货号为RS-122-2501、RS-122-2502和RS-122-2503的产品配置有更改。在新的配置中,文库制备试剂和标签接头均可单独购买。可单独购买的组件列表可在“选择产品”部分中找到。

TruSeq Stranded Total RNA with Ribo-Zero Globin

采用高效率的工作流程从血液来源RNA制备全转录组测序文库,在单个步骤内即可除去核糖体RNA和球蛋白mRNA。 阅读更多...
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Library Prep

TruSeq® Stranded Total RNA Library Prep Globin(48样本)

20020612

TruSeq® Stranded Total RNA Library Prep Globin(96样本)

20020613


Index Adapters

TruSeq RNA CD Index Plate(96标签,96样本)

20019792

TruSeq RNA Single Indexes Set A(12标签,48样本)

20020492

TruSeq RNA Single Indexes Set B(12标签,48样本)

20020493

IDT for Illumina – TruSeq RNA UD Indexes(24标签,96样本)

20020591

IDT for Illumina – TruSeq RNA UD Indexes(96标签,96样本)

20022371

产品特色

TruSeq Stranded Total RNA with Ribo-Zero Globin采用迅捷高效的测序文库制备工作流程,能从血液来源的总RNA中得到清晰、完整的转录组视图。

能得到精确链信息的高质量全转录组分析

这些试剂盒集Ribo-Zero核糖体RNA去除方法与RNA测序(RNA-Seq)技术的优点于一体,可对人类、小鼠或大鼠样本进行全转录组分析。该技术能:

  • 均匀覆盖并精确测量链方向
  • 高度可靠地揭示替代转录本、反义表达和等位基因特异性表达
  • 揭示编码RNA和多种形式的非编码RNA

查看物种兼容表

一步高效去除核糖体RNA和球蛋白mRNA

对血液来源的RNA进行全转录组分析需要去除两种在全血中含量较高的RNA——核糖体RNA(包括细胞质rRNA和线粒体rRNA)和球蛋白mRNA。

传统去除方法需要两个步骤才能完成。这意味着需要的试剂更多、工作流程更长、损失的RNA更多。TruSeq Stranded Total RNA with Ribo-Zero Globin利用了Ribo-Zero测序化学技术,能通过一个简单、快速的步骤高效去除两种含量较高的RNA。

自动化工作流程

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规格

计划推荐

仪器 推荐的样本数 读长
NextSeq 550 System RNA分析:每次运行6-20个样本(基于每个样本2000万条read)
转录组分析:每次运行2–8个样本(基于每个样本5000万条read)
2 x 75 bp
2 x 75 bp
HiSeq 2500 System RNA分析:每次运行30-200个样本(双流动槽;基于每个样本2000万条read)
转录组分析:每次运行12–80个样本(双流动槽;基于每个样本5000万条read)
2 x 75 bp
2 x 75 bp
NovaSeq 6000 System RNA分析(每次运行的样本,双流动槽):S1: 160, S2: 320, S4: 768. 受标签组合的限制(双重)。基于2000万条read。
转录组分析(每次运行的样本,双流动槽): S1: 64, S2: 128, S4: 400.受标签组合的限制(双重)。基于5000万条read。
≤ 2 × 100 bp
≤ 2 × 100 bp

产品比较

TruSeq Stranded Total RNA with Ribo-Zero Globin Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus or Ribo-Zero Plus Microbiome
作用机制 基于微珠的rRNA去除、cDNA合成和PCR 酶法rRNA去除,连接接头和标签
内容说明 捕获编码RNA以及多种形式的非编码RNA。 捕获编码RNA以及多种形式的非编码RNA。
分析时间 11.5小时 约7小时
变异种类 新型转录本, 转录变异, 基因融合, 单核苷酸多态性 (SNPs) 新型转录本, 转录变异, 基因融合, 单核苷酸多态性 (SNPs)
多重分析 高通量试剂盒:使用组合双标签或唯一双标签序列制备96个带标签的样本。, 低通量试剂盒:混合最多12个样本。或混合24个样本(组A和B一起) 多达384个唯一双标签序列(UDI)
手动操作时间 5.5小时 <3小时
技术 测序 测序
方法 全转录组测序 全转录组测序
核酸类型 RNA RNA
物种类别 人类, 大鼠, 小鼠 细菌, 大鼠, 小鼠, 人类
物种详情 rRNA去除:消耗人、小鼠和大鼠rRNA(细胞质和线粒体)和球蛋白mRNA 包含Ribo-Zero Plus,用于去除多个物种的转录本,包括人类细胞质和线粒体rRNA、小鼠rRNA、大鼠rRNA、细菌革兰氏+/- rRNA和人β珠蛋白转录本。
特殊的样本类型 血液
自动化功能 液体处理机器人 液体处理机器人
说明 用于血液来源RNA的全转录组测序研究。去除细胞质rRNA、线粒体rRNA和珠蛋白mRNA。 用于多种类型样本的全转录组测序研究。包含Ribo-Zero plus模块,一个试管即可去除多个物种的转录本。
起始量 0.1–1 ug血液来源的高质量纯化总RNA 对于标准质量RNA样本,可使用1–1000 ng的总RNA。对于FFPE样本,建议最少使用10 ng的总RNA,以获得理想效果。

货号为RS-122-2501、RS-122-2502和RS-122-2503的产品配置有更改。在新的配置中,文库制备试剂和标签接头均可单独购买。可单独购买的组件列表可在“选择产品”部分中找到。

方法特异的工作流程示例

 

支持数据和图像

 

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