
NextSeq 1000/2000系列基因测序仪
这些测序系统提供了广泛的应用范围、操作简便性、高灵活性和可扩展性,以及经过验证的性能。
对>200种病毒和亚型进行全基因组测序和表征,包括SARS-CoV-2、流感病毒、虫媒病毒和肝炎,并进行靶向富集。
分析时间
手动操作时间
起始量
Illumina Viral Surveillance Panel v1仍可通过My Illumina或客户服务获取。请联系您的销售代表,了解更多信息。
联合Viral Surveillance Panel v2和Illumina RNA Prep with Enrichment试剂盒,研究人员可以获得全基因组测序(WGS)数据,这些数据可以表征多种病毒,包括SARS-CoV-2、流感和脊髓灰质炎病毒。
采用杂交捕获方法的靶标富集可对多种病毒进行WGS,而无需鸟枪法宏基因组测序所需的高测序深度,有助于了解病毒进化情况并进行广泛的病毒监测。1 此外,与其他靶向重测序方法相比(如扩增子测序),杂交捕获可提供更高的捕获、测序和突变鉴定能力,因此是监测快速进化病毒暴发的理想选择。
这一全面的工作流程整合了文库制备、靶向富集、测序和数据分析,使研究人员和公共卫生科学家能够通过一个panel/工作流程监测多种高风险病毒。
分析时间 | 文库制备时间<9小时 |
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自动化功能 | 液体处理机器人 |
自动化详情 | 探索可用的自动化方法 |
Analytical sensitivity | Viral Surveillance Panel with the Illumina RNA Prep with Enrichment提供了优化的工作流程,支持病毒爆发检测和200多种RNA和DNA病毒病原体的监测。 |
手动操作时间 | 文库制备时间<2小时 |
起始量 | 10-100 ng |
系统 | MiSeq 系统, iSeq 100系统, NextSeq 550系统, NextSeq 2000系统, NextSeq 1000系统, MiniSeq基因测序仪 |
作用机制 | 磁珠上酶切法片段化,然后进行单个杂交步骤 |
方法 | 靶向DNA测序, 全基因组测序, 靶向RNA测序, 靶向富集 |
多重分析 | 使用唯一双标签,单次运行最多可分析384个样本 |
核酸类型 | DNA, RNA |
物种 | 病毒 |
链特异性 | 非链 |
技术 | Illumina测序 |
完整的试剂盒包括文库制备和富集所需的一切,包括纯化磁珠和标签接头。使用多达4个试剂盒,可进行多达384个样本的大型运行。
Viral Surveillance Panel v2 Kit提供了优化的工作流程,支持病毒爆发检测和监测200多种RNA和DNA病毒病原体。
Viral Surveillance Panel v2 Kit(Sets A-D)
Viral Surveillance Panel v2 | Illumina Respiratory Virus Enrichment Kit | Respiratory Pathogen ID/AMR Enrichment Panel Kit | |
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分析时间 | 文库制备时间<9小时 | 文库制备时间<9小时 | 文库制备时间<9小时 |
自动化功能 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 |
自动化详情 | 探索可用的自动化方法 | 探索可用的自动化方法 | 探索可用的自动化方法 |
Analytical sensitivity | Viral Surveillance Panel with the Illumina RNA Prep with Enrichment提供了优化的工作流程,支持病毒爆发检测和200多种RNA和DNA病毒病原体的监测。 | 用于检测和分析SARS-CoV-2和其他常见呼吸道病毒的简化工作流程。不可知的设计允许广泛鉴定多种目标样本类型的致病病毒。 | 鉴定呼吸道感染和合并感染,检测抗菌药物耐药性标志物,并对关键病原体(SARS-CoV-2和Flu A/B病毒)进行毒株分型,以研究病毒的进化和传播。 |
手动操作时间 | 文库制备时间<2小时 | 文库制备时间<2小时 | 文库制备时间<2小时 |
起始量 | 10-100 ng | 10-100 ng | 基于体积(非浓度依赖性) |
系统 | MiSeq 系统, iSeq 100系统, NextSeq 550系统, NextSeq 2000系统, NextSeq 1000系统, MiniSeq基因测序仪 | MiSeq 系统, NextSeq 550系统, NextSeq 2000系统, MiniSeq基因测序仪 | MiSeq 系统, NextSeq 550系统, MiniSeq基因测序仪 |
作用机制 | 磁珠上酶切法片段化,然后进行单个杂交步骤 | 磁珠上酶切法片段化,然后进行单个杂交步骤 | 磁珠上酶切法片段化,然后进行单个杂交步骤 |
方法 | 靶向DNA测序, 全基因组测序, 靶向RNA测序, 靶向富集 | 靶向DNA测序, 靶向RNA测序, 靶向富集 | 靶向DNA测序, 靶向RNA测序, 靶向富集 |
多重分析 | 使用唯一双标签,单次运行最多可分析384个样本 | 使用唯一双标签,单次运行最多可分析384个样本 | 使用唯一双标签,单次运行最多可分析384个样本 |
核酸类型 | DNA, RNA | DNA, RNA | DNA, RNA |
物种 | 病毒 | 人, 病毒 | 真菌, 病毒, 细菌 |
链特异性 | 非链 | ||
技术 | Illumina测序 | Illumina测序 | Illumina测序 |
寻找符合您需求的测序文库制备试剂盒或芯片。按方法、种类等筛选。比较、分享和订购试剂盒。
与鸟枪法宏基因组测序相比,对所有RNA/DNA进行测序,靶向杂交捕获减少了对宿主和非靶向微生物不必要的测序。
Viral Surveillance Panel v2 Kit中的靶向富集探针可均匀覆盖全病毒基因组。通过将已知拷贝数的病毒对照与10 ng人RNA/DNA混合液混合来制备病毒对照。按照Viral Surveillance Panel v2 Kit 工作流程制备文库并进行测序。
使用Viral Surveillance Panel v2 Kit 或鸟枪法测序在废水中检测到的病毒。a使用Viral Surveillance Panel v2 Kit时,可轻松检测到病毒浓度较低的样本。
有关检测到的完整病毒列表,请参见数据表或病毒列表电子表格。
下载Viral Surveillance Panel v2病毒列表电子表格
a. 样本由科罗拉多州立大学的研究人员收集,纯化的总核酸被运送到Illumina进行测试。使用100 ng总核酸制备文库并进行测序
该panel可检测200多种病毒和亚型,包括世界卫生组织(WHO)确定为公共卫生重要风险的66种病毒。2
包含在Viral Surveillance Panel中 | ||||
腺相关病毒2 | 人腺病毒(A-G种) | 乳腺病毒 | “轮状病毒(物种A、B、C、H) | |
爱奇病毒1型 | 人博卡病毒 | 马尔堡病毒 | 风疹病毒 | |
Aigai病毒 | 人类冠状病毒(4种) | Mayaro病毒 | 萨比亚病毒 | |
孟巴利病毒 | 人类巨细胞病毒 | 麻疹病毒 | 水痘病毒A | |
波旁病毒 | 人类免疫缺陷病毒(1和2) | 孟格尔病毒 | 西西里山蝇热病毒 | |
缓存谷病毒 | 人类偏肺病毒 | MERS-CoV | 札幌病毒 | |
加州脑炎病毒 | 人乳头瘤病毒(28种) | 痘病毒 | SARS-CoV | |
查帕雷病毒 | 人类副流感病毒(1-4型) | 腮腺炎病毒 | SARS-CoV-2 | |
基孔肯雅病毒 | 人双埃柯病毒 | 默里谷脑炎病毒 | Semliki森林病毒 | |
科罗拉多蜱热病毒 | 人细小病毒B19 | 尼帕病毒 | 严重发热伴血小板减少综合征病毒 | |
柯萨奇病毒(A和B) | 甲型流感病毒(20种亚型) | 诺如病毒 | Sindbis病毒 | |
克里米亚-刚果出血热病毒 | 乙型流感病毒(两个谱系) | 鄂木斯克出血热病毒 | 雪鞋野兔病毒 | |
登革热病毒(4种类型) | 丙型流感病毒 | Onyong-nyong病毒 | Sosuga病毒 | |
埃博拉病毒(6种) | 詹姆斯敦峡谷病毒 | 孔雀病毒 | 圣路易斯脑炎病毒 | |
回声病毒 | 日本脑炎病毒 | 脊髓灰质炎病毒 | 塔城蜱病毒2 | |
肠病毒(A-D) | 鸠宁病毒 | 多瘤病毒(13种) | 塔希纳病毒 | |
EB病毒 | 科萨努尔森林病毒 | 波瓦桑病毒 | 蜱传脑炎病毒 | |
马脑炎病毒(3种) | 拉克罗斯病毒 | 蓬塔图罗病毒 | 扭转腱病毒(Anelloviruses) | |
瓜纳里托病毒 | 拉沙病毒 | 狂犬病病毒 | 托斯卡纳病毒 | |
汉坦病毒(22种) | Lloviu病毒 | 拉文病毒 | Usutu病毒 | |
心地病毒 | 卢约病毒 | 呼吸道合胞病毒(A型和B型) | 水痘-带状疱疹病毒 | |
亨德拉病毒 | 淋巴细胞性脉络丛脑膜炎病毒 | 鼻病毒(A-C种) | 天花病毒 | |
肝炎病毒(A-E) | 溶菌病毒 | 裂谷热病毒 | 西尼罗河病毒 | |
单纯疱疹病毒(1种和2种) | 马丘波病毒 | 罗斯河病毒 | 黄热病毒 | |
寨卡病毒 |
Illumina Viral Surveillance Panel v2 Kit, Set A (96样本)
20108081
Viral Surillance Panel V2 Kit(VSP V2)是一种杂交捕获富集试剂盒,可对200多种公共卫生领域关注的病毒和亚型进行全基因组测序。
Illumina Viral Surveillance Panel v2 Kit, Set B (96样本)
20108082
Viral Surillance Panel V2 Kit(VSP V2)是一种杂交捕获富集试剂盒,可对200多种公共卫生领域关注的病毒和亚型进行全基因组测序。
Illumina Viral Surveillance Panel v2 Kit, Set C (96样本)
20108083
Viral Surillance Panel V2 Kit(VSP V2)是一种杂交捕获富集试剂盒,可对200多种公共卫生领域关注的病毒和亚型进行全基因组测序。
Illumina Viral Surveillance Panel v2 Kit, Set D (96样本)
20108084
Viral Surillance Panel V2 Kit(VSP V2)是一种杂交捕获富集试剂盒,可对200多种公共卫生领域关注的病毒和亚型进行全基因组测序。
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Viral Surveillance Panel v1提供了66种公共卫生相关病毒的结果。 Viral Surveillance Panel v2将此目标列表扩展到200多种病毒和亚型。 Viral Surveillance Panel v2包含Illumina纯化磁珠,不包含在Viral Surveillance Panel v1中。
对于高质量样本,每个样本的读长至少为2M双端读数,读长为150 bp。对于更复杂的样本,例如废水,建议每个样本至少8M双端读数。
是的,可以检测dsRNA、ssRNA、dsDNA和ssDNA病毒。
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