NovaSeq X系列
将先进的化学、光学和信息学技术相结合，实现了超凡的速度和数据质量、出色的通量和可扩展性。
AmpliSeq for Illumina Immune Repertoire Plus, TCR beta Panel是一种高度多重的靶向重测序panel，通过对T细胞受体（TCR）β链的基因重组进行测序，检测T细胞多样性及其克隆性扩增。使用包含多重PCR引物、文库试剂和样本条形码的单一混池，采用从全血、新鲜冷冻组织或FACS分选细胞中提取的RNA制备成文库。
AmpliSeq for Illumina Immune Repertoire Plus, TCR beta Panel
通过对T细胞受体β链的重排进行测序，研究T细胞多样性及其克隆扩增的靶向RNA研究panel。
5.5–7.5小时（仅包括文库制备时间，不包括文库定量、归一化或混合时间）
分析时间
< 1.5小时
手动操作时间
概览
主要特点
Immune Repertoire Plus, TCR beta Panel是包括AmpliSeq for Illumina聚合酶链式反应（PCR）文库制备、因美纳边合成边测序（SBS）NGS技术以及自动化分析在内的集成化工作流程的一部分。
即用型panel助您节省鉴定目标基因、设计引物和优化panel所需的时间和精力。
规格
| 分析时间 | 5.5–7.5小时（仅包括文库制备时间，不包括文库定量、归一化或混合时间） |
|---|---|
| 内容说明 | 对TCR β链重排的RNA评估，包括CDR1、CDR2和CDR3（具有最多400 bp读长的扩增子） |
| 手动操作时间 | < 1.5小时 |
| インプット量 | 10～1,000 ng |
| 系统 | MiSeq 系统, NextSeq 550系统, NextSeq 2000系统, NextSeq 1000系统, MiniSeq基因测序仪 |
| 作用机制 | 多重PCR |
| 方法 | 扩增子测序, 靶向RNA测序 |
| 多重分析 | 96个双标签序列组合 |
| 核酸类型 | RNA |
| Analytical sensitivity | 文库可以从全血、新鲜/冷冻组织或荧光激活细胞分选（FACS）分选细胞中提取的RNA中生成。 |
| 特殊的样本类型 | 血液 |
| 物种 | 人 |
| 技术 | Illumina测序 |
| 变异类别 | 转录本变异 |
需要的产品
AmpliSeq for Illumina Immune Repertoire Plus， TCR beta Panel工作流程需要Immune Response Panel寡核苷酸、AmpliSeq Library PLUS试剂盒之一、AmpliSeq cDNA Synthesis试剂盒和至少一个AmpliSeq标签试剂盒。
/
结果
应用
工作流程示例
制备
AmpliSeq for Illumina Immune Repertoire Plus, TCR beta Panel
项目建议
| 仪器 | 推荐的样本数 | 读长 |
|---|---|---|
| MiniSeq基因测序仪 | 每次运行的样本数取决于样本类型。 |
2 × 150 bp |
| MiSeq 系统 | 每次运行的样本数取决于样本类型。 |
2×300 bp |
| NextSeq 550系统 | 每次运行的样本数取决于样本类型。 |
2 × 150 bp |
相关应用和方法
文档
产品资料
支持文档
- Infinium Global Clinical Research Array Documentation
- AmpliSeq for Illumina Immune Repertoire Panel Checklist
- Illumina Adapter Sequences
- Index Adapters Pooling Guide
- AmpliSeq for Illumina Immune Repertoire Panel Reference Guide
- AmpliSeq for Illumina Immune Repertoire Panel Support - Documentation & Literature
- 全部 AmpliSeq for Illumina Immune Repertoire Panel Support
比较
| AmpliSeq for Illumina Immune Repertoire Plus, TCR beta Panel | AmpliSeq for Illumina TCR beta-SR Panel | |
|---|---|---|
| 分析时间 | 5.5–7.5小时（仅包括文库制备时间，不包括文库定量、归一化或混合时间） | 5.5–7.5小时（仅包括文库制备时间，不包括文库定量、归一化或混合时间） |
| 内容说明 | 对TCR β链重排的RNA评估，包括CDR1、CDR2和CDR3（具有最多400 bp读长的扩增子） | 对TCR β链重组进行测序，读取长达80 bp的扩增子，从而确定CDR3的特征。 |
| 手动操作时间 | < 1.5小时 | <1.5小时 |
| インプット量 | 10～1,000 ng | 1 ng |
| 系统 | MiSeq 系统, NextSeq 550系统, NextSeq 2000系统, NextSeq 1000系统, MiniSeq基因测序仪 | MiSeq 系统, NextSeq 550系统, NextSeq 2000系统, NextSeq 1000系统, MiniSeq基因测序仪 |
| 作用机制 | 多重PCR | 多重PCR |
| 方法 | 扩增子测序, 靶向RNA测序 | 靶向DNA测序, 扩增子测序, 靶向RNA测序 |
| 多重分析 | 96个双标签序列组合 | |
| 核酸类型 | RNA | DNA, RNA |
| Analytical sensitivity | 文库可以从全血、新鲜/冷冻组织或荧光激活细胞分选（FACS）分选细胞中提取的RNA中生成。 | |
| 特殊的样本类型 | 血液 | 血液, FFPE组织 |
| 物种 | 人 | 人 |
| 技术 | Illumina测序 | Illumina测序 |
| 变异类别 | 转录本变异 | 转录本变异 |
图
与T细胞克隆型匹配的高质量测序数据
Panel (1)
AmpliSeq™ for Illumina® Immune Repertoire Plus, TCR beta Panel
20024479
与AmpliSeq Library PLUS for Illumina搭配使用时，足以进行24次反应。单独购买文库制备、标签接头和配套产品。
文库制备 (3)
AmpliSeq™ Library PLUS（24次反应）for Illumina®
20019101
包含用于制备24个文库的试剂。单独购买AmpliSeq for Illumina panel和标签接头。
AmpliSeq™ Library PLUS（96次反应）for Illumina®
20019102
包含用于制备96个文库的试剂。单独购买AmpliSeq for Illumina panel和标签接头。
AmpliSeq™ Library PLUS（384次反应）for Illumina®
20019103
包含用于制备384个文库的试剂。单独购买AmpliSeq for Illumina panel和标签接头。
标签接头 (6)
AmpliSeq™ UD Indexes for Illumina®（24标签，24样本）
20019104
包含足以标记24个样本的24个标签。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。
AmpliSeq™ CD Indexes Set A for Illumina®
20019105
包含96个标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。
AmpliSeq™ CD Indexes Set B for Illumina®
20019106
包含96个标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。
AmpliSeq™ CD Indexes Set C for Illumina®
20019107
包含96个标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备试剂、富集试剂和探针panel。
AmpliSeq™ CD Indexes Set D for Illumina®
20019167
包含96、8 bp标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备试剂和探针panel。
AmpliSeq™ CD Indexes Set A-D for Illumina®（384标签，384样本）
20031676
包含四组AmpliSeq CD Indexes for Illumina、Set A、Set B、Set C和Set D。每组包含96、8 bp标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备和探针panel。
配套产品 (2)
Ampliseq™ cDNA Synthesis for Illumina®
20022654
使用AmpliSeq for Illumina RNA Panel（例如，AmpliSeq for Illumina Immune Response、Immune Repertoire Plus、TCR beta Panel、Myeloid、Transcriptome Human Gene Expression、Focus和 Comprehensive Panel v3以及定制或社区RNA Panel）时，包含反应混合物和酶混合物，可将总RNA转化为cDNA。反应次数因panel而异（例如，AmpliSeq for Illumina Immune Response、Focus、 Comprehensive Panel v3和Custom Panel的每个试剂盒有100次反应，AmpliSeq for Illumina Transcriptome Human Gene Expression、Myeloid、Immune Repertoire Plus和TCR beta Panel的每个试剂盒有200次反应）。
AmpliSeq™ Library Equalizer for Illumina®
20019171
在制备用于测序的AmpliSeq for Illumina文库时，包含用于文库归一化的磁珠和试剂。
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MiSeq v3试剂盒
与早期版本相比，优化的试剂盒可增加簇密度和读长，从而提高测序质量分值。
TruSight Oncology 500
使用涵盖所有主要变异类别以及来自FFPE组织的基因特征（TMB、MSI和HRD）的大型泛癌panel实现CGP。
Illumina DNA Prep
快速、集成的文库制备工作流程，适用于各种测序应用。
AmpliSeq for Illumina Immune Response Panel
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TruSight Hereditary Cancer Panel
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iSeq 100试剂盒
iSeq 100测序仪的试剂盒采用即用型卡盒以及单通道SBS化学和CMOS技术，可实现简单、低成本的测序。
AmpliSeq for Illumina Custom RNA Panel
优化的靶向定制RNA研究panel，可测序多达1200个感兴趣的基因组靶点。
AmpliSeq for Illumina Childhood Cancer Panel
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AmpliSeq for Illumina Focus Panel
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