在分析指定样本的特定突变时,靶向的基因测序panel是有用的工具。重点panel包含了一组精选的基因或基因区域,它们与正在研究的疾病或表型有着已知或疑似的关联。在购买基因panel时,可挑选预先选定的内容,或定制设计内容,从而将感兴趣的基因组区域包含在内。
新一代测序(NGS)为评估感兴趣的靶向基因提供了可扩展性、高速和分辨率。可平行评估多个样本的多个基因,与多次进行单独分析相比节约了时间,且降低了成本。与全基因组测序等更广泛的方法相比,靶向基因测序能生成更小、更易于管理的数据集,使分析更加轻松。
桌面式测序仪使新手用户能够在多种应用领域中进行靶向测序。
预设计的Panel包含与某种疾病或表型相关的重要的基因或基因区域,这些是根据已发表的研究和专家建议精心挑选的。通过专注于最有可能参与其中的基因,这些Panel能够节省资源并减少数据分析的复杂性。预设计的Panel可用于多种疾病的研究,例如癌症、遗传性疾病、心血管疾病和自闭症。
通过定制设计,研究人员可以靶向与其特定研究兴趣相关的基因组区域。定制靶向测序非常适合用于检查特定通路中的基因、或作为全基因组关联研究和全基因组测序的进一步实验。
Illumina支持两种靶向测序方法:目标富集和扩增子生成。
目标富集 |
扩增子测序 |
基因内容较大,通常大于50个基因 | 基因内容较小,通常小于50个基因 |
更全面地分析所有变异类型 | 非常适合分析单核苷酸位点变异和插入/缺失 |
方法更全面,但手动操作时间和周转时间更长* | 工作流程更经济、更简便 |
* 周转时间为文库制备分析时间(从DNA到完成文库)。
一款易于使用的在线软件工具,能够提供动态反馈以优化探针设计。
创建针对感兴趣内容优化的定制靶向测序Panel。
一种快速、灵活的DNA靶向测序文库制备解决方案。
靶向癌症panel主要关注选定的一组与癌症有已知关联的基因或基因区域。靶向重测序研究提供的深度覆盖实现了高度灵敏的变异检出。 深入了解靶向癌症panel。
NGS可以帮助科学家发现与罕见和未确诊疾病相关的变异,并研究疾病机制。 了解更多关于罕见疾病的基因组学知识。
与需要进行多次分析,使用多个系统和分析程序的传统方法相比,使用NGS进行HLA分型研究可通过单次分析得到相位分辨结果。 深入了解HLA测序。
该方法通过筛选所有23对染色体来确定胚胎的染色体状态,为体外受精研究提供了有价值的见解。了解更多关于PGS的信息。
在这次采访中,雷吉娜·玛丽亚遗传中心实验室的协调员伊琳娜·约尔达内斯库博士(Dr. Irina Iordanescu)解释了NGS如何增强检测手段,例如全外显子测序和用于儿科遗传病检测及肿瘤学的靶向测序Panel。继续阅读,了解她是如何利用NGS加速并扩展样本处理,同时降低成本的。