Illumina COVIDSeq检测（版本）是一种基于扩增子的NGS检测方法，包含旨在研究检测SARS-CoV-2病毒RNA的2019-nCoV引物，可用于临床研究应用。
Illumina COVIDSeq检测（研究版本）可根据不同样本数量的需求扩大或缩小规模。在NovaSeq 6000系统上使用两个SP或S4试剂盒，可在12小时内分别处理1536至3072个结果，使用NextSeq 500/550/550Dx（研究模式）HO试剂盒，可在12小时内处理384个结果。
工作流程包含病毒RNA提取、RNA-cDNA转化、PCR、文库制备、测序、分析和报告生成等步骤。主要组件包括高通量NovaSeq 6000系统或NextSeq 500/550/550Dx（研究模式）系统，配合Illumina COVIDSeq检测（研究版本）和BaseSpace Sequence Hub中用于快速分析的DRAGEN COVIDSeq检测流程（研究版本）或DRAGEN COVIDSeq检测应用程序（研究版本）。
Illumina COVIDSeq检测（研究版本）利用经过验证的公开ARTIC多重PCR工具的改进版本，含有98个可用于扩增SARS-CoV-2病毒特异性序列的扩增子，并与成熟的Illumina测序技术相结合。COVIDSeq提供的共有序列信息（FASTA文件）可上传至开源软件工具，以分配谱系和注释突变。FASTA文件可直接通过BaseSpace Sequencing Hub简单快捷地上传至NCBI和/或GISAID App。
COVIDSeq V4引物池可作为RUO产品出售。它的设计基于ARTIC network V4，包含99个扩增子，无人类对照。该试剂盒可供384份样本使用。本产品未在所有国家/地区上市。请联系当地销售代表了解详情。
一致性序列信息（FASTA文件）可上传至开源软件工具，以分配谱系和注释突变。FASTA文件可直接通过BaseSpace Sequencing Hub简单快捷地上传至NCBI和/或GISAID App。
Illumina COVIDSeq Test (Research Use Only)
Data Sheet | PDF < 1 MB
Automated processing for COVIDSeq™ workflow flexibility
Brochure | PDF < 1 MB
Surveillance of infectious disease through wastewater sequencing
Application Note | PDF < 1 MB
Aliquot procedure for Illumina COVIDSeq Test (RUO Version) kit reagents
Technical Note | PDF < 1 MB
Sequencing guidelines for COVID-19 surveillance using the Illumina COIVDSeq Test (RUO Version)
Technical Note | PDF 1 MB
Technical Note | PDF | 2 versions
Illumina COVIDSeq RUO Kits Reference Guide Documentation
Illumina Adapter Sequences Documentation
Illumina DRAGEN COVIDSeq Test App Guide (RUO) Documentation
Illumina DRAGEN COVID Pipeline Software Guide Documentation
Illumina DRAGEN COVIDSeq Test Pipeline Software Guide (RUO) Documentation
Index Adapters Pooling Guide Documentation
全部 Illumina COVIDSeq Test RUO Support 全部 Illumina COVIDSeq Test RUO Documentation Support
This NGS panel targets >280 respiratory pathogens (including SARS-CoV-2) and 1200+ antimicrobial resistance alleles, with data analysis powered by IDbyDNA.
This low- to mid-throughput NGS assay enables labs to identify and track the emergence and prevalence of novel strains of SARS-CoV-2.
