AmpliSeq for Illumina Immune Repertoire Plus, TCR beta Panel

通过对T细胞受体β链的重排进行测序,研究T细胞多样性及其克隆扩增的靶向RNA研究panel。

5.5–7.5小时(仅包括文库制备时间,不包括文库定量、归一化或混合时间)

分析时间

< 1.5小时

手动操作时间

详情请参见规格表

概述

AmpliSeq for Illumina Immune Repertoire Plus, TCR beta Panel是一种高度多重的靶向重测序panel,通过对T细胞受体(TCR)β链的基因重组进行测序,检测T细胞多样性及其克隆性扩增。使用包含多重PCR引物、文库试剂和样本条形码的单一混池,采用从全血、新鲜冷冻组织或FACS分选细胞中提取的RNA制备成文库。

主要特点

  • 高价值内容——全面覆盖TCR β链序列

  • 快速、简化的工作流程——在一天内从全血、新鲜/冷冻组织或荧光激活的细胞分选(FACS)细胞中制备可用于测序的文库

  • 低起始量需求——仅需10 ng起始量RNA即可生成高质量的测序文库

Immune Repertoire Plus, TCR beta Panel是包括AmpliSeq for Illumina聚合酶链式反应(PCR)文库制备、因美纳边合成边测序(SBS)NGS技术以及自动化分析在内的集成化工作流程的一部分。

即用型panel助您节省鉴定目标基因、设计引物和优化panel所需的时间和精力。


性能参数


所需产品

AmpliSeq for Illumina Immune Repertoire Plus, TCR beta Panel工作流程需要Immune Response Panel寡核苷酸、AmpliSeq Library PLUS试剂盒之一、AmpliSeq cDNA Synthesis试剂盒和至少一个AmpliSeq标签试剂盒。

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应用

工作流程示例


项目建议

仪器 Recommended number of samples Read length
MiniSeq System

Samples per run will depend on sample type.

2 × 150 bp

MiSeq, MiSeq System

Samples per run will depend on sample type.

2×300 bp

NextSeq 550 System

Samples per run will depend on sample type.

2 × 150 bp


相关应用和方法

比较

AmpliSeq for Illumina Immune Repertoire Plus, TCR beta Panel AmpliSeq for Illumina TCR beta-SR Panel
Method Targeted RNA Sequencing, Amplicon Sequencing Targeted RNA Sequencing, Targeted DNA Sequencing, Amplicon Sequencing
Specialized sample types Blood FFPE Tissue, Blood
Variant class Transcript variants Transcript variants
インプット量 10~1,000 ng
作用机制 多重PCR 多重PCR
内容说明 对TCR β链重排的RNA评估,包括CDR1、CDR2和CDR3(具有最多400 bp读长的扩增子) 对TCR β链重组进行测序,读取长达80 bp的扩增子,从而确定CDR3的特征。
分析时间 5.5–7.5小时(仅包括文库制备时间,不包括文库定量、归一化或混合时间)
手动操作时间 < 1.5小时 <1.5小时
技术 Illumina测序 Illumina测序
样本类型详情

文库可以从从全血、新鲜/冷冻组织或荧光激活细胞分选(FACS)分选细胞中提取的RNA中生成。

核酸类型 RNA DNA, RNA
物种
系统 MiSeq Desktop Sequencer, NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, MiniSeq System MiSeq Desktop Sequencer, NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, MiniSeq System

与T细胞克隆型匹配的高质量测序数据

Panel (1)

AmpliSeq™ for Illumina® Immune Repertoire Plus, TCR beta Panel

20024479

与AmpliSeq Library PLUS for Illumina搭配使用时,足以进行24次反应。单独购买文库制备、标签接头和配套产品。

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文库制备 (3)

AmpliSeq™ Library PLUS (24 Reactions) for Illumina®

20019101

包含用于制备24个文库的试剂。单独购买AmpliSeq for Illumina panel和标签接头。

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AmpliSeq™ Library PLUS (96 Reactions) for Illumina®

20019102

包含用于制备96个文库的试剂。单独购买AmpliSeq for Illumina panel和标签接头。

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AmpliSeq™ Library PLUS (384 Reactions) for Illumina®

20019103

包含用于制备384个文库的试剂。单独购买AmpliSeq for Illumina panel和标签接头。

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标签接头 (6)

AmpliSeq™ UD Indexes for Illumina® (24 Indexes, 24 Samples)

20019104

包含足以标记24个样本的24个标签。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。

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AmpliSeq™ CD Indexes Set A for Illumina®

20019105

包含96个标签,足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。

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AmpliSeq™ CD Indexes Set B for Illumina®

20019106

包含96个标签,足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。

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AmpliSeq™ CD Indexes Set C for Illumina®

20019107

包含96个标签,足以标记96个样本。单独购买文库制备试剂、富集试剂和探针panel。

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AmpliSeq™ CD Indexes Set D for Illumina®

20019167

包含96、8 bp标签,足以标记96个样本。单独购买文库制备试剂和探针panel。

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AmpliSeq™ CD Indexes Set A-D for Illumina® (384 Indexes, 384 Samples)

20031676

包含四组AmpliSeq CD Indexes for Illumina、Set A、Set B、Set C和Set D。每组包含96、8 bp标签,足以标记96个样本。单独购买文库制备和探针panel。

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配套产品 (2)

Ampliseq™ cDNA Synthesis for Illumina®

20022654

使用AmpliSeq for Illumina RNA Panel(例如,AmpliSeq for Illumina Immune Response、Immune Repertoire Plus、TCR beta Panel、Myeloid、Transcriptome Human Gene Expression、Focus和 Comprehensive Panel v3以及定制或社区RNA Panel)时,包含反应混合物和酶混合物,可将总RNA转化为cDNA。反应次数因panel而异(例如,AmpliSeq for Illumina Immune Response、Focus、 Comprehensive Panel v3和Custom Panel的每个试剂盒有100次反应,AmpliSeq for Illumina Transcriptome Human Gene Expression、Myeloid、Immune Repertoire Plus和TCR beta Panel的每个试剂盒有200次反应)。

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AmpliSeq™ Library Equalizer for Illumina®

20019171

在制备用于测序的AmpliSeq for Illumina文库时,包含用于文库归一化的磁珠和试剂。

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选择汇总

产品

数量

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订购NovaSeq X系列

将先进的化学、光学和信息学技术相结合,实现了超凡的速度和数据质量、出色的通量和可扩展性。

MiSeq Reagent Kit v3

经过优化的试剂盒,可提供更高的簇密度和读长,与早期版本相比,提高了测序质量分值。

TruSight Oncology 500

靶向多种变异类型(包括微卫星不稳定性(MSI)和肿瘤突变负荷(TMB))的检测。

Illumina DNA Prep

快速、集成的工作流程,用于制备文库,用于广泛的测序应用。

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