FFPE兼容panel，可通过对T细胞受体β链重排进行测序来测量肿瘤样本中的T细胞多样性和克隆扩增。
分析时间
手动操作时间
起始量
AmpliSeq for Illumina TCR beta-SR（Short Read）Panel是一种高度多重靶向重测序panel，可用于多种样本类型，包括福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）肿瘤样本。该产品通过对T细胞受体（TCR）β链重排进行测序来检测T细胞多样性及克隆扩增。您可以使用包含多重PCR引物、文库试剂和样本条形码的单一混池，采用从FFPE、全血、新鲜冷冻组织或经过荧光活化分选（FACS）的细胞中提取的DNA/RNA制备文库。
AmpliSeq for Illumina TCR beta-SR Panel是集成工作流程的一部分，该工作流程包括AmpliSeq for Illumina聚合酶链式反应（PCR）的文库制备、因美纳边合成边测序（SBS）化学技术、新一代测序（NGS）技术以及自动化分析过程。
即用型panel助您节省鉴定目标基因、设计引物和优化panel所需的时间和精力。它能够表征TCR β链的高变互补决定区3（CDR3）。这些信息能够帮助免疫学研究人员了解免疫功能、自身免疫性疾病和免疫介导的不良反应。
| 分析时间 | 5.5–7.5小时（仅包括文库制备时间，不包括文库定量、归一化或混合时间） |
|---|---|
| 自动化功能 | 液体处理机器人 |
| 癌症类型 | 实体瘤 |
| 内容说明 | 对TCR β链重组进行测序，读取长达80 bp的扩增子，从而确定CDR3的特征。 |
| 手动操作时间 | <1.5小时 |
| 起始量 | 1 ng |
| 系统 | MiSeq 系统, NextSeq 550系统, NextSeq 2000系统, NextSeq 1000系统, MiniSeq基因测序仪 |
| 作用机制 | 多重PCR |
| 方法 | 靶向DNA测序, 扩增子测序, 靶向RNA测序 |
| 核酸类型 | DNA, RNA |
| 扩增子数 | 不定 |
| 特殊的样本类型 | 血液, FFPE组织 |
| 物种 | 人 |
| 目标插入片段大小 | 80 bp |
| 技术 | Illumina测序 |
| 变异类别 | 转录本变异 |
AmpliSeq for Illumina文库制备工作流程需要panel、文库制备试剂（Library PLUS）和标签。以下产品可用于cDNA合成、样本鉴定和FFPE样本制备：
AmpliSeq for Illumina TCR beta-SR Panel
AmpliSeq for Illumina Library PLUS
AmpliSeq for Illumina CD Indexes
AmpliSeq for Illumina cDNA Synthesis
| 仪器 | 推荐的样本数 | 读长 |
|---|---|---|
| MiniSeq基因测序仪 | 每次运行的样本数取决于样本类型。 |
2 × 151 bp |
| MiSeq 系统 | 每次运行的样本数取决于样本类型。 |
2 × 151 bp |
| NextSeq 550系统 | 每次运行的样本数取决于样本类型。 |
2 × 151 bp |
| AmpliSeq for Illumina TCR beta-SR Panel | AmpliSeq for Illumina Immune Repertoire Plus, TCR beta Panel | |
|---|---|---|
| 分析时间 | 5.5–7.5小时（仅包括文库制备时间，不包括文库定量、归一化或混合时间） | 5.5–7.5小时（仅包括文库制备时间，不包括文库定量、归一化或混合时间） |
| 自动化功能 | 液体处理机器人 | |
| 癌症类型 | 实体瘤 | |
| 内容说明 | 对TCR β链重组进行测序，读取长达80 bp的扩增子，从而确定CDR3的特征。 | 对TCR β链重排的RNA评估，包括CDR1、CDR2和CDR3（具有最多400 bp读长的扩增子） |
| 手动操作时间 | <1.5小时 | < 1.5小时 |
| 起始量 | 1 ng | 10～1,000 ng |
| 系统 | MiSeq 系统, NextSeq 550系统, NextSeq 2000系统, NextSeq 1000系统, MiniSeq基因测序仪 | MiSeq 系统, NextSeq 550系统, NextSeq 2000系统, NextSeq 1000系统, MiniSeq基因测序仪 |
| 作用机制 | 多重PCR | 多重PCR |
| 方法 | 靶向DNA测序, 扩增子测序, 靶向RNA测序 | 扩增子测序, 靶向RNA测序 |
| 核酸类型 | DNA, RNA | RNA |
| 扩增子数 | 不定 | |
| 特殊的样本类型 | 血液, FFPE组织 | 血液 |
| 物种 | 人 | 人 |
| 目标插入片段大小 | 80 bp | |
| 技术 | Illumina测序 | Illumina测序 |
| 变异类别 | 转录本变异 | 转录本变异 |
寻找符合您需求的测序文库制备试剂盒或芯片。按方法、种类等筛选。比较、分享和订购试剂盒。
AmpliSeq™ for Illumina® TCR beta-SR Panel
20031675
与AmpliSeq Library PLUS for Illumina配对时，足够用于24个DNA或RNA样本。包含AmpliSeq dNTP Mix for Illumina。单独购买文库制备、标签接头和配套产品。
AmpliSeq™ Library PLUS（24次反应）for Illumina®
20019101
包含用于制备24个文库的试剂。单独购买AmpliSeq for Illumina panel和标签接头。
AmpliSeq™ Library PLUS（96次反应）for Illumina®
20019102
包含用于制备96个文库的试剂。单独购买AmpliSeq for Illumina panel和标签接头。
AmpliSeq™ Library PLUS（384次反应）for Illumina®
20019103
包含用于制备384个文库的试剂。单独购买AmpliSeq for Illumina panel和标签接头。
AmpliSeq™ UD Indexes for Illumina®（24标签，24样本）
20019104
包含足以标记24个样本的24个标签。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。
AmpliSeq™ CD Indexes Set A for Illumina®
20019105
包含96个标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。
AmpliSeq™ CD Indexes Set B for Illumina®
20019106
包含96个标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。
AmpliSeq™ CD Indexes Set C for Illumina®
20019107
包含96个标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备试剂、富集试剂和探针panel。
AmpliSeq™ CD Indexes Set D for Illumina®
20019167
包含96、8 bp标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备试剂和探针panel。
AmpliSeq™ CD Indexes Set A-D for Illumina®（384标签，384样本）
20031676
包含四组AmpliSeq CD Indexes for Illumina、Set A、Set B、Set C和Set D。每组包含96、8 bp标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备和探针panel。
Ampliseq™ cDNA Synthesis for Illumina®
20022654
使用AmpliSeq for Illumina RNA Panel（例如，AmpliSeq for Illumina Immune Response、Immune Repertoire Plus、TCR beta Panel、Myeloid、Transcriptome Human Gene Expression、Focus和 Comprehensive Panel v3以及定制或社区RNA Panel）时，包含反应混合物和酶混合物，可将总RNA转化为cDNA。反应次数因panel而异（例如，AmpliSeq for Illumina Immune Response、Focus、 Comprehensive Panel v3和Custom Panel的每个试剂盒有100次反应，AmpliSeq for Illumina Transcriptome Human Gene Expression、Myeloid、Immune Repertoire Plus和TCR beta Panel的每个试剂盒有200次反应）。
AmpliSeq™ Library Equalizer for Illumina®
20019171
在制备用于测序的AmpliSeq for Illumina文库时，包含用于文库归一化的磁珠和试剂。
AmpliSeq™ for Illumina® Direct FFPE DNA
20023378
包括24次反应，用于使用AmpliSeq for Illumina实验方案从未染色的玻片固定FFPE组织中制备DNA，无需脱蜡或DNA纯化。
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将先进的化学、光学和信息学技术相结合，实现了超凡的速度和数据质量、出色的通量和可扩展性。
与早期版本相比，优化的试剂盒可增加簇密度和读长，从而提高测序质量分值。
使用涵盖所有主要变异类别以及来自FFPE组织的基因特征（TMB、MSI和HRD）的大型泛癌panel实现CGP。
快速、集成的文库制备工作流程，适用于各种测序应用。
用于研究395种参与肿瘤—免疫系统相互作用基因的靶向RNA表达panel。
评估与遗传癌症风险倾向相关的113个基因和125个SNP的生殖系突变的靶向测序panel。
iSeq 100测序仪的试剂盒采用即用型卡盒以及单通道SBS化学和CMOS技术，可实现简单、低成本的测序。
专为特异性靶点或感兴趣的基因组内容测序进行优化的靶向定制研究panel。
用于研究203个儿童和年轻成年人的癌症相关基因的靶向panel。
用于研究52个与实体瘤相关的基因的靶向DNA和RNA研究panel。
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