MiSeq i100系列
简化的操作流程、先进的化学技术和机载信息学提供了易于使用、快速灵活的仪器，支持广泛的应用领域。
Pillar oncoReveal Multi-Cancer RNA Fusion v2 Panel是一种强大的NGS检测，可使用从福尔马林固定、石蜡包埋（FFPE）样本中分离出的RNA检测与多种实体瘤类型相关的18个驱动基因和83个融合伴侣基因。
Pillar oncoReveal Multi-Cancer RNA Fusion v2 Panel
靶向多个实体瘤类型中FFPE组织的83个RNA融合的靶向panel。
从样本到报告仅需48小时
分析时间
约3小时
手动操作时间
10–50 ng RNA
起始量
概述
主要特点
这款靶向panel可检测从FFPE组织中分离的RNA中的基因重排。
该检测采用专有的茎环阻遏介导扩增（SLIMamp）技术。这是一种基于平铺扩增子的文库制备化学技术，可实现高效的单管靶向富集。
此工作流程让实验室能够通过任何NGS实验室内部可进行的单管平铺扩增方法来维持样本和结果的把控。
性能参数
| Assay time | 从样本到报告仅需48小时 |
|---|---|
| 癌症类型 | 泛癌种, 实体瘤 |
| Content specifications | 18个驱动基因和83个融合伴侣基因 |
| Description | RNA融合panel可分析FFPE组织中的18个驱动基因和83个融合伴侣基因 |
| 手动操作时间 | 约3小时 |
| Input quantity | 10–50 ng RNA |
| 系统 | MiSeq 系统, iSeq 100系统, NextSeq 550系统, 研究模式下的MiSeqDx, MiniSeq基因测序仪, 研究模式下的NextSeq 550Dx, MiSeq i100系统 |
| 方法 | 扩增子测序, 靶向RNA测序 |
| 核酸类型 | RNA |
| Number of amplicons | 池1： 83个扩增子 |
| Number of reactions | 每个试剂盒24次反应 |
| 特殊的样本类型 | FFPE组织 |
| 物种 | 人 |
| 链特异性 | 非链 |
| Target insert size | 120 bp |
| 技术 | Illumina测序 |
| 变异类别 | 基因融合 |
需要的产品
Pillar oncoReveal Multi-Cancer RNA Fusion v2 Panel还需要使用Pillar标签序列试剂盒、测序试剂和DRAGEN Amplicon或PiVAT二级分析软件。如需额外的变异解读，建议采用Illumina Connected Insights。
/
结果
应用
Pillar oncoReveal Multi-Cancer RNA Fusion v2 Panel可在9小时内使用从FFPE样本中分离的RNA分析多种实体瘤类型，其中手动操作时间仅约3小时。
工作流程示例
文库制备
Pillar oncoReveal Multi-Cancer RNA Fusion v2 Panel
相关应用和方法
研究人员可以使用液体活检NGS检测方法来检测和表征癌症患者血液中的肿瘤生物标志物。
我们的测序和芯片技术支持多种癌症基因组学研究应用，包括DNA和RNA分析、表观遗传学等。
利用RNA新一代测序（RNA-Seq）检测癌症基因表达和转录组变化，鉴定新的癌症转录本。
比较
| Pillar oncoReveal Multi-Cancer RNA Fusion v2 Panel | Pillar oncoReveal Solid Tumor v2 Panel | Pillar® oncoReveal™ Multi-Cancer CNV + RNA Fusion Panel | TruSight RNA Pan-Cancer Panel | |
|---|---|---|---|---|
| Assay time | 从样本到报告仅需48小时 | 从样本到报告仅需48小时 | 48小时从样本到报告 | 2.5天 |
| Content specifications | 18个驱动基因和83个融合伴侣基因 | 48个基因 | 覆盖78个基因的小型泛肿瘤肿瘤学panel | 具有1385个靶标基因和21,043个靶向外显子区域的泛癌panel。包括507个涉及癌症基因融合的基因。 |
| 手动操作时间 | 约3小时 | 约3小时 | 约3小时 | 11小时 |
| Input quantity | 10–50 ng RNA | 20–80 ng DNA | 5-80 ng DNA，10-50 ng RNA | 10 ng总RNA，20-100 ng FFPE RNA |
| 方法 | 扩增子测序, 靶向RNA测序 | 靶向DNA测序, 扩增子测序 | 靶向DNA测序, 扩增子测序, 靶向RNA测序 | 靶向RNA测序, 靶向富集, 定制测序 |
| 核酸类型 | RNA | DNA | DNA, RNA | RNA |
| Number of reactions | 每个试剂盒24次反应 | 每个试剂盒24次反应 | 24次（DNA）/24次（RNA） | |
| 特殊的样本类型 | FFPE组织 | FFPE组织 | 血液, 低起始量样本, FFPE组织 | 低起始量样本, FFPE组织 |
| 物种 | 人 | 人 | 人 | 人 |
| 技术 | Illumina测序 | Illumina测序 | Illumina测序 | Illumina测序 |
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数据图
基因列表
Pillar oncoReveal Multi-Cancer RNA Fusion v2 Panel包括18个驱动基因和83个伴侣基因。
Panel规格
用于检测从FFPE组织中分离的融合转录本（RNA）的Pillar oncoReveal Multi-Cancer RNA Fusion v2 Panel规格。
文库制备 (3)
oncoReveal™ MultiCancer RNA Fusion v2 Pnl 24rxn
HRA-HS-1002-24
SLIMamp™工作流程上的18基因（24样本）实体瘤RNA组panel
标签序列PI501-8、PI701-4（32个组合，96反应）
IDX-PI-1001-96
标签序列PI501-8、PI701-4（32个组合，96反应）
试剂盒D，标签序列PI501-8、PI701-12
IDX-PI-1004-192
试剂盒D，标签序列PI501-8、PI701-12
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