NovaSeq X系列
将先进的化学、光学和信息学技术相结合，实现了超凡的速度和数据质量、出色的通量和可扩展性。
TruSeq Stranded Total RNA with Ribo-Zero Globin采用迅捷高效的测序文库制备工作流程，能从血液来源的总RNA中得到清晰、完整的转录组视图。
TruSeq Stranded Total RNA with Ribo-Zero Globin
采用高效率的工作流程从血液来源RNA制备全转录组测序文库，在单个步骤内即可除去核糖体RNA和球蛋白mRNA。
11.5小时
分析时间
5.5小时
手动操作时间
0.1–1 ug血液来源的高质量纯化总RNA
起始量
概述
主要特点
一步高效去除核糖体RNA和球蛋白mRNA
对血液来源的RNA进行全转录组分析需要去除两种在全血中含量较高的RNA——核糖体RNA（包括细胞质rRNA和线粒体rRNA）和球蛋白mRNA。
传统去除方法需要两个步骤才能完成。这意味着需要的试剂更多、工作流程更长、损失的RNA更多。TruSeq Stranded Total RNA with Ribo-Zero Globin利用了Ribo-Zero测序化学技术，能通过一个简单、快速的步骤高效去除两种含量较高的RNA。
自动化工作流程
规格
| 分析时间 | 11.5小时 |
|---|---|
| 自动化功能 | 液体处理机器人 |
| 内容说明 | 捕获编码RNA以及多种形式的非编码RNA |
| 说明 | 用于血液来源RNA的全转录组测序研究。去除细胞质rRNA、线粒体rRNA和珠蛋白mRNA。 |
| 手动操作时间 | 5.5小时 |
| 起始量 | 0.1–1 ug血液来源的高质量纯化总RNA |
| 系统 | NextSeq 550系统, NextSeq 2000系统, NextSeq 1000系统, NovaSeq X基因测序仪, NextSeq 500系统, NovaSeq 6000系统, NovaSeq X Plus基因测序仪 |
| 作用机制 | 基于磁珠的rRNA去除、cDNA合成和PCR |
| 方法 | 全转录组测序 |
| 多重分析 | 高通量试剂盒：使用组合双标签序列或唯一双标签序列制备96个标签样本, 低通量试剂盒：混合最多12个样本。或混合24个样本（组A和B一起） |
| 核酸类型 | RNA |
| 特殊的样本类型 | 血液 |
| 物种 | 小鼠, 人, 大鼠 |
| Analytical sensitivity | rRNA去除：去除人、小鼠和大鼠rRNA（细胞质和线粒体）和球蛋白mRNA |
| 技术 | Illumina测序 |
| 变异类别 | 单核苷酸多态性（SNP）, 基因融合, 新型转录本, 转录本变异 |
需要的产品
Illumina现提供模块化产品的预订，让您的工作流程变得灵活。您可以订购带有以下任何标签的以下任何文库制备产品。
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结果
应用
工作流程示例
制备
TruSeq Stranded Total RNA with Ribo-Zero Globin
项目建议
| 仪器 | 推荐的样本数 | 读长 |
|---|---|---|
| NextSeq 550系统 | RNA分析：每次运行6–20个样本（基于每个样本2000万条read） |
2×75 bp |
| NovaSeq 6000系统 | RNA分析（每次运行的样本，双流动槽）：S1：160、S2：320、S4：768。受标签组合的限制（双重）。基于2000万条read。 |
≤ 2 × 100 bp |
相关应用和方法
分析编码RNA和多种形式的非编码RNA，获得完整的转录组视图。
查找从降解的FFPE组织和其他低质量样本中获得高质量结果的FFPE RNA测序解决方案。
RNA-Seq使用新一代测序技术分析全转录组的表达，使研究人员能够检测已知或新的特性并对RNA进行定量。
文档
支持文档
- TruSeq Stranded Total RNA Sample Preparation User-Supplied Consumables and Equipment
- TruSeq Stranded Total RNA Consumables & Equipment
- TruSeq Stranded Total RNA With Illumina Ribo-Zero Plus rRNA Depletion Reference Guide
- Sequencing Library qPCR Quantification Guide
- Illumina Experiment Manager User Guide
- TruSeq Stranded Total RNA Dual Index Product Insert
- TruSeq Stranded Total RNA Documentation
- TruSeq Stranded Total RNA Reference Guide
- TruSeq Stranded Total RNA Sample Prep HS EUC and LTF
- TruSeq Sample Prep Best Practices Guide
- TruSeq Stranded Total RNA Sample Preparation LS EUC and LTF
- TruSeq Stranded Total RNA Sample Prep Guide
- TruSeq HT Dual Index Quick Reference Card
- TruSeq Stranded Total RNA Checklist
- 全部 TruSeq Stranded Total RNA Support
- 全部 TruSeq Stranded Total RNA支持——文档和文献 Support
比较
| TruSeq Stranded Total RNA with Ribo-Zero Globin | Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus或Ribo-Zero Plus Microbiome | |
|---|---|---|
| 分析时间 | 11.5小时 | 约7小时 |
| 自动化功能 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 |
| 内容说明 | 捕获编码RNA以及多种形式的非编码RNA | 捕获编码RNA以及多种形式的非编码RNA |
| 说明 | 用于血液来源RNA的全转录组测序研究。去除细胞质rRNA、线粒体rRNA和珠蛋白mRNA。 | 用于从低RNA起始量和低质量样本制备全转录组测序文库，支持多种RNA-Seq应用。包括Ribo-Zero Plus，用于单管去除来自多个物种的rRNA和珠蛋白RNA，以便进行丰富的转录组分析。 |
| 手动操作时间 | 5.5小时 | ＜3小时 |
| 起始量 | 0.1–1 ug血液来源的高质量纯化总RNA | 标准质量RNA样本为1–1000 ng总RNA。建议至少10 ng总RNA，以获得最佳性能和FFPE样本 |
| 系统 | NextSeq 550系统, NextSeq 2000系统, NextSeq 1000系统, NovaSeq X基因测序仪, NextSeq 500系统, NovaSeq 6000系统, NovaSeq X Plus基因测序仪 | NextSeq 550系统, NextSeq 2000系统, NextSeq 1000系统, NovaSeq X基因测序仪, NextSeq 500系统, NovaSeq 6000系统, NovaSeq X Plus基因测序仪 |
| 作用机制 | 基于磁珠的rRNA去除、cDNA合成和PCR | 酶法rRNA去除，连接接头和标签 |
| 方法 | 全转录组测序 | 全转录组测序, 宏转录组测序 |
| 多重分析 | 高通量试剂盒：使用组合双标签序列或唯一双标签序列制备96个标签样本, 低通量试剂盒：混合最多12个样本。或混合24个样本（组A和B一起） | 多达384个唯一双标签（UDI） |
| 核酸类型 | RNA | RNA |
| 特殊的样本类型 | 血液 | 微生物组样本, 低起始量样本, FFPE组织 |
| 物种 | 小鼠, 人, 大鼠 | 小鼠, 人, 大鼠, 细菌 |
| Analytical sensitivity | rRNA去除：去除人、小鼠和大鼠rRNA（细胞质和线粒体）和球蛋白mRNA | Ribo-Zero Plus可去除多个物种的大量转录本，包括：人类细胞质和线粒体rRNA、小鼠rRNA、大鼠rRNA、细菌（大肠杆菌和枯草芽孢杆菌）rRNA以及人类β珠蛋白转录本 Ribo-Zero Plus Microbiome去除了多个物种的大量转录本，包括：在Ribo-Zero Plus中去除的转录本以及多种微生物物种和ATCC MSA-2002, MSA-2005和MSA-2006 |
| 技术 | Illumina测序 | Illumina测序 |
| 变异类别 | 单核苷酸多态性（SNP）, 基因融合, 新型转录本, 转录本变异 | 单核苷酸多态性（SNP）, 基因融合, 新型转录本, 转录本变异 |
图
技术平行分析
FFPE组织的技术平行分析显示出高度的一致性，表明文库制备的性能稳定。轴为log2(FPKM)。显示 R2值。
均匀覆盖转录本
TruSeq Stranded Total RNA在新鲜冷冻（FF，上图）和FFPE（下图）肿瘤以及匹配正常乳腺组织中的前1,000个表达转录本中具有出色的覆盖度，比对链read＞98%。X轴：转录本的不同位置，Y轴：结合read的覆盖度百分比。
文库制备 (2)
TruSeq® Stranded Total RNA Library Prep Globin（48样本）
20020612
包括用于从血液样本中去除rRNA和球蛋白mRNA的RiboZero磁珠、用于将RNA转录成cDNA的PCR预混液，以及用于制备48个样本的试剂。单独购买标签接头和纯化磁珠。
TruSeq® Stranded Total RNA Library Prep Globin（96样本）
20020613
包括用于从血液样本中去除rRNA和球蛋白mRNA的RiboZero磁珠、用于将RNA转录成cDNA的PCR预混液，以及用于制备48个样本的试剂。单独购买标签接头和纯化磁珠。
标签接头 (4)
TruSeq RNA CD Index Plate（96标签，96样本）
20019792
TruSeq Stranded RNA HT Kit 96样本接头孔板盒
IDT for Illumina – TruSeq RNA UD Indexes（24标签，96样本）
20020591
唯一双重标签（UDI），与TruSeq Stranded mRNA和TruSeq Stranded Total RNA Library Prep Kit兼容。UDI试剂盒以孔板形式供货，包含24个UDI（x4），足够用于96个样本。
IDT for Illumina – TruSeq DNA UD Indexes v2（96标签，96样本）
20040870
包含96、8 bp标签，足以标记96个样本，与TruSeq Nano和TruSeq PCR-Free Library Prep Kit兼容。版本 2 包含板 20022370 中 192 个标签寡核苷酸中 8 个的改进，其余 184 个未作更改。单独购买文库制备和探针panel。
IDT for Illumina – TruSeq RNA UD Indexes v2（96标签，96样本）
20040871
包含96、8 bp标签，足以标记96个样本，与TruSeq Stranded mRNA和TruSeq Stranded Total RNA Library Prep Kit兼容。版本 2 包含板 20022371 中 192 个标签寡核苷酸中 8 个的改进，其余 184 个未作更改。单独购买文库制备和探针panel。
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MiSeq v3试剂盒
与早期版本相比，优化的试剂盒可增加簇密度和读长，从而提高测序质量分值。
TruSight Oncology 500
使用涵盖所有主要变异类别以及来自FFPE组织的基因特征（TMB、MSI和HRD）的大型泛癌panel实现CGP。
Illumina DNA Prep
快速、集成的文库制备工作流程，适用于各种测序应用。
NextSeq 500/550 v2.5试剂盒
与早期版本相比，v2.5试剂盒使用弹性流动槽，可保持起始荧光强度，具有更高的稳定性和性能。
TruSight Hereditary Cancer Panel
评估与遗传癌症风险倾向相关的113个基因和125个SNP的生殖系突变的靶向测序panel。
TruSeq Stranded mRNA
从mRNA制备测序文库，获得清晰的编码转录组视图以及链特异性信息。
TruSeq Stranded Total RNA
可靠的、扩展自如的全转录组分析（RNA-Seq）解决方案适用于各种物种与样本类型，包括人类、小鼠与福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）样本。
TruSeq RNA Exome
为FFPE组织及其他低质量样本的RNA测序提供的可重现且经济的解决方案。只需10 ng的总RNA即可保证准确性。
Illumina RNA Prep with Enrichment
快速、集成的工作流程，针对各种样本类型和RNA起始量生成富集并标记的测序文库。
标签使用有限许可：
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