强大的DNA NGS检测可分析多种实体瘤癌症类型的48个基因。
分析时间
手动操作时间
起始量
Pillar oncoReveal Solid Tumor v2 Panel是一种强大的48基因检测，可同时检测实体瘤DNA中存在的关键突变，包括福尔马林固定、石蜡包埋（FFPE）样本的非小细胞肺癌（NSCLC）、结直肠癌、黑色素瘤、子宫内膜癌、胰腺癌、胃肠道基质瘤（GIST）、膀胱癌、甲状腺和胶质瘤。此外，还可以分析在免疫肿瘤学中具有潜在重要性的基因，如POLD1和POLE。
该panel可用于检测从FFPE组织中分离的DNA中的单核苷酸位点变异（SNV）和插入/缺失（indel）。
该检测采用专有的茎环阻遏介导扩增（SLIMamp）技术。这是一种基于平铺扩增子的文库制备化学技术，可实现高效的单管靶向富集。
此工作流程让实验室能够通过任何NGS实验室内部可进行的单管平铺扩增方法来维持样本和结果的把控。
| 分析时间 | 从样本到报告仅需48小时 |
|---|---|
| 癌症类型 | 泛癌种, 实体瘤 |
| 试剂盒应用 | 48个基因 |
| 描述 | Pillar oncoReveal Solid Tumor v2 Panel是一款强大的DNA NGS检测，可分析多种实体瘤癌症类型的48个基因。 |
| 手动操作时间 | 约3小时 |
| 起始量 | 20–80 ng DNA |
| 系统 | MiSeq测序仪, iSeq 100测序仪, NextSeq 550测序仪, MiSeqDx测序仪下的科研模式, MiniSeq测序仪, NextSeq 550Dx测序仪下的科研模式, MiSeq i100系统 |
| 作用机制 | 使用平铺扩增子进行多重PCR |
| 方法 | 靶向DNA测序, 扩增子测序 |
| 核酸类型 | DNA |
| 扩增子数 | 池1：246个扩增子 |
| 反应次数 | 每个试剂盒24次反应 |
| 在靶read | 98% |
| 特殊的样本类型 | FFPE组织 |
| 物种 | 人 |
| Target insert size | 154 bp |
| 技术 | Illumina测序 |
| 均一性 | 98% |
| 变异类别 | 单核苷酸位点变异（SNV）, 插入缺失（indel） |
Pillar oncoReveal Solid Tumor v2 Panel还需要使用Pillar标签序列试剂盒、测序试剂和DRAGEN Amplicon或PiVAT二级分析软件。如需额外的变异解读，建议采用Illumina Connected Insights。
Pillar oncoReveal Solid Tumor v2 Panel还需要使用Pillar标签序列试剂盒、测序试剂和DRAGEN Amplicon或PiVAT二级分析软件。如需额外的变异解读，建议采用Illumina Connected Insights。
Pillar oncoReveal Solid Tumor v2 Panel
| Pillar oncoReveal Solid Tumor v2 Panel | TruSight Oncology 500 v2 | Pillar® oncoReveal™ Multi-Cancer CNV + RNA Fusion Panel | Pillar oncoReveal Multi-Cancer RNA Fusion v2 Panel | |
|---|---|---|---|---|
| 分析时间 | 从样本到报告仅需48小时 | 3-4天完成从样本起始到最终结果的整个流程 | 从样本到报告仅需48小时 | 从样本到报告仅需48小时 |
| 试剂盒应用 | 48个基因 |
对523个基因的DNA和55个基因的RNA进行靶向测序，panel总共1.94 Mb。包括MSI和TMB检测。 整合的HRD检测panel † 覆盖约25,000个SNP，可通过由Myriad Genetics提供支持的综合基因组不稳定性评分（LOH+TAI+LST）来评估同源重组修复缺陷。 †日本尚不支持购买TruSight Oncology 500 v2 |
覆盖78个基因的小型泛肿瘤肿瘤学panel | 18个驱动基因和83个融合伴侣基因 |
| 描述 | Pillar oncoReveal Solid Tumor v2 Panel是一款强大的DNA NGS检测，可分析多种实体瘤癌症类型的48个基因。 | 可利用FFPE组织中的DNA和RNA对实体瘤进行全景变异分析。通过单个样本实现实现变异检测和生物标志物评估，以进行广泛的肿瘤特征分析。 | 基于78个基因扩增子的panel，包含DNA和RNA内容，简单的单管工作流程 | RNA融合panel可分析FFPE组织中的18个驱动基因和83个融合伴侣基因 |
| 手动操作时间 | 约3小时 |
自动化工作流程约 3.25 小时 手动工作流程约 5-7 小时 |
约3小时 | 约3小时 |
| 起始量 | 20–80 ng DNA | 30 ng DNA（最低10 ng），40 ng RNA（最低20 ng） | 5–80 ng DNA, 10–50 ng RNA | 10–50 ng RNA |
| 方法 | 靶向DNA测序, 扩增子测序 | 靶向DNA测序, 靶向RNA测序, 靶向富集 | 靶向DNA测序, 扩增子测序, 靶向RNA测序 | 扩增子测序, 靶向RNA测序 |
| 核酸类型 | DNA | DNA, RNA | DNA, RNA | RNA |
| 反应次数 | 每个试剂盒24次反应 | 24次（DNA）/24次（RNA） | 每个试剂盒24次反应 | |
| 在靶read | 98% | 99.5% ± 0.1% | ||
| 特殊的样本类型 | FFPE组织 | FFPE组织 | 血液, 低起始量样本, FFPE组织 | FFPE组织 |
| 物种 | 人 | 人 | 人 | 人 |
| Target insert size | 154 bp | 平均：120 bp（范围 86-185 bp） | 120 bp |
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基因列表
Pillar oncoReveal Solid Tumor v2 Panel包括48个基因。
Panel规格
用于检测FFPE组织中提取DNA的Pillar oncoReveal Solid Tumor v2 Panel规格。
OncoReveal Solid Tumor Panel v2 24 Rxn
HDA-CH-3003-24
SLIMamp™工作流程上的48基因（24样本）实体瘤DNA组panel
List Price:
Discounts:
标签序列PI501-8、PI701-4（32个组合，96反应）
IDX-PI-1001-96
标签序列PI501-8、PI701-4（32个组合，96反应）
List Price:
Discounts:
试剂盒D，标签序列PI501-8、PI701-12
IDX-PI-1004-192
试剂盒D，标签序列PI501-8、PI701-12
List Price:
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靶向多个实体瘤类型中FFPE组织的83个RNA融合的靶向panel。
一种涵盖DNA/RNA组合内容的泛癌panel，利用单管SLIMamp™工作流程实现快速的文库制备并缩短周转时间。
一种涉及58个基因且涵盖DNA/RNA组合内容的泛癌panel，利用单管SLIMamp™工作流程实现快速的文库制备并缩短周转时间。
BRCA1/2基因靶向panel，利用单管SLIMamp™工作流程实现快速的文库制备并缩短周转时间。
以MPL、JAK2和CALR基因中的关键突变为靶标的可靠检测，利用单管SLIMamp工作流程实现快速文库制备并缩短周转时间。
这是一种基于单管SLIMamp工作流程的稳健新一代测序（NGS）检测方案，旨在检测与血液肿瘤及实体瘤相关的基因。
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