Illumina Connected Analytics Cohorts

一种研究设计工具,将私人数据和公共数据集相结合,可快速构建和探索队列。

概述

Illumina Connected Analytics Cohorts整合到Illumina Connected Analytics中,将多组学和表型数据整合到一个地方,以便更好地分析队列并增加新的研究见解。Illumina Connected Analytics Cohorts提供: 

  • 访问高度精选的公共数据集,包括TCGA、Broad RGP、DRAGEN 1kGP和GEO 

  • 现有队列的新数据和过滤标准,无需从头开始 

  • 简单的可视化工具,可选择和可视化队列,避免复杂的查询 

  • 队列的可行性分析,确保队列定义完成,用于下游统计分析(GWAS、PheWAS) 

简化数据结构

利用数据模型结合基因组和表型数据,获得专业服务,实现定制上样和协调。 

快速选择队列标准

使用浏览器查找适合您队列的受试者,整合基因组和表型数据,查看汇总统计信息。 

无缝集成工作流程

轻松访问工作流程,包括DRAGEN流程,并导出到Illumina Connected Analytics Bench,以增强数据科学研究。 


合规性认证


软件更新

Illumina Connected Analytics Cohorts v2.14.0更新

  • 检测和提升基因组构建:队列文档提供了在导入队列之前将hg19/GRCh37 VCF转换为GRCh38的设置说明 

  • 属性查询:改善了在定义队列时选择一系列数值属性的用户体验 

  • 将队列导出到ICA项目数据:改善了将符合队列定义标准的受试者列表导出到ICA项目中进行进一步分析的用户体验 

  • 分析可视化中的受试者选择:用户可以点击针状图中受试者计数的链接,查看携带所选变异或突变的受试者列表 


所需产品

需要Illumina Connected Analytics许可证。ICA队列的iCredit、存储或消耗不会产生额外费用。

深入了解 iCredit 

/

应用

Illumina Connected Analytics Cohorts将受试者和样本水平的元数据与分子数据相结合,对选定的个体子集进行三级分析,适用于药物发现、癌症研究等多种应用。

软件产品组合

1
实验室
2
运行
3
分析
4
解读

相关应用和方法


Illumina Connected Analytics队列的进展

计划和定价

需要Illumina Connected Analytics许可证。Illumina Connected Analytics Cohorts的iCredit、存储或消费无需额外费用。

了解更多:

* 250个iCredit会在30天的入门试用期后过期。 
**适用于安装了支持Universal Copy Service的控制软件的系统。并非所有传统系统都可用。 

快速轻松地构建和探索队列

Illumina Connected Analytics Cohorts提供了一个友好的用户界面,用于过滤和可视化队列的基因组和表型数据。轻松评估数据比较,以便对选定的队列定义进行可行性分析。 

相关资源

ICA Cohorts Annual Subscription

20065842

Sign in to add to cart or see pricing.

联系我们

List Price:

Discounts:

显示 /

选择汇总

产品

数量

Unit Price

常见问题解答

如果一项研究已加载到Illumina Connected Analytics队列中,客户管理员可以选择与合作者共享该研究的权限。

是的。可以将私人数据导入Illumina Connected Analytics队列,独立分析,或与公共数据结合使用,以扩展队列分析。

Illumina Connected Analytics Cohorts支持DNA测序(例如单核苷酸改变、CNV、生殖系和体细胞检出)和RNA-Seq(例如TPM和差异表达)研究的基因组数据、医学属性的表型数据(例如人口统计资料、病史和治疗干预),以及公共数据库(例如TCGA、Broad RGP、DRAGEN 1kGP和GEO)中的27,000多个受试者水平数据集。

/

订购NovaSeq X系列

将先进的化学、光学和信息学技术相结合,实现了超凡的速度和数据质量、出色的通量和可扩展性。

MiSeq Reagent Kit v3

与早期版本相比,优化的试剂盒可增加簇密度和读长,从而提高测序质量分值。

TruSight Oncology 500

使用涵盖所有主要变异类别以及来自FFPE组织的基因特征(TMB、MSI和HRD)的大型泛癌panel实现CGP。

Illumina DNA Prep

快速、集成的文库制备工作流程,适用于各种测序应用。

* 250个iCredit会在30天的入门试用期后过期。 
**适用于安装了支持Universal Copy Service的控制软件的系统。并非所有传统系统都可用。 

咨询专家

获取有关我们产品和服务的信息,或获得有关我们技术问题的答案。