AmpliSeq for Illumina Immune Response Panel

用于研究395种参与肿瘤—免疫系统相互作用基因的靶向RNA表达panel。

6小时(仅包括文库制备时间;不包括文库定量、归一化或混合时间)

分析时间

< 1.5小时

手动操作时间

1–100 ng(建议每个混池10 ng)

起始量

详情请参见规格表

概览

AmpliSeq for Illumina Immune Response Panel是一种靶向重测序研究检测,可用于对395种基因癌症生物标记物进行定量,这些基因参与肿瘤-免疫系统相互作用。

Panel特点

  • 相关基因内容——靶向395个指示免疫疗法响应的癌症生物标记物的表达

  • 快速的一体化工作流程——可在一天内使用起始量低至1 ng的高质量RNA或10 ng福尔马林固定、石蜡包埋(FFPE)RNA起始量样本制备直接测序的文库

  • 准确的数据——检测参与肿瘤-免疫相互作用的相关基因的表达

Immune Response Panel是集成RNA—注释变异解决方案的一部分,该解决方案包括基于AmpliSeq for Illumina聚合酶链式反应(PCR)的文库制备、采用Illumina边合成边测序(SBS)的新一代测序(NGS)技术以及自动化分析过程。

这种panel可检测与不同白细胞亚群、抗原呈递、检查点通路以及与肿瘤进展相关的生物标记物。即用型panel助您节省鉴定目标基因、设计引物和优化panel所需的时间和精力。


规格


需要的产品

AmpliSeq for Illumina Immune Response Panel工作流程需要使用Immune Response Panel、Library PLUS试剂盒和标签接头。此外,需要cDNA合成试剂盒将总RNA转化为cDNA。

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应用

工作流程示例


项目建议

仪器 Recommended number of samples Read length
iSeq 100 System

4 samples per run (assumes 1 million reads per sample)

2 × 150 bp

MiniSeq System

Samples per run: mid output: 8, high output: 24 (assumes 1 million reads per sample)

2 × 150 bp

MiSeq System

Samples per run (by reagent kit version): v2 micro: 4, v2: 15, v3: 24 (assumes 1 million reads per sample)

2 × 150 bp


相关应用和方法

Panel (1)

AmpliSeq™ Immune Response Panel for Illumina®

20019169

与AmpliSeq Library PLUS for Illumina搭配使用时,足以进行24次反应。单独购买文库制备、标签接头和配套产品。

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文库制备 (3)

AmpliSeq™ Library PLUS (24 Reactions) for Illumina®

20019101

包含用于制备24个文库的试剂。单独购买AmpliSeq for Illumina panel和标签接头。

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AmpliSeq™ Library PLUS (96 Reactions) for Illumina®

20019102

包含用于制备96个文库的试剂。单独购买AmpliSeq for Illumina panel和标签接头。

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AmpliSeq™ Library PLUS (384 Reactions) for Illumina®

20019103

包含用于制备384个文库的试剂。单独购买AmpliSeq for Illumina panel和标签接头。

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标签接头 (6)

AmpliSeq™ UD Indexes for Illumina® (24 Indexes, 24 Samples)

20019104

包含足以标记24个样本的24个标签。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。

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AmpliSeq™ CD Indexes Set A for Illumina®

20019105

包含96个标签,足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。

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AmpliSeq™ CD Indexes Set B for Illumina®

20019106

包含96个标签,足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。

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AmpliSeq™ CD Indexes Set C for Illumina®

20019107

包含96个标签,足以标记96个样本。单独购买文库制备试剂、富集试剂和探针panel。

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AmpliSeq™ CD Indexes Set D for Illumina®

20019167

包含96、8 bp标签,足以标记96个样本。单独购买文库制备试剂和探针panel。

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AmpliSeq™ CD Indexes Set A-D for Illumina® (384 Indexes, 384 Samples)

20031676

包含四组AmpliSeq CD Indexes for Illumina、Set A、Set B、Set C和Set D。每组包含96、8 bp标签,足以标记96个样本。单独购买文库制备和探针panel。

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配套产品 (3)

Ampliseq™ cDNA Synthesis for Illumina®

20022654

使用AmpliSeq for Illumina RNA Panel(例如,AmpliSeq for Illumina Immune Response、Immune Repertoire Plus、TCR beta Panel、Myeloid、Transcriptome Human Gene Expression、Focus和 Comprehensive Panel v3以及定制或社区RNA Panel)时,包含反应混合物和酶混合物,可将总RNA转化为cDNA。反应次数因panel而异(例如,AmpliSeq for Illumina Immune Response、Focus、 Comprehensive Panel v3和Custom Panel的每个试剂盒有100次反应,AmpliSeq for Illumina Transcriptome Human Gene Expression、Myeloid、Immune Repertoire Plus和TCR beta Panel的每个试剂盒有200次反应)。

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AmpliSeq™ for Illumina® Direct FFPE DNA

20023378

包括24次反应,用于使用AmpliSeq for Illumina实验方案从未染色的玻片固定FFPE组织中制备DNA,无需脱蜡或DNA纯化。

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AmpliSeq™ Library Equalizer for Illumina®

20019171

在制备用于测序的AmpliSeq for Illumina文库时,包含用于文库归一化的磁珠和试剂。

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产品

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订购NovaSeq X系列

将先进的化学、光学和信息学技术相结合,实现了超凡的速度和数据质量、出色的通量和可扩展性。

MiSeq Reagent Kit v3

与早期版本相比,优化的试剂盒可增加簇密度和读长,从而提高测序质量分值。

TruSight Oncology 500

使用涵盖所有主要变异类别以及来自FFPE组织的基因特征(TMB、MSI和HRD)的大型泛癌panel实现CGP。

Illumina DNA Prep

快速、集成的文库制备工作流程,适用于各种测序应用。

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