聚焦关键靶向基因

使用预设计或定制panel对感兴趣的基因进行深度测序

靶向基因测序

在分析指定样本的特定突变时,靶向的基因测序panel是有用的工具。重点panel包含了一组精选的基因或基因区域,它们与正在研究的疾病或表型有着已知或疑似的关联。在购买基因panel时,可挑选预先选定的内容,或定制设计内容,从而将感兴趣的基因组区域包含在内。

新一代测序(NGS)为评估感兴趣的靶向基因提供了可扩展性、高速和分辨率。可平行评估多个样本的多个基因,与多次进行单独分析相比节约了时间,且降低了成本。与全基因组测序等更广泛的方法相比,靶向基因测序能生成更小、更易于管理的数据集,使分析更加轻松。

灵活、便捷的测序仪

桌面式测序仪使新手用户能够在多种应用领域中进行靶向测序。

探索桌面式测序仪
  • 深度测序重要基因或感兴趣的区域(500–1000倍或更高),实现罕见变异的鉴定
  • 为研究疾病相关的基因提供一种经济高效的探索方案
  • 带来准确且容易阐释的结果,可鉴定等位基因频率低(低至5%)的变异
  • 在单次检测中实现新的致病性突变或遗传性突变的可信鉴定

预设计的Panel包含与某种疾病或表型相关的重要的基因或基因区域,这些是根据已发表的研究和专家建议精心挑选的。通过专注于最有可能参与其中的基因,这些Panel能够节省资源并减少数据分析的复杂性。预设计的Panel可用于多种疾病的研究,例如癌症、遗传性疾病、心血管疾病和自闭症。

TruSight Sequencing Panels

AmpliSeq for Illumina Panels

通过定制设计,研究人员可以靶向与其特定研究兴趣相关的基因组区域。定制靶向测序非常适合用于检查特定通路中的基因、或作为全基因组关联研究和全基因组测序的进一步实验。

Illumina支持两种靶向测序方法:目标富集和扩增子生成。

  • 目标富集: 感兴趣的区域通过与生物素标记的探针杂交而被捕获,之后通过磁珠沉淀而被分离。视具体的实验设计而定,目标富集可捕获20 kb–62 Mb的区域。
  • 扩增子测序: 使用高度多重的寡核苷酸库来扩增并纯化感兴趣的区域。该方法让研究人员可以根据选用的文库制备试剂盒,在单次运行中对几个到数百个基因进行测序。
目标富集与扩增子测序的优点
目标富集
扩增子测序
基因内容较大,通常大于50个基因 基因内容较小,通常小于50个基因
更全面地分析所有变异类型 非常适合分析单核苷酸位点变异和插入/缺失
方法更全面,但手动操作时间和周转时间更长* 工作流程更经济、更简便

* 周转时间为文库制备分析时间(从DNA到完成文库)。

MiSeq i100 in a lab setting

特色测序仪

MiSeq i100系列

因美纳用于靶向基因测序的快速、简单的桌面式测序系统。

特色解决方案

DesignStudio软件

一款易于使用的在线软件工具,能够提供动态反馈以优化探针设计。

AmpliSeq for Illumina Custom Panels

创建针对感兴趣内容优化的定制靶向测序Panel。

Illumina DNA Prep with Enrichment

一种快速、灵活的DNA靶向测序文库制备解决方案。

新一代测序新手指南

想将新一代测序引入您的实验室,但又不确定从何开始?这些资源涵盖了NGS的核心主题,可以帮助您规划第一次实验。

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新一代测序新手指南

从桑格测序转向使用NGS进行靶向测序,帮助米兰的研究人员解锁了与神经和代谢紊乱相关的变异数据。

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Targeted Multigene Panels Enable Efficient Variant Discovery
癌症基因测序
Cancer Gene Sequencing

靶向癌症panel主要关注选定的一组与癌症有已知关联的基因或基因区域。靶向重测序研究提供的深度覆盖实现了高度灵敏的变异检出。 深入了解靶向癌症panel

罕见病变异分析
Scientists Pipetting

NGS可以帮助科学家发现与罕见和未确诊疾病相关的变异,并研究疾病机制。 了解更多关于罕见疾病的基因组学知识

HLA测序
HLA Sequencing

与需要进行多次分析,使用多个系统和分析程序的传统方法相比,使用NGS进行HLA分型研究可通过单次分析得到相位分辨结果。 深入了解HLA测序

植入前遗传筛查(PGS)
Embryos

该方法通过筛选所有23对染色体来确定胚胎的染色体状态,为体外受精研究提供了有价值的见解。了解更多关于PGS的信息

Targeted Gene Panel for Tumor Analysis
用于肿瘤分析的靶向基因panel

Ravindra Kolhe博士介绍了TruSight Tumor 170如何帮助他的实验室在单次检测中研究多种肿瘤相关变异。

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Development of a Sequencing Panel for Autism
自闭症研究测序panel的开发

Jonathan Pevsner博士介绍了他的实验室如何促进自闭症研究基因panel的开发。

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Analyzing Chromosomes Using Arrays and NGS
使用芯片和NGS分析染色体

MGZ医学遗传学中心的研究人员使用芯片和基因panel来评估染色体异常。

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Targeted RNA Sequencing
靶向RNA测序

研究由靶向基因测序鉴定出的变异对表达的影响。

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Improved MiSeq Reagents
改善后MiSeq试剂

通过v3测序化学,可实现多达15 Gb的产出(25 M测序read和2x300 bp读长)。

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NGS to Detect Blood Cancers
使用NGS检测血液癌症

靶向NGS(新一代测序)能够比桑格测序或细胞遗传学方法更灵敏地识别与髓系相关的基因。

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Germline CNV Analysis App Note
通过实验室内的NGS扩展您的研究

在这次采访中,雷吉娜·玛丽亚遗传中心实验室的协调员伊琳娜·约尔达内斯库博士(Dr. Irina Iordanescu)解释了NGS如何增强检测手段,例如全外显子测序和用于儿科遗传病检测及肿瘤学的靶向测序Panel。继续阅读,了解她是如何利用NGS加速并扩展样本处理,同时降低成本的。

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