NovaSeq X系列基因测序仪
将先进的化学、光学和信息学技术相结合，实现了超凡的速度和数据质量、出色的通量和可扩展性。
AmpliSeq for Illumina Transcriptome Human Gene Expression Panel是一种高度多重的靶向重测序分析套装，可在单次分析中测定20,000多个人类RefSeq基因的表达水平。
AmpliSeq for Illumina Transcriptome Human Gene Expression Panel
用于测定20,000多个人类RefSeq基因的表达水平的靶向panel。
6小时（仅包括文库制备时间；不包括文库定量、归一化或混合时间）
分析时间
< 1.5小时
手动操作时间
1-100 ng RNA（推荐10 ng）
起始量
概述
主要特点
Transcriptome Human Gene Expression Panel是集成工作流程的一部分，该工作流程包括基于AmpliSeq for Illumina聚合酶链式反应（PCR）的文库制备、采用因美纳边合成边测序（SBS）的新一代测序（NGS）技术以及自动化分析过程。
即用型panel助您节省鉴定目标基因、设计引物和优化panel所需的时间和精力。
规格
| 分析时间 | 6小时（仅包括文库制备时间；不包括文库定量、归一化或混合时间） |
|---|---|
| 内容说明 | > 95%的人类RefSeq基因；20,802个基因；捕获人类转录组 |
| 说明 | 使用序列特异性扩增子研究超过20,000个人类RefSeq基因的表达水平。 |
| 手动操作时间 | < 1.5小时 |
| 起始量 | 1-100 ng RNA（推荐10 ng） |
| 系统 | NextSeq 550测序仪, NextSeq 2000测序仪, NextSeq 1000测序仪 |
| 作用机制 | 多重PCR |
| 方法 | 外显子组测序, mRNA测序, 靶向RNA测序 |
| 多重分析 | 96个双标签序列组合 |
| 核酸类型 | RNA |
| 扩增子数 | 一个混合池 |
| 特殊的样本类型 | 血液, FFPE组织 |
| 物种 | 人 |
| 技术 | Illumina测序 |
| 变异类别 | 转录本变异 |
需要的产品
AmpliSeq for Illumina Transcriptome Human Gene Expression Panel工作流程需要Transcriptome Panel、Library PLUS试剂盒和标签接头。 RNA工作流程还需要cDNA合成。
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结果
应用
工作流程示例
制备
AmpliSeq for Illumina Transcriptome Human Gene Expression Panel
分析
相关应用和方法
文档
产品资料
支持文档
- AmpliSeq for Illumina Transcriptome Human Gene Expression Panel Reference Guide
- AmpliSeq for Illumina Transcriptome Human Gene Expression Panel Checklist
- Illumina Adapter Sequences
- Illumina Transcriptome Human Gene Expression Panel Support - Documentation & Literature
- Index Adapters Pooling Guide
- AmpliSeq for Illumina Transcriptome Human Gene Expression Panel Consumables & Equipment
- 全部 AmpliSeq for Illumina Transcriptome Human Gene Expression Panel Support
比较
| AmpliSeq for Illumina Transcriptome Human Gene Expression Panel | Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus或Ribo-Zero Plus Microbiome | TruSeq Stranded Total RNA | TruSeq Stranded Total RNA with Ribo-Zero Globin | |
|---|---|---|---|---|
| 分析时间 | 6小时（仅包括文库制备时间；不包括文库定量、归一化或混合时间） | 约7小时 | 11.5小时 | 11.5小时 |
| 内容说明 | > 95%的人类RefSeq基因；20,802个基因；捕获人类转录组 | 捕获编码RNA以及多种形式的非编码RNA | 捕获编码RNA以及多种形式的非编码RNA | 捕获编码RNA以及多种形式的非编码RNA |
| 说明 | 使用序列特异性扩增子研究超过20,000个人类RefSeq基因的表达水平。 | 用于从低RNA起始量和低质量样本制备全转录组测序文库，支持多种RNA-Seq应用。包括Ribo-Zero Plus，用于单管去除来自多个物种的rRNA和珠蛋白RNA，以便进行丰富的转录组分析。 | 用于全转录组测序研究。Total RNA版本可去除细胞质rRNA，而Total RNA Gold版本可去除细胞质和线粒体rRNA。 | 用于血液来源RNA的全转录组测序研究。去除细胞质rRNA、线粒体rRNA和珠蛋白mRNA。 |
| 手动操作时间 | < 1.5小时 | ＜3小时 | 5.5小时 | 5.5小时 |
| 起始量 | 1-100 ng RNA（推荐10 ng） | 标准质量RNA样本为1–1000 ng总RNA。建议至少10 ng总RNA，以获得最佳性能和FFPE样本 | 0.1 – 1 ug高质量总RNA。低质量样本可能需要进一步优化。 | 0.1–1 ug血液来源的高质量纯化总RNA |
| 系统 | NextSeq 550测序仪, NextSeq 2000测序仪, NextSeq 1000测序仪 | NextSeq 550测序仪, NextSeq 2000测序仪, NextSeq 1000测序仪, NovaSeq X测序仪, NextSeq 500测序仪, NovaSeq 6000测序仪, NovaSeq X Plus测序仪 | NextSeq 550测序仪, NextSeq 2000测序仪, NextSeq 1000测序仪, NovaSeq X测序仪, NextSeq 500测序仪, NovaSeq 6000测序仪, NovaSeq X Plus测序仪 | NextSeq 550测序仪, NextSeq 2000测序仪, NextSeq 1000测序仪, NovaSeq X测序仪, NextSeq 500测序仪, NovaSeq 6000测序仪, NovaSeq X Plus测序仪 |
| 作用机制 | 多重PCR | 酶法rRNA去除，连接接头和标签 | 基于磁珠的rRNA去除、cDNA合成和PCR | 基于磁珠的rRNA去除、cDNA合成和PCR |
| 方法 | 外显子组测序, mRNA测序, 靶向RNA测序 | 全转录组测序, 宏转录组测序 | 全转录组测序 | 全转录组测序 |
| 多重分析 | 96个双标签序列组合 | 多达384个唯一双标签（UDI） | 低通量试剂盒：混合最多12个样本。或混合24个样本（组A和B一起）, 高通量试剂盒：使用组合双标签序列或唯一双标签序列制备96个标签样本 | 高通量试剂盒：使用组合双标签序列或唯一双标签序列制备96个标签样本, 低通量试剂盒：混合最多12个样本。或混合24个样本（组A和B一起） |
| 核酸类型 | RNA | RNA | RNA | RNA |
| 扩增子数 | 一个混合池 | |||
| 特殊的样本类型 | 血液, FFPE组织 | 微生物组样本, 低起始量样本, FFPE组织 | FFPE组织 | 血液 |
| 物种 | 人 | 小鼠, 人, 大鼠, 细菌 | 小鼠, 人, 大鼠 | 小鼠, 人, 大鼠 |
| 技术 | Illumina测序 | Illumina测序 | Illumina测序 | Illumina测序 |
| 变异类别 | 转录本变异 | 单核苷酸多态性（SNP）, 基因融合, 新型转录本, 转录本变异 | 单核苷酸多态性（SNP）, 基因融合, 新型转录本, 转录本变异 | 单核苷酸多态性（SNP）, 基因融合, 新型转录本, 转录本变异 |
Panel (1)
AmpliSeq™ Transcriptome Human Gene Expression Panel for Illumina®
20019170
与AmpliSeq Library PLUS for Illumina搭配使用时，足以进行24次反应。单独购买文库制备、标签接头和配套产品。
List Price:
Discounts:
文库制备 (3)
AmpliSeq™ Library PLUS（24次反应）for Illumina®
20019101
包含用于制备24个文库的试剂。单独购买AmpliSeq for Illumina panel和标签接头。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ Library PLUS（96次反应）for Illumina®
20019102
包含用于制备96个文库的试剂。单独购买AmpliSeq for Illumina panel和标签接头。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ Library PLUS（384次反应）for Illumina®
20019103
包含用于制备384个文库的试剂。单独购买AmpliSeq for Illumina panel和标签接头。
List Price:
Discounts:
标签接头 (6)
AmpliSeq™ UD Indexes for Illumina®（24标签，24样本）
20019104
包含足以标记24个样本的24个标签。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ CD Indexes Set A for Illumina®
20019105
包含96个标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ CD Indexes Set B for Illumina®
20019106
包含96个标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ CD Indexes Set C for Illumina®
20019107
包含96个标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备试剂、富集试剂和探针panel。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ CD Indexes Set D for Illumina®
20019167
包含96、8 bp标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备试剂和探针panel。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ CD Indexes Set A-D for Illumina®（384标签，384样本）
20031676
包含四组AmpliSeq CD Indexes for Illumina、Set A、Set B、Set C和Set D。每组包含96、8 bp标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备和探针panel。
List Price:
Discounts:
配套产品 (4)
Ampliseq™ cDNA Synthesis for Illumina®
20022654
使用AmpliSeq for Illumina RNA Panel（例如，AmpliSeq for Illumina Immune Response、Immune Repertoire Plus、TCR beta Panel、Myeloid、Transcriptome Human Gene Expression、Focus和 Comprehensive Panel v3以及定制或社区RNA Panel）时，包含反应混合物和酶混合物，可将总RNA转化为cDNA。反应次数因panel而异（例如，AmpliSeq for Illumina Immune Response、Focus、 Comprehensive Panel v3和Custom Panel的每个试剂盒有100次反应，AmpliSeq for Illumina Transcriptome Human Gene Expression、Myeloid、Immune Repertoire Plus和TCR beta Panel的每个试剂盒有200次反应）。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ for Illumina® Sample ID Panel
20019162
与AmpliSeq Library PLUS for Illumina搭配使用时，包含8个单核苷酸多态性（SNP）靶向引物对和1个性别区分引物对，足以进行96次反应。实现快速准确的样本鉴定。单独购买文库制备、探针panel和标签接头。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ for Illumina® Direct FFPE DNA
20023378
包括24次反应，用于使用AmpliSeq for Illumina实验方案从未染色的玻片固定FFPE组织中制备DNA，无需脱蜡或DNA纯化。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ Library Equalizer for Illumina®
20019171
在制备用于测序的AmpliSeq for Illumina文库时，包含用于文库归一化的磁珠和试剂。
List Price:
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MiSeq v3试剂盒
与早期版本相比，经过优化的试剂盒可增加簇密度和读长，从而提高测序质量分值。
TruSight Oncology 500 v2
使用涵盖所有主要变异类别以及来自FFPE组织的关键生物标志物（TMB、MSI和HRD）的大型泛癌种panel实现CGP。
Illumina DNA Prep
快速、集成的文库制备工作流程，适用于各种测序应用。
AmpliSeq for Illumina Immune Response Panel
用于研究395种参与肿瘤—免疫系统相互作用基因的靶向RNA表达panel。
TruSight Hereditary Cancer Panel
评估与遗传癌症风险倾向相关的113个基因和125个SNP的生殖系突变的靶向测序panel。
iSeq 100试剂盒
iSeq 100测序仪的试剂盒采用即用型卡盒以及单通道SBS化学和CMOS技术，可实现简单、低成本的测序。
AmpliSeq for Illumina Custom DNA Panel
专为特异性靶点或感兴趣的基因组内容测序进行优化的靶向定制研究panel。
AmpliSeq for Illumina Childhood Cancer Panel
用于研究203个儿童和年轻成年人的癌症相关基因的靶向panel。
AmpliSeq for Illumina Focus Panel
用于研究52个与实体瘤相关的基因的靶向DNA和RNA研究panel。
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