Skip to content

核糖体分析

核糖体分析简介

核糖体分析是一种基于被核糖体保护的mRNA片段的深度测序方法。对这些片段的纯化和测序,可提供具体时间点某一细胞内处于活动状态的所有核糖体的“快照”。该信息可以确定细胞中哪些蛋白在活跃地进行翻译。

核糖体分析能对细胞转译流程进行系统性监控并预测蛋白质丰度。 确定哪些信息区域正在被翻译有助于定义复杂生物的蛋白质组。核糖体分析与大规模平行Illumina高通量测序相结合,能详细、准确地分析体内的蛋白生成。

核糖体分析的优势

确定正在进行翻译的转录本,以了解基因调控的重要方面。

  • 研究翻译调控并测量基因表达
  • 鉴别翻译起始位点
  • 确定蛋白合成速率
  • 预测蛋白质丰度

制备用于核糖体分析的测序文库

核糖体分析使用尺寸排阻色谱。此方法简化了将核糖体保护的RNA片段化为兼容Illumina仪器测序的文库的步骤。它是简单、快速且可扩展的方法,不需要专门的仪器。相反,其他分离多核糖体和单核糖体的方法依赖数小时使用蔗糖梯度或缓冲物的超速离心。

特色核糖体分析产品

NextSeq 550系统

灵活的力量。快速简约,适合日常基因组学。每次运行7–20个核糖体分析样本。

查看系统
BaseSpace TopHat Alignment App

用业界标准方法比对RNA read并检测基因融合。整合了Cufflinks Assembly & DE App。

查看应用程序
TruSeq Ribo Profile的替代方案

TruSeq Ribo Profile Kit已停产,该试剂盒基于以下文献发表的核糖体分析实验方案:Ingolia NT, Brar GA, Rouskin S, McGeachy AM, Weissman JS.The ribosome profiling strategy for monitoring translation in vivo by deep sequencing of ribosome-protected mRNA fragments.Nat Protoc.2012;7(8);1534-1550。此文献提供有关该检测所需试剂的详细信息及其购买方式。

查看文献

相关解决方案

癌症研究:基因失调

对核糖体保护的mRNA片段进行测序能提供癌症中有关基因失调的重要信息。研究人员通过测量参与翻译特定mRNA的核糖体数量,能获得癌症发展过程中出现的功能改变的相关信息。深入了解癌症基因表达研究

复杂疾病研究:翻译调控

翻译调控能决定转录组进行翻译的部分。 核糖体分析进一步弥合了基因组学/转录组学和蛋白质组学之间的差距,提供了转录后调控重要层面的可见性以及对驱动复杂疾病的机制的潜在新见解。深入了解复杂疾病基因组学

希望收到有关测序方法的快讯、案例研究和信息?请输入您的电子邮箱地址。

请输入您的电子邮箱地址。

其他资源

采用NextSeq系列的RNA-Seq
采用NextSeq系列的RNA-Seq

适用于RNA测序的灵活实惠解决方案提供更深层次的生物学理解。

RNA-Seq数据分析
RNA-Seq数据分析

用户友好型软件工具为生物学家简化了RNA-Seq数据分析,无需具备生物信息学研究经验。

Ribosome Profiling Enables Full Translation Analysis
Ribosome Profiling Enables Full Translation Analysis

A direct method for analyzing gene expression at the protein synthesis level.

*根据Illumina公司2015年存档数据计算