简化的RNA-Seq解决方案，用于对编码和非编码转录组进行清晰、全面的分析，具有出色的研究灵活性。
分析时间
手动操作时间
起始量
Illumina Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus可准确测量基因和转录本丰度，并编码RNA和多种形式的非编码RNA中已知的和新的特征。研究人员能够可靠地揭示替代转录本、基因融合和等位基因特异性表达。此外，Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus Microbiome可为宏转录组学应用提供高质量数据。
| 分析时间 | 约7小时 |
|---|---|
| 自动化功能 | 液体处理机器人 |
| 内容说明 | 捕获编码RNA以及多种形式的非编码RNA |
| 说明 | 用于从低RNA起始量和低质量样本制备全转录组测序文库，支持多种RNA-Seq应用。包括Ribo-Zero Plus，用于单管去除来自多个物种的rRNA和珠蛋白RNA，以便进行丰富的转录组分析。 |
| 手动操作时间 | ＜3小时 |
| 起始量 | 标准质量RNA样本为1–1000 ng总RNA。建议至少10 ng总RNA，以获得最佳性能和FFPE样本 |
| 系统 | NextSeq 550桌面式基因测序仪, NextSeq 2000基因测序仪, NextSeq 1000系统, NovaSeq X基因测序仪, NextSeq 500桌面式基因测序仪, NovaSeq 6000基因测序仪, NovaSeq X Plus基因测序仪 |
| 作用机制 | 酶法rRNA去除，连接接头和标签 |
| 方法 | 全转录组测序, 宏转录组测序 |
| 多重分析 | 多达384个唯一双标签（UDI） |
| 核酸类型 | RNA |
| 特殊的样本类型 | 微生物组样本, 低起始量样本, FFPE组织 |
| 物种 | 小鼠, 人, 大鼠, 细菌 |
| 物种详情 | Ribo-Zero Plus可去除多个物种的大量转录本，包括：人类细胞质和线粒体rRNA、小鼠rRNA、大鼠rRNA、细菌（大肠杆菌和枯草芽孢杆菌）rRNA以及人类β珠蛋白转录本 Ribo-Zero Plus Microbiome去除了多个物种的大量转录本，包括：在Ribo-Zero Plus中去除的转录本以及多种微生物物种和ATCC MSA-2002, MSA-2005和MSA-2006 |
| 链特异性 | 链状 |
| 技术 | Illumina测序 |
| 变异类别 | 单核苷酸多态性（SNP）, 基因融合, 新型转录本, 转录本变异 |
选择满足您处理需求的文库制备试剂盒大小（16个样本或96个样本）。
标签单独出售，是多重分析所必需的。选择最适合您目标测序通量的标签选项。测序通量和多重分析能力可能因测序仪和流动槽试剂而异。
Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus或Ribo-Zero Plus Microbiome Kit可在约7小时内从低RNA起始量和低质量样本中制备全转录组测序可用文库，手动操作时间不到3小时。
Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus或Ribo-Zero Plus Microbiome
| 仪器 | Recommended number of samples | Read length |
|---|---|---|
| NextSeq 550 System | 中通量：2个样本/流动槽 高通量：8个样本/流动槽 |
2 × 50 bp |
| NextSeq 2000 System | P2：8个样本/流动槽 P3：24个样本/流动槽 |
2 × 50 bp |
| NovaSeq 6000 System | SP：16个样本/流动槽 S1：32个样本/流动槽 S2：82个样本/流动槽 S4：200个样本/流动槽 |
2 × 50 bp |
| Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus或Ribo-Zero Plus Microbiome | TruSeq Stranded Total RNA | TruSeq Stranded Total RNA with Ribo-Zero Globin | |||
|---|---|---|---|---|---|
| 分析时间 | 约7小时 | 11.5小时 | 11.5小时 | ||
| 自动化功能 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 | ||
| 内容说明 | 捕获编码RNA以及多种形式的非编码RNA | 捕获编码RNA以及多种形式的非编码RNA | 捕获编码RNA以及多种形式的非编码RNA | ||
| 说明 | 用于从低RNA起始量和低质量样本制备全转录组测序文库，支持多种RNA-Seq应用。包括Ribo-Zero Plus，用于单管去除来自多个物种的rRNA和珠蛋白RNA，以便进行丰富的转录组分析。 | 用于全转录组测序研究。Total RNA版本可去除细胞质rRNA，而Total RNA Gold版本可去除细胞质和线粒体rRNA。 | 用于血液来源RNA的全转录组测序研究。去除细胞质rRNA、线粒体rRNA和珠蛋白mRNA。 | ||
| 手动操作时间 | ＜3小时 | 5.5小时 | 5.5小时 | ||
| 起始量 | 标准质量RNA样本为1–1000 ng总RNA。建议至少10 ng总RNA，以获得最佳性能和FFPE样本 | 0.1 – 1 ug高质量总RNA。低质量样本可能需要进一步优化。 | 0.1–1 ug血液来源的高质量纯化总RNA | ||
| 系统 | NextSeq 550桌面式基因测序仪, NextSeq 2000基因测序仪, NextSeq 1000系统, NovaSeq X基因测序仪, NextSeq 500桌面式基因测序仪, NovaSeq 6000基因测序仪, NovaSeq X Plus基因测序仪 | NextSeq 550桌面式基因测序仪, NextSeq 2000基因测序仪, NextSeq 1000系统, NovaSeq X基因测序仪, NextSeq 500桌面式基因测序仪, NovaSeq 6000基因测序仪, NovaSeq X Plus基因测序仪 | NextSeq 550桌面式基因测序仪, NextSeq 2000基因测序仪, NextSeq 1000系统, NovaSeq X基因测序仪, NextSeq 500桌面式基因测序仪, NovaSeq 6000基因测序仪, NovaSeq X Plus基因测序仪 | ||
| 作用机制 | 酶法rRNA去除，连接接头和标签 | 基于磁珠的rRNA去除、cDNA合成和PCR | 基于磁珠的rRNA去除、cDNA合成和PCR | ||
| 方法 | 全转录组测序, 宏转录组测序 | 全转录组测序 | 全转录组测序 | ||
| 多重分析 | 多达384个唯一双标签（UDI） | 低通量试剂盒：混合最多12个样本。或混合24个样本（组A和B一起）, 高通量试剂盒：使用组合双标签序列或唯一双标签序列制备96个标签样本 | 高通量试剂盒：使用组合双标签序列或唯一双标签序列制备96个标签样本, 低通量试剂盒：混合最多12个样本。或混合24个样本（组A和B一起） | ||
| 核酸类型 | RNA | RNA | RNA | ||
| 特殊的样本类型 | 微生物组样本, 低起始量样本, FFPE组织 | FFPE组织 | 血液 | ||
| 物种 | 小鼠, 人, 大鼠, 细菌 | 小鼠, 人, 大鼠 | 小鼠, 人, 大鼠 | ||
| 物种详情 | Ribo-Zero Plus可去除多个物种的大量转录本，包括：人类细胞质和线粒体rRNA、小鼠rRNA、大鼠rRNA、细菌（大肠杆菌和枯草芽孢杆菌）rRNA以及人类β珠蛋白转录本 Ribo-Zero Plus Microbiome去除了多个物种的大量转录本，包括：在Ribo-Zero Plus中去除的转录本以及多种微生物物种和ATCC MSA-2002, MSA-2005和MSA-2006 | rRNA去除：去除人类、小鼠和大鼠rRNA | rRNA去除：消耗人、小鼠和大鼠rRNA（细胞质和线粒体）和球蛋白mRNA | ||
| 链特异性 | 链状 | ||||
| 技术 | Illumina测序 | Illumina测序 | Illumina测序 | ||
| 变异类别 | 单核苷酸多态性（SNP）, 基因融合, 新型转录本, 转录本变异 | 单核苷酸多态性（SNP）, 基因融合, 新型转录本, 转录本变异 | 单核苷酸多态性（SNP）, 基因融合, 新型转录本, 转录本变异 |
寻找符合您需求的测序文库制备试剂盒或芯片。按方法、种类等筛选。比较、分享和订购试剂盒。
Illumina Stranded Total Prep提供了快速的工作流程，且手动操作时间短。时间长短因使用的设备、处理的样本数量、自动化程序或用户经验而异。
性能参数比较——将Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus与TruSeq Stranded Total RNA with Ribo-Zero进行比较。Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus更高效，尤其是在使用10 ng和1 ng的低起始量总UHR RNA的情况下。
Ribo-Zero Plus Microbiome rRNA Depletion Kit可有效去除粪便样本中的rRNA（5S、16S和23S）水平。将Ribo-Zero Plus rRNA Depletion试剂盒的检测结果与X公司的市售核酸去除试剂盒进行了比较。共检测了两份粪便混合物样品。
Illumina Stranded Total RNA Prep Kit包括（A） Ribo-Zero Plus，用于去除人类、小鼠、大鼠、细菌和流行病学样本等多个物种的大量rRNA，或（B） Ribo-Zero Plus Microbiome，可稳定去除包括粪便样本在内的复杂微生物样本中的大量rRNA，用于宏转录组研究。
A. Ribo-Zero Plus试剂盒
| 去除靶标 | rRNA靶标 |
| 人细胞质rRNA | 28S、18S、5.8S和5S |
| 人线粒体rRNA | 12S和16S |
| 人β珠蛋白转录本 | HBA1、HBA2、HBB、HBG1和HBG2 |
| 小鼠和大鼠 | 12S、16S、28S、18S、5.8S和5S |
| 革兰氏阴性细菌rRNA | 大肠埃希菌：5S、16S、23S |
| 革兰氏阳性细菌rRNA | 枯草芽孢杆菌：5S、16S、23S |
Ribo-Zero Plus Microbiome
| 去除靶标 | rRNA靶标 |
| 微生物组rRNA* | 来自不同微生物的5S, 16S, 23S，包括常见成人、婴儿细菌物种和ATCC MSA-2002, MSA-2005和MSA-2006 |
*仅包含在Illumina Stranded Total Ribo-Zero Plus Microbiome Kit（货号20072063）中。rRNA去除针对人类微生物组rRNA进行了优化，使用其他样本类型时性能可能会有所不同。
Illumina® Stranded Total RNA Prep, Ligation with Ribo-Zero Plus（16样本）
20040525
包含用于制备16个样本的试剂和Ribo-Zero Plus去除模块。仅与IDT for Illumina RNA UD标签、Ligation兼容。标签和纯化磁珠单独出售。
Illumina® Stranded Total RNA Prep, Ligation with Ribo-Zero Plus（96样本）
20040529
包含用于制备96个样本的试剂和Ribo-Zero Plus去除模块。仅与IDT for Illumina RNA UD Index、Ligation兼容。标签和纯化磁珠单独出售。
Illumina® Stranded Total RNA Prep with Ligation, Ribo-Zero Plus Microbiome（96样本）
20072063
包含用于制备96个文库的试剂和Ribo-Zero Plus Microbiome去除模块。仅与IDT for Illumina RNA UD Index、Ligation兼容。标签单独出售。
Illumina® RNA UD Indexes Set A, Ligation（96标签，96样本）
20091655
Illumina® RNA UD Indexes Set A， Ligation（96个标签，96个样本）包括96个10 bp标签，足以标记96个样本和RNA Index Anchor板。配合Illumina Stranded Total RNA Prep和Illumina Stranded mRNA Prep Kit使用。单独购买文库制备试剂。
Illumina® RNA UD Indexes Set B, Ligation（96标签，96样本）
20091657
Illumina® RNA UD Indexes Set B， Ligation（96个标签，96个样本）包括96个10 bp标签，足以标记96个样本和RNA Index Anchor板。配合Illumina Stranded Total RNA Prep和Illumina Stranded mRNA Prep Kit使用。单独购买文库制备试剂。
Illumina® RNA UD Indexes Set C, Ligation（96标签，96样本）
20091659
Illumina® RNA UD Indexes Set C， Ligation（96个标签，96个样本）包括96个10 bp标签，足以标记96个样本和RNA Index Anchor板。配合Illumina Stranded Total RNA Prep和Illumina Stranded mRNA Prep Kit使用。单独购买文库制备试剂。
Illumina® RNA UD Indexes Set D, Ligation（96标签，96样本）
20091661
Illumina® RNA UD Indexes Set D， Ligation（96个标签，96个样本）包括96个10 bp标签，足以标记96个样本和RNA Index Anchor板。配合Illumina Stranded Total RNA Prep和Illumina Stranded mRNA Prep Kit使用。单独购买文库制备试剂。
IDT® for Illumina® RNA UD Indexes Set A, Ligation（96标签，96样本）
20040553
包含96、10 bp标签，足以标记96个样本和RNA Index Anchor板。配合Illumina Stranded Total RNA Prep和Illumina Stranded mRNA Prep Kit使用。单独购买文库制备和探针panel。
IDT® for Illumina® RNA UD Indexes Set B, Ligation（96标签，96样本）
20040554
包含96、10 bp标签，足以标记96个样本和RNA Index Anchor板。配合Illumina Stranded Total RNA Prep和Illumina Stranded mRNA Prep Kit使用。单独购买文库制备和探针panel。
IDT® for Illumina® RNA UD Indexes Set C, Ligation（96标签，96样本）
20040555
包含96、10 bp标签，足以标记96个样本和RNA Index Anchor板。配合Illumina Stranded Total RNA Prep和Illumina Stranded mRNA Prep Kit使用。单独购买文库制备和探针panel。
IDT® for Illumina® RNA UD Indexes Set D, Ligation（96标签，96样本）
20040556
包含96、10 bp标签，足以标记96个样本和RNA Index Anchor板。配合Illumina Stranded Total RNA Prep和Illumina Stranded mRNA Prep Kit使用。单独购买文库制备和探针panel。
Illumina Stranded Total RNA Library Prep培训
20044764
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Illumina Stranded Total RNA Prep with Ligation， Ribo-Zero Plus Microbiome Kit包含扩展捕获探针，可靶向来自不同微生物物种的5S, 16S和23S rRNA，包括常见的成人和婴儿肠道细菌，而Ribo-Zero Plus rRNA Depletion Kit靶向 大肠杆菌和枯草芽孢杆菌的 5S, 16S和23S。
Illumina Stranded Total RNA Prep with Ligation、Ribo-Zero Plus Microbiome可去除人类珠蛋白转录本和多个物种的rRNA，包括人类、小鼠、大鼠和人类肠道和皮肤中常见的多种细菌菌株。Illumina无法保证去除所列物种以外的rRNA。
建议将Agilent Technologies的Universal Human Reference RNA阳性样本对照品（货号740000）与Illumina Stranded Total RNA Prep一起使用。
为了检查最终文库的质量和浓度，可以使用以下两种方法：
• 如果使用NextSeq 1000/2000测序系统，按1:10000x稀释文库，然后使用KAPA qPCR Library Quantification Kit分析2 μL文库。
• 如果使用其他测序系统，使用Agilent 2100 Bioanalyzer和DNA 1000 Kit分析1 µL文库。
Illumina Stranded Total RNA Prep靶向起始链。
使用Illumina Stranded Total RNA Prep with Ligation， Ribo-Zero Plus Microbiome Kit时，RNA的最低推荐起始量为25 ng，以获得最佳性能。
将先进的化学、光学和信息学技术相结合，实现了超凡的速度和数据质量、出色的通量和可扩展性。
与早期版本相比，优化的试剂盒可增加簇密度和读长，从而提高测序质量分值。
使用涵盖所有主要变异类别以及来自FFPE组织的基因特征（TMB、MSI和HRD）的大型泛癌panel实现CGP。
快速、集成的文库制备工作流程，适用于各种测序应用。
在BaseSpace Sequence Hub中管理运行、分析、存储和共享测序数据。查找应用程序、订阅选项和文档。
用于NextSeq 1000/2000系列基因测序仪的试剂盒，具有简便易用的卡盒和多种流动槽配置，可提供灵活的测序选项。
快速、经济高效的工作流程，通过精确测量链信息准确、无偏差地检测蛋白质编码转录组。
唯一双（UD）标签能够制备可多重分析的高质量文库，从而提高通量并节省成本。
易于使用的云端基因组运行管理和生物信息学计算和存储环境，可实现安全、高性能的测序操作。
用于NovaSeq 6000基因测序仪的试剂盒，由即用型预装试剂卡盒和流动槽组成。
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