
NovaSeq X系列
将先进的化学、光学和信息学技术相结合,实现了超凡的速度和数据质量、出色的通量和可扩展性。
用于测定20,000多个人类RefSeq基因的表达水平的靶向panel。
分析时间
手动操作时间
起始量
AmpliSeq for Illumina Transcriptome Human Gene Expression Panel是一种高度多重的靶向重测序分析套装,可在单次分析中测定20,000多个人类RefSeq基因的表达水平。
Transcriptome Human Gene Expression Panel是集成工作流程的一部分,该工作流程包括基于AmpliSeq for Illumina聚合酶链式反应(PCR)的文库制备、采用因美纳边合成边测序(SBS)的新一代测序(NGS)技术以及自动化分析过程。
即用型panel助您节省鉴定目标基因、设计引物和优化panel所需的时间和精力。
分析时间 | 6小时(仅包括文库制备时间;不包括文库定量、归一化或混合时间) |
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内容说明 | > 95%的人类RefSeq基因;20,802个基因;捕获人类转录组 |
说明 | 使用序列特异性扩增子研究超过20,000个人类RefSeq基因的表达水平。 |
手动操作时间 | < 1.5小时 |
起始量 | 1-100 ng RNA(推荐10 ng) |
系统 | NextSeq 550系统, NextSeq 2000系统, NextSeq 1000系统 |
作用机制 | 多重PCR |
方法 | 外显子组测序, mRNA测序, 靶向RNA测序 |
多重分析 | 96个双标签序列组合 |
核酸类型 | RNA |
扩增子数 | 一个混合池 |
特殊的样本类型 | 血液, FFPE组织 |
物种 | 人 |
技术 | Illumina测序 |
变异类别 | 转录本变异 |
AmpliSeq for Illumina Transcriptome Human Gene Expression Panel工作流程需要Transcriptome Panel、Library PLUS试剂盒和标签接头。 RNA工作流程还需要cDNA合成。
AmpliSeq for Illumina Transcriptome Human Gene Expression Panel
AmpliSeq for Illumina Transcriptome Human Gene Expression Panel | Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus或Ribo-Zero Plus Microbiome | TruSeq Stranded Total RNA | TruSeq Stranded Total RNA with Ribo-Zero Globin | ||
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分析时间 | 6小时(仅包括文库制备时间;不包括文库定量、归一化或混合时间) | 约7小时 | 11.5小时 | 11.5小时 | |
内容说明 | > 95%的人类RefSeq基因;20,802个基因;捕获人类转录组 | 捕获编码RNA以及多种形式的非编码RNA | 捕获编码RNA以及多种形式的非编码RNA | 捕获编码RNA以及多种形式的非编码RNA | |
说明 | 使用序列特异性扩增子研究超过20,000个人类RefSeq基因的表达水平。 | 用于从低RNA起始量和低质量样本制备全转录组测序文库,支持多种RNA-Seq应用。包括Ribo-Zero Plus,用于单管去除来自多个物种的rRNA和珠蛋白RNA,以便进行丰富的转录组分析。 | 用于全转录组测序研究。Total RNA版本可去除细胞质rRNA,而Total RNA Gold版本可去除细胞质和线粒体rRNA。 | 用于血液来源RNA的全转录组测序研究。去除细胞质rRNA、线粒体rRNA和珠蛋白mRNA。 | |
手动操作时间 | < 1.5小时 | <3小时 | 5.5小时 | 5.5小时 | |
起始量 | 1-100 ng RNA(推荐10 ng) | 标准质量RNA样本为1–1000 ng总RNA。建议至少10 ng总RNA,以获得最佳性能和FFPE样本 | 0.1 – 1 ug高质量总RNA。低质量样本可能需要进一步优化。 | 0.1–1 ug血液来源的高质量纯化总RNA | |
系统 | NextSeq 550系统, NextSeq 2000系统, NextSeq 1000系统 | NextSeq 550系统, NextSeq 2000系统, NextSeq 1000系统, NovaSeq X基因测序仪, NextSeq 500系统, NovaSeq 6000系统, NovaSeq X Plus基因测序仪 | NextSeq 550系统, NextSeq 2000系统, NextSeq 1000系统, NovaSeq X基因测序仪, NextSeq 500系统, NovaSeq 6000系统, NovaSeq X Plus基因测序仪 | NextSeq 550系统, NextSeq 2000系统, NextSeq 1000系统, NovaSeq X基因测序仪, NextSeq 500系统, NovaSeq 6000系统, NovaSeq X Plus基因测序仪 | |
作用机制 | 多重PCR | 酶法rRNA去除,连接接头和标签 | 基于磁珠的rRNA去除、cDNA合成和PCR | 基于磁珠的rRNA去除、cDNA合成和PCR | |
方法 | 外显子组测序, mRNA测序, 靶向RNA测序 | 全转录组测序, 宏转录组测序 | 全转录组测序 | 全转录组测序 | |
多重分析 | 96个双标签序列组合 | 多达384个唯一双标签(UDI) | 低通量试剂盒:混合最多12个样本。或混合24个样本(组A和B一起), 高通量试剂盒:使用组合双标签序列或唯一双标签序列制备96个标签样本 | 高通量试剂盒:使用组合双标签序列或唯一双标签序列制备96个标签样本, 低通量试剂盒:混合最多12个样本。或混合24个样本(组A和B一起) | |
核酸类型 | RNA | RNA | RNA | RNA | |
扩增子数 | 一个混合池 | ||||
特殊的样本类型 | 血液, FFPE组织 | 微生物组样本, 低起始量样本, FFPE组织 | FFPE组织 | 血液 | |
物种 | 人 | 小鼠, 人, 大鼠, 细菌 | 小鼠, 人, 大鼠 | 小鼠, 人, 大鼠 | |
技术 | Illumina测序 | Illumina测序 | Illumina测序 | Illumina测序 | |
变异类别 | 转录本变异 | 单核苷酸多态性(SNP), 基因融合, 新型转录本, 转录本变异 | 单核苷酸多态性(SNP), 基因融合, 新型转录本, 转录本变异 | 单核苷酸多态性(SNP), 基因融合, 新型转录本, 转录本变异 |
AmpliSeq™ Transcriptome Human Gene Expression Panel for Illumina®
20019170
与AmpliSeq Library PLUS for Illumina搭配使用时,足以进行24次反应。单独购买文库制备、标签接头和配套产品。
AmpliSeq™ Library PLUS(24次反应)for Illumina®
20019101
包含用于制备24个文库的试剂。单独购买AmpliSeq for Illumina panel和标签接头。
AmpliSeq™ Library PLUS(96次反应)for Illumina®
20019102
包含用于制备96个文库的试剂。单独购买AmpliSeq for Illumina panel和标签接头。
AmpliSeq™ Library PLUS(384次反应)for Illumina®
20019103
包含用于制备384个文库的试剂。单独购买AmpliSeq for Illumina panel和标签接头。
AmpliSeq™ UD Indexes for Illumina®(24标签,24样本)
20019104
包含足以标记24个样本的24个标签。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。
AmpliSeq™ CD Indexes Set A for Illumina®
20019105
包含96个标签,足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。
AmpliSeq™ CD Indexes Set B for Illumina®
20019106
包含96个标签,足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。
AmpliSeq™ CD Indexes Set C for Illumina®
20019107
包含96个标签,足以标记96个样本。单独购买文库制备试剂、富集试剂和探针panel。
AmpliSeq™ CD Indexes Set D for Illumina®
20019167
包含96、8 bp标签,足以标记96个样本。单独购买文库制备试剂和探针panel。
AmpliSeq™ CD Indexes Set A-D for Illumina®(384标签,384样本)
20031676
包含四组AmpliSeq CD Indexes for Illumina、Set A、Set B、Set C和Set D。每组包含96、8 bp标签,足以标记96个样本。单独购买文库制备和探针panel。
Ampliseq™ cDNA Synthesis for Illumina®
20022654
使用AmpliSeq for Illumina RNA Panel(例如,AmpliSeq for Illumina Immune Response、Immune Repertoire Plus、TCR beta Panel、Myeloid、Transcriptome Human Gene Expression、Focus和 Comprehensive Panel v3以及定制或社区RNA Panel)时,包含反应混合物和酶混合物,可将总RNA转化为cDNA。反应次数因panel而异(例如,AmpliSeq for Illumina Immune Response、Focus、 Comprehensive Panel v3和Custom Panel的每个试剂盒有100次反应,AmpliSeq for Illumina Transcriptome Human Gene Expression、Myeloid、Immune Repertoire Plus和TCR beta Panel的每个试剂盒有200次反应)。
AmpliSeq™ for Illumina® Sample ID Panel
20019162
与AmpliSeq Library PLUS for Illumina搭配使用时,包含8个单核苷酸多态性(SNP)靶向引物对和1个性别区分引物对,足以进行96次反应。实现快速准确的样本鉴定。单独购买文库制备、探针panel和标签接头。
AmpliSeq™ for Illumina® Direct FFPE DNA
20023378
包括24次反应,用于使用AmpliSeq for Illumina实验方案从未染色的玻片固定FFPE组织中制备DNA,无需脱蜡或DNA纯化。
AmpliSeq™ Library Equalizer for Illumina®
20019171
在制备用于测序的AmpliSeq for Illumina文库时,包含用于文库归一化的磁珠和试剂。
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