Indexes Set A-D for Illumina®(384个标签,384个样本)

20031676

Ampliseq™ CD Indexes Large Volume for Illumina®(96个标签,96个样本)

20019108

配件产品

Ampliseq™ cDNA Synthesis for Illumina®

20022654

AmpliSeq™ for Illumina® Direct FFPE DNA

20023378

AmpliSeq™ Library Equalizer for Illumina®

20019171

产品特色

AmpliSeq for Illumina Comprehensive Panel v3可覆盖关键癌症基因,包括参与DNA修复的激酶域和基因。

相关基因内容
  • 靶定161种独特的癌症相关基因
快速的一体化工作流程
  • 可在一天内使用起始量低至1 ng的高质量样本或10 ng福尔马林固定、石蜡包埋(FFPE)的样本制备直接测序的文库
准确的数据
  • 使用本地或云端分析方法检测频率低至5%的体细胞突变

Comprehensive Panel v3是集成工作流程的一部分,该工作流程包括基于AmpliSeq for Illumina聚合酶链式反应(PCR)的文库制备、采用因美纳边合成边测序(SBS)的新一代测序(NGS)技术以及自动化分析过程。

该panel涵盖了热点区域、全长基因*、拷贝数基因、基因间和基因内融合。 即用型panel助您节省鉴定目标基因、设计引物和优化panel所需的时间和精力。

深入了解AmpliSeq for Illumina

*对于该panel,因美纳将全长基因内容定义为覆盖基因的大部分编码区域的内容,计算机模拟覆盖度通常高于90%,而且,大多数基因的覆盖度均高于99%。有关详细信息,请参阅我们提供的产品清单

经常一并购买

规格

计划推荐

仪器 推荐的样本数 读长
MiniSeq System 每次运行3个样本(高通量;假设最小覆盖度为500倍) 2 × 150 bp
MiSeq System 每次运行3个样本(v3试剂,假设最小覆盖度为500倍) 2 × 150 bp
NextSeq 550 System 每次运行的样本:中通量: 16,高通量: 48(假设最小覆盖度为500倍) 2 × 150 bp

产品比较

AmpliSeq for Illumina Comprehensive Panel v3 TruSight Tumor 170 TruSight Tumor 15 AmpliSeq for Illumina Focus Panel AmpliSeq for Illumina Cancer Hotspot Panel v2
内容说明 161个癌基因的DNA和RNA靶点 Probes enrich for full coding sequences of 170 genes. Calls single nucleotide variants, small insertions, and deletions in 151 genes, amplifications in 59 genes, and fusions plus splice variants in 55 genes. 从15个实体瘤相关基因中扩增250个扩增子 52个癌基因的DNA和RNA靶点 50种与癌症具有已知关联的基因的热点区域
分析时间 5-6小时(仅为文库制备时间,不包括文库定量、归一化或混合时间) 约2天(文库制备) 7小时 5-6小时(仅为文库制备时间,不包括文库定量、归一化或混合时间) 5小时(仅包括文库制备时间;不包括文库定量、归一化或混合时间)
多重分析 96个双标签序列组合 Up to 32-plex for DNA using both index sets, up to 16-plex for RNA 1-24重 96个双标签序列组合 96个双标签序列组合
手动操作时间 <1.5小时 约10.5小时 3.5小时 <1.5小时 <1.5小时
方法 扩增子测序, 靶向RNA测序, 靶向DNA测序 靶向富集, 靶向RNA测序, 靶向DNA测序 扩增子测序, 靶向DNA测序 扩增子测序, 靶向RNA测序, 靶向DNA测序 扩增子测序, 靶向DNA测序
核酸类型 DNA, RNA RNA, DNA DNA DNA, RNA DNA
物种类别 人类 人类 人类 人类 人类
特殊的样本类型 FFPE组织 低起始量样本, FFPE组织 FFPE组织 FFPE组织 FFPE组织
癌症类型 实体瘤 实体瘤 实体瘤 实体瘤 泛癌种, 实体瘤
说明 针对实体瘤相关基因热点及全长靶点的体细胞分析研究。 Perform comprehensive somatic variant detection research in solid tumors using variant calling information from both DNA and RNA. 重点panel,使用简单的工作流程研究15个基因中的相关实体瘤体细胞变异。 针对52个实体瘤相关基因的体细胞分析研究。 针对50个癌症相关基因的热点区域的体细胞分析研究。
起始量 1–100 ng(建议每个混池10 ng) 40 ng DNA和/或RNA 20 ng 1–100 ng(建议每个混池10 ng) 1–100 ng(建议每个混池10 ng)

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