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AmpliSeq for Illumina
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AmpliSeq for Illumina SARS-CoV-2 Research Panel

此款测序panel提供了一种快速、准确且经济的方法，用以研究SARS-CoV-2病毒。

概述

这种研究panel有2个混池，包含247个扩增子，靶向SARS-CoV-2基因组。此panel对冠状病毒基因组（约30kb）的覆盖度 > 99%，并覆盖了所有可能的血清型。

联盟panel的特点

AmpliSeq for Illumina Community Panels需要订购。我们可以提供方便您使用的设计，但可能无法提供相关性能指标。有关预设计和经过测试的内容，请查看AmpliSeq for Illumina Ready-to-Use Panels。

AmpliSeq for Illumina Community Panels包含根据行业领军的疾病研究人员的建议挑选和设计的内容。您可以订购此款联盟panel，也可以使用Illumina Concierge添加或删除基因和扩增子来定制符合您需求的panel。

更多信息

深入了解AmpliSeq for Illumina

规格

起始量 1–100 ng（建议每个混池10 ng）
方法 扩增子测序
核酸类型 RNA
扩增子数 共247个。2个混合池。（池1：125个扩增子。 混合池2：122个扩增子）。
物种 病毒
物种详情 SARS-CoV-2
技术 Illumina测序

需要的产品

除了联盟panel，您还需要AmpliSeq Library PLUS试剂盒和标签接头。

订购文库PLUS、接头和cDNA合成

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比较

AmpliSeq for Illumina SARS-CoV-2 Research Panel Illumina Respiratory Virus Enrichment Kit Respiratory Pathogen ID/AMR Enrichment Panel Kit COVIDSeq Test（研究版本）
起始量 1–100 ng（建议每个混池10 ng） 10-100 ng 基于体积（非浓度依赖性）
方法 扩增子测序 靶向DNA测序, 靶向RNA测序, 靶向富集 靶向DNA测序, 靶向RNA测序, 靶向富集 扩增子测序, 靶向RNA测序
核酸类型 RNA DNA, RNA DNA, RNA RNA
扩增子数 共247个。2个混合池。（池1：125个扩增子。 混合池2：122个扩增子）。
物种 病毒 人, 病毒 真菌, 病毒, 细菌 人, 病毒
物种详情 SARS-CoV-2 检测常见呼吸道病毒，包括最近的流感毒株和SARS-CoV-2。该试剂盒包括作为阳性对照的人类靶标探针，因此可以在每个分析样本中检测到这些人类靶标。 检测呼吸道病原体（180多种细菌、50多种真菌和40多种病毒，包括SARS-CoV-2）和抗菌药物耐药性等位基因（2000多种）。 SARS-CoV-2
技术 Illumina测序 Illumina测序 Illumina测序 Illumina测序

Panel (1)

AmpliSeq™ SARS-CoV-2 Research Panel for Illumina®

20020496

专为特异性靶点或感兴趣的基因组内容进行优化的靶向定制扩增子panel。Library PLUS和标签接头均为单独出售。

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常见问题解答

AmpliSeq for Illumina SARS-CoV-2 Community Panel与AmpliSeq for Illumina文库制备、标签和配套产品相结合，是一种靶向RNA/cDNA扩增子检测，用于SARS-CoV-2病毒的流行病学研究（仅供研究使用）。该panel为2个混合设计，包含247个扩增子/引物对（242个唯一扩增子（池1：125个扩增子，池2：122个扩增子）：237个病毒特异性SARS-CoV-2靶点和5个人类基因表达对照），长度范围为125-275 bps，覆盖＞99%的病毒基因组和病毒的所有潜在血清型。

该panel仅供研究使用（RUO），不可用于诊断程序。任何声明或声明都不能提供信息，表明panel可用于诊断、预防或管理感染。

我们建议客户评估能够分离病毒RNA的市售提取试剂盒。QIAGEN QIAmp Viral RNA Mini Kit（PN 52904）已被证明与新一代测序文库制备和其他内部检测方法兼容。如果发生延期交货，其他公司的任何市售提取试剂盒也应兼容。

请参阅以下资源，了解更多信息：

AmpliSeq for Illumina SARS-CoV-2 Community Panel的文库制备遵循AmpliSeq for Illumina Custom and Community Panel参考指南：第3章 RNA Panel实验方案（https://support.illumina.com/downloads/ampliseq-for-illumina-custom-and-community-panels-reference-guide-1000000036408.html）。

在“扩增cDNA靶标”中，进行以下操作：

  • 用于AMP_RNA程序的2个引物池
  • 表7：18个循环和4分钟时，每个混合池97–192个引物对
    • 池1：125个扩增子/引物对，池2：122个扩增子/引物对
  • 表8：可根据样本质量和样本起始量进行调整

使用AmpliSeq Library PLUS for Illumina制备文库与所有AmpliSeq CD或UD Index Sets for Illumina兼容。

Read深度：每个样本250，000条read。

读长：2 x 151 bp。

平台：AmpliSeq for Illumina文库与iSeq 100、MiSeq、MiniSeq和NextSeq系统兼容。

将panel添加到MyIllumina购物车并结账后，您将收到panel订单。panel应说明解决方案ID：IAACY126664577_100。

根据样本通量的不同，客户还需要订购以下产品：

文库制备
标签接头
配套产品

1个订单包含足够的寡核苷酸，可制备2250个样本。

1份订单=2223美元，足以制备2250个样本（约9美元/扩增子）。这不包括AmpliSeq Library PLUS for Illumina、Ampliseq cDNA Synthesis for Illumina或AmpliSeq CD或UD Indexes for Illumina。

BaseSpace Sequence Hub DNA Amplicon 或 DRAGEN Metagenomics Pipeline 应用程序可用于数据分析。

如有其他问题，请联系  techsupport@illumina.com

/ 结果

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