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总RNA测序

总RNA测序简介

全转录组分析和总RNA测序(RNA-Seq)能检测编码RNA和多种形式的非编码RNA。总RNA-Seq可以准确测量基因和转录本丰度,并鉴定转录组已知的和新的特性。

总RNA-Seq为正常或低质量样本提供了最佳的覆盖度。物种特异性核糖体RNA探针可以高效地去除高丰度的RNA种类。这会留下片段化和完整的目标转录本,并进行文库捕获。

总RNA测序的优点

总RNA测序的优点

总RNA-Seq能分析编码RNA和多种形式的非编码RNA,获得完整的转录组图像。

  • 捕获已知和新颖的特性
  • 可让研究人员在最广泛的转录本中鉴定生物标记
  • 能够更全面地了解感兴趣的表型
  • 能在广泛的动态范围内分析整个转录组
从全基因组芯片过渡到总RNA测序

从全基因组芯片过渡到总RNA-Seq

波士顿大学医学中心的肺部疾病和重症监护医师Avrum Spira博士建立了一个实验室,其目标是用全基因组基因表达芯片来分析样本,研究潜在的肺部疾病生物标记。了解Spira的实验室如何利用总RNA-Seq来发现表达芯片可能检测不到的新的和罕见转录本。
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总RNA测序工作流程

Illumina边合成边测序(SBS)技术是最广泛采用的新一代测序(NGS)技术,产生了全世界约90%的测序数据。*

除了高质量数据,Illumina还提供集成的全转录组测序工作流程,简化了从文库制备到数据分析和生物学解读的整个过程。

RNA测序注意事项

每种RNA-Seq实验类型—无论为基因表达图谱、靶向RNA表达、还是小分子RNA分析—对读长和深度都有独特要求。本公告综述了试验注意事项并提供帮助研究设计的资源。

阅读Bulletin
RNA测序注意事项
Using NGS to Study Rare Undiagnosed Genetic Disease

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*根据Illumina公司2015年存档数据计算