TruSeq Stranded Total RNA的物种兼容性

物种兼容性详情

TruSeq Stranded Total RNA专为人类、小鼠、大鼠和植物序列而设计,但也可能适用于各类真核生物物种。下表列出的生物经过了实验室检测并受Illumina的完全支持,通过了计算机模拟测试,或由我们的客户报告过。Illumina无法根据客户报告的结果确保rRNA去除效果。

如果您感兴趣的物种未列出,请联系Illumina技术支持,并提供您选择的生物体的rRNA序列。我们可以进行计算机模拟评估,帮助您确定该生物体是否与TruSeq Stranded Total RNA试剂盒兼容。我们在计算机中进行了设计评估,但Illumina无法保证rRNA的去除效果。

RNA测序的优势

RNA-Seq使用新一代测序技术分析全转录组的表达,使研究人员能够检测已知或新的特性并对RNA进行定量。

了解更多
TruSeq Stranded Total RNA-with Ribo-Zero Human/Mouse/Rat
TruSeq Stranded Total RNA-with Ribo-Zero Gold
生物经实验室测试计算机模拟测试客户报告备注
蜜蜂(西方蜜蜂)   尽可能采用最高质量的RNA。
鸡(原鸡)   去除5S、18S和28S rRNA。未测试线粒体rRNA。
玻璃海鞘   去除18S rRNA。未测试其他rRNA。
希金斯炭疽菌   去除28S和5.8S rRNA。不能去除5S rRNA。未评估18S rRNA。
桡脚类物种   去除28S和18S rRNA。未评估其他rRNA。
牛    
盘基网柄菌   从高质量RNA中去除28S和18S rRNA。不能去除小rRNA。
犬    
鼬(林鼬)    
雀(家朱雀)   去除5S和18S rRNA。不能去除18S rRNA。未测试线粒体rRNA。
面象虫(赤拟谷盗)    
青蛙(非洲爪蟾)    
果蝇(果蝇属)   不能去除5S rRNA或28S rRNA的“右侧”片段。
真菌(黑曲霉)   不能从降解的样本中去除18S rRNA的300 nt区域。尽可能采用最高质量的RNA。
真菌(担子菌)   尽可能采用最高质量的RNA。
真菌(白色念珠菌)    
真菌(新型隐球菌)   不能去除5.8S或5S rRNA。尽可能采用最高质量的RNA。
真菌(解脂耶氏酵母)   不能去除5.8S或5S rRNA。尽可能采用最高质量的RNA。
马(马)    
人类   除血液外的所有组织;血液样本使用TruSeq Stranded Total RNA-with Ribo-Zero Globin。
昆虫(长红锥蝽)   尽可能采用最高质量的RNA。不能去除线粒体rRNA。
七鳃鳗   尽可能采用最高质量的RNA。
海绵(海甘蓝)   尽可能采用最高质量的RNA。
猴(猕猴;食蟹猴)    
猴(非洲绿猴;绿猴)    
猴(恒河猴;普通猕猴)    
蚊子(冈比亚按蚊)   去除18S rRNA。不能去除5S、5.8S和12S、16S线粒体rRNA。未测试28S rRNA。
小鼠   除血液外的所有组织;血液样本使用TruSeq Stranded Total RNA-with Ribo-Zero Globin。
线虫(秀丽隐杆线虫)   尽可能采用最高质量的RNA。
蝾螈(绿红东美螈)   可能不会去除5.8S或5S rRNA。尽可能采用最高质量的RNA。
恶性疟原虫   不能去除5.8S或5S rRNA。尽可能采用最高质量的RNA。
花鳉鱼   去除28S和18S rRNA。可能不会完全去除5S rRNA。
大鼠   除血液外的所有组织;血液样本使用TruSeq Stranded Total RNA-with Ribo-Zero Globin。
鲑鱼(大西洋鮭)   去除18S、5.8S和5S rRNA。不能去除28S rRNA。未评估线粒体rRNA。
海葵(星状海葵)   尽可能采用最高质量的RNA。
猪   去除28S、18S、5.8S和5S rRNA。
弓形虫   使用高质量RNA。
布氏锥虫   去除28S和18S rRNA。未评估其他rRNA。
大葱(葱)   去除18S rRNA。未测试其他rRNA。
斑马鱼(斑马鱼)    

TruSeq Stranded Total RNA-with Ribo-Zero Globin
生物经实验室测试计算机模拟测试客户报告备注
人类   仅用于血液样本;其他的所有组织使用TruSeq Stranded Total RNA-with Ribo-Zero Human/Mouse/Rat或TruSeq Stranded Total RNA-with Ribo-Zero Gold
小鼠   仅用于血液样本;其他的所有组织使用TruSeq Stranded Total RNA-with Ribo-Zero Human/Mouse/Rat或TruSeq Stranded Total RNA-with Ribo-Zero Gold
大鼠   仅用于血液样本;其他的所有组织使用TruSeq Stranded Total RNA-with Ribo-Zero Human/Mouse/Rat或TruSeq Stranded Total RNA-with Ribo-Zero Gold

TruSeq Stranded Total RNA-with Ribo-Zero Plant
生物经实验室测试计算机模拟测试客户报告备注
拟南芥   可使用叶片、种子和根。
鹰嘴豆(鹰嘴豆)   去除4.5S、16S、23S叶绿体rRNA和18S细胞质rRNA。不能去除5S叶绿体和5S细胞质rRNA。未测试其他rRNA。
玉米   可使用叶片、种子和根。
棉花    
真核绿藻(衣藻)   尽可能采用最高质量的RNA。
葡萄藤    
金银花(忍冬)    
玉米   可使用叶片、种子和根。
镜面灌木(蔓臭叶木)    
苔藓(小立碗藓属)    
微小原甲藻   去除28S和18S rRNA。未测试其他rRNA。
水稻   可使用叶片、种子和根。
大豆   可使用叶片、种子和根。
西红柿(番茄)    
叻沙叶(越南香菜)    
水三叶草(苹属)    
大葱   尽可能采用最高质量的RNA。
小麦   可使用叶片、种子和根。

相关解决方案

总RNA测序

分析编码RNA和多种形式的非编码RNA,获得完整的转录组视图。

文库制备

查找有关文库制备工作的更多信息,探索解决方案并获得技术要点。

基因panel和芯片查找工具

确定针对您感兴趣的基因的测序panel和芯片。