Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus
使用多种样本快速制备文库，以极大的灵活性来研究编码和非编码转录组。Read More...
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Illumina Stranded Total RNA Library Prep培训
20044764
*有效期至2021年6月30日，仅限首次购买单个文库制备试剂盒。不包括标签接头和panel。
Illumina Stranded Total RNA Library Prep培训
20044764
Illumina Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus为编码RNA和多种形式的非编码RNA的分析提供了卓越的性能。能够可靠地揭示替代转录本、基因融合和等位基因特异性表达。
Illumina Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus是基于TruSeq连接技术，自2011年起已被至少9926篇文献引用。该连接方法具有覆盖度均一性高、链信息精确的优势，即使采用降解的样本也能进行可靠的文库制备。
Illumina Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus支持较宽的RNA起始量范围（1 ng–1000 ng）。*它兼容多种类型样本，包括福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）及其他低质量样品。配备的Ribo-Zero Plus可从多个物种的样本（包括人类、小鼠、大鼠、细菌和流行病学样本)中去除大量RNA。
仅7个小时就可以完成文库制备。Illumina将通自动化合作伙伴提供经Illumina认证的自动化方法。
在单次运行中可多重分析最多384个样本。（Index Set A和B已上市，Set C和D即将推出。）每次运行测序的样本数量取决于测序仪的通量。
*该起始量范围适用于高质量的RNA。为获得理想结果，针对FFPE或降解样本，我们推荐的起始量为10 ng。/p>
| 仪器 | 推荐的样本数 | 读长 |
|---|---|---|
| NextSeq 550 System | 中通量: 2 高通量: 8 (基于每个样本50 M reads) |
2 × 75 bp |
| NextSeq 2000 System | 全转录组分析: 每次运行8（P2）–20（P3）个样本（基于每个样本50 M reads） |
2 × 75 bp |
| NovaSeq 6000 System | 全转录组分析: SP: 16 S1: 32 S2: 82 S4: 200 每次运行的样本数（基于每个样本50 M reads） |
2 × 75 bp |
| Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus | TruSeq Stranded Total RNA | TruSeq Stranded Total RNA with Ribo-Zero Globin | |
|---|---|---|---|
| Assay Time | 约7小时 | 11.5 hours | |
| Automation Capability | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 |
| Content Specifications | 捕获编码RNA以及多种形式的非编码RNA。 | 捕获编码RNA以及多种形式的非编码RNA。 | 捕获编码RNA以及多种形式的非编码RNA。 |
| Description | 用于多种类型样本的全转录组测序研究。包含Ribo-Zero plus模块，一个试管即可去除多个物种的转录本。 | For whole-transcriptome sequencing studies. The Total RNA version depletes cytoplasmic rRNA while the Total RNA Gold version depletes cytoplasmic and mitochondrial rRNA. | 用于血液来源RNA的全转录组测序研究。去除细胞质rRNA、线粒体rRNA和珠蛋白mRNA。 |
| Hands-On Time | ＜3小时 | 5.5 hours | |
| Input Quantity | 对于标准质量RNA样本，可使用1–1000 ng的总RNA。对于FFPE样本，建议最少使用10 ng的总RNA，以获得理想效果。 | 0.1 – 1 ug high-quality total RNA. Lower-quality samples may require further optimization. | 0.1–1 ug血液来源的高质量纯化总RNA |
| Mechanism of Action | 酶法rRNA去除，连接接头和标签 | 基于微珠的rRNA去除、cDNA合成和PCR | 基于微珠的rRNA去除、cDNA合成和PCR |
| Method | 全转录组测序 | 全转录组测序 | 全转录组测序 |
| Multiplexing | 多达384个唯一双标签序列（UDI） | 低通量试剂盒：混合最多12个样本。或混合24个样本（组A和B一起）, 高通量试剂盒：使用组合双标签或唯一双标签序列制备96个带标签的样本。 | 高通量试剂盒：使用组合双标签或唯一双标签序列制备96个带标签的样本。, 低通量试剂盒：混合最多12个样本。或混合24个样本（组A和B一起） |
| Species Category | Virus, 人类, 大鼠, 小鼠, 细菌 | 人类, 大鼠, 小鼠 | 人类, 大鼠, 小鼠 |
| Technology | 测序 | 测序 | 测序 |
上方- 使用Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus去除多个物种的核糖核酸。Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus可在单试管反应中有效降低人类、小鼠、大鼠和细菌的rRNA浓度。将结果与TruSeq Stranded Total RNA配合Ribo-Zero Gold（哺乳动物种属）和Ribo-Zero Bacteria（大肠杆菌）的结果进行比较（枯草芽孢杆菌数据未显示）。下方- 使用Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus去除人外周血白细胞中的珠蛋白mRNA。
Illumina Stranded Total RNA Prep为（A）高质量和合成降解的UHR RNA（RIN = 2）和（B）起始量为100 ng和10 ng的FFPE RNA提供了高覆盖度均一性。FFPE样本的DV200质量分值为55%。所有文库都在NovaSeq 6000系统上以50 M reads进行测序。使用BaseSpace RNA-Seq Alignment App v2.0.1进行数据分析。
上方- 性能参数比较——将Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus与TruSeq Stranded Total RNA with Ribo-Zero进行比较。Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus更高效，尤其是在使用10 ng和1 ng的低起始量总UHR RNA的情况下。在NextSeq 550系统上对文库进行测序，下采样至30 M reads。通过下采样至4 M reads 来计算重复比例，并使用BaseSpace RNA-Seq Alignment App v2.0进行分析。下方- Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus 的性能参数。
Illumina Stranded Total RNA Prep 在（A）1 ng和100 ng UHR RNA的起始量和（B）10 ng FFPE RNA的技术平行分析之间实现了高数据一致性。文库在NovaSeq 6000系统上以2 × 74 bp读长进行测序。使用BaseSpace RNA-Seq Alignment App v2.0.1进行数据分析。
Illumina Stranded Total Prep提供了快速的工作流程，且手动操作时间短。时间长短会因使用的设备、处理的样本数量、自动化程序或用户经验而异。
Data Sheet | PDF | 6 versions
Best practices for read trimming for Illumina Stranded mRNA and Total RNA workflows
Technical Note | PDF< 1 MB
Application Note | PDF< 1 MB
Illumina library preparation solutions
Brochure | PDF2 MB
Illumina Stranded Total RNA Prep Ligation with Ribo-Zero Plus Reference Guide Documentation
Illumina Stranded Total RNA Prep Ligation with Ribo-Zero Plus Consumables & Equipment Documentation
Illumina Stranded Total RNA Prep Ligation with Ribo-Zero Plus Documentation
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